MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_021824	TTTTCG	2	12	2207878	2207889	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525871644
44503	NC_021824	GTC	2	6	2207893	2207898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871644
44504	NC_021824	TCT	2	6	2207931	2207936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871644
44505	NC_021824	GTA	2	6	2207968	2207973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871644
44506	NC_021824	CAT	2	6	2208021	2208026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871645
44507	NC_021824	CAT	2	6	2208035	2208040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871645
44508	NC_021824	CGTC	2	8	2208119	2208126	0 %	25 %	25 %	50 %	525871645
44509	NC_021824	CTA	2	6	2208170	2208175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871645
44510	NC_021824	TTC	2	6	2208204	2208209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871645
44511	NC_021824	TAG	2	6	2208248	2208253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871645
44512	NC_021824	CGC	2	6	2208276	2208281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871645
44513	NC_021824	CCG	2	6	2208295	2208300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871645
44514	NC_021824	TGA	2	6	2208319	2208324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871645
44515	NC_021824	TTTC	2	8	2208350	2208357	0 %	75 %	0 %	25 %	525871645
44516	NC_021824	ACT	2	6	2208370	2208375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871645
44517	NC_021824	TCT	2	6	2208376	2208381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871645
44518	NC_021824	CAT	2	6	2208467	2208472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871645
44519	NC_021824	TAAAT	2	10	2208516	2208525	60 %	40 %	0 %	0 %	525871645
44520	NC_021824	AACC	2	8	2208730	2208737	50 %	0 %	0 %	50 %	525871646
44521	NC_021824	CTA	2	6	2208883	2208888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871646
44522	NC_021824	CAAC	2	8	2208994	2209001	50 %	0 %	0 %	50 %	525871646
44523	NC_021824	ACA	2	6	2209033	2209038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871646
44524	NC_021824	AGT	2	6	2209050	2209055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871646
44525	NC_021824	TCT	2	6	2209059	2209064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871646
44526	NC_021824	TTTTG	2	10	2209124	2209133	0 %	80 %	20 %	0 %	525871646
44527	NC_021824	TAA	2	6	2209208	2209213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871646
44528	NC_021824	ATA	2	6	2209226	2209231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871646
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44530	NC_021824	AAG	2	6	2209287	2209292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871646
44531	NC_021824	T	6	6	2209319	2209324	0 %	100 %	0 %	0 %	525871646
44532	NC_021824	CTC	2	6	2209340	2209345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871646
44533	NC_021824	CTT	2	6	2209464	2209469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871646
44534	NC_021824	TTC	2	6	2209502	2209507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871646
44535	NC_021824	TGA	2	6	2209512	2209517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871646
44536	NC_021824	CAT	2	6	2209615	2209620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871646
44537	NC_021824	TCT	2	6	2209668	2209673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871646
44538	NC_021824	ATAA	2	8	2209686	2209693	75 %	25 %	0 %	0 %	525871646
44539	NC_021824	ATA	2	6	2209742	2209747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871646
44540	NC_021824	CGC	2	6	2209823	2209828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871646
44541	NC_021824	GT	3	6	2209888	2209893	0 %	50 %	50 %	0 %	525871646
44542	NC_021824	T	7	7	2209903	2209909	0 %	100 %	0 %	0 %	525871646
44543	NC_021824	AAG	2	6	2211031	2211036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871647
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44545	NC_021824	AT	3	6	2211254	2211259	50 %	50 %	0 %	0 %	525871647
44546	NC_021824	AAC	2	6	2211264	2211269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871647
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44550	NC_021824	TAAC	2	8	2211370	2211377	50 %	25 %	0 %	25 %	525871647
44551	NC_021824	ACT	2	6	2211387	2211392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871647
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44554	NC_021824	GTT	2	6	2211463	2211468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871647
44555	NC_021824	GCA	2	6	2211474	2211479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871647
44556	NC_021824	GCA	2	6	2211498	2211503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871647
44557	NC_021824	CAA	2	6	2211562	2211567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871647
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44562	NC_021824	CAAA	2	8	2211835	2211842	75 %	0 %	0 %	25 %	525871647
44563	NC_021824	A	6	6	2211870	2211875	100 %	0 %	0 %	0 %	525871647
44564	NC_021824	AATC	2	8	2211890	2211897	50 %	25 %	0 %	25 %	525871647
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44567	NC_021824	GAA	2	6	2212107	2212112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871647
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44570	NC_021824	ATC	2	6	2212209	2212214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871647
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44577	NC_021824	TGG	3	9	2212652	2212660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871647
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44584	NC_021824	AACT	2	8	2212900	2212907	50 %	25 %	0 %	25 %	525871647
44585	NC_021824	TTG	2	6	2212921	2212926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871647
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44591	NC_021824	CA	3	6	2213194	2213199	50 %	0 %	0 %	50 %	525871647
44592	NC_021824	A	6	6	2213286	2213291	100 %	0 %	0 %	0 %	525871647
44593	NC_021824	TGA	2	6	2213327	2213332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871647
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44600	NC_021824	TAC	2	6	2213531	2213536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871647
44601	NC_021824	AAC	2	6	2213548	2213553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871647
44602	NC_021824	TACTT	2	10	2213750	2213759	20 %	60 %	0 %	20 %	525871648
44603	NC_021824	A	6	6	2213795	2213800	100 %	0 %	0 %	0 %	525871648
44604	NC_021824	A	6	6	2213864	2213869	100 %	0 %	0 %	0 %	525871648
44605	NC_021824	TCC	2	6	2213883	2213888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871648
44606	NC_021824	ATTT	2	8	2213916	2213923	25 %	75 %	0 %	0 %	525871648
44607	NC_021824	CTA	2	6	2214023	2214028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871648
44608	NC_021824	CTA	3	9	2214141	2214149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871648
