MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J2-064

Total Repeats: 58935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52001	NC_021824	GTC	2	6	2597666	2597671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871969
52002	NC_021824	GCT	3	9	2597713	2597721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871969
52003	NC_021824	AGG	2	6	2597756	2597761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525871969
52004	NC_021824	GGA	2	6	2597773	2597778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525871969
52005	NC_021824	AATG	2	8	2597812	2597819	50 %	25 %	25 %	0 %	525871970
52006	NC_021824	AAACC	2	10	2597927	2597936	60 %	0 %	0 %	40 %	525871970
52007	NC_021824	TCC	2	6	2598011	2598016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871970
52008	NC_021824	TGC	2	6	2598025	2598030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871970
52009	NC_021824	ACT	2	6	2598037	2598042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871970
52010	NC_021824	AT	3	6	2598084	2598089	50 %	50 %	0 %	0 %	525871970
52011	NC_021824	A	6	6	2598106	2598111	100 %	0 %	0 %	0 %	525871970
52012	NC_021824	TTC	2	6	2598129	2598134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871970
52013	NC_021824	AG	3	6	2598137	2598142	50 %	0 %	50 %	0 %	525871970
52014	NC_021824	CAA	2	6	2598203	2598208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871970
52015	NC_021824	TCAGT	2	10	2598213	2598222	20 %	40 %	20 %	20 %	525871970
52016	NC_021824	TACC	2	8	2598226	2598233	25 %	25 %	0 %	50 %	525871970
52017	NC_021824	AAAT	2	8	2598259	2598266	75 %	25 %	0 %	0 %	525871970
52018	NC_021824	TTA	2	6	2598267	2598272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871970
52019	NC_021824	GAT	2	6	2598281	2598286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871970
52020	NC_021824	GAT	2	6	2598367	2598372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871971
52021	NC_021824	TTA	2	6	2598386	2598391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871971
52022	NC_021824	AGA	3	9	2598397	2598405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871971
52023	NC_021824	GTC	2	6	2598437	2598442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871971
52024	NC_021824	GTG	2	6	2598546	2598551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871971
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52028	NC_021824	TGC	2	6	2598799	2598804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871971
52029	NC_021824	TGA	2	6	2598835	2598840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871971
52030	NC_021824	CT	3	6	2598865	2598870	0 %	50 %	0 %	50 %	525871971
52031	NC_021824	TAAA	2	8	2598894	2598901	75 %	25 %	0 %	0 %	525871971
52032	NC_021824	AGCA	2	8	2598909	2598916	50 %	0 %	25 %	25 %	525871971
52033	NC_021824	GGT	3	9	2598938	2598946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871971
52034	NC_021824	CAAAG	2	10	2598976	2598985	60 %	0 %	20 %	20 %	525871971
52035	NC_021824	ATC	2	6	2599001	2599006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871971
52036	NC_021824	GC	3	6	2599023	2599028	0 %	0 %	50 %	50 %	525871971
52037	NC_021824	CAG	2	6	2599038	2599043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871971
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52039	NC_021824	TGG	2	6	2599117	2599122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525871971
52040	NC_021824	TGA	2	6	2599153	2599158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871971
52041	NC_021824	TGTT	2	8	2599183	2599190	0 %	75 %	25 %	0 %	525871971
52042	NC_021824	AAGC	2	8	2599214	2599221	50 %	0 %	25 %	25 %	525871971
52043	NC_021824	TTG	2	6	2599224	2599229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871971
52044	NC_021824	CTG	2	6	2599236	2599241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871971
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52049	NC_021824	TTG	2	6	2599529	2599534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871971
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52052	NC_021824	A	6	6	2599846	2599851	100 %	0 %	0 %	0 %	525871972
52053	NC_021824	ATT	2	6	2599855	2599860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871972
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52055	NC_021824	TTG	2	6	2599884	2599889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871972
52056	NC_021824	AAC	2	6	2599906	2599911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871972
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52069	NC_021824	CG	3	6	2600214	2600219	0 %	0 %	50 %	50 %	525871972
52070	NC_021824	ACA	2	6	2600230	2600235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871972
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52072	NC_021824	AT	3	6	2600293	2600298	50 %	50 %	0 %	0 %	525871972
52073	NC_021824	TTG	2	6	2600310	2600315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871972
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52083	NC_021824	GATT	2	8	2600770	2600777	25 %	50 %	25 %	0 %	525871973
