MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 47101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_021725	GCG	2	6	2984145	2984150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523521379
47002	NC_021725	GCA	2	6	2984152	2984157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523521379
47003	NC_021725	CTT	2	6	2984189	2984194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523521379
47004	NC_021725	CGG	2	6	2984222	2984227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523521379
47005	NC_021725	CAT	2	6	2984288	2984293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523521379
47006	NC_021725	GC	3	6	2984311	2984316	0 %	0 %	50 %	50 %	523521379
47007	NC_021725	GCA	2	6	2984351	2984356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523521379
47008	NC_021725	ATA	2	6	2984403	2984408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523521379
47009	NC_021725	AAT	2	6	2984440	2984445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523521379
47010	NC_021725	ATGG	2	8	2984488	2984495	25 %	25 %	50 %	0 %	523521379
47011	NC_021725	GC	3	6	2984540	2984545	0 %	0 %	50 %	50 %	523521379
47012	NC_021725	AAT	2	6	2984562	2984567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523521379
47013	NC_021725	TGA	2	6	2984569	2984574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523521379
47014	NC_021725	GTC	2	6	2984575	2984580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521379
47015	NC_021725	CAA	2	6	2984599	2984604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523521379
47016	NC_021725	GTT	2	6	2984675	2984680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523521379
47017	NC_021725	CGG	2	6	2984721	2984726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523521379
47018	NC_021725	GCG	2	6	2984742	2984747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523521379
47019	NC_021725	GCT	2	6	2984762	2984767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521379
47020	NC_021725	AG	3	6	2984778	2984783	50 %	0 %	50 %	0 %	523521379
47021	NC_021725	ATA	2	6	2984836	2984841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523521379
47022	NC_021725	AGC	2	6	2984907	2984912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523521379
47023	NC_021725	GCG	2	6	2984981	2984986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523521379
47024	NC_021725	GC	3	6	2985049	2985054	0 %	0 %	50 %	50 %	523521379
47025	NC_021725	TTC	2	6	2985112	2985117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523521379
47026	NC_021725	CCG	2	6	2985127	2985132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523521379
47027	NC_021725	TAA	2	6	2985228	2985233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523521379
47028	NC_021725	TGC	2	6	2985252	2985257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521379
47029	NC_021725	CAT	2	6	2985305	2985310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523521379
47030	NC_021725	CAGA	2	8	2985394	2985401	50 %	0 %	25 %	25 %	523521380
47031	NC_021725	ACTG	2	8	2985402	2985409	25 %	25 %	25 %	25 %	523521380
47032	NC_021725	TAAT	2	8	2985420	2985427	50 %	50 %	0 %	0 %	523521380
47033	NC_021725	GC	3	6	2985577	2985582	0 %	0 %	50 %	50 %	523521380
47034	NC_021725	GCC	2	6	2985619	2985624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523521380
47035	NC_021725	AGA	2	6	2985627	2985632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523521380
47036	NC_021725	TGA	2	6	2985690	2985695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523521380
47037	NC_021725	GCA	2	6	2985717	2985722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523521380
47038	NC_021725	CGC	2	6	2985724	2985729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523521380
47039	NC_021725	TGTT	2	8	2985755	2985762	0 %	75 %	25 %	0 %	523521380
47040	NC_021725	GAT	2	6	2985769	2985774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523521380
47041	NC_021725	AGC	2	6	2985800	2985805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523521380
47042	NC_021725	CTGC	2	8	2985861	2985868	0 %	25 %	25 %	50 %	523521380
47043	NC_021725	T	6	6	2985900	2985905	0 %	100 %	0 %	0 %	523521380
47044	NC_021725	GGT	2	6	2985916	2985921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523521380
47045	NC_021725	TTC	2	6	2985979	2985984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523521380
47046	NC_021725	CG	3	6	2985993	2985998	0 %	0 %	50 %	50 %	523521380
47047	NC_021725	GGCC	2	8	2986076	2986083	0 %	0 %	50 %	50 %	523521380
47048	NC_021725	TGGC	2	8	2986124	2986131	0 %	25 %	50 %	25 %	523521380
47049	NC_021725	GCT	2	6	2986143	2986148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521380
