MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021723	CAT	2	6	1026383	1026388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516601
16003	NC_021723	CTG	2	6	1026397	1026402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516601
16004	NC_021723	GATA	2	8	1026488	1026495	50 %	25 %	25 %	0 %	523516601
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16007	NC_021723	T	6	6	1026638	1026643	0 %	100 %	0 %	0 %	523516601
16008	NC_021723	AT	3	6	1026707	1026712	50 %	50 %	0 %	0 %	523516601
16009	NC_021723	ATG	2	6	1026938	1026943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516602
16010	NC_021723	TCG	2	6	1026980	1026985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516602
16011	NC_021723	A	7	7	1026989	1026995	100 %	0 %	0 %	0 %	523516602
16012	NC_021723	AAG	2	6	1027032	1027037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516602
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16014	NC_021723	ACC	2	6	1027070	1027075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516602
16015	NC_021723	TGA	2	6	1027187	1027192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516603
16016	NC_021723	TAT	2	6	1027267	1027272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516603
16017	NC_021723	TA	3	6	1027298	1027303	50 %	50 %	0 %	0 %	523516603
16018	NC_021723	T	7	7	1027317	1027323	0 %	100 %	0 %	0 %	523516603
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16101	NC_021723	AG	3	6	1032145	1032150	50 %	0 %	50 %	0 %	523516613
16102	NC_021723	CCAG	2	8	1032163	1032170	25 %	0 %	25 %	50 %	523516613
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16117	NC_021723	TGAT	2	8	1033024	1033031	25 %	50 %	25 %	0 %	523516614
16118	NC_021723	AGG	2	6	1033042	1033047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523516614
16119	NC_021723	TGC	2	6	1033058	1033063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516614
16120	NC_021723	AAG	2	6	1033072	1033077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516614
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16122	NC_021723	AAG	2	6	1033144	1033149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516614
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16129	NC_021723	A	7	7	1033506	1033512	100 %	0 %	0 %	0 %	523516615
16130	NC_021723	GGTGG	2	10	1033537	1033546	0 %	20 %	80 %	0 %	523516615
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16137	NC_021723	GAA	3	9	1033876	1033884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516615
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16144	NC_021723	TAG	2	6	1034346	1034351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516616
16145	NC_021723	TAG	2	6	1034382	1034387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516616
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16220	NC_021723	TTGA	2	8	1038940	1038947	25 %	50 %	25 %	0 %	523516625
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16226	NC_021723	TTA	2	6	1039800	1039805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516627
16227	NC_021723	AT	3	6	1039870	1039875	50 %	50 %	0 %	0 %	523516627
16228	NC_021723	GCA	2	6	1039878	1039883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516627
16229	NC_021723	AC	3	6	1039888	1039893	50 %	0 %	0 %	50 %	523516627
16230	NC_021723	AGAA	2	8	1039896	1039903	75 %	0 %	25 %	0 %	523516627
16231	NC_021723	GTT	2	6	1039910	1039915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516627
16232	NC_021723	AGC	2	6	1039916	1039921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516627
16233	NC_021723	AGT	2	6	1039953	1039958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516627
16234	NC_021723	CAG	2	6	1040421	1040426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516628
16235	NC_021723	GAAAG	2	10	1040446	1040455	60 %	0 %	40 %	0 %	523516628
16236	NC_021723	GAA	2	6	1040551	1040556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516628
16237	NC_021723	GAT	2	6	1040591	1040596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516628
16238	NC_021723	TC	3	6	1040624	1040629	0 %	50 %	0 %	50 %	523516628
16239	NC_021723	GAT	3	9	1040696	1040704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516628
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16242	NC_021723	ATTT	2	8	1041019	1041026	25 %	75 %	0 %	0 %	523516628
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16249	NC_021723	AG	3	6	1041929	1041934	50 %	0 %	50 %	0 %	523516629
16250	NC_021723	TGA	2	6	1042080	1042085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516629
16251	NC_021723	CAT	2	6	1042090	1042095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516629
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16253	NC_021723	CA	3	6	1042190	1042195	50 %	0 %	0 %	50 %	523516629
16254	NC_021723	GCG	2	6	1042278	1042283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516629
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16333	NC_021723	CCAA	2	8	1046124	1046131	50 %	0 %	0 %	50 %	523516633
16334	NC_021723	TTC	2	6	1046193	1046198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516633
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16337	NC_021723	ATCAG	2	10	1046308	1046317	40 %	20 %	20 %	20 %	523516633
16338	NC_021723	TGA	2	6	1046344	1046349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516633
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16342	NC_021723	TGA	2	6	1046431	1046436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516633
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16347	NC_021723	TGA	2	6	1046562	1046567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516634
16348	NC_021723	TGC	2	6	1046568	1046573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516634
16349	NC_021723	TTG	2	6	1046744	1046749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516634
16350	NC_021723	AAG	3	9	1046770	1046778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516634
16351	NC_021723	GAG	2	6	1046809	1046814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523516634
16352	NC_021723	TA	3	6	1046831	1046836	50 %	50 %	0 %	0 %	523516634
16353	NC_021723	CTCGA	2	10	1047104	1047113	20 %	20 %	20 %	40 %	523516634
16354	NC_021723	GGCG	2	8	1047162	1047169	0 %	0 %	75 %	25 %	523516634
16355	NC_021723	GAA	2	6	1047174	1047179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516634
16356	NC_021723	TGT	2	6	1047182	1047187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516634
