MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021824	AGT	2	6	418840	418845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870144
8002	NC_021824	CCA	2	6	418971	418976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870144
8003	NC_021824	AAAT	2	8	419005	419012	75 %	25 %	0 %	0 %	525870144
8004	NC_021824	AAG	2	6	419031	419036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870144
8005	NC_021824	TTA	2	6	419070	419075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870144
8006	NC_021824	CGA	2	6	419095	419100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870144
8007	NC_021824	CTT	2	6	419107	419112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870144
8008	NC_021824	TTA	2	6	419115	419120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870144
8009	NC_021824	GAA	2	6	419201	419206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870144
8010	NC_021824	A	6	6	419253	419258	100 %	0 %	0 %	0 %	525870144
8011	NC_021824	AGA	2	6	419272	419277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870144
8012	NC_021824	CT	3	6	419288	419293	0 %	50 %	0 %	50 %	525870144
8013	NC_021824	AGA	2	6	419329	419334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870144
8014	NC_021824	GCG	2	6	419463	419468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870144
8015	NC_021824	ATC	2	6	419516	419521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870144
8016	NC_021824	ATGCAC	2	12	419543	419554	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525870144
8017	NC_021824	GAA	2	6	419575	419580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870144
8018	NC_021824	A	7	7	419579	419585	100 %	0 %	0 %	0 %	525870144
8019	NC_021824	A	7	7	419619	419625	100 %	0 %	0 %	0 %	525870144
8020	NC_021824	CT	3	6	419663	419668	0 %	50 %	0 %	50 %	525870145
8021	NC_021824	AAT	2	6	419710	419715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870145
8022	NC_021824	CTTT	2	8	419722	419729	0 %	75 %	0 %	25 %	525870145
8023	NC_021824	AAT	2	6	419737	419742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870145
8024	NC_021824	CAT	2	6	419752	419757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870145
8025	NC_021824	ATAA	2	8	419771	419778	75 %	25 %	0 %	0 %	525870145
8026	NC_021824	GAA	2	6	419887	419892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870145
8027	NC_021824	AAT	2	6	419905	419910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870145
8028	NC_021824	TA	3	6	420007	420012	50 %	50 %	0 %	0 %	525870145
8029	NC_021824	TCTG	2	8	420045	420052	0 %	50 %	25 %	25 %	525870145
8030	NC_021824	ATA	2	6	420155	420160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870145
8031	NC_021824	TCT	2	6	420207	420212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870145
8032	NC_021824	ATA	2	6	420269	420274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870145
8033	NC_021824	CGC	2	6	420292	420297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525870145
8034	NC_021824	CAA	2	6	420448	420453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870145
8035	NC_021824	TGA	3	9	420456	420464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870145
8036	NC_021824	TGA	2	6	420498	420503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870145
8037	NC_021824	ATAA	2	8	420538	420545	75 %	25 %	0 %	0 %	525870145
8038	NC_021824	TTG	2	6	420559	420564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870145
8039	NC_021824	TATT	2	8	420568	420575	25 %	75 %	0 %	0 %	525870145
8040	NC_021824	AAT	2	6	420634	420639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870145
8041	NC_021824	AATC	2	8	420649	420656	50 %	25 %	0 %	25 %	525870145
8042	NC_021824	T	6	6	420746	420751	0 %	100 %	0 %	0 %	525870145
8043	NC_021824	TCCT	2	8	420785	420792	0 %	50 %	0 %	50 %	525870145
8044	NC_021824	TTCCT	2	10	420806	420815	0 %	60 %	0 %	40 %	525870145
8045	NC_021824	ATG	2	6	420899	420904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870145
8046	NC_021824	TTC	2	6	420944	420949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870145
8047	NC_021824	TTC	2	6	420964	420969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870145
8048	NC_021824	CCA	2	6	420987	420992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870145
8049	NC_021824	ACC	2	6	421037	421042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870145
8050	NC_021824	CGCCC	2	10	421064	421073	0 %	0 %	20 %	80 %	525870145
8051	NC_021824	CAT	2	6	421206	421211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870146
8052	NC_021824	GTT	2	6	421213	421218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870146
8053	NC_021824	T	6	6	421238	421243	0 %	100 %	0 %	0 %	525870146
8054	NC_021824	TAA	2	6	421260	421265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870146
8055	NC_021824	TAA	2	6	421350	421355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870146
8056	NC_021824	TGTTT	2	10	421393	421402	0 %	80 %	20 %	0 %	525870146
8057	NC_021824	AGT	2	6	421497	421502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870146
8058	NC_021824	GCT	2	6	421567	421572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870146
8059	NC_021824	T	6	6	421574	421579	0 %	100 %	0 %	0 %	525870146
8060	NC_021824	TCA	2	6	421609	421614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870146
8061	NC_021824	ACC	2	6	421719	421724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870146
8062	NC_021824	CAT	2	6	421758	421763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870146
8063	NC_021824	GCC	2	6	421770	421775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525870146
8064	NC_021824	CAG	2	6	421778	421783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870146
8065	NC_021824	CCA	2	6	421786	421791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870146
8066	NC_021824	ACG	2	6	421796	421801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870146
8067	NC_021824	TA	3	6	421817	421822	50 %	50 %	0 %	0 %	525870146
