MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_021723	GAA	2	6	1525586	1525591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517104
24003	NC_021723	GA	3	6	1525607	1525612	50 %	0 %	50 %	0 %	523517104
24004	NC_021723	AGA	3	9	1525610	1525618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523517104
24005	NC_021723	GCA	2	6	1525671	1525676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517104
24006	NC_021723	CAA	2	6	1525781	1525786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517104
24007	NC_021723	TCAT	2	8	1525813	1525820	25 %	50 %	0 %	25 %	523517104
24008	NC_021723	AAAT	2	8	1525829	1525836	75 %	25 %	0 %	0 %	523517104
24009	NC_021723	ACC	2	6	1525875	1525880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517104
24010	NC_021723	A	7	7	1525928	1525934	100 %	0 %	0 %	0 %	523517104
24011	NC_021723	TTCT	2	8	1525939	1525946	0 %	75 %	0 %	25 %	523517104
24012	NC_021723	CCA	2	6	1525963	1525968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517104
24013	NC_021723	CGT	2	6	1525971	1525976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517104
24014	NC_021723	CCCA	2	8	1526077	1526084	25 %	0 %	0 %	75 %	523517104
24015	NC_021723	CGC	2	6	1526174	1526179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517104
24016	NC_021723	TGA	2	6	1526183	1526188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517104
24017	NC_021723	TGT	2	6	1526201	1526206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517104
24018	NC_021723	CGG	2	6	1526207	1526212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517104
24019	NC_021723	CAA	2	6	1526223	1526228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517104
24020	NC_021723	A	6	6	1526331	1526336	100 %	0 %	0 %	0 %	523517104
24021	NC_021723	TGCC	2	8	1526381	1526388	0 %	25 %	25 %	50 %	523517104
24022	NC_021723	TTA	2	6	1526542	1526547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517104
24023	NC_021723	CAA	2	6	1526555	1526560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517104
24024	NC_021723	ATT	2	6	1526640	1526645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517104
24025	NC_021723	GCA	2	6	1526656	1526661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517104
24026	NC_021723	CA	3	6	1526740	1526745	50 %	0 %	0 %	50 %	523517104
24027	NC_021723	TCA	2	6	1526758	1526763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517104
24028	NC_021723	GAC	2	6	1526789	1526794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517104
24029	NC_021723	GAC	2	6	1526796	1526801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517104
24030	NC_021723	CAAAT	2	10	1526979	1526988	60 %	20 %	0 %	20 %	523517104
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24032	NC_021723	ATC	2	6	1527250	1527255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
24033	NC_021723	TGGT	2	8	1527263	1527270	0 %	50 %	50 %	0 %	523517106
24034	NC_021723	AATC	2	8	1527279	1527286	50 %	25 %	0 %	25 %	523517106
24035	NC_021723	TCT	2	6	1527320	1527325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517106
24036	NC_021723	TTC	2	6	1527343	1527348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517106
24037	NC_021723	ATC	2	6	1527424	1527429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
24038	NC_021723	ATCA	2	8	1527466	1527473	50 %	25 %	0 %	25 %	523517106
24039	NC_021723	CTT	2	6	1527597	1527602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517106
24040	NC_021723	GTA	2	6	1527661	1527666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517106
24041	NC_021723	CATTTT	2	12	1527789	1527800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	523517106
24042	NC_021723	CAT	2	6	1527904	1527909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
24043	NC_021723	CTTC	2	8	1527933	1527940	0 %	50 %	0 %	50 %	523517106
24044	NC_021723	CA	3	6	1527986	1527991	50 %	0 %	0 %	50 %	523517106
24045	NC_021723	TAA	2	6	1528021	1528026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517106
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24047	NC_021723	A	6	6	1528158	1528163	100 %	0 %	0 %	0 %	523517106
24048	NC_021723	ATC	2	6	1528235	1528240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
24049	NC_021723	TCA	2	6	1528247	1528252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
24050	NC_021723	TGAAT	2	10	1528286	1528295	40 %	40 %	20 %	0 %	523517106
24051	NC_021723	GTGG	2	8	1528306	1528313	0 %	25 %	75 %	0 %	523517106
24052	NC_021723	AGC	2	6	1528321	1528326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517106
24053	NC_021723	ATC	2	6	1528333	1528338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
24054	NC_021723	CCG	2	6	1528401	1528406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517106