52084	NC_021824	CTTC	2	8	2600782	2600789	0 %	50 %	0 %	50 %	525871973
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52088	NC_021824	CAA	2	6	2600920	2600925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525871973
52089	NC_021824	TGC	2	6	2600975	2600980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871973
52090	NC_021824	AATT	2	8	2600999	2601006	50 %	50 %	0 %	0 %	525871973
52091	NC_021824	TCG	2	6	2601018	2601023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871973
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52100	NC_021824	TCTT	2	8	2601477	2601484	0 %	75 %	0 %	25 %	525871973
52101	NC_021824	TCC	2	6	2601533	2601538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871973
52102	NC_021824	CTG	2	6	2601586	2601591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871973
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52104	NC_021824	CCATTG	2	12	2601703	2601714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525871973
52105	NC_021824	TCAT	2	8	2601735	2601742	25 %	50 %	0 %	25 %	525871973
52106	NC_021824	CTTG	2	8	2601774	2601781	0 %	50 %	25 %	25 %	525871973
52107	NC_021824	TCT	2	6	2601831	2601836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871973
52108	NC_021824	ATA	2	6	2601870	2601875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871973
52109	NC_021824	CCA	2	6	2601877	2601882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871973
52110	NC_021824	TAC	3	9	2602043	2602051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871974
52111	NC_021824	GCA	2	6	2602129	2602134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871974
52112	NC_021824	AT	3	6	2602186	2602191	50 %	50 %	0 %	0 %	525871974
52113	NC_021824	ATC	2	6	2602206	2602211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871974
52114	NC_021824	T	7	7	2602249	2602255	0 %	100 %	0 %	0 %	525871974
52115	NC_021824	CATG	2	8	2602416	2602423	25 %	25 %	25 %	25 %	525871974
52116	NC_021824	AAT	2	6	2602473	2602478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871974
52117	NC_021824	ATC	2	6	2602542	2602547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871974
52118	NC_021824	CTT	2	6	2602562	2602567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871974
52119	NC_021824	AAT	2	6	2602690	2602695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871974
52120	NC_021824	TCT	2	6	2602696	2602701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871974
52121	NC_021824	AGA	2	6	2602731	2602736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871974
52122	NC_021824	CTT	2	6	2602760	2602765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871974
52123	NC_021824	A	8	8	2602802	2602809	100 %	0 %	0 %	0 %	525871974
52124	NC_021824	TG	3	6	2602848	2602853	0 %	50 %	50 %	0 %	525871974
52125	NC_021824	GTTTG	2	10	2602881	2602890	0 %	60 %	40 %	0 %	525871974
52126	NC_021824	TCG	2	6	2602976	2602981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871974
52127	NC_021824	T	6	6	2603199	2603204	0 %	100 %	0 %	0 %	525871975
52128	NC_021824	TCT	2	6	2603210	2603215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871975
52129	NC_021824	CCA	2	6	2603228	2603233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871975
52130	NC_021824	TTC	2	6	2603377	2603382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871975
52131	NC_021824	GCA	2	6	2603435	2603440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871975
52132	NC_021824	CTA	2	6	2603466	2603471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871975
52133	NC_021824	TCG	2	6	2603474	2603479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525871975
52134	NC_021824	TAA	2	6	2603505	2603510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871975
52135	NC_021824	CTT	2	6	2603520	2603525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871975
52136	NC_021824	TAC	2	6	2603611	2603616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871975
52137	NC_021824	GTT	2	6	2603634	2603639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525871975
52138	NC_021824	CTT	2	6	2603700	2603705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871975
52139	NC_021824	GATC	2	8	2603757	2603764	25 %	25 %	25 %	25 %	525871975
52140	NC_021824	TGA	2	6	2603849	2603854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871976
52141	NC_021824	AGT	2	6	2603866	2603871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871976
52142	NC_021824	TAA	2	6	2603894	2603899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871976
52143	NC_021824	CAC	2	6	2603954	2603959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871976
52144	NC_021824	GTTC	2	8	2604016	2604023	0 %	50 %	25 %	25 %	525871976
52145	NC_021824	CGC	2	6	2604047	2604052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525871976
52146	NC_021824	TCA	2	6	2604151	2604156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871976
