MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK908

Total Repeats: 47101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021725	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518465
2	NC_021725	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518465
3	NC_021725	GCATCA	2	12	267	278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523518465
4	NC_021725	CGATGA	2	12	285	296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523518465
5	NC_021725	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518465
6	NC_021725	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518465
7	NC_021725	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	523518465
8	NC_021725	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518465
9	NC_021725	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518465
10	NC_021725	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	523518465
11	NC_021725	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	523518465
12	NC_021725	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518465
13	NC_021725	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
14	NC_021725	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
15	NC_021725	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518465
16	NC_021725	GCCT	2	8	746	753	0 %	25 %	25 %	50 %	523518465
17	NC_021725	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518465
18	NC_021725	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
19	NC_021725	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518465
20	NC_021725	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518465
21	NC_021725	GA	3	6	1184	1189	50 %	0 %	50 %	0 %	523518465
22	NC_021725	A	6	6	1265	1270	100 %	0 %	0 %	0 %	523518465
23	NC_021725	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518465
24	NC_021725	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518466
25	NC_021725	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518466
26	NC_021725	GC	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	523518466
27	NC_021725	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518466
28	NC_021725	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518466
29	NC_021725	CGTTGC	2	12	2042	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518466
30	NC_021725	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518466
31	NC_021725	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518466
32	NC_021725	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518466
33	NC_021725	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518466
34	NC_021725	CGT	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518466
35	NC_021725	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518466
36	NC_021725	CAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518466
37	NC_021725	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518467
38	NC_021725	ATG	2	6	2878	2883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518467
39	NC_021725	ATAG	2	8	2895	2902	50 %	25 %	25 %	0 %	523518467
40	NC_021725	CGA	3	9	3521	3529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518468
41	NC_021725	CAC	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518468
42	NC_021725	TGAT	2	8	3593	3600	25 %	50 %	25 %	0 %	523518468
43	NC_021725	GCG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518468
44	NC_021725	CGT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518468
45	NC_021725	GAT	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518468
46	NC_021725	A	6	6	3761	3766	100 %	0 %	0 %	0 %	523518469
47	NC_021725	GCAAG	2	10	3836	3845	40 %	0 %	40 %	20 %	523518469
48	NC_021725	GC	3	6	3882	3887	0 %	0 %	50 %	50 %	523518469
49	NC_021725	CAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518469
50	NC_021725	GC	3	6	3939	3944	0 %	0 %	50 %	50 %	523518469
51	NC_021725	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518469
52	NC_021725	TCA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518469
53	NC_021725	GATCG	2	10	4026	4035	20 %	20 %	40 %	20 %	523518469
54	NC_021725	TTTG	2	8	4079	4086	0 %	75 %	25 %	0 %	523518469
55	NC_021725	CGG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518469
56	NC_021725	GGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518469
57	NC_021725	TGC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518469
58	NC_021725	TGC	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518469
59	NC_021725	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518469
60	NC_021725	AGC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518469
61	NC_021725	GAT	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518469
62	NC_021725	CAG	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518469
63	NC_021725	CAC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518469
64	NC_021725	GAC	3	9	4763	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518469
65	NC_021725	ATC	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518469
66	NC_021725	AAGA	2	8	4897	4904	75 %	0 %	25 %	0 %	523518470
67	NC_021725	GAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
68	NC_021725	AAGA	2	8	4918	4925	75 %	0 %	25 %	0 %	523518470
69	NC_021725	GCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518470
70	NC_021725	ATG	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
71	NC_021725	CAT	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518470
72	NC_021725	TTGAAG	2	12	5102	5113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
73	NC_021725	GTC	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518470
74	NC_021725	GGT	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518470
75	NC_021725	TGGCGG	2	12	5238	5249	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523518470
76	NC_021725	CGG	2	6	5262	5267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
77	NC_021725	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
78	NC_021725	CGG	2	6	5334	5339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
79	NC_021725	GAGCAT	2	12	5410	5421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523518470
80	NC_021725	CCGGAT	2	12	5443	5454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523518470
81	NC_021725	TGA	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
82	NC_021725	GCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
83	NC_021725	GGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
84	NC_021725	GAA	3	9	5628	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
85	NC_021725	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518470
86	NC_021725	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
87	NC_021725	GTT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
88	NC_021725	AGACCA	2	12	5942	5953	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	523518470
89	NC_021725	GGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518470
90	NC_021725	CAA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518470
91	NC_021725	ATT	2	6	6049	6054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518470
92	NC_021725	GCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518470
93	NC_021725	AAG	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
94	NC_021725	ACA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518470
95	NC_021725	GGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
96	NC_021725	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
97	NC_021725	ATC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518470
98	NC_021725	CCGATG	2	12	6425	6436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523518470
99	NC_021725	GTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
100	NC_021725	ATG	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518470
101	NC_021725	GCC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518470
102	NC_021725	GCCA	2	8	6667	6674	25 %	0 %	25 %	50 %	523518470
