MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021824	ATC	3	9	313957	313965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870060
6002	NC_021824	CG	3	6	313977	313982	0 %	0 %	50 %	50 %	525870060
6003	NC_021824	CAA	2	6	314021	314026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870060
6004	NC_021824	CCA	2	6	314125	314130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870060
6005	NC_021824	GTT	2	6	314141	314146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870060
6006	NC_021824	AAT	2	6	314222	314227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870060
6007	NC_021824	CAC	2	6	314241	314246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870060
6008	NC_021824	AAG	2	6	314262	314267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870060
6009	NC_021824	AT	3	6	314296	314301	50 %	50 %	0 %	0 %	525870060
6010	NC_021824	AAAT	2	8	314313	314320	75 %	25 %	0 %	0 %	525870060
6011	NC_021824	TTC	2	6	314350	314355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870060
6012	NC_021824	CGC	2	6	314400	314405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525870060
6013	NC_021824	GCC	2	6	314506	314511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525870060
6014	NC_021824	TACAAA	2	12	314595	314606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525870060
6015	NC_021824	CTCA	2	8	314664	314671	25 %	25 %	0 %	50 %	525870060
6016	NC_021824	ATC	2	6	314740	314745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870060
6017	NC_021824	TAA	2	6	314784	314789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870060
6018	NC_021824	ACA	2	6	314794	314799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870060
6019	NC_021824	A	6	6	314799	314804	100 %	0 %	0 %	0 %	525870060
6020	NC_021824	ACA	2	6	314848	314853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872284
6021	NC_021824	ATAAA	2	10	314855	314864	80 %	20 %	0 %	0 %	525872284
6022	NC_021824	CAA	2	6	314870	314875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872284
6023	NC_021824	ATT	2	6	314886	314891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872284
6024	NC_021824	AAC	2	6	314906	314911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872284
6025	NC_021824	CAG	2	6	315196	315201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870061
6026	NC_021824	AGC	2	6	315239	315244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870061
6027	NC_021824	GCAGAA	2	12	315282	315293	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525870061
6028	NC_021824	TTA	2	6	315324	315329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870061
6029	NC_021824	GAA	2	6	315365	315370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870061
6030	NC_021824	A	6	6	315369	315374	100 %	0 %	0 %	0 %	525870061
6031	NC_021824	TTA	2	6	315403	315408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870061
6032	NC_021824	ATG	2	6	315426	315431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870061
6033	NC_021824	A	6	6	315607	315612	100 %	0 %	0 %	0 %	525870062
6034	NC_021824	TGG	2	6	315668	315673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870062
6035	NC_021824	TAG	2	6	315685	315690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870062
6036	NC_021824	AAC	2	6	315756	315761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870062
6037	NC_021824	CGG	2	6	315827	315832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525870062
6038	NC_021824	ACT	2	6	315866	315871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870062
6039	NC_021824	TTC	2	6	315926	315931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870062
6040	NC_021824	AGT	2	6	315935	315940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870062
6041	NC_021824	TTC	2	6	315954	315959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870062
6042	NC_021824	TGG	2	6	316004	316009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870062
6043	NC_021824	ATTA	2	8	316037	316044	50 %	50 %	0 %	0 %	525870062
6044	NC_021824	ATTA	2	8	316094	316101	50 %	50 %	0 %	0 %	525870062
6045	NC_021824	TTC	2	6	316200	316205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870062
6046	NC_021824	AGC	2	6	316208	316213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870062
6047	NC_021824	TTTC	2	8	316234	316241	0 %	75 %	0 %	25 %	525870062
6048	NC_021824	CAG	2	6	316288	316293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870062
6049	NC_021824	TAT	2	6	316297	316302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870062
6050	NC_021824	CTTT	2	8	316453	316460	0 %	75 %	0 %	25 %	525870062
6051	NC_021824	ATG	2	6	316602	316607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870062
6052	NC_021824	CAC	2	6	316660	316665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870062
6053	NC_021824	TTGG	2	8	316702	316709	0 %	50 %	50 %	0 %	525870062
6054	NC_021824	ACC	2	6	316745	316750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870062
6055	NC_021824	TCTA	2	8	316817	316824	25 %	50 %	0 %	25 %	525870062
6056	NC_021824	CTTC	2	8	316832	316839	0 %	50 %	0 %	50 %	525870062
6057	NC_021824	CGT	2	6	316872	316877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870062
6058	NC_021824	AAG	2	6	316882	316887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870062
6059	NC_021824	TGC	2	6	316892	316897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870062
6060	NC_021824	CTG	2	6	316909	316914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870062
6061	NC_021824	AAT	2	6	316915	316920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870062
6062	NC_021824	TAT	2	6	316973	316978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870063
6063	NC_021824	GGT	2	6	316995	317000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525870063
6064	NC_021824	A	6	6	317040	317045	100 %	0 %	0 %	0 %	525870063
6065	NC_021824	ACT	2	6	317093	317098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870063
6066	NC_021824	CAT	2	6	317106	317111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870063
6067	NC_021824	CAAA	2	8	317115	317122	75 %	0 %	0 %	25 %	525870063
6068	NC_021824	A	6	6	317149	317154	100 %	0 %	0 %	0 %	525870063
6069	NC_021824	AATG	2	8	317195	317202	50 %	25 %	25 %	0 %	525870063
6070	NC_021824	GAAA	2	8	317225	317232	75 %	0 %	25 %	0 %	525870063
6071	NC_021824	AATA	2	8	317250	317257	75 %	25 %	0 %	0 %	525870063
6072	NC_021824	ATT	2	6	317583	317588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872285
6073	NC_021824	T	7	7	317587	317593	0 %	100 %	0 %	0 %	525872285
