MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_021824	CG	3	6	2233176	2233181	0 %	0 %	50 %	50 %	525871663
45003	NC_021824	TTG	2	6	2233261	2233266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871663
45004	NC_021824	T	6	6	2233284	2233289	0 %	100 %	0 %	0 %	525871663
45005	NC_021824	GAA	2	6	2233291	2233296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871663
45006	NC_021824	CAG	2	6	2233297	2233302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871663
45007	NC_021824	AAC	2	6	2233315	2233320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871663
45008	NC_021824	ATC	2	6	2233402	2233407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871663
45009	NC_021824	GAA	2	6	2233458	2233463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871663
45010	NC_021824	TTCA	2	8	2233573	2233580	25 %	50 %	0 %	25 %	525871663
45011	NC_021824	CTG	2	6	2233591	2233596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871664
45012	NC_021824	CTT	2	6	2233603	2233608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871664
45013	NC_021824	CTT	2	6	2233615	2233620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871664
45014	NC_021824	GTT	2	6	2233624	2233629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871664
45015	NC_021824	ATCA	2	8	2233709	2233716	50 %	25 %	0 %	25 %	525871664
45016	NC_021824	TG	3	6	2233753	2233758	0 %	50 %	50 %	0 %	525871664
45017	NC_021824	TTC	2	6	2233814	2233819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871664
45018	NC_021824	CAT	2	6	2233846	2233851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871664
45019	NC_021824	GCT	2	6	2233903	2233908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871664
45020	NC_021824	ACC	2	6	2233913	2233918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871664
45021	NC_021824	AG	3	6	2233919	2233924	50 %	0 %	50 %	0 %	525871664
45022	NC_021824	CTT	3	9	2234017	2234025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871664
45023	NC_021824	TAA	2	6	2234204	2234209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871664
45024	NC_021824	CAA	2	6	2234236	2234241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871664
45025	NC_021824	TCA	2	6	2234301	2234306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871664
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45027	NC_021824	TCT	2	6	2234385	2234390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871664
45028	NC_021824	AAG	2	6	2234422	2234427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871664
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45030	NC_021824	TAA	2	6	2234483	2234488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871664
45031	NC_021824	AGT	2	6	2234494	2234499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871664
45032	NC_021824	TCCA	2	8	2234534	2234541	25 %	25 %	0 %	50 %	525871664
45033	NC_021824	AAT	2	6	2234591	2234596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871664
45034	NC_021824	ATC	2	6	2234601	2234606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871664
45035	NC_021824	T	7	7	2234643	2234649	0 %	100 %	0 %	0 %	525871664
45036	NC_021824	CTT	2	6	2234656	2234661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871664
45037	NC_021824	GTTT	2	8	2234664	2234671	0 %	75 %	25 %	0 %	525871664
45038	NC_021824	TCT	2	6	2234688	2234693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871664
45039	NC_021824	CT	3	6	2234736	2234741	0 %	50 %	0 %	50 %	525871664
45040	NC_021824	AGC	2	6	2234768	2234773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871664
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45042	NC_021824	TTG	2	6	2234957	2234962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871664
45043	NC_021824	TCG	2	6	2234980	2234985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871664
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45045	NC_021824	CGTAAA	2	12	2235060	2235071	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525871664
45046	NC_021824	TAT	2	6	2235085	2235090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871664
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45050	NC_021824	TCGT	2	8	2235198	2235205	0 %	50 %	25 %	25 %	525871664
45051	NC_021824	AAT	2	6	2235227	2235232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871664
45052	NC_021824	GCG	2	6	2235235	2235240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871664
45053	NC_021824	AACT	2	8	2235242	2235249	50 %	25 %	0 %	25 %	525871664
45054	NC_021824	A	6	6	2235311	2235316	100 %	0 %	0 %	0 %	525871664
45055	NC_021824	ACA	2	6	2235344	2235349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871664
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45057	NC_021824	AAATAA	2	12	2235379	2235390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525871664
