MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus LOCK900

Total Repeats: 45332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021723	GAA	2	6	835414	835419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516412
13002	NC_021723	CCA	2	6	835456	835461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516413
13003	NC_021723	GCG	2	6	835486	835491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516413
13004	NC_021723	CTG	2	6	835541	835546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516413
13005	NC_021723	CAC	2	6	835580	835585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516413
13006	NC_021723	CAA	2	6	835592	835597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516413
13007	NC_021723	ATG	2	6	835605	835610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516413
13008	NC_021723	A	7	7	835634	835640	100 %	0 %	0 %	0 %	523516413
13009	NC_021723	ACC	2	6	835643	835648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516413
13010	NC_021723	TGA	2	6	835657	835662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516413
13011	NC_021723	CAA	2	6	835696	835701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516413
13012	NC_021723	CAA	2	6	835721	835726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516413
13013	NC_021723	ATC	2	6	835739	835744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516413
13014	NC_021723	GGT	2	6	835745	835750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516413
13015	NC_021723	AAG	2	6	835851	835856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516413
13016	NC_021723	GGCG	2	8	835892	835899	0 %	0 %	75 %	25 %	523516413
13017	NC_021723	GCTT	2	8	835948	835955	0 %	50 %	25 %	25 %	523516413
13018	NC_021723	TGTT	2	8	835971	835978	0 %	75 %	25 %	0 %	523516413
13019	NC_021723	TAA	2	6	835993	835998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516413
13020	NC_021723	CGA	2	6	836029	836034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516413
13021	NC_021723	TGG	2	6	836052	836057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516413
13022	NC_021723	CTTG	2	8	836089	836096	0 %	50 %	25 %	25 %	523516413
13023	NC_021723	GTTT	2	8	836112	836119	0 %	75 %	25 %	0 %	523516413
13024	NC_021723	ATT	3	9	836135	836143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516413
13025	NC_021723	CTTGA	2	10	836240	836249	20 %	40 %	20 %	20 %	523516413
13026	NC_021723	GCG	2	6	836302	836307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516413
13027	NC_021723	GGTG	2	8	836400	836407	0 %	25 %	75 %	0 %	523516414
13028	NC_021723	AATG	2	8	836413	836420	50 %	25 %	25 %	0 %	523516414
13029	NC_021723	TGA	2	6	836517	836522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516414
13030	NC_021723	CTTA	2	8	836611	836618	25 %	50 %	0 %	25 %	523516415
13031	NC_021723	GCTT	2	8	836644	836651	0 %	50 %	25 %	25 %	523516415
13032	NC_021723	GTTG	2	8	836794	836801	0 %	50 %	50 %	0 %	523516415
13033	NC_021723	AGTT	2	8	836812	836819	25 %	50 %	25 %	0 %	523516415
13034	NC_021723	ATT	2	6	836827	836832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516415
13035	NC_021723	CTGG	2	8	836871	836878	0 %	25 %	50 %	25 %	523516415
13036	NC_021723	TGG	2	6	836891	836896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516415
13037	NC_021723	TGC	2	6	836922	836927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516415
13038	NC_021723	CG	3	6	837001	837006	0 %	0 %	50 %	50 %	523516415
13039	NC_021723	ACGTCA	2	12	837055	837066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523516415
13040	NC_021723	TTG	2	6	837174	837179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516415
13041	NC_021723	TGG	2	6	837303	837308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516415
13042	NC_021723	GGT	2	6	837436	837441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516415
13043	NC_021723	CAA	2	6	837529	837534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516415
13044	NC_021723	GGA	2	6	837676	837681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523516415
13045	NC_021723	GAA	2	6	837690	837695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516415
13046	NC_021723	TTG	2	6	837704	837709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516416
13047	NC_021723	ATG	2	6	837710	837715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516416
13048	NC_021723	TGC	2	6	837734	837739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516416
13049	NC_021723	AGG	2	6	837791	837796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523516416
13050	NC_021723	TAT	2	6	837831	837836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516416
13051	NC_021723	GAA	2	6	837892	837897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516416
13052	NC_021723	TCG	2	6	837953	837958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516416
13053	NC_021723	GAT	2	6	837976	837981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516416
