MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_021824	CTT	2	6	2821638	2821643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872155
56502	NC_021824	TGA	2	6	2821652	2821657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872155
56503	NC_021824	ATCC	2	8	2821710	2821717	25 %	25 %	0 %	50 %	525872155
56504	NC_021824	CAA	2	6	2821729	2821734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872155
56505	NC_021824	ATC	2	6	2821753	2821758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872155
56506	NC_021824	AAG	2	6	2821768	2821773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872155
56507	NC_021824	TGT	2	6	2821798	2821803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872155
56508	NC_021824	AAT	2	6	2821830	2821835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872155
56509	NC_021824	TGGT	2	8	2821849	2821856	0 %	50 %	50 %	0 %	525872155
56510	NC_021824	T	6	6	2821856	2821861	0 %	100 %	0 %	0 %	525872155
56511	NC_021824	TAA	2	6	2821868	2821873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872155
56512	NC_021824	GT	3	6	2821905	2821910	0 %	50 %	50 %	0 %	525872155
56513	NC_021824	AGA	2	6	2821972	2821977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872155
56514	NC_021824	CATCA	2	10	2822008	2822017	40 %	20 %	0 %	40 %	525872155
56515	NC_021824	CTT	2	6	2822037	2822042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872155
56516	NC_021824	TCA	2	6	2822060	2822065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872155
56517	NC_021824	CTT	2	6	2822103	2822108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872155
56518	NC_021824	CAT	2	6	2822130	2822135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872155
56519	NC_021824	CATA	2	8	2822157	2822164	50 %	25 %	0 %	25 %	525872155
56520	NC_021824	CTT	2	6	2822341	2822346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872155
56521	NC_021824	T	6	6	2822378	2822383	0 %	100 %	0 %	0 %	525872155
56522	NC_021824	AC	3	6	2822403	2822408	50 %	0 %	0 %	50 %	525872155
56523	NC_021824	ACG	2	6	2822422	2822427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872155
56524	NC_021824	CAA	2	6	2822449	2822454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872155
56525	NC_021824	ATT	2	6	2822530	2822535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872155
56526	NC_021824	CCT	2	6	2822595	2822600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525872155
56527	NC_021824	ATA	2	6	2822731	2822736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872155
56528	NC_021824	CATATA	2	12	2822835	2822846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525872155
56529	NC_021824	GCT	2	6	2822905	2822910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872155
56530	NC_021824	TCT	2	6	2822942	2822947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872155
56531	NC_021824	T	6	6	2822952	2822957	0 %	100 %	0 %	0 %	525872155
56532	NC_021824	CTT	2	6	2823036	2823041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872155
56533	NC_021824	GAT	2	6	2823140	2823145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872156
56534	NC_021824	TA	3	6	2823146	2823151	50 %	50 %	0 %	0 %	525872156
56535	NC_021824	TGC	2	6	2823154	2823159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872156
56536	NC_021824	TGGTA	2	10	2823208	2823217	20 %	40 %	40 %	0 %	525872156
56537	NC_021824	AAGA	2	8	2823243	2823250	75 %	0 %	25 %	0 %	525872156
56538	NC_021824	A	6	6	2823331	2823336	100 %	0 %	0 %	0 %	525872156
56539	NC_021824	GCA	2	6	2823337	2823342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872156
56540	NC_021824	A	6	6	2823376	2823381	100 %	0 %	0 %	0 %	525872156
56541	NC_021824	CAAAT	2	10	2823391	2823400	60 %	20 %	0 %	20 %	525872156
56542	NC_021824	CAG	2	6	2823411	2823416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872156
56543	NC_021824	TTC	2	6	2823436	2823441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872156
56544	NC_021824	AAT	2	6	2823468	2823473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872156
56545	NC_021824	ATA	2	6	2823478	2823483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872156
56546	NC_021824	AAT	2	6	2823494	2823499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872156
56547	NC_021824	T	6	6	2823520	2823525	0 %	100 %	0 %	0 %	525872156
56548	NC_021824	ATA	2	6	2823535	2823540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872156
56549	NC_021824	T	6	6	2823549	2823554	0 %	100 %	0 %	0 %	525872156
56550	NC_021824	TAA	2	6	2823597	2823602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872156
56551	NC_021824	CTT	3	9	2823613	2823621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872156
56552	NC_021824	ATTTC	2	10	2823651	2823660	20 %	60 %	0 %	20 %	525872156
56553	NC_021824	A	6	6	2823668	2823673	100 %	0 %	0 %	0 %	525872156
56554	NC_021824	GAT	2	6	2823696	2823701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872156
56555	NC_021824	TC	3	6	2823717	2823722	0 %	50 %	0 %	50 %	525872156
56556	NC_021824	TTG	2	6	2823781	2823786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872156
56557	NC_021824	TCCT	2	8	2823815	2823822	0 %	50 %	0 %	50 %	525872156
56558	NC_021824	AGT	2	6	2823867	2823872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872156
56559	NC_021824	AGA	2	6	2823907	2823912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872156
56560	NC_021824	TTCCAC	2	12	2823985	2823996	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525872156
56561	NC_021824	T	6	6	2824033	2824038	0 %	100 %	0 %	0 %	525872156
56562	NC_021824	GCT	2	6	2824040	2824045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525872156
