MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_021721	TGC	2	6	2855205	2855210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515306
46003	NC_021721	TCA	2	6	2855236	2855241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
46004	NC_021721	T	6	6	2855242	2855247	0 %	100 %	0 %	0 %	523515306
46005	NC_021721	TTA	2	6	2855331	2855336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515306
46006	NC_021721	TAA	2	6	2855366	2855371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515306
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46008	NC_021721	AATT	2	8	2855548	2855555	50 %	50 %	0 %	0 %	523515306
46009	NC_021721	TGC	2	6	2855692	2855697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515306
46010	NC_021721	TAT	2	6	2855701	2855706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515306
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46014	NC_021721	ATT	2	6	2855954	2855959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515306
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46017	NC_021721	CAT	2	6	2856097	2856102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515306
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46055	NC_021721	CTTATC	2	12	2857646	2857657	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	523515307
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46081	NC_021721	GTCAG	2	10	2858874	2858883	20 %	20 %	40 %	20 %	523515308
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46115	NC_021721	AAT	2	6	2860626	2860631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515309
46116	NC_021721	TCA	2	6	2860643	2860648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515309
46117	NC_021721	GTT	2	6	2860738	2860743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515310
46118	NC_021721	TGC	2	6	2860761	2860766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515310
46119	NC_021721	GTG	2	6	2860837	2860842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515310
46120	NC_021721	GCG	2	6	2860906	2860911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515310
46121	NC_021721	CAC	2	6	2860912	2860917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515310
46122	NC_021721	GTT	2	6	2860995	2861000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515310
46123	NC_021721	AGACA	2	10	2861060	2861069	60 %	0 %	20 %	20 %	523515310
46124	NC_021721	CAA	2	6	2861274	2861279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515311
46125	NC_021721	CTT	3	9	2861311	2861319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515311
46126	NC_021721	TGCCA	2	10	2861438	2861447	20 %	20 %	20 %	40 %	523515311
46127	NC_021721	ATG	2	6	2861549	2861554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515311
46128	NC_021721	TGCAA	2	10	2861657	2861666	40 %	20 %	20 %	20 %	523515311
46129	NC_021721	CG	3	6	2861761	2861766	0 %	0 %	50 %	50 %	523515311
46130	NC_021721	CGT	2	6	2861769	2861774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515311
46131	NC_021721	ATA	2	6	2861807	2861812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515311
46132	NC_021721	GTT	2	6	2861867	2861872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515311
46133	NC_021721	TCA	2	6	2861891	2861896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515311
46134	NC_021721	ATG	2	6	2861924	2861929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515311
46135	NC_021721	T	6	6	2862016	2862021	0 %	100 %	0 %	0 %	523515311
46136	NC_021721	GCC	2	6	2862104	2862109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515312
46137	NC_021721	CCG	2	6	2862125	2862130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515312
46138	NC_021721	TTG	2	6	2862144	2862149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515312
46139	NC_021721	CA	3	6	2862206	2862211	50 %	0 %	0 %	50 %	523515312
46140	NC_021721	AT	3	6	2862237	2862242	50 %	50 %	0 %	0 %	523515312
46141	NC_021721	CTT	2	6	2862245	2862250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515312
46142	NC_021721	CAG	2	6	2862283	2862288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515312
46143	NC_021721	ACCC	2	8	2862295	2862302	25 %	0 %	0 %	75 %	523515312
46144	NC_021721	TAA	2	6	2862416	2862421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515312
46145	NC_021721	TGT	2	6	2862422	2862427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515312
46146	NC_021721	GTT	2	6	2862491	2862496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515312
46147	NC_021721	CGC	2	6	2862566	2862571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515312
46148	NC_021721	ACCA	2	8	2862611	2862618	50 %	0 %	0 %	50 %	523515312
46149	NC_021721	GGT	2	6	2862639	2862644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515312
46150	NC_021721	ACC	2	6	2862650	2862655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515312
46151	NC_021721	AAC	2	6	2862704	2862709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515312
46152	NC_021721	ATAA	2	8	2862753	2862760	75 %	25 %	0 %	0 %	523515312
46153	NC_021721	CAAAA	2	10	2862796	2862805	80 %	0 %	0 %	20 %	523515312
46154	NC_021721	GCC	2	6	2862807	2862812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515312
46155	NC_021721	GT	3	6	2862987	2862992	0 %	50 %	50 %	0 %	523515313