16357	NC_021723	AAG	2	6	1047199	1047204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516634
16358	NC_021723	GCA	2	6	1047259	1047264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516634
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16360	NC_021723	AG	3	6	1047351	1047356	50 %	0 %	50 %	0 %	523516634
16361	NC_021723	AAGG	2	8	1047361	1047368	50 %	0 %	50 %	0 %	523516634
16362	NC_021723	TGA	2	6	1047387	1047392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516634
16363	NC_021723	CTA	2	6	1047441	1047446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516634
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16365	NC_021723	CCA	2	6	1047535	1047540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516634
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16368	NC_021723	CAA	2	6	1047672	1047677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516634
16369	NC_021723	AAG	2	6	1047697	1047702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516634
16370	NC_021723	A	7	7	1047748	1047754	100 %	0 %	0 %	0 %	523516634
16371	NC_021723	AT	3	6	1047765	1047770	50 %	50 %	0 %	0 %	523516634
16372	NC_021723	TGC	2	6	1047803	1047808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516634
16373	NC_021723	ATA	2	6	1047887	1047892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516634
16374	NC_021723	TGA	2	6	1047998	1048003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516634
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16377	NC_021723	ATCA	2	8	1048097	1048104	50 %	25 %	0 %	25 %	523516634
16378	NC_021723	T	6	6	1048121	1048126	0 %	100 %	0 %	0 %	523516634
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16383	NC_021723	CCTGAT	2	12	1048508	1048519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523516635
16384	NC_021723	AAG	2	6	1048562	1048567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516635
16385	NC_021723	GAGAAG	2	12	1048583	1048594	50 %	0 %	50 %	0 %	523516635
16386	NC_021723	GCT	2	6	1048598	1048603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516635
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16389	NC_021723	CGTC	2	8	1048864	1048871	0 %	25 %	25 %	50 %	523516635
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16400	NC_021723	CTA	2	6	1049659	1049664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516636
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16405	NC_021723	CTG	2	6	1049823	1049828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516636
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16419	NC_021723	GAT	2	6	1050541	1050546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516637
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16445	NC_021723	CTCAAT	2	12	1051696	1051707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516640
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16448	NC_021723	CAA	2	6	1051894	1051899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516641
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16450	NC_021723	GTT	2	6	1051976	1051981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516641
16451	NC_021723	AAG	2	6	1052074	1052079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516641
16452	NC_021723	AGC	2	6	1052082	1052087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516641
16453	NC_021723	TGA	2	6	1052099	1052104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516641
16454	NC_021723	ACTGAT	2	12	1052223	1052234	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	523516641
16455	NC_021723	GGT	2	6	1052241	1052246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516641
16456	NC_021723	CTG	2	6	1052287	1052292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516641
16457	NC_021723	TGC	2	6	1052569	1052574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516642
16458	NC_021723	CGTC	2	8	1052621	1052628	0 %	25 %	25 %	50 %	523516642
16459	NC_021723	ATGAA	2	10	1052697	1052706	60 %	20 %	20 %	0 %	523516642
16460	NC_021723	A	6	6	1052734	1052739	100 %	0 %	0 %	0 %	523516642
16461	NC_021723	GACA	2	8	1052911	1052918	50 %	0 %	25 %	25 %	523516643
16462	NC_021723	AGCA	2	8	1052933	1052940	50 %	0 %	25 %	25 %	523516643
16463	NC_021723	ACC	2	6	1052965	1052970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516643
16464	NC_021723	CCTAAG	2	12	1052983	1052994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523516643
16465	NC_021723	TGA	2	6	1053006	1053011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516643
16466	NC_021723	CAAA	2	8	1053099	1053106	75 %	0 %	0 %	25 %	523516643
16467	NC_021723	AG	3	6	1053107	1053112	50 %	0 %	50 %	0 %	523516643
16468	NC_021723	GAAA	2	8	1053184	1053191	75 %	0 %	25 %	0 %	523516643
16469	NC_021723	GGAG	2	8	1053192	1053199	25 %	0 %	75 %	0 %	523516643
16470	NC_021723	CAA	2	6	1053318	1053323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516644
16471	NC_021723	CAA	2	6	1053507	1053512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516644
16472	NC_021723	TTC	2	6	1053556	1053561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516644
16473	NC_021723	TGC	2	6	1053643	1053648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516644
16474	NC_021723	CTG	2	6	1053762	1053767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516644
16475	NC_021723	GCA	2	6	1053847	1053852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516644
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16484	NC_021723	GGC	2	6	1054435	1054440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516644
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16488	NC_021723	GGA	2	6	1054577	1054582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523516644
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16491	NC_021723	TGT	2	6	1054642	1054647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516644
16492	NC_021723	CTG	2	6	1054674	1054679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516644
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16495	NC_021723	CTT	2	6	1054774	1054779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516644
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16498	NC_021723	CT	3	6	1055013	1055018	0 %	50 %	0 %	50 %	523516644
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16500	NC_021723	TTC	2	6	1055078	1055083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523516644

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