MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021723	GAC	2	6	1245997	1246002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516847
19503	NC_021723	TTA	2	6	1246034	1246039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516847
19504	NC_021723	CAG	2	6	1246102	1246107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516847
19505	NC_021723	AGC	2	6	1246165	1246170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516847
19506	NC_021723	CGG	2	6	1246311	1246316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516847
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19508	NC_021723	TACC	2	8	1246369	1246376	25 %	25 %	0 %	50 %	523516847
19509	NC_021723	AATT	2	8	1246410	1246417	50 %	50 %	0 %	0 %	523516847
19510	NC_021723	CGG	2	6	1246470	1246475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516847
19511	NC_021723	GGT	2	6	1246517	1246522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516847
19512	NC_021723	TTTGC	2	10	1246541	1246550	0 %	60 %	20 %	20 %	523516847
19513	NC_021723	CACC	2	8	1246567	1246574	25 %	0 %	0 %	75 %	523516847
19514	NC_021723	ATC	2	6	1246595	1246600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516847
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19517	NC_021723	GCAAA	2	10	1246784	1246793	60 %	0 %	20 %	20 %	523516847
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19521	NC_021723	GCA	2	6	1247054	1247059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516848
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19552	NC_021723	GGCG	2	8	1248462	1248469	0 %	0 %	75 %	25 %	523516849
19553	NC_021723	ATT	2	6	1248491	1248496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516849
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19556	NC_021723	TGA	2	6	1248612	1248617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516849
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19616	NC_021723	CGA	2	6	1252117	1252122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516853
19617	NC_021723	TGC	2	6	1252141	1252146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516853
19618	NC_021723	AAG	2	6	1252285	1252290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516853
19619	NC_021723	CAC	2	6	1252407	1252412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516853
19620	NC_021723	TGC	2	6	1252415	1252420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516853
19621	NC_021723	GGT	2	6	1252442	1252447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516853
19622	NC_021723	TGC	2	6	1252469	1252474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516853
19623	NC_021723	ATC	2	6	1252477	1252482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516853
19624	NC_021723	GGC	2	6	1252529	1252534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516853
19625	NC_021723	T	6	6	1252563	1252568	0 %	100 %	0 %	0 %	523516853
19626	NC_021723	TGG	2	6	1252910	1252915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516854
19627	NC_021723	A	6	6	1252931	1252936	100 %	0 %	0 %	0 %	523516854
19628	NC_021723	GAC	2	6	1252956	1252961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516854
19629	NC_021723	TGT	2	6	1253021	1253026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516854
19630	NC_021723	CCGA	2	8	1253059	1253066	25 %	0 %	25 %	50 %	523516854
19631	NC_021723	CCTTA	2	10	1253113	1253122	20 %	40 %	0 %	40 %	523516854
19632	NC_021723	GCA	2	6	1253192	1253197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516854
19633	NC_021723	AAG	2	6	1253211	1253216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516854
19634	NC_021723	TGA	2	6	1253237	1253242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516854
19635	NC_021723	AAC	2	6	1253288	1253293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516854
19636	NC_021723	GC	3	6	1253409	1253414	0 %	0 %	50 %	50 %	523516854
19637	NC_021723	TAA	2	6	1253429	1253434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516854
19638	NC_021723	GTT	2	6	1253447	1253452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516854
19639	NC_021723	GCG	2	6	1253621	1253626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516854
19640	NC_021723	GAT	2	6	1253700	1253705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516854
19641	NC_021723	CCGG	2	8	1253770	1253777	0 %	0 %	50 %	50 %	523516854
19642	NC_021723	ACC	2	6	1253865	1253870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516854
19643	NC_021723	GGC	2	6	1253897	1253902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516854
19644	NC_021723	CGAA	2	8	1253904	1253911	50 %	0 %	25 %	25 %	523516854
19645	NC_021723	CGA	2	6	1253954	1253959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516854
19646	NC_021723	TGA	2	6	1254001	1254006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516854
19647	NC_021723	TTGGCG	2	12	1254208	1254219	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	523516854
19648	NC_021723	A	6	6	1254303	1254308	100 %	0 %	0 %	0 %	523516854
19649	NC_021723	GTT	2	6	1254312	1254317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516854
19650	NC_021723	GTTT	2	8	1254344	1254351	0 %	75 %	25 %	0 %	523516854
19651	NC_021723	CTT	2	6	1254482	1254487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516854
19652	NC_021723	GCG	2	6	1254503	1254508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516854
19653	NC_021723	ACA	2	6	1254567	1254572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516855
19654	NC_021723	A	6	6	1254572	1254577	100 %	0 %	0 %	0 %	523516855
19655	NC_021723	T	7	7	1254596	1254602	0 %	100 %	0 %	0 %	523516855
19656	NC_021723	AAC	2	6	1254627	1254632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516855
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19658	NC_021723	CGG	3	9	1254732	1254740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516856
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19661	NC_021723	GGC	2	6	1254997	1255002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516856
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19663	NC_021723	G	6	6	1255069	1255074	0 %	0 %	100 %	0 %	523516856
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19667	NC_021723	CGA	2	6	1255165	1255170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516856
19668	NC_021723	ATT	2	6	1255271	1255276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516856
19669	NC_021723	GAGT	2	8	1255279	1255286	25 %	25 %	50 %	0 %	523516856
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19673	NC_021723	TGC	2	6	1255928	1255933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516857
19674	NC_021723	AGA	2	6	1255937	1255942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516857
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19676	NC_021723	TGC	2	6	1256093	1256098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516857
