MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 59506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_021823	ATC	2	6	2354120	2354125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867864
47003	NC_021823	TGT	2	6	2354152	2354157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867864
47004	NC_021823	CCA	2	6	2354207	2354212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867864
47005	NC_021823	TCA	2	6	2354276	2354281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867864
47006	NC_021823	T	7	7	2354283	2354289	0 %	100 %	0 %	0 %	525867864
47007	NC_021823	AAT	2	6	2354335	2354340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867864
47008	NC_021823	CTT	2	6	2354345	2354350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867864
47009	NC_021823	GCG	2	6	2354351	2354356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525867864
47010	NC_021823	ATT	2	6	2354369	2354374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867864
47011	NC_021823	ATG	2	6	2354379	2354384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867864
47012	NC_021823	TTCC	2	8	2354394	2354401	0 %	50 %	0 %	50 %	525867864
47013	NC_021823	CCT	2	6	2354413	2354418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525867865
47014	NC_021823	CCA	2	6	2354458	2354463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867865
47015	NC_021823	ACC	2	6	2354478	2354483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867865
47016	NC_021823	T	7	7	2354604	2354610	0 %	100 %	0 %	0 %	525867865
47017	NC_021823	TGCT	2	8	2354621	2354628	0 %	50 %	25 %	25 %	525867865
47018	NC_021823	CTT	2	6	2354657	2354662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867865
47019	NC_021823	AAG	2	6	2354721	2354726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867865
47020	NC_021823	AGT	2	6	2354834	2354839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867865
47021	NC_021823	CTT	2	6	2354840	2354845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867865
47022	NC_021823	CCA	2	6	2354965	2354970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867865
47023	NC_021823	ACA	2	6	2355055	2355060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867865
47024	NC_021823	ATAAA	2	10	2355090	2355099	80 %	20 %	0 %	0 %	525867865
47025	NC_021823	ATT	2	6	2355186	2355191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867865
47026	NC_021823	CCG	2	6	2355226	2355231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867865
47027	NC_021823	T	6	6	2355355	2355360	0 %	100 %	0 %	0 %	525867865
47028	NC_021823	GCG	2	6	2355398	2355403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525867865
47029	NC_021823	CAA	2	6	2355449	2355454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525867865
47030	NC_021823	T	7	7	2355461	2355467	0 %	100 %	0 %	0 %	525867865
47031	NC_021823	CT	3	6	2355522	2355527	0 %	50 %	0 %	50 %	525867865
47032	NC_021823	AGC	2	6	2355528	2355533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867865
47033	NC_021823	TCT	2	6	2355577	2355582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867865
47034	NC_021823	GTT	2	6	2355593	2355598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867865
47035	NC_021823	TCA	2	6	2355646	2355651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867865
47036	NC_021823	TCA	2	6	2355661	2355666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867865
47037	NC_021823	TTC	2	6	2355687	2355692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867865
47038	NC_021823	T	6	6	2355759	2355764	0 %	100 %	0 %	0 %	525867865
47039	NC_021823	TAA	2	6	2355783	2355788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867865
47040	NC_021823	TCT	2	6	2355838	2355843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867865
47041	NC_021823	GTT	2	6	2355853	2355858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867865
47042	NC_021823	TC	3	6	2355965	2355970	0 %	50 %	0 %	50 %	525867865
47043	NC_021823	CCA	2	6	2356012	2356017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867865
47044	NC_021823	TGC	2	6	2356032	2356037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867865
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47046	NC_021823	CGC	2	6	2356092	2356097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867865
47047	NC_021823	GC	3	6	2356144	2356149	0 %	0 %	50 %	50 %	525867865
47048	NC_021823	TCT	2	6	2356219	2356224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867865
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47051	NC_021823	TTA	2	6	2356393	2356398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867865
47052	NC_021823	TCT	2	6	2356630	2356635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867865
47053	NC_021823	CATT	2	8	2356752	2356759	25 %	50 %	0 %	25 %	525867866
47054	NC_021823	T	7	7	2356880	2356886	0 %	100 %	0 %	0 %	525867866
47055	NC_021823	TTC	2	6	2356933	2356938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867866
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47057	NC_021823	GGTA	2	8	2357063	2357070	25 %	25 %	50 %	0 %	525867867
47058	NC_021823	AAG	2	6	2357071	2357076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525867867
47059	NC_021823	GC	3	6	2357114	2357119	0 %	0 %	50 %	50 %	525867867
47060	NC_021823	GTC	2	6	2357162	2357167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867867
47061	NC_021823	ACT	2	6	2357183	2357188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867867
47062	NC_021823	TCG	2	6	2357208	2357213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867867
47063	NC_021823	TAAACA	2	12	2357224	2357235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525867867
47064	NC_021823	AAT	2	6	2357248	2357253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867867
47065	NC_021823	ATC	2	6	2357261	2357266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867867
47066	NC_021823	TA	3	6	2357277	2357282	50 %	50 %	0 %	0 %	525867867
47067	NC_021823	TAC	2	6	2357299	2357304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867867
47068	NC_021823	AAAT	2	8	2357379	2357386	75 %	25 %	0 %	0 %	525867867
47069	NC_021823	TAA	3	9	2357392	2357400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867867
47070	NC_021823	CCA	2	6	2357417	2357422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867867
47071	NC_021823	AGT	2	6	2357449	2357454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867867
