MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_021723	CCGTAT	2	12	1582037	1582048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523517156
25003	NC_021723	T	8	8	1582102	1582109	0 %	100 %	0 %	0 %	523517156
25004	NC_021723	GTTTG	2	10	1582115	1582124	0 %	60 %	40 %	0 %	523517156
25005	NC_021723	T	7	7	1582257	1582263	0 %	100 %	0 %	0 %	523517156
25006	NC_021723	TCG	2	6	1582280	1582285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517156
25007	NC_021723	GC	3	6	1582286	1582291	0 %	0 %	50 %	50 %	523517156
25008	NC_021723	CCG	3	9	1582304	1582312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517156
25009	NC_021723	ATA	2	6	1582315	1582320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517156
25010	NC_021723	ATTG	2	8	1582363	1582370	25 %	50 %	25 %	0 %	523517156
25011	NC_021723	ACA	2	6	1582405	1582410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517156
25012	NC_021723	CT	3	6	1582416	1582421	0 %	50 %	0 %	50 %	523517156
25013	NC_021723	GCACCA	2	12	1582444	1582455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	523517156
25014	NC_021723	TGA	2	6	1582491	1582496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517156
25015	NC_021723	TCCG	2	8	1582628	1582635	0 %	25 %	25 %	50 %	523517156
25016	NC_021723	GCA	2	6	1582676	1582681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517156
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25019	NC_021723	GCC	2	6	1582828	1582833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517156
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25021	NC_021723	CG	3	6	1583046	1583051	0 %	0 %	50 %	50 %	523517156
25022	NC_021723	AACA	2	8	1583091	1583098	75 %	0 %	0 %	25 %	523517156
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25024	NC_021723	CAG	2	6	1583381	1583386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517157
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25032	NC_021723	TCG	2	6	1583807	1583812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517158
25033	NC_021723	CTT	2	6	1583896	1583901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517158
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25040	NC_021723	T	6	6	1584355	1584360	0 %	100 %	0 %	0 %	523517159
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25101	NC_021723	GCC	2	6	1588366	1588371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517163
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25115	NC_021723	GC	3	6	1588979	1588984	0 %	0 %	50 %	50 %	523517164
25116	NC_021723	CCAT	2	8	1589041	1589048	25 %	25 %	0 %	50 %	523517164
25117	NC_021723	TCG	2	6	1589216	1589221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517164
25118	NC_021723	CGG	2	6	1589230	1589235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517164
25119	NC_021723	ATC	2	6	1589238	1589243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517164
25120	NC_021723	ATC	2	6	1589262	1589267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517164
25121	NC_021723	CAT	2	6	1589336	1589341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517164
25122	NC_021723	ACG	2	6	1589350	1589355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517164
25123	NC_021723	GCC	2	6	1589385	1589390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517164
25124	NC_021723	TTG	2	6	1589504	1589509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517164
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25204	NC_021723	CTG	2	6	1594648	1594653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517172
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25208	NC_021723	ATCC	2	8	1594828	1594835	25 %	25 %	0 %	50 %	523517172
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25216	NC_021723	TGC	2	6	1595106	1595111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517173
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25218	NC_021723	AATT	2	8	1595216	1595223	50 %	50 %	0 %	0 %	523517174
25219	NC_021723	CAA	2	6	1595305	1595310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517174
25220	NC_021723	TAA	2	6	1595340	1595345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517174
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25223	NC_021723	CGGCAT	2	12	1595493	1595504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523517174
25224	NC_021723	TCG	2	6	1595540	1595545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517174
25225	NC_021723	TCT	2	6	1595633	1595638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517175
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25227	NC_021723	CTTGTA	2	12	1595658	1595669	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523517175
25228	NC_021723	AAC	2	6	1595673	1595678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517175
25229	NC_021723	CTT	2	6	1595804	1595809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517175
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25231	NC_021723	TAA	2	6	1595876	1595881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517175
25232	NC_021723	ATAA	2	8	1596208	1596215	75 %	25 %	0 %	0 %	523517176
25233	NC_021723	CCAC	2	8	1596232	1596239	25 %	0 %	0 %	75 %	523517176
25234	NC_021723	TAAC	2	8	1596252	1596259	50 %	25 %	0 %	25 %	523517176