19677	NC_021723	GTT	2	6	1256169	1256174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516857
19678	NC_021723	GACT	2	8	1256186	1256193	25 %	25 %	25 %	25 %	523516857
19679	NC_021723	TGA	2	6	1256198	1256203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516857
19680	NC_021723	TGA	2	6	1256270	1256275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516857
19681	NC_021723	AT	3	6	1256369	1256374	50 %	50 %	0 %	0 %	523516857
19682	NC_021723	ATCG	2	8	1256469	1256476	25 %	25 %	25 %	25 %	523516857
19683	NC_021723	ATC	2	6	1256508	1256513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516857
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19686	NC_021723	TTC	2	6	1256745	1256750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516857
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19688	NC_021723	CCGT	2	8	1256905	1256912	0 %	25 %	25 %	50 %	523516857
19689	NC_021723	GGC	2	6	1256916	1256921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516857
19690	NC_021723	GTT	2	6	1256940	1256945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516857
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19692	NC_021723	CGAT	2	8	1257369	1257376	25 %	25 %	25 %	25 %	523516858
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19697	NC_021723	ATAG	2	8	1257607	1257614	50 %	25 %	25 %	0 %	523516858
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19701	NC_021723	TTGC	2	8	1257765	1257772	0 %	50 %	25 %	25 %	523516858
19702	NC_021723	T	6	6	1257836	1257841	0 %	100 %	0 %	0 %	523516858
19703	NC_021723	GCTG	2	8	1257972	1257979	0 %	25 %	50 %	25 %	523516858
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19712	NC_021723	CAC	2	6	1258626	1258631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516859
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19718	NC_021723	TGTT	2	8	1258929	1258936	0 %	75 %	25 %	0 %	523516859
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19722	NC_021723	CGGTGA	2	12	1259125	1259136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523516860
19723	NC_021723	AT	3	6	1259202	1259207	50 %	50 %	0 %	0 %	523516860
19724	NC_021723	GCCGCA	2	12	1259253	1259264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	523516860
19725	NC_021723	T	6	6	1259308	1259313	0 %	100 %	0 %	0 %	523516860
19726	NC_021723	T	6	6	1259387	1259392	0 %	100 %	0 %	0 %	523516861
19727	NC_021723	TGA	2	6	1259423	1259428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516861
19728	NC_021723	TGA	2	6	1259613	1259618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516861
19729	NC_021723	CCG	2	6	1259653	1259658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516861
19730	NC_021723	ATT	2	6	1259659	1259664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516861
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19732	NC_021723	GTA	2	6	1259701	1259706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516861
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19956	NC_021723	ATGA	2	8	1273589	1273596	50 %	25 %	25 %	0 %	523516873
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19963	NC_021723	CAA	2	6	1273822	1273827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516873
19964	NC_021723	T	6	6	1273858	1273863	0 %	100 %	0 %	0 %	523516873
19965	NC_021723	CAA	2	6	1273872	1273877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516873
19966	NC_021723	TTTC	2	8	1273980	1273987	0 %	75 %	0 %	25 %	523516873
19967	NC_021723	GCT	2	6	1273991	1273996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516873
19968	NC_021723	GCAG	2	8	1274029	1274036	25 %	0 %	50 %	25 %	523516873
19969	NC_021723	CTT	2	6	1274112	1274117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516873
19970	NC_021723	CTT	3	9	1274130	1274138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516873
19971	NC_021723	GCT	2	6	1274153	1274158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516873
19972	NC_021723	TCA	2	6	1274195	1274200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516873
19973	NC_021723	AGC	2	6	1274269	1274274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516873
19974	NC_021723	GAA	2	6	1274314	1274319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516873
19975	NC_021723	TGATTC	2	12	1274452	1274463	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523516873
19976	NC_021723	CGTCAG	2	12	1274490	1274501	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523516873
19977	NC_021723	TCA	2	6	1274537	1274542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516873
19978	NC_021723	AGT	2	6	1274594	1274599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516873
19979	NC_021723	TCC	2	6	1274621	1274626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516874
19980	NC_021723	CTT	2	6	1274631	1274636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516874
19981	NC_021723	CAT	2	6	1274745	1274750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516874
19982	NC_021723	ACCG	2	8	1274800	1274807	25 %	0 %	25 %	50 %	523516874
19983	NC_021723	CAG	2	6	1274814	1274819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516874
19984	NC_021723	CAC	2	6	1274871	1274876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516874
19985	NC_021723	TGT	2	6	1274900	1274905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516874
19986	NC_021723	GCG	2	6	1274923	1274928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516874
19987	NC_021723	AGC	2	6	1274980	1274985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516874
19988	NC_021723	GAT	2	6	1275018	1275023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516874
19989	NC_021723	AGT	2	6	1275038	1275043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516874
19990	NC_021723	GGT	2	6	1275052	1275057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516874
19991	NC_021723	ATA	2	6	1275149	1275154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516874
19992	NC_021723	AGCTT	2	10	1275182	1275191	20 %	40 %	20 %	20 %	523516874
19993	NC_021723	CGT	2	6	1275447	1275452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516874
19994	NC_021723	AATC	2	8	1275504	1275511	50 %	25 %	0 %	25 %	523516874
19995	NC_021723	CCT	2	6	1275548	1275553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523516875
19996	NC_021723	ACTT	2	8	1275659	1275666	25 %	50 %	0 %	25 %	523516875
19997	NC_021723	CTT	2	6	1275725	1275730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516875
19998	NC_021723	TGGTG	2	10	1275738	1275747	0 %	40 %	60 %	0 %	523516875
19999	NC_021723	ATG	2	6	1275804	1275809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516875
20000	NC_021723	TAA	2	6	1275929	1275934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516875

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