13054	NC_021723	CGC	2	6	838001	838006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516416
13055	NC_021723	ATT	2	6	838012	838017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516416
13056	NC_021723	AGTCAA	2	12	838045	838056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	523516416
13057	NC_021723	CGGT	2	8	838094	838101	0 %	25 %	50 %	25 %	523516416
13058	NC_021723	CGG	2	6	838262	838267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516416
13059	NC_021723	GTCA	2	8	838291	838298	25 %	25 %	25 %	25 %	523516416
13060	NC_021723	GTT	2	6	838589	838594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516417
13061	NC_021723	ACC	2	6	838610	838615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516417
13062	NC_021723	ATC	2	6	838650	838655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516417
13063	NC_021723	TGGCT	2	10	838830	838839	0 %	40 %	40 %	20 %	523516417
13064	NC_021723	AAG	2	6	838863	838868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516417
13065	NC_021723	A	6	6	838910	838915	100 %	0 %	0 %	0 %	523516417
13066	NC_021723	GCC	2	6	838936	838941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516417
13067	NC_021723	TGAT	2	8	839046	839053	25 %	50 %	25 %	0 %	523516417
13068	NC_021723	TTGA	2	8	839075	839082	25 %	50 %	25 %	0 %	523516417
13069	NC_021723	GAT	2	6	839197	839202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516417
13070	NC_021723	TCA	3	9	839230	839238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516417
13071	NC_021723	GTC	2	6	839307	839312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516417
13072	NC_021723	TTG	2	6	839379	839384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516417
13073	NC_021723	ATT	2	6	839495	839500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516417
13074	NC_021723	TCA	2	6	839529	839534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516417
13075	NC_021723	CGAAT	2	10	839560	839569	40 %	20 %	20 %	20 %	523516417
13076	NC_021723	AAG	2	6	839597	839602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516417
13077	NC_021723	CGA	2	6	839608	839613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516417
13078	NC_021723	AGT	2	6	839791	839796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516417
13079	NC_021723	GC	3	6	839894	839899	0 %	0 %	50 %	50 %	523516417
13080	NC_021723	GTC	2	6	839901	839906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516417
13081	NC_021723	ATGG	2	8	839960	839967	25 %	25 %	50 %	0 %	523516417
13082	NC_021723	CAG	2	6	840038	840043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516417
13083	NC_021723	TGA	2	6	840050	840055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516417
13084	NC_021723	A	7	7	840145	840151	100 %	0 %	0 %	0 %	523516418
13085	NC_021723	GCA	2	6	840203	840208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516418
13086	NC_021723	AATC	2	8	840233	840240	50 %	25 %	0 %	25 %	523516418
13087	NC_021723	GCG	2	6	840280	840285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516418
13088	NC_021723	GAA	2	6	840409	840414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516418
13089	NC_021723	TGG	2	6	840440	840445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516418
13090	NC_021723	TCTT	2	8	840533	840540	0 %	75 %	0 %	25 %	523516418
13091	NC_021723	GCAA	2	8	840653	840660	50 %	0 %	25 %	25 %	523516418
13092	NC_021723	ATG	2	6	840901	840906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516418
13093	NC_021723	AGA	2	6	840920	840925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516418
13094	NC_021723	A	6	6	840935	840940	100 %	0 %	0 %	0 %	523516418
13095	NC_021723	AGT	2	6	840969	840974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516418
13096	NC_021723	GTC	2	6	840998	841003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516418
13097	NC_021723	ATG	2	6	841153	841158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516419
13098	NC_021723	A	7	7	841182	841188	100 %	0 %	0 %	0 %	523516419
13099	NC_021723	TCA	2	6	841195	841200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516419
13100	NC_021723	GCG	2	6	841209	841214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516419
13101	NC_021723	GTG	2	6	841261	841266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516419
13102	NC_021723	GT	3	6	841349	841354	0 %	50 %	50 %	0 %	523516419
13103	NC_021723	GAT	2	6	841407	841412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516419
13104	NC_021723	T	6	6	841434	841439	0 %	100 %	0 %	0 %	523516419
13105	NC_021723	TAC	2	6	841520	841525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516419
13106	NC_021723	GCT	2	6	841539	841544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516419
13107	NC_021723	TTTTG	2	10	841650	841659	0 %	80 %	20 %	0 %	523516419
13108	NC_021723	GAC	2	6	841767	841772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516419
