MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_021723	GCT	2	6	2541761	2541766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518084
40003	NC_021723	CAA	2	6	2541781	2541786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518084
40004	NC_021723	GTT	3	9	2541885	2541893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518084
40005	NC_021723	AAC	2	6	2541908	2541913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518084
40006	NC_021723	ACC	2	6	2541989	2541994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518084
40007	NC_021723	AGC	2	6	2541999	2542004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518084
40008	NC_021723	GGAA	2	8	2542084	2542091	50 %	0 %	50 %	0 %	523518084
40009	NC_021723	TCA	2	6	2542169	2542174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518084
40010	NC_021723	A	7	7	2542174	2542180	100 %	0 %	0 %	0 %	523518084
40011	NC_021723	CTG	2	6	2542470	2542475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518085
40012	NC_021723	ACA	2	6	2542509	2542514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518085
40013	NC_021723	GAA	2	6	2542555	2542560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518085
40014	NC_021723	TGCAGC	2	12	2542567	2542578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523518085
40015	NC_021723	TTG	2	6	2542605	2542610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518085
40016	NC_021723	GAA	2	6	2542631	2542636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518085
40017	NC_021723	GCCT	2	8	2542680	2542687	0 %	25 %	25 %	50 %	523518085
40018	NC_021723	TGAT	2	8	2542779	2542786	25 %	50 %	25 %	0 %	523518085
40019	NC_021723	GGC	2	6	2542817	2542822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518085
40020	NC_021723	TTG	2	6	2542893	2542898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518085
40021	NC_021723	AAAGC	2	10	2543000	2543009	60 %	0 %	20 %	20 %	523518085
40022	NC_021723	TTG	2	6	2543100	2543105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518085
40023	NC_021723	GAA	2	6	2543147	2543152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518085
40024	NC_021723	TAC	2	6	2543162	2543167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518085
40025	NC_021723	GAA	2	6	2543240	2543245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518085
40026	NC_021723	TGC	2	6	2543329	2543334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518085
40027	NC_021723	ATCG	2	8	2543387	2543394	25 %	25 %	25 %	25 %	523518085
40028	NC_021723	GACA	2	8	2543431	2543438	50 %	0 %	25 %	25 %	523518085
40029	NC_021723	T	6	6	2543502	2543507	0 %	100 %	0 %	0 %	523518086
40030	NC_021723	GTGAGC	2	12	2543513	2543524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523518086
40031	NC_021723	CAA	2	6	2543771	2543776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518087
40032	NC_021723	GC	3	6	2543975	2543980	0 %	0 %	50 %	50 %	523518087
40033	NC_021723	CATT	2	8	2544118	2544125	25 %	50 %	0 %	25 %	523518087
40034	NC_021723	ATG	2	6	2544138	2544143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518087
40035	NC_021723	GAC	2	6	2544218	2544223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518087
40036	NC_021723	CA	3	6	2544343	2544348	50 %	0 %	0 %	50 %	523518087
40037	NC_021723	TGG	2	6	2544361	2544366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518087
40038	NC_021723	AGCAA	2	10	2544395	2544404	60 %	0 %	20 %	20 %	523518087
40039	NC_021723	TCC	2	6	2544410	2544415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523518087
40040	NC_021723	CT	3	6	2544584	2544589	0 %	50 %	0 %	50 %	523518087
40041	NC_021723	TGA	2	6	2544787	2544792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518088
40042	NC_021723	AGC	2	6	2544796	2544801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518088
40043	NC_021723	GGC	2	6	2544865	2544870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518088
40044	NC_021723	CTG	2	6	2544917	2544922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518088
40045	NC_021723	A	7	7	2544971	2544977	100 %	0 %	0 %	0 %	523518088
40046	NC_021723	ATC	2	6	2545215	2545220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518088
40047	NC_021723	A	7	7	2545239	2545245	100 %	0 %	0 %	0 %	523518088
40048	NC_021723	CAC	2	6	2545384	2545389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518088
40049	NC_021723	CAG	2	6	2545406	2545411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518088
40050	NC_021723	TTC	2	6	2545433	2545438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518088
40051	NC_021723	TGG	2	6	2545530	2545535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518089
40052	NC_021723	TCA	2	6	2545579	2545584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518089
40053	NC_021723	TATCG	2	10	2545589	2545598	20 %	40 %	20 %	20 %	523518089
40054	NC_021723	TGG	2	6	2545608	2545613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523518089
40055	NC_021723	GCTT	2	8	2545639	2545646	0 %	50 %	25 %	25 %	523518089
40056	NC_021723	GCAG	2	8	2545665	2545672	25 %	0 %	50 %	25 %	523518089
40057	NC_021723	ATG	2	6	2545743	2545748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518089
40058	NC_021723	AGA	2	6	2545760	2545765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518089
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40062	NC_021723	CG	3	6	2545865	2545870	0 %	0 %	50 %	50 %	523518089
40063	NC_021723	TTG	2	6	2546047	2546052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518089
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40066	NC_021723	CGGC	2	8	2546181	2546188	0 %	0 %	50 %	50 %	523518089
40067	NC_021723	ATG	2	6	2546278	2546283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518089
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40089	NC_021723	ACCATT	2	12	2547650	2547661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518090
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40096	NC_021723	GCC	2	6	2547986	2547991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518090
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40098	NC_021723	ACCA	2	8	2548209	2548216	50 %	0 %	0 %	50 %	523518090
40099	NC_021723	AGG	2	6	2548224	2548229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523518090
