MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49118	NC_021721	TTCAAA	2	12	3042301	3042312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	523515497
49119	NC_021721	TTG	2	6	3042323	3042328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515497
49120	NC_021721	CGT	2	6	3042348	3042353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515497
49121	NC_021721	GCT	2	6	3042360	3042365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515497
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49221	NC_021721	AC	3	6	3047567	3047572	50 %	0 %	0 %	50 %	523515503
49222	NC_021721	GAT	2	6	3047629	3047634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515503
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49224	NC_021721	TGG	2	6	3047830	3047835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515504
49225	NC_021721	CTG	2	6	3047910	3047915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515504
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49231	NC_021721	CAT	2	6	3048305	3048310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515504
49232	NC_021721	CTG	2	6	3048326	3048331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515504
49233	NC_021721	CAGC	2	8	3048377	3048384	25 %	0 %	25 %	50 %	523515504
49234	NC_021721	TGAT	2	8	3048387	3048394	25 %	50 %	25 %	0 %	523515504
49235	NC_021721	GCA	2	6	3048398	3048403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515504
49236	NC_021721	AAG	2	6	3048483	3048488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515504
49237	NC_021721	TAT	2	6	3048539	3048544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515504
49238	NC_021721	TGA	2	6	3048600	3048605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515504
49239	NC_021721	TTC	2	6	3048793	3048798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515505
49240	NC_021721	GAT	2	6	3048804	3048809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515505
49241	NC_021721	AGA	2	6	3048858	3048863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515505
49242	NC_021721	CTT	2	6	3048879	3048884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515505
49243	NC_021721	CTTG	2	8	3048927	3048934	0 %	50 %	25 %	25 %	523515505
49244	NC_021721	GCC	2	6	3048939	3048944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515505
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49253	NC_021721	ATCA	2	8	3049300	3049307	50 %	25 %	0 %	25 %	523515505
49254	NC_021721	CAT	2	6	3049437	3049442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515505
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49260	NC_021721	TAA	3	9	3049676	3049684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515506
49261	NC_021721	TGA	2	6	3049691	3049696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515506
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49264	NC_021721	GTC	2	6	3049975	3049980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515506
49265	NC_021721	ATTT	2	8	3049997	3050004	25 %	75 %	0 %	0 %	523515506
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49302	NC_021721	TTTC	2	8	3051734	3051741	0 %	75 %	0 %	25 %	523515507
49303	NC_021721	AAT	2	6	3051775	3051780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515507
49304	NC_021721	GTTT	2	8	3051820	3051827	0 %	75 %	25 %	0 %	523515507
49305	NC_021721	TG	3	6	3051838	3051843	0 %	50 %	50 %	0 %	523515507
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49308	NC_021721	CCAG	2	8	3051988	3051995	25 %	0 %	25 %	50 %	523515507
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49310	NC_021721	TGA	2	6	3052070	3052075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515507
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49318	NC_021721	ACTG	2	8	3052946	3052953	25 %	25 %	25 %	25 %	523515508
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49322	NC_021721	CTT	2	6	3053312	3053317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515508
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49324	NC_021721	GCA	2	6	3053520	3053525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515509
49325	NC_021721	ATC	2	6	3053532	3053537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515509
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49329	NC_021721	A	7	7	3053612	3053618	100 %	0 %	0 %	0 %	523515509
49330	NC_021721	TTGA	2	8	3053622	3053629	25 %	50 %	25 %	0 %	523515509
49331	NC_021721	TTG	2	6	3053643	3053648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515509
49332	NC_021721	AGC	2	6	3053654	3053659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515509
49333	NC_021721	CAC	2	6	3053737	3053742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515509
49334	NC_021721	ATA	2	6	3053801	3053806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515509
49335	NC_021721	GGAATC	2	12	3053826	3053837	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523515509
49336	NC_021721	CGTT	2	8	3053868	3053875	0 %	50 %	25 %	25 %	523515509
49337	NC_021721	AG	3	6	3053933	3053938	50 %	0 %	50 %	0 %	523515509
49338	NC_021721	CAA	2	6	3054001	3054006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515509
