MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 47101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_021725	CA	3	6	1149948	1149953	50 %	0 %	0 %	50 %	523519606
18003	NC_021725	GGC	2	6	1149957	1149962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519606
18004	NC_021725	CTT	2	6	1150025	1150030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519606
18005	NC_021725	AAG	2	6	1150104	1150109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519606
18006	NC_021725	GTC	2	6	1150129	1150134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519606
18007	NC_021725	ACGC	2	8	1150165	1150172	25 %	0 %	25 %	50 %	523519606
18008	NC_021725	GTCA	2	8	1150262	1150269	25 %	25 %	25 %	25 %	523519607
18009	NC_021725	T	7	7	1150294	1150300	0 %	100 %	0 %	0 %	523519607
18010	NC_021725	TTG	2	6	1150330	1150335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519607
18011	NC_021725	AGC	2	6	1150351	1150356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519607
18012	NC_021725	GATT	2	8	1150520	1150527	25 %	50 %	25 %	0 %	523519608
18013	NC_021725	AAT	2	6	1150547	1150552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519608
18014	NC_021725	GCG	2	6	1150558	1150563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519608
18015	NC_021725	AAG	2	6	1150569	1150574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519608
18016	NC_021725	GAT	2	6	1150655	1150660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519608
18017	NC_021725	TTG	2	6	1150668	1150673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519608
18018	NC_021725	TGA	2	6	1150747	1150752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519608
18019	NC_021725	CTG	2	6	1150754	1150759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519608
18020	NC_021725	TAA	2	6	1150801	1150806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519608
18021	NC_021725	AATG	2	8	1151182	1151189	50 %	25 %	25 %	0 %	523519609
18022	NC_021725	TTTG	2	8	1151293	1151300	0 %	75 %	25 %	0 %	523519609
18023	NC_021725	ATA	2	6	1151303	1151308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519609
18024	NC_021725	TTA	2	6	1151382	1151387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519609
18025	NC_021725	TA	3	6	1151428	1151433	50 %	50 %	0 %	0 %	523519609
18026	NC_021725	CCAT	2	8	1151435	1151442	25 %	25 %	0 %	50 %	523519609
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18028	NC_021725	TGAG	2	8	1151509	1151516	25 %	25 %	50 %	0 %	523519609
18029	NC_021725	T	6	6	1151607	1151612	0 %	100 %	0 %	0 %	523519609
18030	NC_021725	GTT	2	6	1151627	1151632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519609
18031	NC_021725	CTG	2	6	1151698	1151703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519609
18032	NC_021725	GCTTG	2	10	1151723	1151732	0 %	40 %	40 %	20 %	523519609
18033	NC_021725	CTT	2	6	1151764	1151769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519609
18034	NC_021725	CTG	2	6	1151799	1151804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519609
18035	NC_021725	TTA	3	9	1151820	1151828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519609
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18037	NC_021725	TA	3	6	1152111	1152116	50 %	50 %	0 %	0 %	523519610
18038	NC_021725	TTG	2	6	1152129	1152134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519610
18039	NC_021725	TGC	2	6	1152140	1152145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519610
18040	NC_021725	TGT	2	6	1152164	1152169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519610
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18042	NC_021725	GGCTGC	2	12	1152202	1152213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523519610
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18046	NC_021725	GCA	2	6	1152302	1152307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519610
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18050	NC_021725	T	8	8	1152407	1152414	0 %	100 %	0 %	0 %	523519610
18051	NC_021725	GT	3	6	1152442	1152447	0 %	50 %	50 %	0 %	523519610
18052	NC_021725	T	6	6	1152447	1152452	0 %	100 %	0 %	0 %	523519610
18053	NC_021725	CAG	2	6	1152460	1152465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519610
18054	NC_021725	AAC	2	6	1152496	1152501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519610
18055	NC_021725	ATA	2	6	1152569	1152574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519610
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18057	NC_021725	TCGTT	2	10	1152601	1152610	0 %	60 %	20 %	20 %	523519610
18058	NC_021725	CCCA	2	8	1152658	1152665	25 %	0 %	0 %	75 %	523519610
18059	NC_021725	CAC	2	6	1152840	1152845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519611
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18061	NC_021725	GTTC	2	8	1152895	1152902	0 %	50 %	25 %	25 %	523519611