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44610	NC_021824	A	7	7	2214290	2214296	100 %	0 %	0 %	0 %	525871649
44611	NC_021824	ACAT	2	8	2214320	2214327	50 %	25 %	0 %	25 %	525871649
44612	NC_021824	TCG	2	6	2214405	2214410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871649
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44615	NC_021824	TAT	2	6	2214486	2214491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871649
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44735	NC_021824	CGA	2	6	2220485	2220490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871654
44736	NC_021824	GATT	2	8	2220512	2220519	25 %	50 %	25 %	0 %	525871654
44737	NC_021824	T	6	6	2220518	2220523	0 %	100 %	0 %	0 %	525871654
44738	NC_021824	CGC	2	6	2220530	2220535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871654
44739	NC_021824	AAG	2	6	2220560	2220565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871654
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44742	NC_021824	ATG	2	6	2220830	2220835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871654
44743	NC_021824	TTTC	2	8	2220845	2220852	0 %	75 %	0 %	25 %	525871654
44744	NC_021824	AATT	2	8	2221147	2221154	50 %	50 %	0 %	0 %	525871655
44745	NC_021824	TCC	2	6	2221172	2221177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871655
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44750	NC_021824	TTG	3	9	2221432	2221440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871655
44751	NC_021824	CTTC	2	8	2221515	2221522	0 %	50 %	0 %	50 %	525871655
44752	NC_021824	AT	3	6	2221544	2221549	50 %	50 %	0 %	0 %	525871655
44753	NC_021824	TGA	2	6	2221571	2221576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871655
44754	NC_021824	AAT	2	6	2221660	2221665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871655
44755	NC_021824	ATG	2	6	2221674	2221679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871655
44756	NC_021824	AGCG	2	8	2221688	2221695	25 %	0 %	50 %	25 %	525871655
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44762	NC_021824	GCA	2	6	2221987	2221992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871656
44763	NC_021824	GGA	2	6	2222054	2222059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525871656
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44765	NC_021824	TTCGAT	2	12	2222100	2222111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525871656
44766	NC_021824	TTTTCT	2	12	2222113	2222124	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525871656
44767	NC_021824	TCT	2	6	2222176	2222181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871656
44768	NC_021824	TTG	2	6	2222206	2222211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871656
44769	NC_021824	CTG	2	6	2222222	2222227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871656
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44787	NC_021824	T	6	6	2222956	2222961	0 %	100 %	0 %	0 %	525871657
44788	NC_021824	GGTT	2	8	2222986	2222993	0 %	50 %	50 %	0 %	525871657
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44833	NC_021824	AAGA	2	8	2224907	2224914	75 %	0 %	25 %	0 %	525871657
44834	NC_021824	T	6	6	2224998	2225003	0 %	100 %	0 %	0 %	525871657
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44842	NC_021824	TTTC	2	8	2225420	2225427	0 %	75 %	0 %	25 %	525871657
44843	NC_021824	ATTTT	2	10	2225454	2225463	20 %	80 %	0 %	0 %	525871657
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44847	NC_021824	TCA	2	6	2225759	2225764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871658
44848	NC_021824	AAG	2	6	2225838	2225843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871658
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44850	NC_021824	TCA	2	6	2225900	2225905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871658
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44969	NC_021824	TAT	2	6	2231214	2231219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871662
44970	NC_021824	TTA	2	6	2231244	2231249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871662
44971	NC_021824	ATC	2	6	2231304	2231309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871662
44972	NC_021824	TGA	2	6	2231377	2231382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871662
44973	NC_021824	TAA	2	6	2231437	2231442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871662
44974	NC_021824	TGT	2	6	2231471	2231476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871662
44975	NC_021824	A	6	6	2231547	2231552	100 %	0 %	0 %	0 %	525871662
44976	NC_021824	AACA	2	8	2231558	2231565	75 %	0 %	0 %	25 %	525871662
44977	NC_021824	CAT	2	6	2231582	2231587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871662
44978	NC_021824	TGG	2	6	2231591	2231596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871662
44979	NC_021824	CTT	2	6	2231847	2231852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871663
44980	NC_021824	AAT	2	6	2231884	2231889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871663
44981	NC_021824	GCAATC	2	12	2231948	2231959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525871663
44982	NC_021824	TC	3	6	2231972	2231977	0 %	50 %	0 %	50 %	525871663
44983	NC_021824	GCA	2	6	2232194	2232199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871663
44984	NC_021824	CAT	2	6	2232382	2232387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871663
44985	NC_021824	CAA	2	6	2232426	2232431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871663
44986	NC_021824	CTT	2	6	2232573	2232578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871663
44987	NC_021824	ATA	2	6	2232590	2232595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871663
44988	NC_021824	GCC	2	6	2232611	2232616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871663
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44990	NC_021824	A	6	6	2232671	2232676	100 %	0 %	0 %	0 %	525871663
44991	NC_021824	TAA	2	6	2232690	2232695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871663
44992	NC_021824	AAT	2	6	2232757	2232762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871663
44993	NC_021824	AAATC	2	10	2232780	2232789	60 %	20 %	0 %	20 %	525871663
44994	NC_021824	ACG	2	6	2232883	2232888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871663
44995	NC_021824	TTG	2	6	2232901	2232906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871663
44996	NC_021824	TCG	2	6	2232967	2232972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871663
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44998	NC_021824	TA	3	6	2233047	2233052	50 %	50 %	0 %	0 %	525871663
44999	NC_021824	CGC	2	6	2233081	2233086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871663
45000	NC_021824	AAAC	2	8	2233105	2233112	75 %	0 %	0 %	25 %	525871663

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