49339	NC_021721	TTC	2	6	3054084	3054089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515509
49340	NC_021721	ATG	2	6	3054454	3054459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515510
49341	NC_021721	CGA	2	6	3054509	3054514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515510
49342	NC_021721	TGG	2	6	3054518	3054523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515510
49343	NC_021721	GGT	2	6	3054568	3054573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515510
49344	NC_021721	TGT	2	6	3054578	3054583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515510
49345	NC_021721	ACC	2	6	3054610	3054615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515510
49346	NC_021721	ATTCA	2	10	3054661	3054670	40 %	40 %	0 %	20 %	523515510
49347	NC_021721	TGC	2	6	3054680	3054685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515510
49348	NC_021721	TTA	2	6	3054769	3054774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515510
49349	NC_021721	CGCCA	2	10	3054792	3054801	20 %	0 %	20 %	60 %	523515510
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49351	NC_021721	T	6	6	3054883	3054888	0 %	100 %	0 %	0 %	523515510
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49450	NC_021721	GAT	2	6	3060701	3060706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515514
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49457	NC_021721	GCA	2	6	3060904	3060909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515514
49458	NC_021721	TGA	2	6	3060916	3060921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515514
49459	NC_021721	CAA	2	6	3060926	3060931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515514
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49462	NC_021721	T	7	7	3061037	3061043	0 %	100 %	0 %	0 %	523515515
49463	NC_021721	A	6	6	3061057	3061062	100 %	0 %	0 %	0 %	523515515
49464	NC_021721	GTGG	2	8	3061082	3061089	0 %	25 %	75 %	0 %	523515515
49465	NC_021721	T	6	6	3061125	3061130	0 %	100 %	0 %	0 %	523515515
49466	NC_021721	ACTAA	2	10	3061242	3061251	60 %	20 %	0 %	20 %	523515515
49467	NC_021721	TCAA	2	8	3061286	3061293	50 %	25 %	0 %	25 %	523515515
49468	NC_021721	ACT	2	6	3061311	3061316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515515
49469	NC_021721	TAC	2	6	3061347	3061352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515515
49470	NC_021721	GAT	2	6	3061389	3061394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515515
49471	NC_021721	TCC	2	6	3061421	3061426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515515
49472	NC_021721	A	6	6	3061429	3061434	100 %	0 %	0 %	0 %	523515515
49473	NC_021721	TTG	2	6	3061444	3061449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515515
49474	NC_021721	GTTG	2	8	3061466	3061473	0 %	50 %	50 %	0 %	523515515
49475	NC_021721	AGC	2	6	3061491	3061496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515515
49476	NC_021721	GGC	2	6	3061608	3061613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515515
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49478	NC_021721	CG	3	6	3061970	3061975	0 %	0 %	50 %	50 %	523515516
49479	NC_021721	ATC	2	6	3061976	3061981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515516
49480	NC_021721	CAA	2	6	3062008	3062013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515516
49481	NC_021721	TGC	2	6	3062030	3062035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515516
49482	NC_021721	TGCTG	2	10	3062040	3062049	0 %	40 %	40 %	20 %	523515516
49483	NC_021721	AATC	2	8	3062050	3062057	50 %	25 %	0 %	25 %	523515516
49484	NC_021721	CAGCC	2	10	3062152	3062161	20 %	0 %	20 %	60 %	523515516
49485	NC_021721	CAA	2	6	3062215	3062220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515516
49486	NC_021721	AAT	2	6	3062230	3062235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515516
49487	NC_021721	CCA	2	6	3062499	3062504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515516
49488	NC_021721	ATCA	2	8	3062560	3062567	50 %	25 %	0 %	25 %	523515516
49489	NC_021721	AAT	2	6	3062584	3062589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515516
49490	NC_021721	TAA	2	6	3062600	3062605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515516
49491	NC_021721	CCG	2	6	3062664	3062669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515516
49492	NC_021721	TGT	2	6	3062737	3062742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515516
49493	NC_021721	TGCG	2	8	3062762	3062769	0 %	25 %	50 %	25 %	523515516
49494	NC_021721	AAC	2	6	3062779	3062784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515516
49495	NC_021721	TGC	2	6	3062866	3062871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515516
49496	NC_021721	CAT	3	9	3062922	3062930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515516
49497	NC_021721	CGA	2	6	3062976	3062981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515516
49498	NC_021721	GCA	2	6	3063080	3063085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515516
49499	NC_021721	GCT	2	6	3063143	3063148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515516
49500	NC_021721	T	6	6	3063148	3063153	0 %	100 %	0 %	0 %	523515516

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