24055	NC_021723	TTG	2	6	1528477	1528482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517106
24056	NC_021723	GGC	2	6	1528814	1528819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517106
24057	NC_021723	TCG	2	6	1528848	1528853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517106
24058	NC_021723	AACC	2	8	1528866	1528873	50 %	0 %	0 %	50 %	523517106
24059	NC_021723	AACC	2	8	1528884	1528891	50 %	0 %	0 %	50 %	523517106
24060	NC_021723	ATA	2	6	1528964	1528969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517106
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24066	NC_021723	ATC	2	6	1529200	1529205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
24067	NC_021723	TCG	2	6	1529363	1529368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517106
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24069	NC_021723	TAA	2	6	1529418	1529423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517106
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24071	NC_021723	GC	4	8	1529495	1529502	0 %	0 %	50 %	50 %	523517106
24072	NC_021723	CAT	2	6	1529521	1529526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
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24085	NC_021723	GATC	2	8	1530159	1530166	25 %	25 %	25 %	25 %	523517106
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24099	NC_021723	TCA	3	9	1530695	1530703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517106
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24105	NC_021723	GCT	2	6	1530989	1530994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517106
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24114	NC_021723	TCG	2	6	1531380	1531385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517106
24115	NC_021723	CTG	2	6	1531479	1531484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517106
24116	NC_021723	CTT	2	6	1531726	1531731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517107
24117	NC_021723	CAA	2	6	1531774	1531779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517107
24118	NC_021723	TCA	2	6	1531782	1531787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517107
24119	NC_021723	T	6	6	1531793	1531798	0 %	100 %	0 %	0 %	523517107
24120	NC_021723	ACCG	2	8	1531799	1531806	25 %	0 %	25 %	50 %	523517107
24121	NC_021723	AATCGG	2	12	1531831	1531842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523517107
24122	NC_021723	CGTT	2	8	1531860	1531867	0 %	50 %	25 %	25 %	523517107
24123	NC_021723	CCA	2	6	1531876	1531881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517107
24124	NC_021723	CTGC	2	8	1532020	1532027	0 %	25 %	25 %	50 %	523517107
24125	NC_021723	TCA	2	6	1532106	1532111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517107
24126	NC_021723	CG	3	6	1532179	1532184	0 %	0 %	50 %	50 %	523517107
24127	NC_021723	CCTT	2	8	1532223	1532230	0 %	50 %	0 %	50 %	523517107
24128	NC_021723	CCA	2	6	1532320	1532325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517107
24129	NC_021723	TAT	2	6	1532347	1532352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517107
24130	NC_021723	AAT	2	6	1532357	1532362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517107
24131	NC_021723	CAC	2	6	1532503	1532508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517107
24132	NC_021723	ATAA	2	8	1532541	1532548	75 %	25 %	0 %	0 %	523517107
24133	NC_021723	TTAA	2	8	1532556	1532563	50 %	50 %	0 %	0 %	523517107
24134	NC_021723	CAA	2	6	1532582	1532587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517107
24135	NC_021723	AGC	2	6	1532588	1532593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517107
24136	NC_021723	CGC	2	6	1532791	1532796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517107
24137	NC_021723	TCA	2	6	1532967	1532972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517107
24138	NC_021723	ACA	2	6	1532995	1533000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517107
24139	NC_021723	TTC	2	6	1533056	1533061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517107
24140	NC_021723	TAAA	2	8	1533109	1533116	75 %	25 %	0 %	0 %	523517107
24141	NC_021723	TTC	2	6	1533146	1533151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517107
24142	NC_021723	CATCTT	2	12	1533179	1533190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	523517107
24143	NC_021723	TTCGA	2	10	1533230	1533239	20 %	40 %	20 %	20 %	523517107
24144	NC_021723	CAT	2	6	1533314	1533319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517107
24145	NC_021723	CTG	2	6	1533337	1533342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517107
24146	NC_021723	CTT	2	6	1533352	1533357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517107
24147	NC_021723	ATT	2	6	1533410	1533415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517108