47050	NC_021725	GC	3	6	2986406	2986411	0 %	0 %	50 %	50 %	523521380
47051	NC_021725	CAA	2	6	2986456	2986461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523521380
47052	NC_021725	TCA	2	6	2986565	2986570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523521380
47053	NC_021725	AATG	2	8	2986608	2986615	50 %	25 %	25 %	0 %	523521380
47054	NC_021725	GGT	2	6	2986721	2986726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523521380
47055	NC_021725	A	7	7	2987123	2987129	100 %	0 %	0 %	0 %	523521381
47056	NC_021725	ACT	2	6	2987183	2987188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523521381
47057	NC_021725	ATC	2	6	2987208	2987213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523521381
47058	NC_021725	AGTT	2	8	2987241	2987248	25 %	50 %	25 %	0 %	523521382
47059	NC_021725	GAC	3	9	2987265	2987273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523521382
47060	NC_021725	ATTG	2	8	2987315	2987322	25 %	50 %	25 %	0 %	523521382
47061	NC_021725	CG	4	8	2987405	2987412	0 %	0 %	50 %	50 %	523521382
47062	NC_021725	GTTC	2	8	2987413	2987420	0 %	50 %	25 %	25 %	523521382
47063	NC_021725	GGC	2	6	2987444	2987449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523521382
47064	NC_021725	ATG	2	6	2987476	2987481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523521382
47065	NC_021725	GCT	2	6	2987622	2987627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521382
47066	NC_021725	GTG	2	6	2987716	2987721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523521382
47067	NC_021725	GGT	2	6	2987845	2987850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523521382
47068	NC_021725	GTT	2	6	2988028	2988033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523521383
47069	NC_021725	T	6	6	2988053	2988058	0 %	100 %	0 %	0 %	523521383
47070	NC_021725	TTC	2	6	2988107	2988112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523521383
47071	NC_021725	CAA	2	6	2988146	2988151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523521383
47072	NC_021725	AAC	2	6	2988179	2988184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523521383
47073	NC_021725	GGTAA	2	10	2988207	2988216	40 %	20 %	40 %	0 %	523521383
47074	NC_021725	ATC	3	9	2988249	2988257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523521383
47075	NC_021725	GCT	2	6	2988263	2988268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521383
47076	NC_021725	CAT	2	6	2988290	2988295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523521383
47077	NC_021725	GAA	2	6	2988402	2988407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523521383
47078	NC_021725	TCG	2	6	2988516	2988521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521383
47079	NC_021725	GTTTG	2	10	2988526	2988535	0 %	60 %	40 %	0 %	523521383
47080	NC_021725	T	6	6	2988560	2988565	0 %	100 %	0 %	0 %	523521383
47081	NC_021725	CTG	2	6	2988596	2988601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523521383
47082	NC_021725	AAAATC	2	12	2988639	2988650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	523521383
47083	NC_021725	GAT	2	6	2988671	2988676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523521383
47084	NC_021725	CAAA	2	8	2988697	2988704	75 %	0 %	0 %	25 %	523521383
47085	NC_021725	GCCA	2	8	2988708	2988715	25 %	0 %	25 %	50 %	523521383
47086	NC_021725	AGA	2	6	2988804	2988809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523521383
47087	NC_021725	AGACT	2	10	2988811	2988820	40 %	20 %	20 %	20 %	523521383
47088	NC_021725	CATGA	2	10	2988940	2988949	40 %	20 %	20 %	20 %	523521384
47089	NC_021725	TTC	2	6	2988956	2988961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523521384
47090	NC_021725	CG	3	6	2988998	2989003	0 %	0 %	50 %	50 %	523521384
47091	NC_021725	A	6	6	2989010	2989015	100 %	0 %	0 %	0 %	523521384
47092	NC_021725	T	6	6	2989108	2989113	0 %	100 %	0 %	0 %	523521384
47093	NC_021725	CTT	2	6	2989224	2989229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523521384
47094	NC_021725	T	6	6	2989228	2989233	0 %	100 %	0 %	0 %	523521384
47095	NC_021725	ATG	2	6	2989254	2989259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523521384
47096	NC_021725	TCAT	2	8	2989453	2989460	25 %	50 %	0 %	25 %	523521385
47097	NC_021725	GATT	2	8	2989550	2989557	25 %	50 %	25 %	0 %	523521385
47098	NC_021725	GCTCT	2	10	2989977	2989986	0 %	40 %	20 %	40 %	523521387
47099	NC_021725	A	8	8	2989987	2989994	100 %	0 %	0 %	0 %	523521387
47100	NC_021725	ATA	2	6	2990023	2990028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523521387
47101	NC_021725	TTGG	2	8	2990128	2990135	0 %	50 %	50 %	0 %	523521388

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.