MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021829	TCG	2	6	998030	998035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723822
18502	NC_021829	CTT	2	6	998063	998068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723822
18503	NC_021829	TTACTT	2	12	998098	998109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525723822
18504	NC_021829	ATGA	2	8	998132	998139	50 %	25 %	25 %	0 %	525723822
18505	NC_021829	TAA	2	6	998237	998242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723822
18506	NC_021829	TCA	2	6	998244	998249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723822
18507	NC_021829	TCA	2	6	998265	998270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723822
18508	NC_021829	TTA	2	6	998343	998348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723822
18509	NC_021829	TTGC	2	8	998378	998385	0 %	50 %	25 %	25 %	525723822
18510	NC_021829	CTT	2	6	998437	998442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723822
18511	NC_021829	TAT	2	6	998446	998451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723822
18512	NC_021829	ATAA	2	8	998452	998459	75 %	25 %	0 %	0 %	525723822
18513	NC_021829	T	6	6	998491	998496	0 %	100 %	0 %	0 %	525723822
18514	NC_021829	TAT	2	6	998518	998523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723822
18515	NC_021829	TTC	2	6	998546	998551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723822
18516	NC_021829	T	7	7	998693	998699	0 %	100 %	0 %	0 %	525723822
18517	NC_021829	TCC	2	6	998780	998785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723822
18518	NC_021829	T	6	6	998804	998809	0 %	100 %	0 %	0 %	525723822
18519	NC_021829	TGC	2	6	998820	998825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723822
18520	NC_021829	TGC	2	6	998870	998875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723822
18521	NC_021829	T	7	7	998922	998928	0 %	100 %	0 %	0 %	525723822
18522	NC_021829	CTT	2	6	998980	998985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723822
18523	NC_021829	AAT	2	6	998999	999004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723822
18524	NC_021829	CGG	2	6	999144	999149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525723823
18525	NC_021829	TTA	2	6	999150	999155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723823
18526	NC_021829	T	6	6	999193	999198	0 %	100 %	0 %	0 %	525723823
18527	NC_021829	ATAAA	2	10	999356	999365	80 %	20 %	0 %	0 %	525723823
18528	NC_021829	TCA	2	6	999366	999371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723823
18529	NC_021829	ATTC	2	8	999383	999390	25 %	50 %	0 %	25 %	525723823
18530	NC_021829	ATA	2	6	999572	999577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723823
18531	NC_021829	CAG	2	6	999727	999732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723823
18532	NC_021829	CTT	2	6	999766	999771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723823
18533	NC_021829	T	7	7	999950	999956	0 %	100 %	0 %	0 %	525723824
18534	NC_021829	GTA	2	6	999957	999962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723824
18535	NC_021829	ATTT	2	8	1000023	1000030	25 %	75 %	0 %	0 %	525723824
18536	NC_021829	CG	3	6	1000032	1000037	0 %	0 %	50 %	50 %	525723824
18537	NC_021829	ACC	2	6	1000100	1000105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723824
18538	NC_021829	GCC	2	6	1000117	1000122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525723824
18539	NC_021829	TTCA	2	8	1000123	1000130	25 %	50 %	0 %	25 %	525723824
18540	NC_021829	TGT	2	6	1000156	1000161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723824
18541	NC_021829	AATT	2	8	1000168	1000175	50 %	50 %	0 %	0 %	525723824
18542	NC_021829	TTA	2	6	1000208	1000213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723824
18543	NC_021829	ACG	2	6	1000247	1000252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723824
18544	NC_021829	ACC	2	6	1000336	1000341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723824
18545	NC_021829	TAA	2	6	1000374	1000379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18546	NC_021829	TGA	2	6	1000402	1000407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723824
18547	NC_021829	GTA	2	6	1000412	1000417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723824
18548	NC_021829	TGA	2	6	1000428	1000433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723824
18549	NC_021829	AAT	2	6	1000450	1000455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18550	NC_021829	TCG	2	6	1000464	1000469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723824
18551	NC_021829	AAT	2	6	1000528	1000533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18552	NC_021829	TAA	2	6	1000560	1000565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18553	NC_021829	AAT	2	6	1000570	1000575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18554	NC_021829	CCG	2	6	1000596	1000601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525723824
