MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021824	CGT	2	6	516183	516188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
10002	NC_021824	GGT	2	6	516189	516194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870227
10003	NC_021824	GAT	2	6	516225	516230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
10004	NC_021824	TTG	2	6	516244	516249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870227
10005	NC_021824	TTC	2	6	516276	516281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870227
10006	NC_021824	ATC	2	6	516357	516362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870227
10007	NC_021824	ACTT	2	8	516364	516371	25 %	50 %	0 %	25 %	525870227
10008	NC_021824	TGA	2	6	516425	516430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
10009	NC_021824	TAC	2	6	516446	516451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870227
10010	NC_021824	ATCT	2	8	516608	516615	25 %	50 %	0 %	25 %	525870227
10011	NC_021824	AGA	2	6	516623	516628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
10012	NC_021824	GCT	2	6	516654	516659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870227
10013	NC_021824	GAT	2	6	516720	516725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
10014	NC_021824	AAAC	2	8	516762	516769	75 %	0 %	0 %	25 %	525870227
10015	NC_021824	GGT	2	6	516801	516806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870227
10016	NC_021824	GAA	2	6	516876	516881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
10017	NC_021824	TGA	2	6	516983	516988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
10018	NC_021824	AGA	3	9	517025	517033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
10019	NC_021824	GAA	2	6	517050	517055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
10020	NC_021824	CA	3	6	517073	517078	50 %	0 %	0 %	50 %	525870227
10021	NC_021824	TGA	2	6	517085	517090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870227
10022	NC_021824	AGA	2	6	517121	517126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870227
10023	NC_021824	AGT	2	6	517296	517301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870228
10024	NC_021824	AATC	2	8	517326	517333	50 %	25 %	0 %	25 %	525870228
10025	NC_021824	AGC	2	6	517335	517340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870228
10026	NC_021824	TAT	2	6	517343	517348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
10027	NC_021824	ATTA	2	8	517383	517390	50 %	50 %	0 %	0 %	525870228
10028	NC_021824	CTA	2	6	517402	517407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870228
10029	NC_021824	ATTA	2	8	517557	517564	50 %	50 %	0 %	0 %	525870228
10030	NC_021824	ACA	2	6	517586	517591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870228
10031	NC_021824	GAA	2	6	517687	517692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870228
10032	NC_021824	AGGTT	2	10	517826	517835	20 %	40 %	40 %	0 %	525870228
10033	NC_021824	AAG	2	6	517892	517897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870228
10034	NC_021824	TGAT	2	8	517985	517992	25 %	50 %	25 %	0 %	525870228
10035	NC_021824	GAA	2	6	518029	518034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870228
10036	NC_021824	TGC	2	6	518160	518165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870228
10037	NC_021824	TTA	2	6	518174	518179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
10038	NC_021824	ACA	2	6	518193	518198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870228
10039	NC_021824	CGG	2	6	518247	518252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870228
10040	NC_021824	GAG	2	6	518353	518358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525870228
10041	NC_021824	TTA	2	6	518408	518413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
10042	NC_021824	GAT	2	6	518509	518514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870228
10043	NC_021824	GGACG	2	10	518544	518553	20 %	0 %	60 %	20 %	525870228
10044	NC_021824	ATG	2	6	518627	518632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870228
10045	NC_021824	CAT	2	6	518647	518652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870228
10046	NC_021824	ATT	2	6	518724	518729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870228
10047	NC_021824	TCTA	2	8	518748	518755	25 %	50 %	0 %	25 %	525870228
10048	NC_021824	AAT	2	6	518857	518862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870229
10049	NC_021824	AAT	2	6	518871	518876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870229
10050	NC_021824	TCG	2	6	518909	518914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870229
10051	NC_021824	TCAG	2	8	518949	518956	25 %	25 %	25 %	25 %	525870229
10052	NC_021824	TTTTA	2	10	518964	518973	20 %	80 %	0 %	0 %	525870229
10053	NC_021824	ATT	3	9	519049	519057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870229
10054	NC_021824	GTT	2	6	519154	519159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870229
10055	NC_021824	TGA	2	6	519228	519233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870229
10056	NC_021824	ATG	2	6	519257	519262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870229
10057	NC_021824	A	7	7	519359	519365	100 %	0 %	0 %	0 %	525872305
10058	NC_021824	TAA	2	6	519372	519377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872305
10059	NC_021824	A	6	6	519388	519393	100 %	0 %	0 %	0 %	525872305
10060	NC_021824	TTC	2	6	519591	519596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870230
10061	NC_021824	T	7	7	519601	519607	0 %	100 %	0 %	0 %	525870230
10062	NC_021824	GAT	2	6	519619	519624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870230
10063	NC_021824	CAA	2	6	519761	519766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870230
10064	NC_021824	TA	3	6	519782	519787	50 %	50 %	0 %	0 %	525870230
10065	NC_021824	A	6	6	519814	519819	100 %	0 %	0 %	0 %	525870230
