MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021824	TCA	2	6	612184	612189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870290
12003	NC_021824	GCA	2	6	612220	612225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870290
12004	NC_021824	AAG	2	6	612245	612250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870290
12005	NC_021824	AGA	2	6	612267	612272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870290
12006	NC_021824	AC	3	6	612412	612417	50 %	0 %	0 %	50 %	525870290
12007	NC_021824	CAA	2	6	612419	612424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870290
12008	NC_021824	TCG	2	6	612431	612436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870290
12009	NC_021824	GAC	2	6	612457	612462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870290
12010	NC_021824	A	6	6	612469	612474	100 %	0 %	0 %	0 %	525870290
12011	NC_021824	AGC	2	6	612486	612491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870290
12012	NC_021824	ACC	2	6	612492	612497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870290
12013	NC_021824	A	6	6	612527	612532	100 %	0 %	0 %	0 %	525870290
12014	NC_021824	TAT	2	6	612581	612586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870290
12015	NC_021824	GTT	3	9	612679	612687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870290
12016	NC_021824	GAT	2	6	612712	612717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870290
12017	NC_021824	CAT	2	6	612804	612809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870290
12018	NC_021824	A	6	6	612811	612816	100 %	0 %	0 %	0 %	525870290
12019	NC_021824	A	6	6	612842	612847	100 %	0 %	0 %	0 %	525870290
12020	NC_021824	TAT	2	6	612863	612868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870291
12021	NC_021824	AAT	2	6	612881	612886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870291
12022	NC_021824	TAG	2	6	612889	612894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870291
12023	NC_021824	ATC	2	6	613008	613013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870291
12024	NC_021824	AGC	2	6	613061	613066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870291
12025	NC_021824	TATTAG	2	12	613111	613122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525870291
12026	NC_021824	TAGCAG	2	12	613174	613185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525870291
12027	NC_021824	TCGT	2	8	613204	613211	0 %	50 %	25 %	25 %	525870291
12028	NC_021824	GCA	3	9	613332	613340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870291
12029	NC_021824	ATTC	2	8	613346	613353	25 %	50 %	0 %	25 %	525870291
12030	NC_021824	CAG	2	6	613354	613359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870291
12031	NC_021824	TCTT	2	8	613371	613378	0 %	75 %	0 %	25 %	525870291
12032	NC_021824	GGA	2	6	613422	613427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525870291
12033	NC_021824	ATG	2	6	613464	613469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870291
12034	NC_021824	CTA	2	6	613471	613476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870291
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12039	NC_021824	AT	3	6	613654	613659	50 %	50 %	0 %	0 %	525870291
12040	NC_021824	TAA	2	6	613671	613676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870291
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12042	NC_021824	AG	3	6	613720	613725	50 %	0 %	50 %	0 %	525870292
12043	NC_021824	TTCA	2	8	613755	613762	25 %	50 %	0 %	25 %	525870292
12044	NC_021824	TGG	2	6	613793	613798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870292
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12046	NC_021824	TA	3	6	613834	613839	50 %	50 %	0 %	0 %	525870292
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12049	NC_021824	GAA	3	9	613941	613949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870292
12050	NC_021824	TGA	2	6	613970	613975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870292
12051	NC_021824	ATG	2	6	614004	614009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870292
12052	NC_021824	TTC	2	6	614121	614126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870292
12053	NC_021824	TGA	2	6	614204	614209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870292
12054	NC_021824	TGG	2	6	614216	614221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870292
12055	NC_021824	TAC	2	6	614224	614229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870292
12056	NC_021824	CGC	2	6	614273	614278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525870292
12057	NC_021824	TGA	2	6	614336	614341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870292
12058	NC_021824	ATTG	2	8	614352	614359	25 %	50 %	25 %	0 %	525870292
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12061	NC_021824	GCA	2	6	614487	614492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870292
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12063	NC_021824	A	7	7	614529	614535	100 %	0 %	0 %	0 %	525870292
12064	NC_021824	ATC	2	6	614547	614552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870292
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12069	NC_021824	A	8	8	615102	615109	100 %	0 %	0 %	0 %	525870293
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12071	NC_021824	A	6	6	615247	615252	100 %	0 %	0 %	0 %	525870294
12072	NC_021824	TACA	2	8	615295	615302	50 %	25 %	0 %	25 %	525870294
12073	NC_021824	A	6	6	615313	615318	100 %	0 %	0 %	0 %	525870294
12074	NC_021824	AGA	2	6	615330	615335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870294
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12083	NC_021824	ATTA	2	8	615655	615662	50 %	50 %	0 %	0 %	525870295
12084	NC_021824	A	6	6	615687	615692	100 %	0 %	0 %	0 %	525870295
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12088	NC_021824	TTCC	2	8	615743	615750	0 %	50 %	0 %	50 %	525870295
12089	NC_021824	TAA	2	6	615761	615766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870295
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12091	NC_021824	TAA	3	9	615912	615920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870295
12092	NC_021824	A	6	6	616095	616100	100 %	0 %	0 %	0 %	525870296
12093	NC_021824	T	6	6	616115	616120	0 %	100 %	0 %	0 %	525870296
12094	NC_021824	TGC	2	6	616142	616147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870296
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12096	NC_021824	CAA	2	6	616251	616256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870296