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24149	NC_021723	ACA	2	6	1533491	1533496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517108
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24152	NC_021723	TTA	2	6	1533701	1533706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523517108
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24173	NC_021723	GCA	2	6	1534693	1534698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517109
24174	NC_021723	AGT	2	6	1534710	1534715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517109
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24193	NC_021723	CGC	2	6	1535548	1535553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517110
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24203	NC_021723	TGC	2	6	1536082	1536087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517110
24204	NC_021723	TTGT	2	8	1536118	1536125	0 %	75 %	25 %	0 %	523517110
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24208	NC_021723	CCAT	2	8	1536173	1536180	25 %	25 %	0 %	50 %	523517110
24209	NC_021723	CAT	2	6	1536584	1536589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517111
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24211	NC_021723	CTT	2	6	1536734	1536739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517111
24212	NC_021723	TGA	2	6	1536861	1536866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517111
24213	NC_021723	GCC	2	6	1536916	1536921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517111
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24215	NC_021723	AAGC	2	8	1536972	1536979	50 %	0 %	25 %	25 %	523517111
24216	NC_021723	TTC	2	6	1537029	1537034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517111
24217	NC_021723	AAT	2	6	1537065	1537070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517111
24218	NC_021723	T	6	6	1537111	1537116	0 %	100 %	0 %	0 %	523517112
24219	NC_021723	TTG	2	6	1537230	1537235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517112
24220	NC_021723	ATG	2	6	1537236	1537241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517112
24221	NC_021723	TG	3	6	1537246	1537251	0 %	50 %	50 %	0 %	523517112
24222	NC_021723	TTTG	2	8	1537283	1537290	0 %	75 %	25 %	0 %	523517112
24223	NC_021723	CTG	2	6	1537354	1537359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517112
24224	NC_021723	GCC	2	6	1537406	1537411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517112
24225	NC_021723	ACG	2	6	1537422	1537427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517112
24226	NC_021723	TCA	2	6	1537558	1537563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517112
24227	NC_021723	GCC	2	6	1537643	1537648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517112
24228	NC_021723	CA	3	6	1537653	1537658	50 %	0 %	0 %	50 %	523517112
24229	NC_021723	TGG	2	6	1537721	1537726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517112
24230	NC_021723	AACG	2	8	1538242	1538249	50 %	0 %	25 %	25 %	523517113
24231	NC_021723	GCC	2	6	1538264	1538269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517113
24232	NC_021723	T	6	6	1538386	1538391	0 %	100 %	0 %	0 %	523517113
24233	NC_021723	TTC	2	6	1538414	1538419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517113
24234	NC_021723	TCA	2	6	1538448	1538453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517113
24235	NC_021723	TAC	2	6	1538464	1538469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517113
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24244	NC_021723	GCA	2	6	1538754	1538759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517113
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24323	NC_021723	CG	3	6	1542508	1542513	0 %	0 %	50 %	50 %	523517118
24324	NC_021723	ATC	2	6	1542567	1542572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517118
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24332	NC_021723	ATG	2	6	1542936	1542941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517118
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24336	NC_021723	GTTT	2	8	1543145	1543152	0 %	75 %	25 %	0 %	523517118
24337	NC_021723	CAT	2	6	1543160	1543165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517118
24338	NC_021723	TCG	2	6	1543172	1543177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517118
24339	NC_021723	TTG	2	6	1543254	1543259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517118
24340	NC_021723	TGA	2	6	1543261	1543266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517118
24341	NC_021723	TGA	2	6	1543291	1543296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517118
24342	NC_021723	GTCACG	2	12	1543348	1543359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523517118
