MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 47101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21004	NC_021725	ATC	2	6	1338475	1338480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519802
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21008	NC_021725	ATT	2	6	1338905	1338910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519803
21009	NC_021725	CGG	2	6	1338916	1338921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519803
21010	NC_021725	T	7	7	1338926	1338932	0 %	100 %	0 %	0 %	523519803
21011	NC_021725	GCA	2	6	1338934	1338939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519803
21012	NC_021725	TAG	2	6	1338991	1338996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519803
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21017	NC_021725	CAA	2	6	1339181	1339186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519803
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21019	NC_021725	GTG	2	6	1339320	1339325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519803
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21039	NC_021725	AACGC	2	10	1340148	1340157	40 %	0 %	20 %	40 %	523519804
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21042	NC_021725	TTG	2	6	1340296	1340301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519804
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21049	NC_021725	TGA	2	6	1340492	1340497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519804
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21054	NC_021725	ATT	3	9	1340773	1340781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519804
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21063	NC_021725	TGCA	2	8	1341059	1341066	25 %	25 %	25 %	25 %	523519804
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21116	NC_021725	GAC	2	6	1344835	1344840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519809
21117	NC_021725	TGT	2	6	1344900	1344905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519809
21118	NC_021725	CCGA	2	8	1344938	1344945	25 %	0 %	25 %	50 %	523519809
21119	NC_021725	GCCTT	2	10	1344991	1345000	0 %	40 %	20 %	40 %	523519809
21120	NC_021725	ATC	2	6	1345013	1345018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519809
21121	NC_021725	GCA	2	6	1345071	1345076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519809
21122	NC_021725	AAG	2	6	1345090	1345095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519809
21123	NC_021725	TGA	2	6	1345116	1345121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519809
21124	NC_021725	AAC	2	6	1345167	1345172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519809
21125	NC_021725	TAA	2	6	1345308	1345313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519809
21126	NC_021725	GTT	2	6	1345326	1345331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519809
21127	NC_021725	GCG	2	6	1345500	1345505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519809
21128	NC_021725	GAT	2	6	1345579	1345584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519809
21129	NC_021725	CCGG	2	8	1345649	1345656	0 %	0 %	50 %	50 %	523519809
21130	NC_021725	ACC	2	6	1345744	1345749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519809
21131	NC_021725	GGC	2	6	1345776	1345781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519809
21132	NC_021725	CGAA	2	8	1345783	1345790	50 %	0 %	25 %	25 %	523519809
21133	NC_021725	CGA	2	6	1345833	1345838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519809
21134	NC_021725	TGA	2	6	1345880	1345885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519809
21135	NC_021725	TTGGCG	2	12	1346087	1346098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	523519809
21136	NC_021725	GTT	2	6	1346191	1346196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519809
21137	NC_021725	GTTT	2	8	1346223	1346230	0 %	75 %	25 %	0 %	523519809
21138	NC_021725	CTT	2	6	1346361	1346366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519809
21139	NC_021725	GCG	2	6	1346382	1346387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519809
21140	NC_021725	TCA	2	6	1346405	1346410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519809
21141	NC_021725	ACA	2	6	1346446	1346451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519810
21142	NC_021725	A	6	6	1346451	1346456	100 %	0 %	0 %	0 %	523519810
21143	NC_021725	T	7	7	1346475	1346481	0 %	100 %	0 %	0 %	523519810
21144	NC_021725	AAC	2	6	1346506	1346511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519810
21145	NC_021725	AGG	2	6	1346515	1346520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523519810
21146	NC_021725	CGG	3	9	1346611	1346619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519811
21147	NC_021725	GCTTG	2	10	1346784	1346793	0 %	40 %	40 %	20 %	523519811
21148	NC_021725	TGC	2	6	1346824	1346829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519811
21149	NC_021725	GGC	2	6	1346876	1346881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519811