46156	NC_021721	CAT	2	6	2863028	2863033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515313
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46161	NC_021721	GAA	2	6	2863299	2863304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515313
46162	NC_021721	TTG	3	9	2863344	2863352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515313
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46167	NC_021721	CATG	2	8	2863835	2863842	25 %	25 %	25 %	25 %	523515314
46168	NC_021721	CGC	2	6	2863857	2863862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515314
46169	NC_021721	GAA	3	9	2863864	2863872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515314
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46171	NC_021721	TAA	2	6	2864002	2864007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515314
46172	NC_021721	ATC	2	6	2864058	2864063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515314
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46174	NC_021721	TG	3	6	2864121	2864126	0 %	50 %	50 %	0 %	523515314
46175	NC_021721	TGA	2	6	2864200	2864205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515314
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46177	NC_021721	T	6	6	2864289	2864294	0 %	100 %	0 %	0 %	523515314
46178	NC_021721	AAT	2	6	2864338	2864343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515314
46179	NC_021721	CTT	2	6	2864366	2864371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515314
46180	NC_021721	AAG	2	6	2864425	2864430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515314
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46183	NC_021721	ATC	3	9	2864828	2864836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515315
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46185	NC_021721	AGC	2	6	2864925	2864930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515315
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46187	NC_021721	TTGA	2	8	2865068	2865075	25 %	50 %	25 %	0 %	523515315
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46189	NC_021721	CG	3	6	2865141	2865146	0 %	0 %	50 %	50 %	523515315
46190	NC_021721	TTC	2	6	2865245	2865250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515315
46191	NC_021721	TCGC	2	8	2865258	2865265	0 %	25 %	25 %	50 %	523515315
46192	NC_021721	AAGC	2	8	2865401	2865408	50 %	0 %	25 %	25 %	523515315
46193	NC_021721	AGA	2	6	2865439	2865444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515315
46194	NC_021721	ATCA	2	8	2865548	2865555	50 %	25 %	0 %	25 %	523515315
46195	NC_021721	CAC	2	6	2865809	2865814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515316
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46198	NC_021721	TTTG	2	8	2865981	2865988	0 %	75 %	25 %	0 %	523515316
46199	NC_021721	ATA	2	6	2866147	2866152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515316
46200	NC_021721	GAT	2	6	2866154	2866159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515316
46201	NC_021721	TTG	2	6	2866162	2866167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515316
46202	NC_021721	CCA	2	6	2866183	2866188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515316
46203	NC_021721	ATG	2	6	2866267	2866272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515316
46204	NC_021721	CGAT	2	8	2866390	2866397	25 %	25 %	25 %	25 %	523515316
46205	NC_021721	GAA	2	6	2866413	2866418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515316
46206	NC_021721	TGC	2	6	2866433	2866438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515316
46207	NC_021721	A	7	7	2866444	2866450	100 %	0 %	0 %	0 %	523515316
46208	NC_021721	AC	3	6	2866540	2866545	50 %	0 %	0 %	50 %	523515316
46209	NC_021721	ACCTAT	2	12	2866956	2866967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515317
46210	NC_021721	TTC	2	6	2867049	2867054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515317
46211	NC_021721	TTA	2	6	2867077	2867082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515317
46212	NC_021721	TGG	2	6	2867087	2867092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515317
46213	NC_021721	TAT	2	6	2867102	2867107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515317
46214	NC_021721	AGC	2	6	2867123	2867128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515317
46215	NC_021721	TTA	2	6	2867147	2867152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515317
46216	NC_021721	TGT	2	6	2867219	2867224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515317
46217	NC_021721	GCCAA	2	10	2867283	2867292	40 %	0 %	20 %	40 %	523515317
46218	NC_021721	CAA	2	6	2867301	2867306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515317
46219	NC_021721	AT	3	6	2867333	2867338	50 %	50 %	0 %	0 %	523515317
46220	NC_021721	ACG	2	6	2867435	2867440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515317
46221	NC_021721	ATT	2	6	2867531	2867536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515317
46222	NC_021721	CGT	2	6	2867549	2867554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515317
46223	NC_021721	TG	3	6	2867617	2867622	0 %	50 %	50 %	0 %	523515317
46224	NC_021721	ATG	2	6	2867638	2867643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515317
