MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 47101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34617	NC_021725	TTC	2	6	2199285	2199290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520612
34618	NC_021725	A	6	6	2199340	2199345	100 %	0 %	0 %	0 %	523520612
34619	NC_021725	TTGG	2	8	2199353	2199360	0 %	50 %	50 %	0 %	523520612
34620	NC_021725	TCT	2	6	2199400	2199405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520612
34621	NC_021725	CGGCGC	2	12	2199424	2199435	0 %	0 %	50 %	50 %	523520612
34622	NC_021725	CTT	2	6	2199591	2199596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520612
34623	NC_021725	T	6	6	2199595	2199600	0 %	100 %	0 %	0 %	523520612
34624	NC_021725	TGT	2	6	2199762	2199767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520612
34625	NC_021725	TA	3	6	2200102	2200107	50 %	50 %	0 %	0 %	523520613
34626	NC_021725	ATC	2	6	2200122	2200127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520613
34627	NC_021725	ACT	2	6	2200129	2200134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520613
34628	NC_021725	CGG	2	6	2200142	2200147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520613
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34630	NC_021725	T	6	6	2200176	2200181	0 %	100 %	0 %	0 %	523520613
34631	NC_021725	TTC	2	6	2200254	2200259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520613
34632	NC_021725	CAA	2	6	2200262	2200267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520613
34633	NC_021725	GTC	2	6	2200272	2200277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520613
34634	NC_021725	AAG	2	6	2200302	2200307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523520613
34635	NC_021725	TCC	2	6	2200336	2200341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523520613
34636	NC_021725	GTC	2	6	2200443	2200448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520613
34637	NC_021725	ATG	2	6	2200600	2200605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520614
34638	NC_021725	CGC	2	6	2200606	2200611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520614
34639	NC_021725	ATA	2	6	2200645	2200650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520614
34640	NC_021725	ATCA	2	8	2200747	2200754	50 %	25 %	0 %	25 %	523520614
34641	NC_021725	GGCTTC	2	12	2200780	2200791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520614
34642	NC_021725	AATC	2	8	2200869	2200876	50 %	25 %	0 %	25 %	523520614
34643	NC_021725	ATT	2	6	2200945	2200950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520614
34644	NC_021725	ACA	2	6	2200958	2200963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520614
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34646	NC_021725	CGC	2	6	2201017	2201022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520614
34647	NC_021725	CAT	2	6	2201208	2201213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520614
34648	NC_021725	CAT	2	6	2201278	2201283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520614
34649	NC_021725	GCT	2	6	2201341	2201346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520614
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34653	NC_021725	AAT	2	6	2201611	2201616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520614
34654	NC_021725	TCA	2	6	2201670	2201675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520614
34655	NC_021725	CTG	2	6	2201682	2201687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520614
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34657	NC_021725	AATC	2	8	2201737	2201744	50 %	25 %	0 %	25 %	523520614
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34678	NC_021725	TTC	2	6	2202898	2202903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520615
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34704	NC_021725	CCT	2	6	2204306	2204311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523520617
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34709	NC_021725	CAG	2	6	2204415	2204420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520617
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34714	NC_021725	CCG	2	6	2204592	2204597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520617
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34716	NC_021725	ATC	2	6	2204712	2204717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520617
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34720	NC_021725	TCT	2	6	2204851	2204856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520617
34721	NC_021725	CAA	2	6	2204865	2204870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520617
34722	NC_021725	CG	4	8	2204955	2204962	0 %	0 %	50 %	50 %	523520617
34723	NC_021725	GTT	2	6	2204975	2204980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520617
34724	NC_021725	TTG	2	6	2205049	2205054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520617
34725	NC_021725	ATCC	2	8	2205078	2205085	25 %	25 %	0 %	50 %	523520617
34726	NC_021725	GCC	2	6	2205173	2205178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520617
34727	NC_021725	ATC	2	6	2205216	2205221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520617
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34729	NC_021725	T	6	6	2205330	2205335	0 %	100 %	0 %	0 %	523520617