47072	NC_021823	TAA	2	6	2357457	2357462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867867
47073	NC_021823	AAT	2	6	2357650	2357655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867867
47074	NC_021823	AAT	2	6	2357687	2357692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867867
47075	NC_021823	ACT	2	6	2357696	2357701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867867
47076	NC_021823	AAAT	2	8	2357709	2357716	75 %	25 %	0 %	0 %	525867867
47077	NC_021823	CTG	2	6	2357772	2357777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867867
47078	NC_021823	AGT	2	6	2357852	2357857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867867
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47080	NC_021823	TAA	3	9	2358177	2358185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867867
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47082	NC_021823	ATA	2	6	2358218	2358223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867867
47083	NC_021823	TAG	2	6	2358234	2358239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867867
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47085	NC_021823	CTA	2	6	2358551	2358556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867868
47086	NC_021823	TAA	2	6	2358563	2358568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867868
47087	NC_021823	GCT	2	6	2358587	2358592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525867868
47088	NC_021823	GTT	2	6	2358593	2358598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525867868
47089	NC_021823	T	6	6	2358604	2358609	0 %	100 %	0 %	0 %	525867868
47090	NC_021823	ATAC	2	8	2358676	2358683	50 %	25 %	0 %	25 %	525867868
47091	NC_021823	GGTGC	2	10	2358719	2358728	0 %	20 %	60 %	20 %	525867868
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47098	NC_021823	CAAC	2	8	2359292	2359299	50 %	0 %	0 %	50 %	525867868
47099	NC_021823	T	6	6	2359336	2359341	0 %	100 %	0 %	0 %	525867868
47100	NC_021823	AATGC	2	10	2359397	2359406	40 %	20 %	20 %	20 %	525867868
47101	NC_021823	T	6	6	2359463	2359468	0 %	100 %	0 %	0 %	525867868
47102	NC_021823	GAT	2	6	2359485	2359490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867868
47103	NC_021823	AT	3	6	2359489	2359494	50 %	50 %	0 %	0 %	525867868
47104	NC_021823	ATT	2	6	2359503	2359508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525867868
47105	NC_021823	AGC	2	6	2359543	2359548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867868
47106	NC_021823	GCC	2	6	2359618	2359623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525867868
47107	NC_021823	TCC	2	6	2359651	2359656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525867868
47108	NC_021823	AAT	2	6	2359716	2359721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867868
47109	NC_021823	ATATT	2	10	2359753	2359762	40 %	60 %	0 %	0 %	525867868
47110	NC_021823	CAT	2	6	2359791	2359796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867868
47111	NC_021823	A	7	7	2359815	2359821	100 %	0 %	0 %	0 %	525867868
47112	NC_021823	TAA	2	6	2359838	2359843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867868
47113	NC_021823	TAATTC	2	12	2359910	2359921	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525867868
47114	NC_021823	TAA	2	6	2360061	2360066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867868
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47116	NC_021823	ATC	2	6	2360139	2360144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867868
47117	NC_021823	TCA	2	6	2360170	2360175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867868
47118	NC_021823	GATTC	2	10	2360209	2360218	20 %	40 %	20 %	20 %	525867868
47119	NC_021823	ATTA	2	8	2360244	2360251	50 %	50 %	0 %	0 %	525867868
47120	NC_021823	CCA	2	6	2360308	2360313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525867868
47121	NC_021823	TAA	2	6	2360315	2360320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525867868
47122	NC_021823	TAAA	2	8	2360331	2360338	75 %	25 %	0 %	0 %	525867868
47123	NC_021823	TTC	2	6	2360622	2360627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867869
47124	NC_021823	ATC	2	6	2360733	2360738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867869
47125	NC_021823	GCA	2	6	2360758	2360763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525867869
47126	NC_021823	CTT	2	6	2360792	2360797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867869
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47128	NC_021823	TAAT	2	8	2360923	2360930	50 %	50 %	0 %	0 %	525867869
47129	NC_021823	TTGT	2	8	2360936	2360943	0 %	75 %	25 %	0 %	525867869
47130	NC_021823	GTTG	2	8	2360969	2360976	0 %	50 %	50 %	0 %	525867869
47131	NC_021823	AGT	2	6	2361017	2361022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525867869
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47134	NC_021823	AACC	2	8	2361128	2361135	50 %	0 %	0 %	50 %	525867869
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47137	NC_021823	TCA	2	6	2361520	2361525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867869
47138	NC_021823	ATC	2	6	2361541	2361546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525867869
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47147	NC_021823	T	6	6	2362051	2362056	0 %	100 %	0 %	0 %	525867869
47148	NC_021823	TA	4	8	2362227	2362234	50 %	50 %	0 %	0 %	525868635
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47221	NC_021823	AAG	2	6	2365696	2365701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525868636
47222	NC_021823	T	6	6	2365709	2365714	0 %	100 %	0 %	0 %	525868636
47223	NC_021823	TAAT	2	8	2365748	2365755	50 %	50 %	0 %	0 %	525868636
47224	NC_021823	TAT	2	6	2365822	2365827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525868636
47225	NC_021823	GAT	2	6	2365845	2365850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525868636
47226	NC_021823	CTT	2	6	2365860	2365865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525868636
47227	NC_021823	T	6	6	2365917	2365922	0 %	100 %	0 %	0 %	525868636
47228	NC_021823	GAAA	2	8	2365963	2365970	75 %	0 %	25 %	0 %	525868636
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47230	NC_021823	CT	3	6	2366040	2366045	0 %	50 %	0 %	50 %	525868636
47231	NC_021823	TATT	2	8	2366227	2366234	25 %	75 %	0 %	0 %	525867871
47232	NC_021823	TTC	2	6	2366258	2366263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525867871
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