10066	NC_021824	TTA	2	6	519820	519825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870230
10067	NC_021824	A	6	6	519845	519850	100 %	0 %	0 %	0 %	525870230
10068	NC_021824	GTG	2	6	519869	519874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870230
10069	NC_021824	GTATG	2	10	519907	519916	20 %	40 %	40 %	0 %	525870230
10070	NC_021824	A	8	8	519951	519958	100 %	0 %	0 %	0 %	525870230
10071	NC_021824	GTA	2	6	519967	519972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870230
10072	NC_021824	TA	3	6	520028	520033	50 %	50 %	0 %	0 %	525870230
10073	NC_021824	TCA	2	6	520065	520070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870230
10074	NC_021824	TGC	2	6	520137	520142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870230
10075	NC_021824	TAG	2	6	520188	520193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870230
10076	NC_021824	AGT	2	6	520222	520227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870230
10077	NC_021824	TAT	2	6	520272	520277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870230
10078	NC_021824	A	6	6	520287	520292	100 %	0 %	0 %	0 %	525870230
10079	NC_021824	CA	3	6	520398	520403	50 %	0 %	0 %	50 %	525870230
10080	NC_021824	AGT	2	6	520466	520471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872306
10081	NC_021824	AAC	2	6	520504	520509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872306
10082	NC_021824	AAT	2	6	520553	520558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872306
10083	NC_021824	GAA	2	6	520607	520612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872306
10084	NC_021824	AGCAAA	2	12	520624	520635	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525872306
10085	NC_021824	GCTT	2	8	520672	520679	0 %	50 %	25 %	25 %	525872306
10086	NC_021824	GCT	2	6	520724	520729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872306
10087	NC_021824	AT	3	6	520750	520755	50 %	50 %	0 %	0 %	525872306
10088	NC_021824	CAA	2	6	520873	520878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872306
10089	NC_021824	AAAGA	2	10	520922	520931	80 %	0 %	20 %	0 %	525872306
10090	NC_021824	CTG	3	9	520998	521006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872306
10091	NC_021824	GAA	2	6	521018	521023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872306
10092	NC_021824	TCA	2	6	521052	521057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872306
10093	NC_021824	ATGC	2	8	521093	521100	25 %	25 %	25 %	25 %	525872306
10094	NC_021824	AAT	2	6	521155	521160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872306
10095	NC_021824	TGAAAA	2	12	521248	521259	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525872306
10096	NC_021824	TA	3	6	521445	521450	50 %	50 %	0 %	0 %	525870231
10097	NC_021824	A	6	6	521760	521765	100 %	0 %	0 %	0 %	525870231
10098	NC_021824	TGC	2	6	521774	521779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870231
10099	NC_021824	TAG	2	6	521791	521796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870231
10100	NC_021824	CTT	2	6	521827	521832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870231
10101	NC_021824	GTAT	2	8	521833	521840	25 %	50 %	25 %	0 %	525870231
10102	NC_021824	GGC	2	6	521841	521846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870231
10103	NC_021824	GAA	2	6	521958	521963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870231
10104	NC_021824	AAG	2	6	522046	522051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870231
10105	NC_021824	T	6	6	522071	522076	0 %	100 %	0 %	0 %	525870231
10106	NC_021824	AAT	2	6	522104	522109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870231
10107	NC_021824	TCG	2	6	522164	522169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870231
10108	NC_021824	TTC	2	6	522172	522177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870231
10109	NC_021824	ATC	2	6	522269	522274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870231
10110	NC_021824	TGG	2	6	522281	522286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870231
10111	NC_021824	TGC	2	6	522777	522782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870232
10112	NC_021824	ACT	2	6	522790	522795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870232
10113	NC_021824	ATT	2	6	522881	522886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870232
10114	NC_021824	GTA	2	6	523002	523007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870232
10115	NC_021824	A	6	6	523007	523012	100 %	0 %	0 %	0 %	525870232
10116	NC_021824	T	6	6	523020	523025	0 %	100 %	0 %	0 %	525870232
10117	NC_021824	GAA	2	6	523094	523099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870232
10118	NC_021824	CAA	2	6	523143	523148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870232
10119	NC_021824	GTA	2	6	523415	523420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870232
10120	NC_021824	A	6	6	523442	523447	100 %	0 %	0 %	0 %	525870232
10121	NC_021824	GAAA	2	8	523453	523460	75 %	0 %	25 %	0 %	525870232
10122	NC_021824	AAGC	2	8	523464	523471	50 %	0 %	25 %	25 %	525870232
10123	NC_021824	TTA	2	6	523479	523484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870232
10124	NC_021824	AT	3	6	523493	523498	50 %	50 %	0 %	0 %	525870232
10125	NC_021824	TTG	2	6	523560	523565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870232
10126	NC_021824	AGC	2	6	523570	523575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870232
10127	NC_021824	TGA	2	6	523663	523668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870232
10128	NC_021824	ATT	2	6	523739	523744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870232
10129	NC_021824	ATGAA	2	10	523785	523794	60 %	20 %	20 %	0 %	525870232
10130	NC_021824	GAA	2	6	523802	523807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870232
10131	NC_021824	CAAA	2	8	523814	523821	75 %	0 %	0 %	25 %	525870232
