MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021829	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723660
2	NC_021829	A	6	6	361	366	100 %	0 %	0 %	0 %	525723660
3	NC_021829	ATTT	2	8	434	441	25 %	75 %	0 %	0 %	525723660
4	NC_021829	TAAA	2	8	455	462	75 %	25 %	0 %	0 %	525723660
5	NC_021829	TCAT	2	8	463	470	25 %	50 %	0 %	25 %	525723660
6	NC_021829	TA	3	6	471	476	50 %	50 %	0 %	0 %	525723660
7	NC_021829	A	6	6	487	492	100 %	0 %	0 %	0 %	525723660
8	NC_021829	ATAA	2	8	562	569	75 %	25 %	0 %	0 %	525723660
9	NC_021829	TAA	2	6	608	613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
10	NC_021829	AGCA	2	8	618	625	50 %	0 %	25 %	25 %	525723660
11	NC_021829	ACAT	2	8	777	784	50 %	25 %	0 %	25 %	525723660
12	NC_021829	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723660
13	NC_021829	A	6	6	919	924	100 %	0 %	0 %	0 %	525723660
14	NC_021829	AAG	2	6	971	976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723660
15	NC_021829	CAT	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723660
16	NC_021829	ATA	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723660
17	NC_021829	ATAA	2	8	1064	1071	75 %	25 %	0 %	0 %	525723660
18	NC_021829	CCT	2	6	1087	1092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723661
19	NC_021829	TA	4	8	1138	1145	50 %	50 %	0 %	0 %	525723661
20	NC_021829	TGT	2	6	1159	1164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
21	NC_021829	T	8	8	1173	1180	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
22	NC_021829	ATCT	2	8	1283	1290	25 %	50 %	0 %	25 %	525723661
23	NC_021829	TAA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
24	NC_021829	AAT	2	6	1324	1329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723661
25	NC_021829	A	6	6	1366	1371	100 %	0 %	0 %	0 %	525723661
26	NC_021829	GAA	2	6	1387	1392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
27	NC_021829	T	6	6	1465	1470	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
28	NC_021829	TCA	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
29	NC_021829	TCT	2	6	1498	1503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
30	NC_021829	TAATC	2	10	1506	1515	40 %	40 %	0 %	20 %	525723661
31	NC_021829	TCA	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
32	NC_021829	AT	3	6	1536	1541	50 %	50 %	0 %	0 %	525723661
33	NC_021829	GTT	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723661
34	NC_021829	CCA	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525723661
35	NC_021829	T	6	6	1617	1622	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
36	NC_021829	CT	4	8	1660	1667	0 %	50 %	0 %	50 %	525723661
37	NC_021829	T	6	6	1667	1672	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
38	NC_021829	TCA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723661
39	NC_021829	T	8	8	1761	1768	0 %	100 %	0 %	0 %	525723661
40	NC_021829	AGA	2	6	1790	1795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723661
41	NC_021829	CTT	2	6	1888	1893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723661
42	NC_021829	TAT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
43	NC_021829	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723661
44	NC_021829	TTA	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723662
45	NC_021829	GTTA	2	8	2816	2823	25 %	50 %	25 %	0 %	525723662
46	NC_021829	T	6	6	2905	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	525723662
47	NC_021829	TCA	2	6	2979	2984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723662
48	NC_021829	ATA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
49	NC_021829	A	6	6	3618	3623	100 %	0 %	0 %	0 %	525723663
50	NC_021829	ATC	2	6	3641	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
51	NC_021829	GAT	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
52	NC_021829	TCT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
53	NC_021829	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
54	NC_021829	ATC	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723663
55	NC_021829	TTA	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
56	NC_021829	TGT	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
57	NC_021829	ATCT	2	8	3799	3806	25 %	50 %	0 %	25 %	525723663
58	NC_021829	ATT	3	9	3884	3892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
59	NC_021829	ATA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
60	NC_021829	TTA	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
61	NC_021829	AAT	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723663
62	NC_021829	CTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
63	NC_021829	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723663
64	NC_021829	TTATT	2	10	4024	4033	20 %	80 %	0 %	0 %	525723663
65	NC_021829	TTA	2	6	4071	4076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723663
66	NC_021829	TCC	2	6	4082	4087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723663
67	NC_021829	TCT	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723663
68	NC_021829	T	7	7	4133	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	525723663
69	NC_021829	GAT	2	6	4144	4149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723663
70	NC_021829	CAA	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723663
71	NC_021829	CTT	2	6	4325	4330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
72	NC_021829	CT	3	6	4338	4343	0 %	50 %	0 %	50 %	525723664
73	NC_021829	ATT	2	6	4399	4404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723664
74	NC_021829	TTC	2	6	4419	4424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723664
75	NC_021829	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723664
76	NC_021829	T	6	6	4457	4462	0 %	100 %	0 %	0 %	525723664
77	NC_021829	CAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723664
78	NC_021829	TAG	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723665
79	NC_021829	TAT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
80	NC_021829	TTA	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723665
81	NC_021829	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723665
82	NC_021829	AAC	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723665
83	NC_021829	T	6	6	4783	4788	0 %	100 %	0 %	0 %	525723665
84	NC_021829	TGT	2	6	4928	4933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723666
85	NC_021829	AGTT	2	8	4943	4950	25 %	50 %	25 %	0 %	525723666
86	NC_021829	TTC	2	6	4952	4957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
