MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_021824	AAG	2	6	2108649	2108654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871552
42502	NC_021824	TTA	2	6	2108655	2108660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871552
42503	NC_021824	CAC	2	6	2108815	2108820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871552
42504	NC_021824	ACA	2	6	2108868	2108873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871552
42505	NC_021824	TTGA	2	8	2108923	2108930	25 %	50 %	25 %	0 %	525871552
42506	NC_021824	TAC	2	6	2108986	2108991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871552
42507	NC_021824	GTT	2	6	2109036	2109041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871552
42508	NC_021824	AAC	2	6	2109094	2109099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871552
42509	NC_021824	AAC	2	6	2109136	2109141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871552
42510	NC_021824	TTG	2	6	2109161	2109166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871552
42511	NC_021824	CTT	2	6	2109193	2109198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871552
42512	NC_021824	AAG	2	6	2109204	2109209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871552
42513	NC_021824	AGGA	2	8	2109241	2109248	50 %	0 %	50 %	0 %	525871552
42514	NC_021824	TCA	2	6	2109297	2109302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871552
42515	NC_021824	AAG	2	6	2109329	2109334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871552
42516	NC_021824	AAT	2	6	2109352	2109357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871552
42517	NC_021824	ACC	2	6	2109374	2109379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871552
42518	NC_021824	AAG	2	6	2109419	2109424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871552
42519	NC_021824	ATCA	2	8	2109503	2109510	50 %	25 %	0 %	25 %	525871552
42520	NC_021824	TCT	2	6	2109573	2109578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871552
42521	NC_021824	CTTT	2	8	2109624	2109631	0 %	75 %	0 %	25 %	525871552
42522	NC_021824	AGT	2	6	2109644	2109649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871552
42523	NC_021824	AGA	2	6	2109689	2109694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871552
42524	NC_021824	CAACC	2	10	2109766	2109775	40 %	0 %	0 %	60 %	525871552
42525	NC_021824	TTC	2	6	2109800	2109805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871552
42526	NC_021824	CTT	2	6	2109829	2109834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871552
42527	NC_021824	AAT	2	6	2109839	2109844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871552
42528	NC_021824	GTT	2	6	2109861	2109866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871552
42529	NC_021824	AT	3	6	2109885	2109890	50 %	50 %	0 %	0 %	525871552
42530	NC_021824	T	6	6	2109988	2109993	0 %	100 %	0 %	0 %	525871553
42531	NC_021824	ATA	2	6	2110032	2110037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871553
42532	NC_021824	TAA	2	6	2110074	2110079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871553
42533	NC_021824	CAAA	2	8	2110181	2110188	75 %	0 %	0 %	25 %	525871553
42534	NC_021824	AGT	2	6	2110237	2110242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871553
42535	NC_021824	CCA	2	6	2110244	2110249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871553
42536	NC_021824	ACA	2	6	2110283	2110288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871553
42537	NC_021824	TAAAA	2	10	2110345	2110354	80 %	20 %	0 %	0 %	525871553
42538	NC_021824	A	6	6	2110372	2110377	100 %	0 %	0 %	0 %	525871553
42539	NC_021824	TTG	2	6	2110428	2110433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871553
42540	NC_021824	TCT	2	6	2110439	2110444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871553
42541	NC_021824	GTTT	2	8	2110445	2110452	0 %	75 %	25 %	0 %	525871553
42542	NC_021824	AT	3	6	2110520	2110525	50 %	50 %	0 %	0 %	525871553
42543	NC_021824	CAG	2	6	2110578	2110583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871553
42544	NC_021824	AT	3	6	2110604	2110609	50 %	50 %	0 %	0 %	525871553
42545	NC_021824	TAA	2	6	2110656	2110661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871553
42546	NC_021824	GCC	2	6	2110669	2110674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871553
42547	NC_021824	AAT	2	6	2110729	2110734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871553
42548	NC_021824	ATC	2	6	2110790	2110795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871553
42549	NC_021824	CTT	2	6	2111165	2111170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871554
42550	NC_021824	T	6	6	2111193	2111198	0 %	100 %	0 %	0 %	525871554
42551	NC_021824	ATC	2	6	2111256	2111261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871554
42552	NC_021824	GCC	2	6	2111262	2111267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871554
42553	NC_021824	CCA	2	6	2111326	2111331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871554
42554	NC_021824	GTCC	2	8	2111342	2111349	0 %	25 %	25 %	50 %	525871554
42555	NC_021824	CCT	2	6	2111460	2111465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871555
42556	NC_021824	CAC	2	6	2111548	2111553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871555
42557	NC_021824	CAG	2	6	2111571	2111576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871555
42558	NC_021824	ATT	2	6	2111741	2111746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871555
42559	NC_021824	TCT	2	6	2111753	2111758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871555
42560	NC_021824	T	6	6	2111854	2111859	0 %	100 %	0 %	0 %	525871556
42561	NC_021824	TTTATA	2	12	2111878	2111889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871556
42562	NC_021824	TTC	2	6	2111900	2111905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871556
42563	NC_021824	AAC	2	6	2112010	2112015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871556
42564	NC_021824	AAT	2	6	2112094	2112099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871556
42565	NC_021824	CAAT	2	8	2112320	2112327	50 %	25 %	0 %	25 %	525871557
42566	NC_021824	A	6	6	2112356	2112361	100 %	0 %	0 %	0 %	525871557