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18063	NC_021725	CCTT	2	8	1153057	1153064	0 %	50 %	0 %	50 %	523519611
18064	NC_021725	TCA	2	6	1153091	1153096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519611
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18067	NC_021725	AAGT	2	8	1153237	1153244	50 %	25 %	25 %	0 %	523519611
18068	NC_021725	GC	3	6	1153316	1153321	0 %	0 %	50 %	50 %	523519611
18069	NC_021725	GC	3	6	1153533	1153538	0 %	0 %	50 %	50 %	523519611
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18077	NC_021725	GTTTG	2	10	1153889	1153898	0 %	60 %	40 %	0 %	523519611
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18082	NC_021725	TGA	2	6	1154903	1154908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519612
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18089	NC_021725	TGT	2	6	1155332	1155337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519612
18090	NC_021725	TCAA	2	8	1155349	1155356	50 %	25 %	0 %	25 %	523519612
18091	NC_021725	AAC	2	6	1155360	1155365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519612
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18096	NC_021725	AC	3	6	1155670	1155675	50 %	0 %	0 %	50 %	523519613
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18099	NC_021725	TGA	2	6	1155780	1155785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519613
18100	NC_021725	TGC	2	6	1155786	1155791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519613
18101	NC_021725	TGC	2	6	1155810	1155815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519613
18102	NC_021725	TCAG	2	8	1155909	1155916	25 %	25 %	25 %	25 %	523519613
18103	NC_021725	GATT	3	12	1156718	1156729	25 %	50 %	25 %	0 %	523519614
18104	NC_021725	GCT	2	6	1156744	1156749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519614
18105	NC_021725	TGA	2	6	1156787	1156792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519614
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18107	NC_021725	TGA	2	6	1156827	1156832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519614
18108	NC_021725	GTA	2	6	1156833	1156838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519614
18109	NC_021725	TGA	2	6	1156888	1156893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519615
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18112	NC_021725	ATA	2	6	1157032	1157037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519615
18113	NC_021725	ACA	2	6	1158068	1158073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519616
18114	NC_021725	AGA	2	6	1158819	1158824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519617
18115	NC_021725	AAG	2	6	1158851	1158856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519617
18116	NC_021725	GAA	2	6	1159138	1159143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519618
18117	NC_021725	TTTG	2	8	1159210	1159217	0 %	75 %	25 %	0 %	523519618
18118	NC_021725	GAAA	2	8	1159264	1159271	75 %	0 %	25 %	0 %	523519618
18119	NC_021725	A	7	7	1159269	1159275	100 %	0 %	0 %	0 %	523519618
18120	NC_021725	TCC	2	6	1159728	1159733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523519619
18121	NC_021725	GCA	2	6	1159806	1159811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519619
18122	NC_021725	GAA	2	6	1159849	1159854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519619
18123	NC_021725	CAT	2	6	1160198	1160203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519620
18124	NC_021725	GTT	2	6	1160237	1160242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519620
18125	NC_021725	TCA	2	6	1160306	1160311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519620
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18127	NC_021725	CGG	2	6	1160442	1160447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523519621
18128	NC_021725	CAA	2	6	1160476	1160481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519621
18129	NC_021725	GAT	2	6	1160504	1160509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519621
18130	NC_021725	GCC	2	6	1160546	1160551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519621
18131	NC_021725	GAA	2	6	1160708	1160713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519621
18132	NC_021725	TGA	2	6	1160731	1160736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519621
18133	NC_021725	AGAAA	2	10	1160742	1160751	80 %	0 %	20 %	0 %	523519621
18134	NC_021725	CCA	2	6	1160755	1160760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519621
18135	NC_021725	GATA	2	8	1160782	1160789	50 %	25 %	25 %	0 %	523519621
18136	NC_021725	A	6	6	1160969	1160974	100 %	0 %	0 %	0 %	523519621
18137	NC_021725	GTT	2	6	1160979	1160984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519621