24343	NC_021723	TG	3	6	1544334	1544339	0 %	50 %	50 %	0 %	523517119
24344	NC_021723	TGG	2	6	1544422	1544427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523517119
24345	NC_021723	CGC	2	6	1544445	1544450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517119
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24347	NC_021723	TTCGGT	2	12	1544471	1544482	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	523517119
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24451	NC_021723	TCG	2	6	1550035	1550040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517125
24452	NC_021723	GCA	2	6	1550057	1550062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517125
24453	NC_021723	ATCA	2	8	1550076	1550083	50 %	25 %	0 %	25 %	523517125
24454	NC_021723	TCA	2	6	1550164	1550169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517125
24455	NC_021723	CTT	2	6	1550207	1550212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517125
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24461	NC_021723	ATG	2	6	1550379	1550384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517125
24462	NC_021723	TCAA	2	8	1550522	1550529	50 %	25 %	0 %	25 %	523517126
24463	NC_021723	TTGT	2	8	1550574	1550581	0 %	75 %	25 %	0 %	523517126
24464	NC_021723	AGC	2	6	1550606	1550611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517126
24465	NC_021723	CAT	2	6	1550643	1550648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517126
24466	NC_021723	TCA	2	6	1550699	1550704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517126
24467	NC_021723	AAT	2	6	1550719	1550724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523517126
24468	NC_021723	CTT	2	6	1550745	1550750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517126
24469	NC_021723	GCC	2	6	1550765	1550770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517126
24470	NC_021723	CTT	2	6	1550785	1550790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517126
24471	NC_021723	TTG	2	6	1550915	1550920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517126
24472	NC_021723	GTC	2	6	1550951	1550956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517126
24473	NC_021723	TG	3	6	1551039	1551044	0 %	50 %	50 %	0 %	523517126
24474	NC_021723	TTTC	2	8	1551051	1551058	0 %	75 %	0 %	25 %	523517126
24475	NC_021723	GCG	2	6	1551106	1551111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523517127
24476	NC_021723	TGT	2	6	1551139	1551144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517127
24477	NC_021723	TTAA	2	8	1551324	1551331	50 %	50 %	0 %	0 %	523517127
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24479	NC_021723	GC	3	6	1551377	1551382	0 %	0 %	50 %	50 %	523517128
24480	NC_021723	ATG	2	6	1551399	1551404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517128
24481	NC_021723	CAAG	2	8	1551415	1551422	50 %	0 %	25 %	25 %	523517128
24482	NC_021723	TCT	2	6	1551474	1551479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517128
24483	NC_021723	T	6	6	1551766	1551771	0 %	100 %	0 %	0 %	523517129
24484	NC_021723	TTGC	2	8	1551784	1551791	0 %	50 %	25 %	25 %	523517129
24485	NC_021723	TCA	2	6	1551888	1551893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517129
24486	NC_021723	CAA	2	6	1551936	1551941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517129
24487	NC_021723	GAC	2	6	1551945	1551950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517129
24488	NC_021723	CGA	2	6	1551974	1551979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523517129
24489	NC_021723	ATC	2	6	1552109	1552114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517129
24490	NC_021723	ATG	2	6	1552118	1552123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523517129
24491	NC_021723	CTGAT	2	10	1552145	1552154	20 %	40 %	20 %	20 %	523517129
24492	NC_021723	GCC	2	6	1552391	1552396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523517129
24493	NC_021723	CCA	2	6	1552397	1552402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523517129
24494	NC_021723	ACA	2	6	1552430	1552435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523517129
24495	NC_021723	GCT	2	6	1552449	1552454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517129
24496	NC_021723	CTG	2	6	1552479	1552484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523517129
24497	NC_021723	TTC	2	6	1552547	1552552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523517129
24498	NC_021723	TCA	2	6	1552571	1552576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523517129
24499	NC_021723	ATCA	2	8	1552597	1552604	50 %	25 %	0 %	25 %	523517129
24500	NC_021723	GTT	2	6	1552704	1552709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523517129

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