25235	NC_021723	TAA	2	6	1596349	1596354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517176
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25334	NC_021723	TCGA	2	8	1604275	1604282	25 %	25 %	25 %	25 %	523517181
25335	NC_021723	TCA	2	6	1604425	1604430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517181
25336	NC_021723	CAG	2	6	1604538	1604543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517182
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25338	NC_021723	GCGTT	2	10	1604704	1604713	0 %	40 %	40 %	20 %	523517182
25339	NC_021723	ATA	2	6	1604739	1604744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517182
25340	NC_021723	CAA	2	6	1604772	1604777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517182
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25343	NC_021723	ATC	2	6	1605268	1605273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517183
25344	NC_021723	TGC	2	6	1605473	1605478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517183
25345	NC_021723	CAT	2	6	1605510	1605515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517183
25346	NC_021723	CTT	2	6	1605578	1605583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517183
25347	NC_021723	AGC	2	6	1605650	1605655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517183
25348	NC_021723	CG	3	6	1605668	1605673	0 %	0 %	50 %	50 %	523517183
25349	NC_021723	TGA	2	6	1605686	1605691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517183
25350	NC_021723	CAC	2	6	1605713	1605718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517183
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25352	NC_021723	GTT	2	6	1605746	1605751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517183
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25460	NC_021723	CGC	2	6	1611685	1611690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517190
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25463	NC_021723	CATT	2	8	1611967	1611974	25 %	50 %	0 %	25 %	523517190
25464	NC_021723	CCA	2	6	1612022	1612027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517190
25465	NC_021723	TGC	2	6	1612090	1612095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517190
25466	NC_021723	TCAT	2	8	1612437	1612444	25 %	50 %	0 %	25 %	523517191
25467	NC_021723	GTT	2	6	1612497	1612502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517191
25468	NC_021723	AAT	2	6	1612520	1612525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517191
25469	NC_021723	CAA	2	6	1612567	1612572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517191
25470	NC_021723	GTC	2	6	1612604	1612609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517191
25471	NC_021723	CG	3	6	1612615	1612620	0 %	0 %	50 %	50 %	523517191
25472	NC_021723	GGT	2	6	1612685	1612690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517191
25473	NC_021723	CTTG	2	8	1612726	1612733	0 %	50 %	25 %	25 %	523517191
25474	NC_021723	TG	3	6	1612785	1612790	0 %	50 %	50 %	0 %	523517191
25475	NC_021723	TGC	2	6	1612810	1612815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517191
25476	NC_021723	AT	3	6	1612890	1612895	50 %	50 %	0 %	0 %	523517191
25477	NC_021723	GCA	2	6	1612897	1612902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517191
25478	NC_021723	CCGAC	2	10	1612951	1612960	20 %	0 %	20 %	60 %	523517191
25479	NC_021723	GAA	2	6	1612974	1612979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517191
25480	NC_021723	ACTG	2	8	1613050	1613057	25 %	25 %	25 %	25 %	523517191
25481	NC_021723	TGT	2	6	1613083	1613088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517191
25482	NC_021723	CTT	2	6	1613131	1613136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517191
25483	NC_021723	GCCA	2	8	1613142	1613149	25 %	0 %	25 %	50 %	523517191
25484	NC_021723	CAT	2	6	1613150	1613155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517191
25485	NC_021723	GCA	2	6	1613187	1613192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517191
25486	NC_021723	CTT	2	6	1613228	1613233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517191
25487	NC_021723	GCAG	2	8	1613244	1613251	25 %	0 %	50 %	25 %	523517191
25488	NC_021723	TAT	2	6	1613275	1613280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517191
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25490	NC_021723	ACA	2	6	1613346	1613351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517191
25491	NC_021723	TAA	2	6	1613362	1613367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517191
25492	NC_021723	T	6	6	1613390	1613395	0 %	100 %	0 %	0 %	523517191
25493	NC_021723	CTT	2	6	1613540	1613545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517191
25494	NC_021723	TTG	2	6	1613585	1613590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517191
25495	NC_021723	ACTG	2	8	1613607	1613614	25 %	25 %	25 %	25 %	523517191
25496	NC_021723	T	6	6	1613773	1613778	0 %	100 %	0 %	0 %	523517191
25497	NC_021723	TGA	2	6	1614059	1614064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517191
25498	NC_021723	T	7	7	1614079	1614085	0 %	100 %	0 %	0 %	523517191
25499	NC_021723	CGGC	2	8	1614166	1614173	0 %	0 %	50 %	50 %	523517191
25500	NC_021723	CTG	2	6	1614215	1614220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517191

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