MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain C1-387

Total Repeats: 59506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021823	CTGAA	2	10	544704	544713	40 %	20 %	20 %	20 %	525866285
11002	NC_021823	TTG	2	6	544761	544766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866285
11003	NC_021823	T	6	6	544785	544790	0 %	100 %	0 %	0 %	525866285
11004	NC_021823	CTT	2	6	544791	544796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866285
11005	NC_021823	TTC	2	6	544798	544803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866285
11006	NC_021823	AAAT	2	8	544866	544873	75 %	25 %	0 %	0 %	525866285
11007	NC_021823	ATC	2	6	544920	544925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866285
11008	NC_021823	AAT	2	6	544947	544952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866285
11009	NC_021823	GCC	2	6	544953	544958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525866285
11010	NC_021823	CAT	2	6	545022	545027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866285
11011	NC_021823	T	6	6	545082	545087	0 %	100 %	0 %	0 %	525866285
11012	NC_021823	ATGA	2	8	545153	545160	50 %	25 %	25 %	0 %	525866286
11013	NC_021823	TTAA	2	8	545190	545197	50 %	50 %	0 %	0 %	525866286
11014	NC_021823	TTG	2	6	545228	545233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866286
11015	NC_021823	CCA	2	6	545290	545295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866286
11016	NC_021823	AAT	2	6	545378	545383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866286
11017	NC_021823	T	6	6	545399	545404	0 %	100 %	0 %	0 %	525866286
11018	NC_021823	CTG	2	6	545422	545427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866286
11019	NC_021823	ATA	2	6	545493	545498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866286
11020	NC_021823	GTT	2	6	545502	545507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866286
11021	NC_021823	CAA	2	6	545509	545514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866286
11022	NC_021823	A	6	6	545530	545535	100 %	0 %	0 %	0 %	525866286
11023	NC_021823	CCA	2	6	545568	545573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525866286
11024	NC_021823	ACCA	2	8	545612	545619	50 %	0 %	0 %	50 %	525866286
11025	NC_021823	TAAAAT	2	12	545645	545656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866286
11026	NC_021823	ATA	2	6	545696	545701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866286
11027	NC_021823	GAA	2	6	545882	545887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866287
11028	NC_021823	A	7	7	545890	545896	100 %	0 %	0 %	0 %	525866287
11029	NC_021823	TTA	2	6	545903	545908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866287
11030	NC_021823	TGT	2	6	545911	545916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866287
11031	NC_021823	ATT	2	6	545919	545924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866287
11032	NC_021823	ACT	2	6	545925	545930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866287
11033	NC_021823	AAC	2	6	545967	545972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866287
11034	NC_021823	CAG	3	9	545987	545995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866287
11035	NC_021823	GAC	2	6	546016	546021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866287
11036	NC_021823	TGG	2	6	546075	546080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866287
11037	NC_021823	A	6	6	546145	546150	100 %	0 %	0 %	0 %	525866287
11038	NC_021823	A	6	6	546185	546190	100 %	0 %	0 %	0 %	525866287
11039	NC_021823	AGA	2	6	546245	546250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866287
11040	NC_021823	ATG	2	6	546278	546283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866287
11041	NC_021823	CAG	2	6	546320	546325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866287
11042	NC_021823	CAAA	2	8	546336	546343	75 %	0 %	0 %	25 %	525866287
11043	NC_021823	TA	3	6	546362	546367	50 %	50 %	0 %	0 %	525866287
11044	NC_021823	AAAGC	2	10	546376	546385	60 %	0 %	20 %	20 %	525866287
11045	NC_021823	ATGCAG	2	12	546437	546448	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525866287
11046	NC_021823	CAGA	2	8	546460	546467	50 %	0 %	25 %	25 %	525866287
11047	NC_021823	TAC	2	6	546535	546540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866287
11048	NC_021823	A	6	6	546565	546570	100 %	0 %	0 %	0 %	525866287
11049	NC_021823	GAA	2	6	546571	546576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866287
11050	NC_021823	A	6	6	546617	546622	100 %	0 %	0 %	0 %	525866287