18138	NC_021725	TGC	2	6	1160999	1161004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519621
18139	NC_021725	TGC	2	6	1161026	1161031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519621
18140	NC_021725	CTT	2	6	1161037	1161042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519621
18141	NC_021725	GCTG	2	8	1161069	1161076	0 %	25 %	50 %	25 %	523519621
18142	NC_021725	A	6	6	1161098	1161103	100 %	0 %	0 %	0 %	523519621
18143	NC_021725	ACA	2	6	1161183	1161188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519621
18144	NC_021725	GA	3	6	1161260	1161265	50 %	0 %	50 %	0 %	523519621
18145	NC_021725	AGT	2	6	1161303	1161308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519621
18146	NC_021725	GCCA	2	8	1161309	1161316	25 %	0 %	25 %	50 %	523519621
18147	NC_021725	CCAT	2	8	1161332	1161339	25 %	25 %	0 %	50 %	523519621
18148	NC_021725	GCCG	2	8	1161424	1161431	0 %	0 %	50 %	50 %	523519621
18149	NC_021725	CAA	2	6	1161433	1161438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519621
18150	NC_021725	TGAGT	2	10	1161461	1161470	20 %	40 %	40 %	0 %	523519621
18151	NC_021725	TAAA	2	8	1161518	1161525	75 %	25 %	0 %	0 %	523519621
18152	NC_021725	TAC	2	6	1161559	1161564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519621
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18154	NC_021725	TGAA	2	8	1162278	1162285	50 %	25 %	25 %	0 %	523519622
18155	NC_021725	GCCA	2	8	1162449	1162456	25 %	0 %	25 %	50 %	523519622
18156	NC_021725	CAT	2	6	1162558	1162563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519622
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18162	NC_021725	TTG	2	6	1162883	1162888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519622
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18173	NC_021725	TGA	2	6	1164560	1164565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519623
18174	NC_021725	A	6	6	1164585	1164590	100 %	0 %	0 %	0 %	523519623
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18176	NC_021725	ATTAA	2	10	1164605	1164614	60 %	40 %	0 %	0 %	523519623
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18182	NC_021725	CAA	2	6	1165380	1165385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519625
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18185	NC_021725	GTC	2	6	1165500	1165505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519625
18186	NC_021725	TCAAA	2	10	1165622	1165631	60 %	20 %	0 %	20 %	523519625
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18189	NC_021725	TGC	2	6	1166128	1166133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519626
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18201	NC_021725	TTA	2	6	1166537	1166542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519626
18202	NC_021725	GTT	2	6	1166590	1166595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519626
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18204	NC_021725	TGAC	2	8	1166625	1166632	25 %	25 %	25 %	25 %	523519626
18205	NC_021725	ATG	2	6	1166694	1166699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519626
18206	NC_021725	ATC	2	6	1166715	1166720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519626
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18208	NC_021725	GTTA	2	8	1166778	1166785	25 %	50 %	25 %	0 %	523519626
18209	NC_021725	T	7	7	1167201	1167207	0 %	100 %	0 %	0 %	523519627
18210	NC_021725	ATT	2	6	1167298	1167303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519627
18211	NC_021725	TAT	2	6	1167331	1167336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519627
18212	NC_021725	GAT	2	6	1167346	1167351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519627
18213	NC_021725	TTTATT	2	12	1167362	1167373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	523519627
18214	NC_021725	ATT	2	6	1167405	1167410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519627
18215	NC_021725	ACA	2	6	1167411	1167416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519627
18216	NC_021725	TGA	2	6	1167419	1167424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519627
18217	NC_021725	CAT	2	6	1167430	1167435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519627
18218	NC_021725	TTTG	2	8	1167441	1167448	0 %	75 %	25 %	0 %	523519627
18219	NC_021725	T	6	6	1167463	1167468	0 %	100 %	0 %	0 %	523519627
18220	NC_021725	CTCA	2	8	1167487	1167494	25 %	25 %	0 %	50 %	523519627
18221	NC_021725	TGC	2	6	1167504	1167509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519627
18222	NC_021725	T	7	7	1167524	1167530	0 %	100 %	0 %	0 %	523519627
18223	NC_021725	CCA	2	6	1167551	1167556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523519627
18224	NC_021725	GAT	2	6	1167664	1167669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519627