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45064	NC_021824	GAAA	2	8	2235855	2235862	75 %	0 %	25 %	0 %	525871665
45065	NC_021824	CTT	2	6	2235935	2235940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871665
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45079	NC_021824	T	6	6	2236389	2236394	0 %	100 %	0 %	0 %	525871666
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45084	NC_021824	ATT	3	9	2236608	2236616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871666
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45089	NC_021824	CTA	2	6	2236850	2236855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871666
45090	NC_021824	T	7	7	2236868	2236874	0 %	100 %	0 %	0 %	525871666
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45098	NC_021824	AT	3	6	2237729	2237734	50 %	50 %	0 %	0 %	525872581
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45102	NC_021824	TAA	2	6	2237815	2237820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872581
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45107	NC_021824	CATATA	2	12	2238105	2238116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525872581
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45117	NC_021824	TAA	2	6	2238605	2238610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872582
45118	NC_021824	TAA	2	6	2238660	2238665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872582
45119	NC_021824	ATTT	2	8	2239252	2239259	25 %	75 %	0 %	0 %	525871667
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45122	NC_021824	CAA	2	6	2239283	2239288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871667
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45124	NC_021824	T	6	6	2239299	2239304	0 %	100 %	0 %	0 %	525871667
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45218	NC_021824	GCATTA	2	12	2243552	2243563	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525872585
45219	NC_021824	GCA	2	6	2243642	2243647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872585
45220	NC_021824	CAC	2	6	2243754	2243759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525872585
45221	NC_021824	T	6	6	2243933	2243938	0 %	100 %	0 %	0 %	525872585
45222	NC_021824	TCT	2	6	2243960	2243965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872585
45223	NC_021824	TCAT	2	8	2243966	2243973	25 %	50 %	0 %	25 %	525872585
45224	NC_021824	GT	3	6	2244000	2244005	0 %	50 %	50 %	0 %	525872585
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45231	NC_021824	TAAAA	2	10	2244280	2244289	80 %	20 %	0 %	0 %	525872586
45232	NC_021824	TTG	2	6	2244323	2244328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872586
45233	NC_021824	TAA	2	6	2244422	2244427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872586
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45236	NC_021824	TCT	2	6	2244607	2244612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872586
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45342	NC_021824	TAAT	2	8	2249486	2249493	50 %	50 %	0 %	0 %	525871671
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45344	NC_021824	AAC	2	6	2249571	2249576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871672
45345	NC_021824	TTGT	2	8	2249643	2249650	0 %	75 %	25 %	0 %	525871672
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45348	NC_021824	TGC	2	6	2249784	2249789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871672
45349	NC_021824	AT	3	6	2249803	2249808	50 %	50 %	0 %	0 %	525871672
45350	NC_021824	GTT	2	6	2249812	2249817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871672
45351	NC_021824	GTT	2	6	2249824	2249829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871672
45352	NC_021824	CTT	2	6	2249867	2249872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
45353	NC_021824	GAA	2	6	2249933	2249938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871672
45354	NC_021824	TTCT	2	8	2249978	2249985	0 %	75 %	0 %	25 %	525871672
45355	NC_021824	GAT	2	6	2249990	2249995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871672
45356	NC_021824	GTT	2	6	2250001	2250006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871672
45357	NC_021824	TTTTTC	2	12	2250075	2250086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525871672
45358	NC_021824	TTC	2	6	2250117	2250122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
45359	NC_021824	GC	3	6	2250180	2250185	0 %	0 %	50 %	50 %	525871672
45360	NC_021824	ACC	2	6	2250267	2250272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871672
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45362	NC_021824	AAG	2	6	2250337	2250342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871672
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45365	NC_021824	AT	3	6	2250412	2250417	50 %	50 %	0 %	0 %	525871672
45366	NC_021824	ATAAC	2	10	2250430	2250439	60 %	20 %	0 %	20 %	525871672