13109	NC_021723	GTG	2	6	841780	841785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516419
13110	NC_021723	TGCG	2	8	841787	841794	0 %	25 %	50 %	25 %	523516419
13111	NC_021723	GC	4	8	841834	841841	0 %	0 %	50 %	50 %	523516419
13112	NC_021723	TTG	2	6	841888	841893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516419
13113	NC_021723	TGC	2	6	842003	842008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516419
13114	NC_021723	GAA	2	6	842055	842060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516419
13115	NC_021723	GTT	2	6	842088	842093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516420
13116	NC_021723	GGC	2	6	842241	842246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516420
13117	NC_021723	GGCA	2	8	842321	842328	25 %	0 %	50 %	25 %	523516420
13118	NC_021723	GTT	2	6	842415	842420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516420
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13120	NC_021723	ATT	2	6	842643	842648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516420
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13123	NC_021723	CTG	2	6	842707	842712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516420
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13238	NC_021723	GTG	2	6	850295	850300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516429
13239	NC_021723	CAG	2	6	850356	850361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516429
13240	NC_021723	A	6	6	850385	850390	100 %	0 %	0 %	0 %	523516429
13241	NC_021723	ATGA	2	8	850406	850413	50 %	25 %	25 %	0 %	523516429
13242	NC_021723	A	6	6	850471	850476	100 %	0 %	0 %	0 %	523516429
13243	NC_021723	ATA	2	6	850524	850529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516429
13244	NC_021723	GCT	2	6	850535	850540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516429
13245	NC_021723	TGG	2	6	850734	850739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516429
13246	NC_021723	ACC	2	6	850754	850759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516429
13247	NC_021723	CAC	2	6	850769	850774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523516429
13248	NC_021723	TTTGAT	2	12	850895	850906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	523516429
13249	NC_021723	A	7	7	851001	851007	100 %	0 %	0 %	0 %	523516430
13250	NC_021723	ATG	2	6	851009	851014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516430
13251	NC_021723	CAG	2	6	851048	851053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516430
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13254	NC_021723	A	6	6	851338	851343	100 %	0 %	0 %	0 %	523516430
13255	NC_021723	GAA	2	6	851359	851364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516430
13256	NC_021723	G	6	6	851378	851383	0 %	0 %	100 %	0 %	523516430
13257	NC_021723	GGC	3	9	851443	851451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516430
13258	NC_021723	GAA	2	6	851464	851469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516430
13259	NC_021723	TCAT	2	8	851507	851514	25 %	50 %	0 %	25 %	523516430
13260	NC_021723	CGT	2	6	851515	851520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516430
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13263	NC_021723	CAT	2	6	851709	851714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516430
13264	NC_021723	CTG	2	6	851855	851860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516430
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13270	NC_021723	CCGT	2	8	852586	852593	0 %	25 %	25 %	50 %	523516431
13271	NC_021723	TGA	2	6	852734	852739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516431
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13275	NC_021723	GATCA	2	10	853350	853359	40 %	20 %	20 %	20 %	523516431
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13277	NC_021723	GCT	2	6	853485	853490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516431
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13294	NC_021723	CG	3	6	854699	854704	0 %	0 %	50 %	50 %	523516432
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13300	NC_021723	TGG	2	6	854961	854966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516433
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13305	NC_021723	CTTG	2	8	855259	855266	0 %	50 %	25 %	25 %	523516433
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13313	NC_021723	AGC	2	6	855427	855432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516433
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13323	NC_021723	TGGA	2	8	856263	856270	25 %	25 %	50 %	0 %	523516434
13324	NC_021723	GCA	3	9	856363	856371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516434
13325	NC_021723	AATC	2	8	856396	856403	50 %	25 %	0 %	25 %	523516434
13326	NC_021723	TGA	2	6	856467	856472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516434