21150	NC_021725	TGAA	2	8	1346896	1346903	50 %	25 %	25 %	0 %	523519811
21151	NC_021725	G	6	6	1346948	1346953	0 %	0 %	100 %	0 %	523519811
21152	NC_021725	AGC	2	6	1346968	1346973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519811
21153	NC_021725	GCG	2	6	1347024	1347029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519811
21154	NC_021725	ATT	2	6	1347150	1347155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519811
21155	NC_021725	GAGT	2	8	1347158	1347165	25 %	25 %	50 %	0 %	523519811
21156	NC_021725	ATC	3	9	1347352	1347360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519811
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21161	NC_021725	TGC	2	6	1347939	1347944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519812
21162	NC_021725	TGC	2	6	1347972	1347977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519812
21163	NC_021725	GTT	2	6	1348048	1348053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519812
21164	NC_021725	GACT	2	8	1348065	1348072	25 %	25 %	25 %	25 %	523519812
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21166	NC_021725	TGA	2	6	1348149	1348154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519812
21167	NC_021725	AT	3	6	1348248	1348253	50 %	50 %	0 %	0 %	523519812
21168	NC_021725	ATCG	2	8	1348348	1348355	25 %	25 %	25 %	25 %	523519812
21169	NC_021725	ATC	2	6	1348387	1348392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519812
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21172	NC_021725	TTC	2	6	1348624	1348629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519812
21173	NC_021725	CAC	2	6	1348659	1348664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519812
21174	NC_021725	GTT	2	6	1348819	1348824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519812
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21177	NC_021725	ATG	2	6	1349463	1349468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519814
21178	NC_021725	CGAT	2	8	1349473	1349480	25 %	25 %	25 %	25 %	523519814
21179	NC_021725	GCT	2	6	1349498	1349503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519814
21180	NC_021725	ATA	2	6	1349520	1349525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519814
21181	NC_021725	AACAT	2	10	1349615	1349624	60 %	20 %	0 %	20 %	523519814
21182	NC_021725	T	6	6	1349667	1349672	0 %	100 %	0 %	0 %	523519814
21183	NC_021725	ATAG	2	8	1349711	1349718	50 %	25 %	25 %	0 %	523519814
21184	NC_021725	ATG	2	6	1349765	1349770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519814
21185	NC_021725	GGT	2	6	1349821	1349826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519814
21186	NC_021725	CTTG	2	8	1349868	1349875	0 %	50 %	25 %	25 %	523519814
21187	NC_021725	T	6	6	1349940	1349945	0 %	100 %	0 %	0 %	523519814
21188	NC_021725	GCTG	2	8	1350076	1350083	0 %	25 %	50 %	25 %	523519814
21189	NC_021725	TA	3	6	1350100	1350105	50 %	50 %	0 %	0 %	523519814
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21196	NC_021725	TGG	2	6	1350447	1350452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519815
21197	NC_021725	ATG	2	6	1350631	1350636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519815
21198	NC_021725	CAC	2	6	1350730	1350735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519815
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21201	NC_021725	TG	3	6	1350900	1350905	0 %	50 %	50 %	0 %	523519815
21202	NC_021725	T	7	7	1350907	1350913	0 %	100 %	0 %	0 %	523519815
21203	NC_021725	GCT	2	6	1351010	1351015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519815
21204	NC_021725	CTG	2	6	1351018	1351023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519815
21205	NC_021725	ATC	2	6	1351129	1351134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519816
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21208	NC_021725	CGGTGA	2	12	1351229	1351240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523519816
21209	NC_021725	AT	3	6	1351306	1351311	50 %	50 %	0 %	0 %	523519816
21210	NC_021725	T	6	6	1351412	1351417	0 %	100 %	0 %	0 %	523519816
21211	NC_021725	T	6	6	1351491	1351496	0 %	100 %	0 %	0 %	523519817
21212	NC_021725	TGA	2	6	1351527	1351532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519817
21213	NC_021725	TGA	2	6	1351717	1351722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519817
21214	NC_021725	ATT	2	6	1351763	1351768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519817
21215	NC_021725	AAT	2	6	1351784	1351789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519817
21216	NC_021725	GTA	2	6	1351805	1351810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519817
21217	NC_021725	CATT	2	8	1352013	1352020	25 %	50 %	0 %	25 %	523519818
21218	NC_021725	CAA	2	6	1352030	1352035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519818
21219	NC_021725	TAT	2	6	1352097	1352102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519818
21220	NC_021725	GGTGGC	2	12	1352118	1352129	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523519818