10132	NC_021824	A	6	6	523832	523837	100 %	0 %	0 %	0 %	525870232
10133	NC_021824	GC	3	6	523926	523931	0 %	0 %	50 %	50 %	525870233
10134	NC_021824	GTT	2	6	523961	523966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870233
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10136	NC_021824	TTC	2	6	524017	524022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
10137	NC_021824	A	7	7	524033	524039	100 %	0 %	0 %	0 %	525870233
10138	NC_021824	TAT	2	6	524044	524049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870233
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10140	NC_021824	CTG	2	6	524061	524066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870233
10141	NC_021824	GTG	3	9	524082	524090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870233
10142	NC_021824	ATG	2	6	524102	524107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870233
10143	NC_021824	T	6	6	524166	524171	0 %	100 %	0 %	0 %	525870233
10144	NC_021824	TTTA	2	8	524194	524201	25 %	75 %	0 %	0 %	525870233
10145	NC_021824	ATC	2	6	524216	524221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870233
10146	NC_021824	TGA	2	6	524226	524231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870233
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10149	NC_021824	TCT	2	6	524428	524433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
10150	NC_021824	TGA	2	6	524463	524468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870233
10151	NC_021824	ATTA	2	8	524554	524561	50 %	50 %	0 %	0 %	525870233
10152	NC_021824	ATT	2	6	524573	524578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870233
10153	NC_021824	TTC	2	6	524645	524650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
10154	NC_021824	ATG	2	6	524675	524680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870233
10155	NC_021824	TA	3	6	524718	524723	50 %	50 %	0 %	0 %	525870233
10156	NC_021824	ATT	2	6	524759	524764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870233
10157	NC_021824	A	6	6	524780	524785	100 %	0 %	0 %	0 %	525870233
10158	NC_021824	CTT	2	6	524860	524865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
10159	NC_021824	CTT	2	6	524896	524901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
10160	NC_021824	GAT	3	9	524914	524922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870233
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10162	NC_021824	TGT	2	6	525031	525036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870233
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10164	NC_021824	CTT	2	6	525100	525105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
10165	NC_021824	A	6	6	525207	525212	100 %	0 %	0 %	0 %	525870233
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10169	NC_021824	CGT	2	6	525299	525304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870233
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10176	NC_021824	TTC	3	9	525650	525658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
10177	NC_021824	TCT	2	6	525678	525683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870233
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10201	NC_021824	AT	3	6	526855	526860	50 %	50 %	0 %	0 %	525872307
10202	NC_021824	TAATT	2	10	526905	526914	40 %	60 %	0 %	0 %	525872307
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10217	NC_021824	CAA	2	6	527659	527664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872307
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10222	NC_021824	CAG	2	6	527830	527835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872307
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10224	NC_021824	ATG	2	6	527880	527885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872307
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10227	NC_021824	TAA	2	6	527917	527922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872307
10228	NC_021824	T	7	7	527945	527951	0 %	100 %	0 %	0 %	525872307
10229	NC_021824	T	6	6	527962	527967	0 %	100 %	0 %	0 %	525872307
10230	NC_021824	TGC	2	6	528235	528240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870236
10231	NC_021824	TTG	2	6	528288	528293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870236
10232	NC_021824	GGAC	2	8	528313	528320	25 %	0 %	50 %	25 %	525870236
10233	NC_021824	ATC	2	6	528402	528407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870236
10234	NC_021824	AGA	2	6	528415	528420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870236
10235	NC_021824	ATTAA	2	10	528422	528431	60 %	40 %	0 %	0 %	525870236
10236	NC_021824	TGA	2	6	528496	528501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870236
10237	NC_021824	ATG	2	6	528534	528539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870236
10238	NC_021824	TGA	2	6	528547	528552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870236
10239	NC_021824	GTT	2	6	528578	528583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870236
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10241	NC_021824	TGG	2	6	528628	528633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870236
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10484	NC_021824	TAC	2	6	540488	540493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872309
10485	NC_021824	AAT	2	6	540564	540569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872309
10486	NC_021824	AAAC	2	8	540581	540588	75 %	0 %	0 %	25 %	525872309
10487	NC_021824	ACT	2	6	540594	540599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872309
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10490	NC_021824	TA	3	6	540784	540789	50 %	50 %	0 %	0 %	525872310
10491	NC_021824	CAAT	2	8	540805	540812	50 %	25 %	0 %	25 %	525872310
10492	NC_021824	AGT	2	6	540867	540872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872310
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