56563	NC_021824	TCT	2	6	2824092	2824097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872156
56564	NC_021824	TCTT	2	8	2824171	2824178	0 %	75 %	0 %	25 %	525872156
56565	NC_021824	CTTG	2	8	2824179	2824186	0 %	50 %	25 %	25 %	525872156
56566	NC_021824	TAGTAA	2	12	2824206	2824217	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525872156
56567	NC_021824	TCA	2	6	2824522	2824527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872157
56568	NC_021824	TATT	2	8	2824528	2824535	25 %	75 %	0 %	0 %	525872157
56569	NC_021824	ATA	2	6	2824557	2824562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872157
56570	NC_021824	ATC	2	6	2824671	2824676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872157
56571	NC_021824	CTT	2	6	2824688	2824693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872157
56572	NC_021824	AGT	2	6	2824720	2824725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525872157
56573	NC_021824	T	6	6	2824733	2824738	0 %	100 %	0 %	0 %	525872157
56574	NC_021824	CCA	2	6	2824795	2824800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525872157
56575	NC_021824	GA	3	6	2824874	2824879	50 %	0 %	50 %	0 %	525872157
56576	NC_021824	CTT	2	6	2824883	2824888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872157
56577	NC_021824	CATC	2	8	2824901	2824908	25 %	25 %	0 %	50 %	525872157
56578	NC_021824	TCT	2	6	2824954	2824959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872157
56579	NC_021824	T	6	6	2825282	2825287	0 %	100 %	0 %	0 %	525872158
56580	NC_021824	TACG	2	8	2825305	2825312	25 %	25 %	25 %	25 %	525872158
56581	NC_021824	TCA	2	6	2825374	2825379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872158
56582	NC_021824	TAA	2	6	2825397	2825402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872158
56583	NC_021824	GTT	2	6	2825432	2825437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872158
56584	NC_021824	AAT	2	6	2825496	2825501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872158
56585	NC_021824	GAA	2	6	2825528	2825533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525872158
56586	NC_021824	A	6	6	2825567	2825572	100 %	0 %	0 %	0 %	525872158
56587	NC_021824	TTTC	2	8	2825575	2825582	0 %	75 %	0 %	25 %	525872158
56588	NC_021824	TTC	2	6	2825601	2825606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872158
56589	NC_021824	TAT	2	6	2825984	2825989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525872159
56590	NC_021824	GCA	2	6	2825993	2825998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872159
56591	NC_021824	CAG	2	6	2826003	2826008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872159
56592	NC_021824	TTAGC	2	10	2826009	2826018	20 %	40 %	20 %	20 %	525872159
56593	NC_021824	CTT	4	12	2826039	2826050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872159
56594	NC_021824	GCG	2	6	2826216	2826221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525872159
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56596	NC_021824	T	7	7	2826341	2826347	0 %	100 %	0 %	0 %	525872159
56597	NC_021824	TAA	2	6	2826364	2826369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872159
56598	NC_021824	TAC	2	6	2826373	2826378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872159
56599	NC_021824	GATA	2	8	2826388	2826395	50 %	25 %	25 %	0 %	525872159
56600	NC_021824	AAT	2	6	2826424	2826429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525872159
56601	NC_021824	ACGTTG	2	12	2826469	2826480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525872159
56602	NC_021824	CCG	2	6	2826482	2826487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525872159
56603	NC_021824	TTC	2	6	2826568	2826573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872159
56604	NC_021824	GAATAC	2	12	2826594	2826605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525872159
56605	NC_021824	ACG	2	6	2826682	2826687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525872159
56606	NC_021824	CGTG	2	8	2826716	2826723	0 %	25 %	50 %	25 %	525872159
56607	NC_021824	CTA	2	6	2826819	2826824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872159
56608	NC_021824	ATC	2	6	2826862	2826867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872159
56609	NC_021824	CG	3	6	2826871	2826876	0 %	0 %	50 %	50 %	525872159
56610	NC_021824	TTG	2	6	2826896	2826901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525872159
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56612	NC_021824	TTCTAC	2	12	2826954	2826965	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525872159
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56614	NC_021824	CTT	2	6	2827121	2827126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872160
56615	NC_021824	TATT	2	8	2827147	2827154	25 %	75 %	0 %	0 %	525872160
56616	NC_021824	CG	3	6	2827156	2827161	0 %	0 %	50 %	50 %	525872160
56617	NC_021824	GGA	2	6	2827180	2827185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525872160
56618	NC_021824	TTC	2	6	2827224	2827229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525872160
56619	NC_021824	ATC	2	6	2827230	2827235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525872160
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56622	NC_021824	CAA	2	6	2827322	2827327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525872160
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56633	NC_021824	T	6	6	2827766	2827771	0 %	100 %	0 %	0 %	525872160
56634	NC_021824	TAAA	2	8	2827811	2827818	75 %	25 %	0 %	0 %	525872160
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56732	NC_021824	A	8	8	2833910	2833917	100 %	0 %	0 %	0 %	525872165
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