45367	NC_021824	CTG	2	6	2250464	2250469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871672
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45370	NC_021824	ACC	2	6	2250582	2250587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871672
45371	NC_021824	TCACG	2	10	2250647	2250656	20 %	20 %	20 %	40 %	525871672
45372	NC_021824	CTT	2	6	2250659	2250664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
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45376	NC_021824	TTCTTT	2	12	2250855	2250866	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525871672
45377	NC_021824	TCT	2	6	2250919	2250924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
45378	NC_021824	TTC	2	6	2250975	2250980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871672
45379	NC_021824	CTG	2	6	2251025	2251030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871672
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45384	NC_021824	CGG	2	6	2251225	2251230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525871672
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45388	NC_021824	T	7	7	2251531	2251537	0 %	100 %	0 %	0 %	525872587
45389	NC_021824	AATT	2	8	2251693	2251700	50 %	50 %	0 %	0 %	525872587
45390	NC_021824	T	6	6	2251792	2251797	0 %	100 %	0 %	0 %	525872587
45391	NC_021824	GCA	2	6	2251808	2251813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872587
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45465	NC_021824	TGG	2	6	2255359	2255364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872588
45466	NC_021824	TGT	2	6	2255365	2255370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872588
45467	NC_021824	CTA	2	6	2255469	2255474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45468	NC_021824	AGC	2	6	2255515	2255520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872588
45469	NC_021824	AAT	2	6	2255572	2255577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872588
45470	NC_021824	CTG	2	6	2255586	2255591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872588
45471	NC_021824	TGT	2	6	2255752	2255757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872588
45472	NC_021824	TCT	2	6	2255852	2255857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872588
45473	NC_021824	TTTACA	2	12	2255996	2256007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525872588
45474	NC_021824	GTC	2	6	2256061	2256066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872588
45475	NC_021824	TGTC	2	8	2256086	2256093	0 %	50 %	25 %	25 %	525872588
45476	NC_021824	CAT	2	6	2256171	2256176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45477	NC_021824	AG	3	6	2256184	2256189	50 %	0 %	50 %	0 %	525872588
45478	NC_021824	CAC	2	6	2256225	2256230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525872588
45479	NC_021824	TTG	2	6	2256244	2256249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872588
45480	NC_021824	ATA	2	6	2256251	2256256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872588
45481	NC_021824	ATC	2	6	2256313	2256318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45482	NC_021824	GTT	2	6	2256338	2256343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872588
45483	NC_021824	ACTT	2	8	2256406	2256413	25 %	50 %	0 %	25 %	525872588
45484	NC_021824	ATA	2	6	2256463	2256468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872588
45485	NC_021824	TCT	2	6	2256506	2256511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872588
45486	NC_021824	GCT	2	6	2256617	2256622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872588
45487	NC_021824	TCA	2	6	2256656	2256661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45488	NC_021824	TCA	2	6	2256752	2256757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45489	NC_021824	ACT	2	6	2256833	2256838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45490	NC_021824	TGT	2	6	2256980	2256985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872588
45491	NC_021824	TA	3	6	2256996	2257001	50 %	50 %	0 %	0 %	525872588
45492	NC_021824	TGA	2	6	2257039	2257044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872588
45493	NC_021824	TCA	2	6	2257079	2257084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45494	NC_021824	ACG	2	6	2257093	2257098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872588
45495	NC_021824	AAATT	2	10	2257157	2257166	60 %	40 %	0 %	0 %	525872588
45496	NC_021824	ATC	2	6	2257175	2257180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45497	NC_021824	CAT	2	6	2257197	2257202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45498	NC_021824	AT	3	6	2257229	2257234	50 %	50 %	0 %	0 %	525872588
45499	NC_021824	CAT	2	6	2257236	2257241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872588
45500	NC_021824	TAA	2	6	2257293	2257298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872588

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