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40101	NC_021723	CCA	2	6	2548316	2548321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518091
40102	NC_021723	CTT	2	6	2548397	2548402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518091
40103	NC_021723	GCA	2	6	2548424	2548429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518091
40104	NC_021723	GGC	2	6	2548464	2548469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518091
40105	NC_021723	TTGC	2	8	2548473	2548480	0 %	50 %	25 %	25 %	523518091
40106	NC_021723	GCT	2	6	2548580	2548585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518091
40107	NC_021723	ATCAC	2	10	2548671	2548680	40 %	20 %	0 %	40 %	523518091
40108	NC_021723	CTT	2	6	2548703	2548708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518091
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40111	NC_021723	GTGG	2	8	2548845	2548852	0 %	25 %	75 %	0 %	523518091
40112	NC_021723	TCA	2	6	2548862	2548867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518091
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40116	NC_021723	AAG	2	6	2549230	2549235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523518091
40117	NC_021723	TGAT	2	8	2549254	2549261	25 %	50 %	25 %	0 %	523518091
40118	NC_021723	ATG	2	6	2549365	2549370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518091
40119	NC_021723	GTCG	2	8	2549454	2549461	0 %	25 %	50 %	25 %	523518091
40120	NC_021723	AAC	2	6	2549477	2549482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518091
40121	NC_021723	TCA	2	6	2549527	2549532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518091
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40124	NC_021723	CGG	2	6	2549783	2549788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518091
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40128	NC_021723	TAC	2	6	2550081	2550086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518091
40129	NC_021723	A	6	6	2550114	2550119	100 %	0 %	0 %	0 %	523518091
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40133	NC_021723	GCTAT	2	10	2550728	2550737	20 %	40 %	20 %	20 %	523518093
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40137	NC_021723	CGC	2	6	2550900	2550905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518093
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40139	NC_021723	GCA	2	6	2550919	2550924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518093
40140	NC_021723	TTC	2	6	2550950	2550955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518093
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40143	NC_021723	AACC	2	8	2551087	2551094	50 %	0 %	0 %	50 %	523518094
40144	NC_021723	TCT	2	6	2551138	2551143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518094
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40146	NC_021723	GCT	2	6	2551443	2551448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518094
40147	NC_021723	CTT	3	9	2551489	2551497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518094
40148	NC_021723	CGA	2	6	2551534	2551539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518094
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40151	NC_021723	TCTT	2	8	2551713	2551720	0 %	75 %	0 %	25 %	523518094
40152	NC_021723	TCA	2	6	2551755	2551760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518094
40153	NC_021723	AT	3	6	2551761	2551766	50 %	50 %	0 %	0 %	523518094
40154	NC_021723	CTGC	2	8	2551855	2551862	0 %	25 %	25 %	50 %	523518094
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40157	NC_021723	CG	3	6	2552051	2552056	0 %	0 %	50 %	50 %	523518094
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40163	NC_021723	TGC	2	6	2552308	2552313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518094
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40201	NC_021723	CCA	2	6	2555215	2555220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518098
40202	NC_021723	CCA	2	6	2555245	2555250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518098
40203	NC_021723	TTGCG	2	10	2555255	2555264	0 %	40 %	40 %	20 %	523518098
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40213	NC_021723	CAG	2	6	2555619	2555624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518099
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40217	NC_021723	GAT	2	6	2555781	2555786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518099
40218	NC_021723	TCC	2	6	2555797	2555802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523518099
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40220	NC_021723	GATT	2	8	2555897	2555904	25 %	50 %	25 %	0 %	523518099
40221	NC_021723	AAC	2	6	2555905	2555910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518099
40222	NC_021723	T	6	6	2555946	2555951	0 %	100 %	0 %	0 %	523518099
40223	NC_021723	ATG	2	6	2556143	2556148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518100
40224	NC_021723	AAC	2	6	2556208	2556213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518100
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40228	NC_021723	CGC	2	6	2556394	2556399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518100
40229	NC_021723	GTT	2	6	2556448	2556453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518100
40230	NC_021723	CG	3	6	2556553	2556558	0 %	0 %	50 %	50 %	523518100
40231	NC_021723	GGTGCC	2	12	2556583	2556594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523518100
40232	NC_021723	AAT	2	6	2556595	2556600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518100
40233	NC_021723	ACA	2	6	2556800	2556805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518100
40234	NC_021723	CCA	2	6	2556863	2556868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518100
40235	NC_021723	TGT	2	6	2556970	2556975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518100
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40237	NC_021723	AGTTT	2	10	2557042	2557051	20 %	60 %	20 %	0 %	523518101
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40239	NC_021723	CAA	2	6	2557167	2557172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518101
40240	NC_021723	GAT	3	9	2557177	2557185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518101
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40244	NC_021723	TGA	3	9	2557457	2557465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518101