103	NC_021725	ACC	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518470
104	NC_021725	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518470
105	NC_021725	GAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518470
106	NC_021725	TTG	2	6	6821	6826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518470
107	NC_021725	AAC	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518470
108	NC_021725	GAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
109	NC_021725	ACGT	2	8	7021	7028	25 %	25 %	25 %	25 %	523518471
110	NC_021725	ATGA	2	8	7068	7075	50 %	25 %	25 %	0 %	523518471
111	NC_021725	AAG	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518471
112	NC_021725	TCG	2	6	7120	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518471
113	NC_021725	TGACGG	2	12	7250	7261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523518471
114	NC_021725	GCG	3	9	7263	7271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518471
115	NC_021725	CAA	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518471
116	NC_021725	GATT	2	8	7340	7347	25 %	50 %	25 %	0 %	523518471
117	NC_021725	GTT	2	6	7383	7388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518471
118	NC_021725	GC	3	6	7395	7400	0 %	0 %	50 %	50 %	523518471
119	NC_021725	CTG	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518471
120	NC_021725	ACC	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518471
121	NC_021725	CCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518471
122	NC_021725	ATC	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518471
123	NC_021725	CCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518471
124	NC_021725	CCG	2	6	7528	7533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518471
125	NC_021725	GGT	2	6	7572	7577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
126	NC_021725	TTA	2	6	7690	7695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518471
127	NC_021725	CAA	2	6	7715	7720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518471
128	NC_021725	TGG	2	6	7729	7734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
129	NC_021725	GAAAA	2	10	7758	7767	80 %	0 %	20 %	0 %	523518471
130	NC_021725	TGA	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
131	NC_021725	CCG	2	6	7832	7837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518471
132	NC_021725	AAT	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518471
133	NC_021725	TGG	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
134	NC_021725	CGG	3	9	7998	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518471
135	NC_021725	GAA	2	6	8021	8026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518471
136	NC_021725	TGA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
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138	NC_021725	ATT	2	6	8310	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518471
139	NC_021725	ATG	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
140	NC_021725	CTG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518471
141	NC_021725	TGAAGA	2	12	8396	8407	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	523518471
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143	NC_021725	GGT	2	6	8499	8504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518471
144	NC_021725	GAT	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518471
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152	NC_021725	GCA	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
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154	NC_021725	CGG	2	6	9113	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518471
155	NC_021725	GAA	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518471
156	NC_021725	CGA	2	6	9296	9301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
157	NC_021725	CGA	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
158	NC_021725	GAC	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518471
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165	NC_021725	GACC	2	8	10548	10555	25 %	0 %	25 %	50 %	523518472
166	NC_021725	CGA	2	6	10566	10571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518472
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248	NC_021725	CAA	2	6	16716	16721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518481
249	NC_021725	GTA	2	6	16750	16755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518481
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251	NC_021725	GTG	2	6	16772	16777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518481
252	NC_021725	TGAA	2	8	16814	16821	50 %	25 %	25 %	0 %	523518481
253	NC_021725	GTC	2	6	16897	16902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518481
254	NC_021725	AGC	2	6	16937	16942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518481
255	NC_021725	TTTG	2	8	17019	17026	0 %	75 %	25 %	0 %	523518481
256	NC_021725	TCAA	2	8	17039	17046	50 %	25 %	0 %	25 %	523518481
257	NC_021725	CAT	2	6	17052	17057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518481
258	NC_021725	TCGG	2	8	17625	17632	0 %	25 %	50 %	25 %	523518482
259	NC_021725	TCT	3	9	17655	17663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518482
260	NC_021725	TTC	2	6	17792	17797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518482
261	NC_021725	CAT	2	6	17809	17814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518482
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263	NC_021725	ATT	2	6	17912	17917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518482
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265	NC_021725	CGG	2	6	18058	18063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518482
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294	NC_021725	A	6	6	19485	19490	100 %	0 %	0 %	0 %	523518483
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375	NC_021725	CAT	2	6	25123	25128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518489
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378	NC_021725	GCTG	2	8	25406	25413	0 %	25 %	50 %	25 %	523518489
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381	NC_021725	TAA	2	6	25595	25600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518489
382	NC_021725	CTT	2	6	25660	25665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518489
383	NC_021725	T	6	6	25709	25714	0 %	100 %	0 %	0 %	523518489
384	NC_021725	TTGT	2	8	26492	26499	0 %	75 %	25 %	0 %	523518490
385	NC_021725	GAT	2	6	26517	26522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518490
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387	NC_021725	GAT	2	6	26550	26555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518490
388	NC_021725	GATTGC	2	12	26607	26618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	523518490
389	NC_021725	GTTG	2	8	26621	26628	0 %	50 %	50 %	0 %	523518490
390	NC_021725	TTA	2	6	26662	26667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518490
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393	NC_021725	CTG	2	6	26693	26698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518490
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489	NC_021725	TGG	2	6	32155	32160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518494
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495	NC_021725	GATT	2	8	32602	32609	25 %	50 %	25 %	0 %	523518494
496	NC_021725	T	6	6	32617	32622	0 %	100 %	0 %	0 %	523518494
497	NC_021725	ACA	2	6	32640	32645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518494
498	NC_021725	TGAC	2	8	32704	32711	25 %	25 %	25 %	25 %	523518494
499	NC_021725	AGT	2	6	32744	32749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518494
500	NC_021725	ATA	2	6	32859	32864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518494

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