21221	NC_021725	GGT	2	6	1352246	1352251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519818
21222	NC_021725	TGG	2	6	1352384	1352389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519818
21223	NC_021725	GTC	2	6	1352470	1352475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519818
21224	NC_021725	GTGCTG	2	12	1352476	1352487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	523519818
21225	NC_021725	TTA	2	6	1352524	1352529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519818
21226	NC_021725	AAT	2	6	1352554	1352559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519818
21227	NC_021725	TTCG	2	8	1352563	1352570	0 %	50 %	25 %	25 %	523519818
21228	NC_021725	TGC	2	6	1352580	1352585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519818
21229	NC_021725	CGG	2	6	1352590	1352595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519818
21230	NC_021725	ATG	2	6	1352614	1352619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519818
21231	NC_021725	AAT	2	6	1352620	1352625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519818
21232	NC_021725	CAA	2	6	1352701	1352706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519818
21233	NC_021725	ATT	2	6	1352786	1352791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519818
21234	NC_021725	ATT	2	6	1352803	1352808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519818
21235	NC_021725	TCG	2	6	1352861	1352866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519818
21236	NC_021725	CAA	2	6	1352926	1352931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519818
21237	NC_021725	CAG	2	6	1352935	1352940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519818
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21255	NC_021725	TGA	2	6	1353522	1353527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519818
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21325	NC_021725	GTT	2	6	1357330	1357335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519821
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21328	NC_021725	CAG	2	6	1357485	1357490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519822
21329	NC_021725	GCG	2	6	1357561	1357566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519822
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21331	NC_021725	TTACT	2	10	1357881	1357890	20 %	60 %	0 %	20 %	523519823
21332	NC_021725	GGTT	2	8	1358017	1358024	0 %	50 %	50 %	0 %	523519823
21333	NC_021725	TAT	2	6	1358283	1358288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519824
21334	NC_021725	CAA	2	6	1358392	1358397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519824
21335	NC_021725	TCA	2	6	1358537	1358542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519824
21336	NC_021725	GCTG	2	8	1358601	1358608	0 %	25 %	50 %	25 %	523519824
21337	NC_021725	CGC	2	6	1358629	1358634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519824
21338	NC_021725	TAT	2	6	1358659	1358664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519824
21339	NC_021725	TAA	2	6	1358688	1358693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519824
21340	NC_021725	GAT	2	6	1358911	1358916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519824
21341	NC_021725	TGC	2	6	1359113	1359118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519824
21342	NC_021725	TCA	2	6	1359161	1359166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519824
21343	NC_021725	TTC	2	6	1359181	1359186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519824
21344	NC_021725	TGA	2	6	1359290	1359295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519824
21345	NC_021725	TAG	2	6	1359350	1359355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519824
21346	NC_021725	GGT	2	6	1359615	1359620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519824
21347	NC_021725	GCA	2	6	1359736	1359741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519824
21348	NC_021725	AAG	2	6	1359773	1359778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519825
21349	NC_021725	GAA	2	6	1360082	1360087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519825
21350	NC_021725	TTGGC	2	10	1360122	1360131	0 %	40 %	40 %	20 %	523519825
21351	NC_021725	GGT	2	6	1360166	1360171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519825
21352	NC_021725	CAA	2	6	1360172	1360177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519825
21353	NC_021725	CG	3	6	1360196	1360201	0 %	0 %	50 %	50 %	523519825
21354	NC_021725	TGATG	2	10	1360216	1360225	20 %	40 %	40 %	0 %	523519825
21355	NC_021725	TGGT	2	8	1360263	1360270	0 %	50 %	50 %	0 %	523519825
21356	NC_021725	GTG	2	6	1360322	1360327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519825
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21372	NC_021725	ATT	2	6	1361396	1361401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519826