18225	NC_021725	TTA	2	6	1167723	1167728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519627
18226	NC_021725	TCA	2	6	1167786	1167791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519627
18227	NC_021725	CAG	2	6	1167832	1167837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523519627
18228	NC_021725	A	6	6	1167913	1167918	100 %	0 %	0 %	0 %	523519628
18229	NC_021725	ATT	2	6	1167952	1167957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519628
18230	NC_021725	TAA	2	6	1168015	1168020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523519628
18231	NC_021725	TCTT	2	8	1168116	1168123	0 %	75 %	0 %	25 %	523519628
18232	NC_021725	TCA	2	6	1168182	1168187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519628
18233	NC_021725	AAC	2	6	1168240	1168245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523519628
18234	NC_021725	GAT	3	9	1168276	1168284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519628
18235	NC_021725	ATG	2	6	1168292	1168297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519628
18236	NC_021725	ATT	2	6	1168387	1168392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519628
18237	NC_021725	TCA	2	6	1168407	1168412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519628
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18246	NC_021725	ATG	2	6	1168754	1168759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519628
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18340	NC_021725	GCT	2	6	1173914	1173919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519632
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18343	NC_021725	TGGT	2	8	1173985	1173992	0 %	50 %	50 %	0 %	523519632
18344	NC_021725	ATC	2	6	1174012	1174017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519632
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18464	NC_021725	TCA	2	6	1181425	1181430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523519639
18465	NC_021725	AAG	2	6	1181482	1181487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519639
18466	NC_021725	ACTG	2	8	1181495	1181502	25 %	25 %	25 %	25 %	523519639
18467	NC_021725	ATAG	2	8	1181519	1181526	50 %	25 %	25 %	0 %	523519639
18468	NC_021725	ATCGAA	2	12	1181719	1181730	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523519640
18469	NC_021725	AAG	2	6	1181770	1181775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523519640
18470	NC_021725	TTC	2	6	1181792	1181797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523519640
18471	NC_021725	CTG	2	6	1181840	1181845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519640
18472	NC_021725	GTAT	2	8	1181864	1181871	25 %	50 %	25 %	0 %	523519640
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18474	NC_021725	TGATC	2	10	1181937	1181946	20 %	40 %	20 %	20 %	523519640
18475	NC_021725	TTG	2	6	1181948	1181953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519640
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18481	NC_021725	TGA	2	6	1182444	1182449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519641
18482	NC_021725	CGC	2	6	1182464	1182469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519641
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18484	NC_021725	GAAC	2	8	1182493	1182500	50 %	0 %	25 %	25 %	523519642
18485	NC_021725	GCAAA	2	10	1182629	1182638	60 %	0 %	20 %	20 %	523519642
18486	NC_021725	TTCATT	2	12	1182743	1182754	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	523519642
18487	NC_021725	GTT	2	6	1182769	1182774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519642
18488	NC_021725	TTCG	2	8	1182807	1182814	0 %	50 %	25 %	25 %	523519642
18489	NC_021725	ATT	2	6	1182873	1182878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519642
18490	NC_021725	TTA	2	6	1182978	1182983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519642
18491	NC_021725	AGTTTT	2	12	1183024	1183035	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	523519642
18492	NC_021725	GCTT	2	8	1183048	1183055	0 %	50 %	25 %	25 %	523519642
18493	NC_021725	CTTG	2	8	1183090	1183097	0 %	50 %	25 %	25 %	523519642
18494	NC_021725	GTA	2	6	1183131	1183136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523519642
18495	NC_021725	CA	3	6	1183179	1183184	50 %	0 %	0 %	50 %	523519642
18496	NC_021725	TAAT	2	8	1183199	1183206	50 %	50 %	0 %	0 %	523519642
18497	NC_021725	CGC	2	6	1183247	1183252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523519643
18498	NC_021725	GCT	2	6	1183260	1183265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523519643
18499	NC_021725	ATT	2	6	1183395	1183400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523519643
18500	NC_021725	TGT	2	6	1183403	1183408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523519643

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