11051	NC_021823	AGC	2	6	546645	546650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866287
11052	NC_021823	A	6	6	546759	546764	100 %	0 %	0 %	0 %	525866288
11053	NC_021823	GA	3	6	546790	546795	50 %	0 %	50 %	0 %	525866288
11054	NC_021823	TAT	2	6	546798	546803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866288
11055	NC_021823	AGAAA	2	10	546829	546838	80 %	0 %	20 %	0 %	525866288
11056	NC_021823	ATG	2	6	546921	546926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866288
11057	NC_021823	AAT	2	6	547042	547047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866288
11058	NC_021823	ATT	2	6	547082	547087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866288
11059	NC_021823	AAG	2	6	547263	547268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866288
11060	NC_021823	TCA	2	6	547275	547280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866288
11061	NC_021823	CTG	2	6	547326	547331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866288
11062	NC_021823	CAT	2	6	547400	547405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866288
11063	NC_021823	TAC	2	6	547498	547503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866288
11064	NC_021823	AAG	2	6	547554	547559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866288
11065	NC_021823	TAA	2	6	547573	547578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866288
11066	NC_021823	CAA	2	6	547602	547607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866288
11067	NC_021823	ATC	2	6	547634	547639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866288
11068	NC_021823	TTA	2	6	547682	547687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866288
11069	NC_021823	GAC	2	6	547732	547737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866288
11070	NC_021823	GCGA	2	8	547757	547764	25 %	0 %	50 %	25 %	525866288
11071	NC_021823	AAT	2	6	547775	547780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866288
11072	NC_021823	T	6	6	547792	547797	0 %	100 %	0 %	0 %	525866288
11073	NC_021823	GTTG	2	8	547843	547850	0 %	50 %	50 %	0 %	525866288
11074	NC_021823	AAC	2	6	547888	547893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866288
11075	NC_021823	GCT	2	6	547957	547962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866288
11076	NC_021823	AAT	2	6	547971	547976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866288
11077	NC_021823	AAC	2	6	547998	548003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866289
11078	NC_021823	GGAA	2	8	548033	548040	50 %	0 %	50 %	0 %	525866289
11079	NC_021823	GTG	2	6	548126	548131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866289
11080	NC_021823	TGT	2	6	548139	548144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866289
11081	NC_021823	AAG	2	6	548252	548257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866289
11082	NC_021823	ATT	2	6	548272	548277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866289
11083	NC_021823	ATA	2	6	548312	548317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866289
11084	NC_021823	A	7	7	548358	548364	100 %	0 %	0 %	0 %	525866289
11085	NC_021823	GAA	2	6	548383	548388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866289
11086	NC_021823	ACA	2	6	548453	548458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866290
11087	NC_021823	A	6	6	548461	548466	100 %	0 %	0 %	0 %	525866290
11088	NC_021823	TTG	2	6	548527	548532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525866290
11089	NC_021823	AGA	2	6	548567	548572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866290
11090	NC_021823	GAA	2	6	548592	548597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866290
11091	NC_021823	ACACC	2	10	548724	548733	40 %	0 %	0 %	60 %	525866290
11092	NC_021823	AT	3	6	548759	548764	50 %	50 %	0 %	0 %	525866290
11093	NC_021823	AGA	2	6	548801	548806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866290
11094	NC_021823	GGTGG	2	10	548827	548836	0 %	20 %	80 %	0 %	525866290
11095	NC_021823	AAC	2	6	548847	548852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866290
11096	NC_021823	T	6	6	548868	548873	0 %	100 %	0 %	0 %	525866291
11097	NC_021823	GCA	2	6	548913	548918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866291
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11100	NC_021823	AGA	2	6	549042	549047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866291
11101	NC_021823	AGG	2	6	549090	549095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525866291