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12102	NC_021824	AAT	2	6	616381	616386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870297
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12104	NC_021824	AAG	2	6	616454	616459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870297
12105	NC_021824	TCCT	2	8	616494	616501	0 %	50 %	0 %	50 %	525870297
12106	NC_021824	TCT	2	6	616600	616605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870297
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12108	NC_021824	A	6	6	616655	616660	100 %	0 %	0 %	0 %	525870297
12109	NC_021824	AAC	2	6	616709	616714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870297
12110	NC_021824	CGG	2	6	616785	616790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870297
12111	NC_021824	TGG	2	6	616851	616856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870297
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12119	NC_021824	TTTG	2	8	617407	617414	0 %	75 %	25 %	0 %	525870298
12120	NC_021824	CAT	2	6	617416	617421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870298
12121	NC_021824	T	7	7	617421	617427	0 %	100 %	0 %	0 %	525870298
12122	NC_021824	ATA	2	6	617465	617470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870298
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12124	NC_021824	TGT	2	6	617785	617790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870299
12125	NC_021824	GTT	2	6	617791	617796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870299
12126	NC_021824	GAG	2	6	617910	617915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525870299
12127	NC_021824	TGC	2	6	618022	618027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870299
12128	NC_021824	GC	3	6	618106	618111	0 %	0 %	50 %	50 %	525870299
12129	NC_021824	CAA	2	6	618192	618197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870299
12130	NC_021824	TGA	2	6	618222	618227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870299
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12145	NC_021824	CTTA	2	8	618794	618801	25 %	50 %	0 %	25 %	525870299
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12228	NC_021824	ATTT	2	8	622825	622832	25 %	75 %	0 %	0 %	525870301
12229	NC_021824	GTT	2	6	622862	622867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870302
12230	NC_021824	ATA	2	6	622884	622889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870302
12231	NC_021824	GT	3	6	622914	622919	0 %	50 %	50 %	0 %	525870302
12232	NC_021824	GAT	2	6	622929	622934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870302
12233	NC_021824	TAAAAT	2	12	622947	622958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870302
12234	NC_021824	CTT	2	6	622967	622972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870302
12235	NC_021824	AGA	2	6	622977	622982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870302
12236	NC_021824	ATC	2	6	623082	623087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870302
12237	NC_021824	CAAAAT	2	12	623088	623099	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525870302
12238	NC_021824	GGAT	2	8	623100	623107	25 %	25 %	50 %	0 %	525870302
12239	NC_021824	T	6	6	623107	623112	0 %	100 %	0 %	0 %	525870302
12240	NC_021824	GCT	2	6	623138	623143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870302
12241	NC_021824	CAA	2	6	623177	623182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870302
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12243	NC_021824	GTC	2	6	623538	623543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870302
12244	NC_021824	CAT	2	6	623637	623642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870302
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12264	NC_021824	TA	3	6	624287	624292	50 %	50 %	0 %	0 %	525870302
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12272	NC_021824	T	6	6	624575	624580	0 %	100 %	0 %	0 %	525870302
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12347	NC_021824	GAA	2	6	627862	627867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870306
12348	NC_021824	AATA	2	8	627878	627885	75 %	25 %	0 %	0 %	525870306
12349	NC_021824	TTCCA	2	10	627959	627968	20 %	40 %	0 %	40 %	525870306
12350	NC_021824	ATC	2	6	627999	628004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870306
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12353	NC_021824	ATGA	2	8	628093	628100	50 %	25 %	25 %	0 %	525870306
12354	NC_021824	T	6	6	628112	628117	0 %	100 %	0 %	0 %	525870306
12355	NC_021824	AAT	2	6	628135	628140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870306
12356	NC_021824	A	6	6	628147	628152	100 %	0 %	0 %	0 %	525870306
12357	NC_021824	CTT	2	6	628405	628410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870307
12358	NC_021824	CCA	2	6	628448	628453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870307
12359	NC_021824	TTC	2	6	628510	628515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870307
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12482	NC_021824	GAAT	2	8	633818	633825	50 %	25 %	25 %	0 %	525872337
12483	NC_021824	GGC	2	6	633829	633834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525872337
12484	NC_021824	TGG	2	6	633845	633850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525872337
12485	NC_021824	GC	3	6	633913	633918	0 %	0 %	50 %	50 %	525872337
12486	NC_021824	AAAT	2	8	633921	633928	75 %	25 %	0 %	0 %	525872337
12487	NC_021824	TCT	2	6	633975	633980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872337
12488	NC_021824	TAC	2	6	633989	633994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872337
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12490	NC_021824	AAG	2	6	634180	634185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872338
12491	NC_021824	CTG	2	6	634219	634224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872338
12492	NC_021824	TTA	2	6	634373	634378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872338
12493	NC_021824	GAAT	2	8	634561	634568	50 %	25 %	25 %	0 %	525872338
12494	NC_021824	TGA	2	6	634580	634585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872338
12495	NC_021824	TTTAT	2	10	634586	634595	20 %	80 %	0 %	0 %	525872338
12496	NC_021824	A	6	6	634753	634758	100 %	0 %	0 %	0 %	525872338
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12500	NC_021824	ATT	2	6	634947	634952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872339

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