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13330	NC_021723	TGA	2	6	856663	856668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516435
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13332	NC_021723	GGT	2	6	856964	856969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516435
13333	NC_021723	CAA	2	6	857067	857072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516435
13334	NC_021723	GCT	2	6	857190	857195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516435
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13336	NC_021723	GGC	2	6	857498	857503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516435
13337	NC_021723	TGCT	2	8	857506	857513	0 %	50 %	25 %	25 %	523516435
13338	NC_021723	ATT	2	6	857615	857620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516435
13339	NC_021723	TGAT	2	8	857626	857633	25 %	50 %	25 %	0 %	523516435
13340	NC_021723	TGG	2	6	857634	857639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516435
13341	NC_021723	CG	3	6	857706	857711	0 %	0 %	50 %	50 %	523516435
13342	NC_021723	TCAG	2	8	857715	857722	25 %	25 %	25 %	25 %	523516435
13343	NC_021723	GCG	2	6	857730	857735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516435
13344	NC_021723	TGC	2	6	857743	857748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516435
13345	NC_021723	CGT	2	6	857778	857783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516435
13346	NC_021723	AGCT	2	8	857824	857831	25 %	25 %	25 %	25 %	523516435
13347	NC_021723	GGT	2	6	857854	857859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523516435
13348	NC_021723	GAT	2	6	857870	857875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516435
13349	NC_021723	TGA	2	6	857896	857901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516435
13350	NC_021723	TTTC	2	8	857921	857928	0 %	75 %	0 %	25 %	523516435
13351	NC_021723	GCA	2	6	857963	857968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516435
13352	NC_021723	AGA	2	6	858032	858037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516435
13353	NC_021723	ATC	2	6	858123	858128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516435
13354	NC_021723	GA	3	6	858245	858250	50 %	0 %	50 %	0 %	523516435
13355	NC_021723	CAAT	2	8	858303	858310	50 %	25 %	0 %	25 %	523516435
13356	NC_021723	CGT	2	6	858314	858319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516435
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13474	NC_021723	TGC	2	6	866556	866561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523516441
13475	NC_021723	TTA	3	9	866719	866727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516442
13476	NC_021723	ATA	2	6	866797	866802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516442
13477	NC_021723	ATC	2	6	866910	866915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523516442
13478	NC_021723	ATTTT	2	10	866961	866970	20 %	80 %	0 %	0 %	523516442
13479	NC_021723	GAA	2	6	866985	866990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516442
13480	NC_021723	CCG	2	6	867014	867019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516442
13481	NC_021723	GATG	2	8	867050	867057	25 %	25 %	50 %	0 %	523516442
13482	NC_021723	TTA	2	6	867078	867083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516442
13483	NC_021723	ACG	2	6	867120	867125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516442
13484	NC_021723	A	6	6	867151	867156	100 %	0 %	0 %	0 %	523516442
13485	NC_021723	ATA	2	6	867178	867183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523516442
13486	NC_021723	GATG	2	8	867257	867264	25 %	25 %	50 %	0 %	523516442
13487	NC_021723	TTG	2	6	867390	867395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523516442
13488	NC_021723	ACA	2	6	867467	867472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523516442
13489	NC_021723	AGCGT	2	10	867477	867486	20 %	20 %	40 %	20 %	523516442
13490	NC_021723	CA	3	6	867536	867541	50 %	0 %	0 %	50 %	523516442
13491	NC_021723	AAG	2	6	867552	867557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523516442
13492	NC_021723	GGA	2	6	867647	867652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523516443
13493	NC_021723	GAT	2	6	867725	867730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516443
13494	NC_021723	GCC	2	6	867772	867777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523516443
13495	NC_021723	GTTG	2	8	867796	867803	0 %	50 %	50 %	0 %	523516443
13496	NC_021723	T	7	7	867868	867874	0 %	100 %	0 %	0 %	523516443
13497	NC_021723	ATT	2	6	867899	867904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523516443
13498	NC_021723	GGC	2	6	867926	867931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523516443
13499	NC_021723	GCA	2	6	867946	867951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523516443
13500	NC_021723	GAT	2	6	867961	867966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523516443

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