18555	NC_021829	TAA	2	6	1000602	1000607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18556	NC_021829	TAA	2	6	1000623	1000628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18557	NC_021829	TCG	3	9	1000650	1000658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723824
18558	NC_021829	AAT	2	6	1000660	1000665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18559	NC_021829	ACG	2	6	1000667	1000672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723824
18560	NC_021829	TAA	2	6	1000677	1000682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18561	NC_021829	AAT	2	6	1000711	1000716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18562	NC_021829	TA	3	6	1000744	1000749	50 %	50 %	0 %	0 %	525723824
18563	NC_021829	AAT	2	6	1000753	1000758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18564	NC_021829	ACA	2	6	1000763	1000768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723824
18565	NC_021829	ACC	2	6	1000778	1000783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723824
18566	NC_021829	ATG	2	6	1000850	1000855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723824
18567	NC_021829	AAC	2	6	1000885	1000890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723824
18568	NC_021829	ATA	2	6	1000904	1000909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18569	NC_021829	TAA	2	6	1000938	1000943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18570	NC_021829	A	6	6	1000972	1000977	100 %	0 %	0 %	0 %	525723824
18571	NC_021829	TAA	2	6	1000980	1000985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723824
18572	NC_021829	ATTC	2	8	1001130	1001137	25 %	50 %	0 %	25 %	525723824
18573	NC_021829	GTC	2	6	1001138	1001143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723824
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18577	NC_021829	CTT	2	6	1001266	1001271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723824
18578	NC_021829	CTAG	2	8	1001288	1001295	25 %	25 %	25 %	25 %	525723824
18579	NC_021829	CGC	2	6	1001313	1001318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525723824
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18582	NC_021829	CCA	2	6	1001429	1001434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723824
18583	NC_021829	AACC	2	8	1001439	1001446	50 %	0 %	0 %	50 %	525723824
18584	NC_021829	ACT	2	6	1001476	1001481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723824
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18587	NC_021829	GTTCA	2	10	1001674	1001683	20 %	40 %	20 %	20 %	525723824
18588	NC_021829	TCT	2	6	1001724	1001729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525722044
18589	NC_021829	CCTT	2	8	1001787	1001794	0 %	50 %	0 %	50 %	525722044
18590	NC_021829	TCT	2	6	1001851	1001856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525722044
18591	NC_021829	T	6	6	1001861	1001866	0 %	100 %	0 %	0 %	525722044
18592	NC_021829	TAG	2	6	1001941	1001946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525722044
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18598	NC_021829	A	6	6	1002152	1002157	100 %	0 %	0 %	0 %	525722045
18599	NC_021829	TTC	2	6	1002214	1002219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525722045
18600	NC_021829	CTT	2	6	1002246	1002251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525722045
18601	NC_021829	TTC	2	6	1002277	1002282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525722045
18602	NC_021829	AACTA	2	10	1002355	1002364	60 %	20 %	0 %	20 %	525722045
18603	NC_021829	TTA	2	6	1002401	1002406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525722045
18604	NC_021829	ATTT	2	8	1002443	1002450	25 %	75 %	0 %	0 %	525722045
18605	NC_021829	CTG	2	6	1002497	1002502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525723825
18606	NC_021829	CAA	2	6	1002557	1002562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723825
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18608	NC_021829	ACC	2	6	1002648	1002653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723825
18609	NC_021829	T	6	6	1002663	1002668	0 %	100 %	0 %	0 %	525723825
18610	NC_021829	TTG	2	6	1002876	1002881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723825
18611	NC_021829	AGC	2	6	1002957	1002962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723825
18612	NC_021829	TACT	2	8	1003046	1003053	25 %	50 %	0 %	25 %	525722046
18613	NC_021829	TATC	2	8	1003172	1003179	25 %	50 %	0 %	25 %	525722046
18614	NC_021829	ATG	2	6	1003215	1003220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525722046
18615	NC_021829	TTTC	2	8	1003238	1003245	0 %	75 %	0 %	25 %	525722046
18616	NC_021829	TCT	2	6	1003261	1003266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525722046
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18618	NC_021829	ATC	2	6	1003288	1003293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525722046
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