11102	NC_021823	GAT	2	6	549112	549117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866292
11103	NC_021823	ATGA	2	8	549214	549221	50 %	25 %	25 %	0 %	525866292
11104	NC_021823	GGC	2	6	549300	549305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525866292
11105	NC_021823	A	7	7	549307	549313	100 %	0 %	0 %	0 %	525866292
11106	NC_021823	GAC	2	6	549348	549353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866292
11107	NC_021823	GAT	2	6	549376	549381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866292
11108	NC_021823	A	6	6	549524	549529	100 %	0 %	0 %	0 %	525866292
11109	NC_021823	ATT	2	6	549619	549624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525866293
11110	NC_021823	GT	4	8	549691	549698	0 %	50 %	50 %	0 %	525866293
11111	NC_021823	GAA	2	6	549710	549715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866293
11112	NC_021823	A	6	6	549800	549805	100 %	0 %	0 %	0 %	525866293
11113	NC_021823	TGG	2	6	549817	549822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525866293
11114	NC_021823	AGA	2	6	549886	549891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866293
11115	NC_021823	A	6	6	549926	549931	100 %	0 %	0 %	0 %	525866293
11116	NC_021823	AGG	2	6	549945	549950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525866293
11117	NC_021823	AGA	2	6	550060	550065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866293
11118	NC_021823	GTC	2	6	550094	550099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525866293
11119	NC_021823	ATG	2	6	550116	550121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866293
11120	NC_021823	AAAGAT	2	12	550151	550162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525866293
11121	NC_021823	AT	3	6	550183	550188	50 %	50 %	0 %	0 %	525866293
11122	NC_021823	GAAA	2	8	550216	550223	75 %	0 %	25 %	0 %	525866293
11123	NC_021823	GAA	2	6	550448	550453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525866293
11124	NC_021823	ATA	2	6	550518	550523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866293
11125	NC_021823	TAA	2	6	550573	550578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866293
11126	NC_021823	GGC	2	6	550587	550592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525866293
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11133	NC_021823	CAT	2	6	550985	550990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866294
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11136	NC_021823	TAC	2	6	551102	551107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525866294
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11140	NC_021823	AC	3	6	551212	551217	50 %	0 %	0 %	50 %	525866295
11141	NC_021823	T	6	6	551293	551298	0 %	100 %	0 %	0 %	525866295
11142	NC_021823	CAG	2	6	551306	551311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525866295
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11153	NC_021823	AT	3	6	551850	551855	50 %	50 %	0 %	0 %	525866295
11154	NC_021823	TGCT	2	8	551912	551919	0 %	50 %	25 %	25 %	525866295
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11233	NC_021823	AAC	2	6	557290	557295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866300
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11484	NC_021823	CAA	2	6	567262	567267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525866308
11485	NC_021823	CTT	2	6	567278	567283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525866308
11486	NC_021823	AATT	2	8	567291	567298	50 %	50 %	0 %	0 %	525866308
11487	NC_021823	ATGC	2	8	567327	567334	25 %	25 %	25 %	25 %	525866308
11488	NC_021823	TAA	2	6	567592	567597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866309
11489	NC_021823	GAT	2	6	567616	567621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866309
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11491	NC_021823	T	6	6	567724	567729	0 %	100 %	0 %	0 %	525866309
11492	NC_021823	AAT	2	6	567777	567782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525866309
11493	NC_021823	TTCTT	2	10	567783	567792	0 %	80 %	0 %	20 %	525866309
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11496	NC_021823	AATA	2	8	567855	567862	75 %	25 %	0 %	0 %	525866309
11497	NC_021823	AGT	2	6	568019	568024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525866309
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11499	NC_021823	TCTT	2	8	568119	568126	0 %	75 %	0 %	25 %	525866309
11500	NC_021823	A	6	6	568288	568293	100 %	0 %	0 %	0 %	525866310

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