40245	NC_021723	CGC	2	6	2557518	2557523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518101
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40252	NC_021723	CTG	2	6	2557945	2557950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518102
40253	NC_021723	CTG	2	6	2558000	2558005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518102
40254	NC_021723	CGC	2	6	2558117	2558122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518102
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40256	NC_021723	TGT	2	6	2558167	2558172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518102
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40261	NC_021723	CTT	2	6	2558706	2558711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518103
40262	NC_021723	GTT	2	6	2558780	2558785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518104
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40264	NC_021723	GTT	2	6	2558812	2558817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523518104
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40268	NC_021723	TGCCA	2	10	2559319	2559328	20 %	20 %	20 %	40 %	523518104
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40300	NC_021723	TTA	2	6	2560974	2560979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518107
40301	NC_021723	ATT	2	6	2560994	2560999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518107
40302	NC_021723	TGC	2	6	2561052	2561057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518107
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40312	NC_021723	ATTA	2	8	2561798	2561805	50 %	50 %	0 %	0 %	523518108
40313	NC_021723	ATC	2	6	2561909	2561914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518108
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40318	NC_021723	AAT	2	6	2562133	2562138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518108
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40320	NC_021723	ACC	2	6	2562162	2562167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518108
40321	NC_021723	TGAA	2	8	2562188	2562195	50 %	25 %	25 %	0 %	523518108
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40330	NC_021723	CGT	2	6	2562829	2562834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518109
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40333	NC_021723	TGA	2	6	2562983	2562988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523518109
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40335	NC_021723	TCA	2	6	2563055	2563060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518109
40336	NC_021723	TTCATT	2	12	2563285	2563296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	523518109
40337	NC_021723	TTC	2	6	2563335	2563340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518109
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40339	NC_021723	GCG	2	6	2563376	2563381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523518109
40340	NC_021723	GGCG	2	8	2563499	2563506	0 %	0 %	75 %	25 %	523518109
40341	NC_021723	TCT	2	6	2563558	2563563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518109
40342	NC_021723	ATT	2	6	2563665	2563670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518109
40343	NC_021723	TCA	2	6	2563675	2563680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518109
40344	NC_021723	CCA	2	6	2563697	2563702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523518109
40345	NC_021723	CCG	2	6	2563727	2563732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518109
40346	NC_021723	T	6	6	2563734	2563739	0 %	100 %	0 %	0 %	523518109
40347	NC_021723	AGC	2	6	2563815	2563820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523518109
40348	NC_021723	CAA	2	6	2563835	2563840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518109
40349	NC_021723	TGC	2	6	2563864	2563869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518109
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40449	NC_021723	ATA	2	6	2570264	2570269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523518114
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40460	NC_021723	GCC	2	6	2571257	2571262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518115
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40462	NC_021723	CCG	3	9	2571366	2571374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518115
40463	NC_021723	CCG	2	6	2571378	2571383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523518115
40464	NC_021723	AAGA	2	8	2571410	2571417	75 %	0 %	25 %	0 %	523518115
40465	NC_021723	CAA	2	6	2571421	2571426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518115
40466	NC_021723	TTA	2	6	2571588	2571593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518115
40467	NC_021723	ATT	2	6	2571701	2571706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523518115
40468	NC_021723	T	6	6	2571743	2571748	0 %	100 %	0 %	0 %	523518115
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40480	NC_021723	ATC	2	6	2572357	2572362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518116
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40483	NC_021723	CAA	2	6	2572599	2572604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518116
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40485	NC_021723	TCA	2	6	2572656	2572661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518116
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40489	NC_021723	ACA	2	6	2573092	2573097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523518117
40490	NC_021723	TCT	2	6	2573162	2573167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523518117
40491	NC_021723	CAT	2	6	2573183	2573188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518117
40492	NC_021723	GTC	2	6	2573252	2573257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518117
40493	NC_021723	TGTT	2	8	2573343	2573350	0 %	75 %	25 %	0 %	523518117
40494	NC_021723	ATC	2	6	2573367	2573372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523518117
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40496	NC_021723	CTG	2	6	2573411	2573416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523518117
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