34730	NC_021725	GATT	2	8	2205431	2205438	25 %	50 %	25 %	0 %	523520617
34731	NC_021725	CACT	2	8	2205464	2205471	25 %	25 %	0 %	50 %	523520617
34732	NC_021725	CAT	2	6	2205488	2205493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520617
34733	NC_021725	TAA	2	6	2205933	2205938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520618
34734	NC_021725	GTG	2	6	2206142	2206147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520618
34735	NC_021725	CGC	2	6	2206162	2206167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520618
34736	NC_021725	TTGG	2	8	2206174	2206181	0 %	50 %	50 %	0 %	523520618
34737	NC_021725	CAA	2	6	2206203	2206208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520618
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34739	NC_021725	GGT	2	6	2206264	2206269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520618
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34742	NC_021725	GTC	2	6	2206511	2206516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520618
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34746	NC_021725	ACG	2	6	2207005	2207010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520620
34747	NC_021725	TGC	3	9	2207071	2207079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520620
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34750	NC_021725	T	6	6	2207166	2207171	0 %	100 %	0 %	0 %	523520620
34751	NC_021725	TGC	2	6	2207176	2207181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520620
34752	NC_021725	CAT	2	6	2207187	2207192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520620
34753	NC_021725	GAG	2	6	2207306	2207311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523520620
34754	NC_021725	TCA	5	15	2207315	2207329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520620
34755	NC_021725	TTTAT	2	10	2207431	2207440	20 %	80 %	0 %	0 %	523520621
34756	NC_021725	CA	3	6	2207441	2207446	50 %	0 %	0 %	50 %	523520621
34757	NC_021725	AT	3	6	2207501	2207506	50 %	50 %	0 %	0 %	523520621
34758	NC_021725	AAT	2	6	2207510	2207515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523520621
34759	NC_021725	GTC	2	6	2207555	2207560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520621
34760	NC_021725	TGC	2	6	2207667	2207672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520621
34761	NC_021725	GCT	2	6	2207776	2207781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520621
34762	NC_021725	TTTGA	2	10	2207890	2207899	20 %	60 %	20 %	0 %	523520621
34763	NC_021725	CAT	2	6	2207992	2207997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520621
34764	NC_021725	ATG	2	6	2208004	2208009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520621
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34767	NC_021725	CTT	2	6	2208157	2208162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520621
34768	NC_021725	TCGG	2	8	2208200	2208207	0 %	25 %	50 %	25 %	523520621
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34774	NC_021725	ATC	2	6	2208614	2208619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520621
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34779	NC_021725	GGC	2	6	2209056	2209061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520622
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34784	NC_021725	GAAT	2	8	2209370	2209377	50 %	25 %	25 %	0 %	523520622
34785	NC_021725	CA	3	6	2209448	2209453	50 %	0 %	0 %	50 %	523520622
34786	NC_021725	GCA	2	6	2209474	2209479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520622
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34788	NC_021725	CAA	2	6	2209574	2209579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520622
34789	NC_021725	ATC	2	6	2209725	2209730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520622
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34800	NC_021725	CAA	2	6	2210167	2210172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520623
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34802	NC_021725	TTC	2	6	2210305	2210310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523520623
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34822	NC_021725	CCGAC	2	10	2211604	2211613	20 %	0 %	20 %	60 %	523520624
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34826	NC_021725	CCTG	2	8	2211731	2211738	0 %	25 %	25 %	50 %	523520624
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34830	NC_021725	GGT	2	6	2211795	2211800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520624
34831	NC_021725	GCT	2	6	2211831	2211836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520624
34832	NC_021725	TTG	2	6	2211936	2211941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520624
34833	NC_021725	CCG	2	6	2212024	2212029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520624
34834	NC_021725	CCG	2	6	2212050	2212055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520624
34835	NC_021725	GTC	2	6	2212117	2212122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520624
34836	NC_021725	GGC	2	6	2212214	2212219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520624
34837	NC_021725	CTG	2	6	2212414	2212419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520624