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52148	NC_021824	GAT	2	6	2604207	2604212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871976
52149	NC_021824	T	6	6	2604214	2604219	0 %	100 %	0 %	0 %	525871976
52150	NC_021824	GGAAGT	2	12	2604274	2604285	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525871976
52151	NC_021824	CAC	2	6	2604365	2604370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871976
52152	NC_021824	GAC	2	6	2604381	2604386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871976
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52154	NC_021824	CAT	2	6	2604467	2604472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871976
52155	NC_021824	TCT	2	6	2604481	2604486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871976
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52169	NC_021824	T	6	6	2605374	2605379	0 %	100 %	0 %	0 %	525871978
52170	NC_021824	ATT	2	6	2605399	2605404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871978
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52175	NC_021824	TCT	2	6	2605553	2605558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871978
52176	NC_021824	AATG	2	8	2605722	2605729	50 %	25 %	25 %	0 %	525871978
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52181	NC_021824	TTCTGC	2	12	2605948	2605959	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525871978
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52183	NC_021824	CTT	2	6	2606022	2606027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871978
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52186	NC_021824	CAC	2	6	2606152	2606157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525871978
52187	NC_021824	ACT	2	6	2606237	2606242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871978
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52193	NC_021824	TAA	2	6	2606489	2606494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871979
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52198	NC_021824	AT	3	6	2606658	2606663	50 %	50 %	0 %	0 %	525871979
52199	NC_021824	TCT	2	6	2606664	2606669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871979
52200	NC_021824	CG	3	6	2606725	2606730	0 %	0 %	50 %	50 %	525871979
52201	NC_021824	AGC	2	6	2606741	2606746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525871979
52202	NC_021824	GAA	2	6	2606759	2606764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871979
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52205	NC_021824	TTC	3	9	2606882	2606890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525871979
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52209	NC_021824	AT	3	6	2607228	2607233	50 %	50 %	0 %	0 %	525871979
52210	NC_021824	TAGAAC	2	12	2607256	2607267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525871979
52211	NC_021824	GAT	2	6	2607347	2607352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525871979
52212	NC_021824	ATA	2	6	2607383	2607388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871979
52213	NC_021824	T	6	6	2607403	2607408	0 %	100 %	0 %	0 %	525871979
52214	NC_021824	TAA	2	6	2607422	2607427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871980
52215	NC_021824	AATTCC	2	12	2607446	2607457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871980
52216	NC_021824	TAA	2	6	2607464	2607469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871980
52217	NC_021824	T	6	6	2607494	2607499	0 %	100 %	0 %	0 %	525871980
52218	NC_021824	AAG	2	6	2607516	2607521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871980
52219	NC_021824	CAT	2	6	2607583	2607588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525871980
52220	NC_021824	T	6	6	2607703	2607708	0 %	100 %	0 %	0 %	525871980
52221	NC_021824	T	6	6	2607712	2607717	0 %	100 %	0 %	0 %	525871980
52222	NC_021824	AATA	2	8	2607746	2607753	75 %	25 %	0 %	0 %	525871980
52223	NC_021824	ATA	2	6	2607758	2607763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525871980
52224	NC_021824	AAG	2	6	2607794	2607799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871980
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52226	NC_021824	TAT	2	6	2607931	2607936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525871980
52227	NC_021824	ATCTTT	2	12	2607956	2607967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525871980
52228	NC_021824	TCC	2	6	2607978	2607983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525871980
52229	NC_021824	AAG	2	6	2608057	2608062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525871980
52230	NC_021824	TTTATC	2	12	2608070	2608081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525871980
52231	NC_021824	GATTG	2	10	2608132	2608141	20 %	40 %	40 %	0 %	525871980
52232	NC_021824	TCGT	2	8	2608142	2608149	0 %	50 %	25 %	25 %	525871980
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52234	NC_021824	CTTCAT	2	12	2608226	2608237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525871980
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