42567	NC_021824	TCT	2	6	2112374	2112379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871557
42568	NC_021824	TAA	2	6	2112384	2112389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871557
42569	NC_021824	AAGC	2	8	2112447	2112454	50 %	0 %	25 %	25 %	525871557
42570	NC_021824	T	6	6	2112532	2112537	0 %	100 %	0 %	0 %	525871557
42571	NC_021824	AGC	2	6	2112574	2112579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871557
42572	NC_021824	TGT	2	6	2112586	2112591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871557
42573	NC_021824	AT	3	6	2112593	2112598	50 %	50 %	0 %	0 %	525871557
42574	NC_021824	TCC	2	6	2112658	2112663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871557
42575	NC_021824	ATC	2	6	2112680	2112685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871557
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42577	NC_021824	CAA	2	6	2112801	2112806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871557
42578	NC_021824	T	6	6	2112822	2112827	0 %	100 %	0 %	0 %	525871557
42579	NC_021824	AATA	2	8	2112829	2112836	75 %	25 %	0 %	0 %	525871557
42580	NC_021824	AAG	2	6	2112837	2112842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871557
42581	NC_021824	CTAT	2	8	2112878	2112885	25 %	50 %	0 %	25 %	525871557
42582	NC_021824	AAAT	2	8	2112910	2112917	75 %	25 %	0 %	0 %	525871557
42583	NC_021824	ATG	2	6	2112932	2112937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871557
42584	NC_021824	ATC	2	6	2112985	2112990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871557
42585	NC_021824	TGAA	2	8	2113019	2113026	50 %	25 %	25 %	0 %	525871557
42586	NC_021824	ATA	2	6	2113062	2113067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871557
42587	NC_021824	T	6	6	2113078	2113083	0 %	100 %	0 %	0 %	525871557
42588	NC_021824	CTT	2	6	2113095	2113100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871557
42589	NC_021824	TAA	2	6	2113102	2113107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871557
42590	NC_021824	TC	3	6	2113121	2113126	0 %	50 %	0 %	50 %	525871557
42591	NC_021824	TTG	2	6	2113141	2113146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871557
42592	NC_021824	TCG	2	6	2113158	2113163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871557
42593	NC_021824	AAT	2	6	2113183	2113188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871557
42594	NC_021824	CCA	2	6	2113206	2113211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871557
42595	NC_021824	TAGAAA	2	12	2113257	2113268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525871557
42596	NC_021824	CAAG	2	8	2113293	2113300	50 %	0 %	25 %	25 %	525871557
42597	NC_021824	TAA	2	6	2113327	2113332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871557
42598	NC_021824	TCG	2	6	2113341	2113346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871557
42599	NC_021824	TTA	3	9	2113439	2113447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871557
42600	NC_021824	CAA	2	6	2113455	2113460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871557
42601	NC_021824	GCT	2	6	2113463	2113468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871557
42602	NC_021824	TCGA	2	8	2113477	2113484	25 %	25 %	25 %	25 %	525871557
42603	NC_021824	T	6	6	2113485	2113490	0 %	100 %	0 %	0 %	525871557
42604	NC_021824	ATA	2	6	2113501	2113506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871557
42605	NC_021824	ATC	2	6	2113564	2113569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871557
42606	NC_021824	TGC	2	6	2113576	2113581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871557
42607	NC_021824	TAC	2	6	2113609	2113614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871557
42608	NC_021824	T	6	6	2113675	2113680	0 %	100 %	0 %	0 %	525871558
42609	NC_021824	AGCG	2	8	2113705	2113712	25 %	0 %	50 %	25 %	525871558
42610	NC_021824	T	7	7	2113724	2113730	0 %	100 %	0 %	0 %	525871558
42611	NC_021824	TCA	4	12	2113857	2113868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871558
42612	NC_021824	ATA	2	6	2113872	2113877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871558
42613	NC_021824	TG	3	6	2113899	2113904	0 %	50 %	50 %	0 %	525871558
42614	NC_021824	TCA	2	6	2113911	2113916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871558
42615	NC_021824	TCA	3	9	2113936	2113944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871558
42616	NC_021824	TAA	2	6	2113963	2113968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871558
42617	NC_021824	TGG	2	6	2113976	2113981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871558
42618	NC_021824	TCT	2	6	2113989	2113994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871558
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42728	NC_021824	A	6	6	2119248	2119253	100 %	0 %	0 %	0 %	525871564
42729	NC_021824	TA	3	6	2119275	2119280	50 %	50 %	0 %	0 %	525871564
42730	NC_021824	A	6	6	2119344	2119349	100 %	0 %	0 %	0 %	525871564
42731	NC_021824	A	6	6	2119364	2119369	100 %	0 %	0 %	0 %	525871564
42732	NC_021824	A	9	9	2119373	2119381	100 %	0 %	0 %	0 %	525871564
42733	NC_021824	GTA	2	6	2119390	2119395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871564
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42737	NC_021824	A	8	8	2119519	2119526	100 %	0 %	0 %	0 %	525871564
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42972	NC_021824	ACG	2	6	2130361	2130366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871573
42973	NC_021824	CTT	2	6	2130390	2130395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871573
42974	NC_021824	TTTG	2	8	2130428	2130435	0 %	75 %	25 %	0 %	525871573
42975	NC_021824	ATC	2	6	2130472	2130477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871573
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42980	NC_021824	TCCATT	2	12	2130842	2130853	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525871573
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42983	NC_021824	CAT	2	6	2131056	2131061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871573
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42989	NC_021824	AAAT	2	8	2131450	2131457	75 %	25 %	0 %	0 %	525871573
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