6074	NC_021824	CAA	2	6	317640	317645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872285
6075	NC_021824	TA	3	6	317671	317676	50 %	50 %	0 %	0 %	525872285
6076	NC_021824	TTTA	2	8	317708	317715	25 %	75 %	0 %	0 %	525872286
6077	NC_021824	T	6	6	317841	317846	0 %	100 %	0 %	0 %	525872286
6078	NC_021824	TTTACC	2	12	317901	317912	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525872286
6079	NC_021824	TA	3	6	317948	317953	50 %	50 %	0 %	0 %	525872286
6080	NC_021824	CAC	2	6	317954	317959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525872286
6081	NC_021824	TCA	2	6	318028	318033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872286
6082	NC_021824	TTTC	2	8	318083	318090	0 %	75 %	0 %	25 %	525872286
6083	NC_021824	CTT	2	6	318134	318139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872286
6084	NC_021824	ATA	2	6	318202	318207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872286
6085	NC_021824	A	6	6	318222	318227	100 %	0 %	0 %	0 %	525872286
6086	NC_021824	TTCAT	2	10	318238	318247	20 %	60 %	0 %	20 %	525872286
6087	NC_021824	ATT	2	6	318393	318398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525870064
6088	NC_021824	GAC	2	6	318401	318406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870064
6089	NC_021824	TCTT	2	8	318410	318417	0 %	75 %	0 %	25 %	525870064
6090	NC_021824	AGCAC	2	10	318480	318489	40 %	0 %	20 %	40 %	525870064
6091	NC_021824	CCA	2	6	318492	318497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870064
6092	NC_021824	GAA	2	6	318609	318614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870064
6093	NC_021824	TTC	2	6	318621	318626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870064
6094	NC_021824	TAAT	2	8	318643	318650	50 %	50 %	0 %	0 %	525870064
6095	NC_021824	ATAA	2	8	318666	318673	75 %	25 %	0 %	0 %	525870064
6096	NC_021824	AAC	2	6	318678	318683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870064
6097	NC_021824	CAA	2	6	318694	318699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870064
6098	NC_021824	TGA	2	6	318708	318713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870064
6099	NC_021824	TCA	2	6	318781	318786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870064
6100	NC_021824	AACC	2	8	318793	318800	50 %	0 %	0 %	50 %	525870064
6101	NC_021824	AAGTT	2	10	318813	318822	40 %	40 %	20 %	0 %	525870064
6102	NC_021824	GTT	2	6	318843	318848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870064
6103	NC_021824	TAA	2	6	318905	318910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870064
6104	NC_021824	ACA	2	6	318927	318932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525870064
6105	NC_021824	TAA	2	6	318967	318972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870064
6106	NC_021824	AAT	2	6	319010	319015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870064
6107	NC_021824	TCG	2	6	319042	319047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870064
6108	NC_021824	GTT	2	6	319060	319065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870064
6109	NC_021824	TAAT	2	8	319069	319076	50 %	50 %	0 %	0 %	525870064
6110	NC_021824	TAC	2	6	319181	319186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870064
6111	NC_021824	ATG	2	6	319316	319321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870064
6112	NC_021824	A	6	6	319401	319406	100 %	0 %	0 %	0 %	525870064
6113	NC_021824	CTG	2	6	319427	319432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870064
6114	NC_021824	ATA	2	6	319436	319441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870064
6115	NC_021824	CA	3	6	319448	319453	50 %	0 %	0 %	50 %	525870064
6116	NC_021824	ACTA	2	8	319454	319461	50 %	25 %	0 %	25 %	525870064
6117	NC_021824	AAT	2	6	319484	319489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870064
6118	NC_021824	CT	3	6	319528	319533	0 %	50 %	0 %	50 %	525870065
6119	NC_021824	CGC	3	9	319558	319566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525870065
6120	NC_021824	CCA	2	6	319610	319615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525870065
6121	NC_021824	TAA	2	6	319620	319625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525870065
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6123	NC_021824	CACT	2	8	319659	319666	25 %	25 %	0 %	50 %	525870065
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6144	NC_021824	GAAA	2	8	320517	320524	75 %	0 %	25 %	0 %	525870065
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6247	NC_021824	A	6	6	327894	327899	100 %	0 %	0 %	0 %	525872290
6248	NC_021824	ATC	2	6	327944	327949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872290
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6253	NC_021824	GAA	3	9	328061	328069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872290
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6259	NC_021824	ATG	2	6	328419	328424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872290
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6265	NC_021824	CA	3	6	328658	328663	50 %	0 %	0 %	50 %	525872291
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6274	NC_021824	TCT	2	6	329232	329237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870070
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6277	NC_021824	TCT	2	6	329331	329336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870070
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6490	NC_021824	GTT	3	9	340005	340013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870078
6491	NC_021824	ATC	2	6	340025	340030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870078
6492	NC_021824	AG	3	6	340034	340039	50 %	0 %	50 %	0 %	525870078
6493	NC_021824	GCA	2	6	340125	340130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525870078
6494	NC_021824	CTT	2	6	340138	340143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525870078
6495	NC_021824	GTA	2	6	340179	340184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525870078
6496	NC_021824	GCTTT	2	10	340240	340249	0 %	60 %	20 %	20 %	525870078
6497	NC_021824	AAG	2	6	340255	340260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525870078
6498	NC_021824	TAC	2	6	340337	340342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525870078
6499	NC_021824	CTG	2	6	340369	340374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525870078
6500	NC_021824	GTT	3	9	340400	340408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525870078

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