87	NC_021829	TTC	2	6	4998	5003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723666
88	NC_021829	TGCAA	2	10	5151	5160	40 %	20 %	20 %	20 %	525723667
89	NC_021829	AAT	2	6	5209	5214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
90	NC_021829	GTT	2	6	5236	5241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723667
91	NC_021829	CAT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723667
92	NC_021829	TTG	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723667
93	NC_021829	AAT	2	6	5343	5348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
94	NC_021829	GATTT	2	10	5380	5389	20 %	60 %	20 %	0 %	525723667
95	NC_021829	ATA	3	9	5394	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723667
96	NC_021829	AT	4	8	5549	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	525723668
97	NC_021829	ATC	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
98	NC_021829	AAC	2	6	5660	5665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
99	NC_021829	T	6	6	5753	5758	0 %	100 %	0 %	0 %	525723668
100	NC_021829	TCT	2	6	5832	5837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
101	NC_021829	ATAA	2	8	5842	5849	75 %	25 %	0 %	0 %	525723668
102	NC_021829	TCT	3	9	5856	5864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723668
103	NC_021829	TTTG	2	8	5869	5876	0 %	75 %	25 %	0 %	525723668
104	NC_021829	TA	3	6	5925	5930	50 %	50 %	0 %	0 %	525723668
105	NC_021829	CAA	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723668
106	NC_021829	TAT	3	9	6019	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723668
107	NC_021829	GCACTG	2	12	6028	6039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525723668
108	NC_021829	TAC	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
109	NC_021829	TCA	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
110	NC_021829	AATC	2	8	6205	6212	50 %	25 %	0 %	25 %	525723668
111	NC_021829	ATA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
112	NC_021829	TCAA	2	8	6252	6259	50 %	25 %	0 %	25 %	525723668
113	NC_021829	ATG	2	6	6295	6300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
114	NC_021829	TAC	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
115	NC_021829	CAG	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723668
116	NC_021829	TCC	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525723668
117	NC_021829	TAG	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723668
118	NC_021829	A	6	6	6389	6394	100 %	0 %	0 %	0 %	525723668
119	NC_021829	AAT	2	6	6418	6423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
120	NC_021829	TTTA	2	8	6434	6441	25 %	75 %	0 %	0 %	525723668
121	NC_021829	T	7	7	6514	6520	0 %	100 %	0 %	0 %	525723668
122	NC_021829	ATA	2	6	6543	6548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
123	NC_021829	CAG	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525723668
124	NC_021829	T	6	6	6657	6662	0 %	100 %	0 %	0 %	525723668
125	NC_021829	CTA	2	6	6664	6669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
126	NC_021829	CAT	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
127	NC_021829	ATCA	2	8	6854	6861	50 %	25 %	0 %	25 %	525723668
128	NC_021829	TAT	2	6	6862	6867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723668
129	NC_021829	TCA	2	6	6900	6905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
130	NC_021829	TCA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
131	NC_021829	ATTAT	2	10	6954	6963	40 %	60 %	0 %	0 %	525723668
132	NC_021829	TAA	2	6	7079	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
133	NC_021829	TAA	2	6	7099	7104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723668
134	NC_021829	CTA	2	6	7134	7139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723668
135	NC_021829	AT	3	6	7169	7174	50 %	50 %	0 %	0 %	525723668
136	NC_021829	T	8	8	7188	7195	0 %	100 %	0 %	0 %	525723668
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142	NC_021829	T	6	6	7449	7454	0 %	100 %	0 %	0 %	525723668
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264	NC_021829	TTC	2	6	13495	13500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721268
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266	NC_021829	TCT	2	6	13697	13702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721268
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268	NC_021829	GAT	2	6	13762	13767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721268
269	NC_021829	TCG	2	6	13826	13831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721268
270	NC_021829	GAT	2	6	13855	13860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721268
271	NC_021829	T	6	6	13912	13917	0 %	100 %	0 %	0 %	525721268
272	NC_021829	TGA	2	6	13929	13934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525721268
273	NC_021829	GAA	2	6	13992	13997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721268
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345	NC_021829	CTT	2	6	17703	17708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721272
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381	NC_021829	GAA	2	6	19160	19165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525721274
382	NC_021829	TCT	2	6	19206	19211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
383	NC_021829	TGC	2	6	19235	19240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721274
384	NC_021829	ATCCG	2	10	19247	19256	20 %	20 %	20 %	40 %	525721274
385	NC_021829	CTT	2	6	19285	19290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
386	NC_021829	T	7	7	19297	19303	0 %	100 %	0 %	0 %	525721274
387	NC_021829	CG	4	8	19306	19313	0 %	0 %	50 %	50 %	525721274
388	NC_021829	CTT	2	6	19314	19319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525721274
389	NC_021829	T	6	6	19318	19323	0 %	100 %	0 %	0 %	525721274
390	NC_021829	GCT	2	6	19326	19331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525721274
391	NC_021829	T	6	6	19349	19354	0 %	100 %	0 %	0 %	525721274
392	NC_021829	AAT	2	6	19429	19434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525721274
393	NC_021829	T	8	8	19495	19502	0 %	100 %	0 %	0 %	525721274
394	NC_021829	AAC	2	6	19562	19567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525721274
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396	NC_021829	AGCA	2	8	19697	19704	50 %	0 %	25 %	25 %	525721274
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