8068	NC_021824	T	6	6	421902	421907	0 %	100 %	0 %	0 %	525870146
8069	NC_021824	TAA	2	6	422012	422017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870146
8070	NC_021824	CAC	2	6	422069	422074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870146
8071	NC_021824	CCA	2	6	422098	422103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870146
8072	NC_021824	TAA	2	6	422109	422114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870146
8073	NC_021824	CAA	2	6	422144	422149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870146
8074	NC_021824	AAC	2	6	422169	422174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870146
8075	NC_021824	AAC	2	6	422187	422192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870146
8076	NC_021824	TAAT	2	8	422204	422211	50 %	50 %	0 %	0 %	525870146
8077	NC_021824	CAG	2	6	422220	422225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870146
8078	NC_021824	AAT	2	6	422241	422246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870146
8079	NC_021824	CG	3	6	422446	422451	0 %	0 %	50 %	50 %	525870146
8080	NC_021824	AAG	2	6	422476	422481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870146
8081	NC_021824	AACC	2	8	422539	422546	50 %	0 %	0 %	50 %	525870146
8082	NC_021824	AAT	2	6	422557	422562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870146
8083	NC_021824	GAA	2	6	422603	422608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870146
8084	NC_021824	TTCA	2	8	422889	422896	25 %	50 %	0 %	25 %	525870146
8085	NC_021824	ATT	2	6	422898	422903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870146
8086	NC_021824	ATTG	2	8	422939	422946	25 %	50 %	25 %	0 %	525870146
8087	NC_021824	T	6	6	423061	423066	0 %	100 %	0 %	0 %	525870147
8088	NC_021824	AC	3	6	423149	423154	50 %	0 %	0 %	50 %	525870147
8089	NC_021824	TTC	2	6	423193	423198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870147
8090	NC_021824	AAT	2	6	423243	423248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870147
8091	NC_021824	ATA	2	6	423288	423293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870147
8092	NC_021824	TCA	2	6	423307	423312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870147
8093	NC_021824	TAA	2	6	423335	423340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870147
8094	NC_021824	AAT	2	6	423345	423350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870147
8095	NC_021824	TG	4	8	423371	423378	0 %	50 %	50 %	0 %	525870147
8096	NC_021824	CGT	2	6	423380	423385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870147
8097	NC_021824	CCA	2	6	423473	423478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870147
8098	NC_021824	TTC	2	6	423507	423512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870147
8099	NC_021824	GAT	2	6	423593	423598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870147
8100	NC_021824	TCG	2	6	423635	423640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870147
8101	NC_021824	AAGCC	2	10	423799	423808	40 %	0 %	20 %	40 %	525870147
8102	NC_021824	ATT	3	9	423861	423869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870147
8103	NC_021824	CAAA	2	8	423888	423895	75 %	0 %	0 %	25 %	525870147
8104	NC_021824	ATT	2	6	424068	424073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872297
8105	NC_021824	AAT	2	6	424173	424178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872297
8106	NC_021824	CAC	2	6	424205	424210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525872297
8107	NC_021824	CCT	2	6	424268	424273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525872298
8108	NC_021824	TG	3	6	424319	424324	0 %	50 %	50 %	0 %	525872298
8109	NC_021824	T	6	6	424348	424353	0 %	100 %	0 %	0 %	525872298
8110	NC_021824	AAT	2	6	424364	424369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872298
8111	NC_021824	TGTT	2	8	424382	424389	0 %	75 %	25 %	0 %	525872298
8112	NC_021824	ATC	2	6	424393	424398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872298
8113	NC_021824	TAA	2	6	424426	424431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872298
8114	NC_021824	GTT	2	6	424470	424475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872298
8115	NC_021824	T	7	7	424501	424507	0 %	100 %	0 %	0 %	525872298
8116	NC_021824	CTT	2	6	424533	424538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872298
8117	NC_021824	ATC	2	6	424550	424555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872298
8118	NC_021824	T	7	7	424651	424657	0 %	100 %	0 %	0 %	525872298
8119	NC_021824	T	6	6	424672	424677	0 %	100 %	0 %	0 %	525872298
8120	NC_021824	TAA	3	9	424698	424706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872298
8121	NC_021824	AGC	2	6	424748	424753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872298
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8123	NC_021824	AG	3	6	424814	424819	50 %	0 %	50 %	0 %	525872298
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8245	NC_021824	TGA	2	6	430454	430459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870150
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8491	NC_021824	CTA	2	6	443687	443692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870162
8492	NC_021824	ATC	2	6	443694	443699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870162
8493	NC_021824	TTC	2	6	443707	443712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870162
8494	NC_021824	T	7	7	443715	443721	0 %	100 %	0 %	0 %	525870162
8495	NC_021824	T	6	6	443948	443953	0 %	100 %	0 %	0 %	525870163
8496	NC_021824	CAT	2	6	443988	443993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870163
8497	NC_021824	ATA	2	6	443998	444003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870163
8498	NC_021824	CATA	2	8	444011	444018	50 %	25 %	0 %	25 %	525870163
8499	NC_021824	TTAC	2	8	444049	444056	25 %	50 %	0 %	25 %	525870163
8500	NC_021824	ACTTT	2	10	444136	444145	20 %	60 %	0 %	20 %	525870163

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