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21383	NC_021725	CGA	2	6	1361996	1362001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519826
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21424	NC_021725	CTT	3	9	1364220	1364228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519827
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21431	NC_021725	TGATTC	2	12	1364542	1364553	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523519827
21432	NC_021725	CGTCAG	2	12	1364580	1364591	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523519827
21433	NC_021725	GTG	2	6	1364648	1364653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519827
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21437	NC_021725	GCA	2	6	1364750	1364755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519828
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21445	NC_021725	AGT	2	6	1365128	1365133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519828
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21447	NC_021725	ATA	2	6	1365239	1365244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519828
21448	NC_021725	AGCTT	2	10	1365272	1365281	20 %	40 %	20 %	20 %	523519828
21449	NC_021725	CGT	2	6	1365537	1365542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519828
21450	NC_021725	AATC	2	8	1365594	1365601	50 %	25 %	0 %	25 %	523519828
21451	NC_021725	CCT	2	6	1365638	1365643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523519829
21452	NC_021725	CTT	2	6	1365815	1365820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519829
21453	NC_021725	TGGTG	2	10	1365828	1365837	0 %	40 %	60 %	0 %	523519829
21454	NC_021725	ATG	2	6	1365894	1365899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519829
21455	NC_021725	TAA	2	6	1366019	1366024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519829
21456	NC_021725	A	6	6	1366045	1366050	100 %	0 %	0 %	0 %	523519829
21457	NC_021725	GTG	2	6	1366066	1366071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519829
21458	NC_021725	AGC	2	6	1366116	1366121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519829
21459	NC_021725	GTTT	2	8	1366135	1366142	0 %	75 %	25 %	0 %	523519829
21460	NC_021725	ACTT	2	8	1366163	1366170	25 %	50 %	0 %	25 %	523519829
21461	NC_021725	GCT	2	6	1366240	1366245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519829
21462	NC_021725	CGA	2	6	1366264	1366269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519829
21463	NC_021725	TGT	2	6	1366327	1366332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519829
21464	NC_021725	TTC	2	6	1366362	1366367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519829
21465	NC_021725	GGT	2	6	1366728	1366733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519830
21466	NC_021725	CGG	2	6	1366736	1366741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519830
21467	NC_021725	GCA	2	6	1366750	1366755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519830
21468	NC_021725	TGA	2	6	1366769	1366774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519830
21469	NC_021725	GCT	2	6	1366866	1366871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519830
21470	NC_021725	TTA	2	6	1367074	1367079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519830
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21473	NC_021725	GTG	2	6	1367154	1367159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523519830
21474	NC_021725	TGC	2	6	1367180	1367185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519830
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21478	NC_021725	TTG	2	6	1367461	1367466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519830
21479	NC_021725	CCA	2	6	1367467	1367472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519830
21480	NC_021725	AGTACA	2	12	1367671	1367682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523519830
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21482	NC_021725	TGA	2	6	1367882	1367887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519830
21483	NC_021725	AAT	2	6	1367908	1367913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519830
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21485	NC_021725	T	7	7	1368183	1368189	0 %	100 %	0 %	0 %	523519831
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21489	NC_021725	TAT	2	6	1368424	1368429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519831
21490	NC_021725	TTG	2	6	1368463	1368468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519831
21491	NC_021725	GCG	2	6	1368521	1368526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519831
21492	NC_021725	ATG	2	6	1368547	1368552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519831
21493	NC_021725	TAC	2	6	1368598	1368603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519831
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21495	NC_021725	AGT	2	6	1368775	1368780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519831
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