34838	NC_021725	TGC	2	6	2212426	2212431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520624
34839	NC_021725	GC	3	6	2212430	2212435	0 %	0 %	50 %	50 %	523520624
34840	NC_021725	ATC	2	6	2212489	2212494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520624
34841	NC_021725	CAAA	2	8	2212502	2212509	75 %	0 %	0 %	25 %	523520624
34842	NC_021725	ACC	2	6	2212599	2212604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523520624
34843	NC_021725	CGG	2	6	2212660	2212665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520625
34844	NC_021725	TCA	2	6	2212743	2212748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520625
34845	NC_021725	ATCA	2	8	2212877	2212884	50 %	25 %	0 %	25 %	523520625
34846	NC_021725	TCA	2	6	2212933	2212938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520625
34847	NC_021725	CG	3	6	2212956	2212961	0 %	0 %	50 %	50 %	523520625
34848	NC_021725	GTG	2	6	2212977	2212982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520625
34849	NC_021725	TGC	2	6	2213035	2213040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520625
34850	NC_021725	T	6	6	2213051	2213056	0 %	100 %	0 %	0 %	523520625
34851	NC_021725	CGG	2	6	2213102	2213107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520625
34852	NC_021725	TCA	2	6	2213116	2213121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520625
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34854	NC_021725	TGC	2	6	2213155	2213160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520625
34855	NC_021725	GC	3	6	2213180	2213185	0 %	0 %	50 %	50 %	523520625
34856	NC_021725	GGCT	2	8	2213220	2213227	0 %	25 %	50 %	25 %	523520625
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34946	NC_021725	TCA	2	6	2218625	2218630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520630
34947	NC_021725	GCTT	2	8	2218654	2218661	0 %	50 %	25 %	25 %	523520630
34948	NC_021725	T	6	6	2218687	2218692	0 %	100 %	0 %	0 %	523520630
34949	NC_021725	CG	3	6	2218707	2218712	0 %	0 %	50 %	50 %	523520630
34950	NC_021725	TGG	2	6	2218721	2218726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520630
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34953	NC_021725	TGA	2	6	2218949	2218954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520630
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34955	NC_021725	TGT	2	6	2219062	2219067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520630
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34960	NC_021725	TCA	2	6	2219356	2219361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520630
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34962	NC_021725	CGC	2	6	2219382	2219387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523520630
34963	NC_021725	ATG	2	6	2219989	2219994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520631
34964	NC_021725	CAA	2	6	2220012	2220017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520631
34965	NC_021725	ACA	2	6	2220045	2220050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520631
34966	NC_021725	CGG	2	6	2220147	2220152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523520631
34967	NC_021725	T	6	6	2220196	2220201	0 %	100 %	0 %	0 %	523520631
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34969	NC_021725	ATC	2	6	2220293	2220298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520631
34970	NC_021725	GTTA	2	8	2220343	2220350	25 %	50 %	25 %	0 %	523520631
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34980	NC_021725	CATGG	2	10	2220780	2220789	20 %	20 %	40 %	20 %	523520632
34981	NC_021725	CTG	2	6	2220916	2220921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523520632
34982	NC_021725	ATG	2	6	2220922	2220927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520632
34983	NC_021725	TTCA	2	8	2220948	2220955	25 %	50 %	0 %	25 %	523520632
34984	NC_021725	T	6	6	2221055	2221060	0 %	100 %	0 %	0 %	523520632
34985	NC_021725	TTA	2	6	2221120	2221125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523520632
34986	NC_021725	CAGT	2	8	2221139	2221146	25 %	25 %	25 %	25 %	523520632
34987	NC_021725	TGT	2	6	2221178	2221183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523520632
34988	NC_021725	GAA	2	6	2221268	2221273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523520632
34989	NC_021725	AGC	2	6	2221311	2221316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523520632
34990	NC_021725	CA	3	6	2221405	2221410	50 %	0 %	0 %	50 %	523520632
34991	NC_021725	TGA	2	6	2221447	2221452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523520632
34992	NC_021725	TCA	2	6	2221484	2221489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523520632
34993	NC_021725	GTG	2	6	2221605	2221610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523520633
34994	NC_021725	TTGA	2	8	2221652	2221659	25 %	50 %	25 %	0 %	523520633
34995	NC_021725	TGAC	2	8	2221689	2221696	25 %	25 %	25 %	25 %	523520633
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34999	NC_021725	CAA	2	6	2221771	2221776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523520633
35000	NC_021725	TTCA	2	8	2221814	2221821	25 %	50 %	0 %	25 %	523520633

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