46225	NC_021721	ATGA	2	8	2867661	2867668	50 %	25 %	25 %	0 %	523515317
46226	NC_021721	TCA	2	6	2867724	2867729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515318
46227	NC_021721	GAA	3	9	2867734	2867742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515318
46228	NC_021721	ACA	2	6	2867915	2867920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515318
46229	NC_021721	GTT	2	6	2868001	2868006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515318
46230	NC_021721	GAT	2	6	2868060	2868065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515318
46231	NC_021721	CGC	2	6	2868067	2868072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515318
46232	NC_021721	ACT	2	6	2868078	2868083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515318
46233	NC_021721	AAAGAT	2	12	2868091	2868102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	523515318
46234	NC_021721	AGC	2	6	2868130	2868135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515318
46235	NC_021721	AAC	2	6	2868176	2868181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515318
46236	NC_021721	ATC	2	6	2868193	2868198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515318
46237	NC_021721	CT	3	6	2868214	2868219	0 %	50 %	0 %	50 %	523515318
46238	NC_021721	CTT	2	6	2868242	2868247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515318
46239	NC_021721	GCAA	2	8	2868253	2868260	50 %	0 %	25 %	25 %	523515318
46240	NC_021721	CG	3	6	2868373	2868378	0 %	0 %	50 %	50 %	523515318
46241	NC_021721	TAT	2	6	2868501	2868506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515318
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46243	NC_021721	TCA	2	6	2868643	2868648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515319
46244	NC_021721	T	6	6	2868662	2868667	0 %	100 %	0 %	0 %	523515319
46245	NC_021721	GTT	2	6	2868699	2868704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515319
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46247	NC_021721	GTC	2	6	2868838	2868843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515319
46248	NC_021721	GTC	2	6	2868849	2868854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515319
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46251	NC_021721	ACTG	2	8	2869155	2869162	25 %	25 %	25 %	25 %	523515319
46252	NC_021721	TGG	2	6	2869183	2869188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515319
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46254	NC_021721	GAT	2	6	2869297	2869302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515319
46255	NC_021721	ATG	2	6	2869333	2869338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515320
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46259	NC_021721	TGC	2	6	2869422	2869427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515320
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46262	NC_021721	TGT	2	6	2869608	2869613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515320
46263	NC_021721	CG	3	6	2869621	2869626	0 %	0 %	50 %	50 %	523515320
46264	NC_021721	TATTTT	2	12	2869693	2869704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	523515320
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46266	NC_021721	TGC	2	6	2869752	2869757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515320
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46271	NC_021721	CA	3	6	2870014	2870019	50 %	0 %	0 %	50 %	523515320
46272	NC_021721	TCG	2	6	2870027	2870032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515320
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46279	NC_021721	ATTC	2	8	2870559	2870566	25 %	50 %	0 %	25 %	523515321
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46284	NC_021721	CCA	2	6	2870764	2870769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515321
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46301	NC_021721	CAG	2	6	2872179	2872184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515323
46302	NC_021721	TTC	2	6	2872300	2872305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515323
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46314	NC_021721	TGGA	2	8	2873053	2873060	25 %	25 %	50 %	0 %	523515323
46315	NC_021721	CAA	2	6	2873115	2873120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515323
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46323	NC_021721	AT	3	6	2873505	2873510	50 %	50 %	0 %	0 %	523515323
46324	NC_021721	CGTT	2	8	2873520	2873527	0 %	50 %	25 %	25 %	523515323
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46330	NC_021721	TG	3	6	2873802	2873807	0 %	50 %	50 %	0 %	523515323
46331	NC_021721	TGA	2	6	2873829	2873834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515323
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46333	NC_021721	CCAT	2	8	2873922	2873929	25 %	25 %	0 %	50 %	523515323
46334	NC_021721	TCTAA	2	10	2873963	2873972	40 %	40 %	0 %	20 %	523515324
46335	NC_021721	GTC	2	6	2873996	2874001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515324
46336	NC_021721	TCA	2	6	2874014	2874019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515324
46337	NC_021721	TCA	2	6	2874053	2874058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515324
46338	NC_021721	ATG	2	6	2874095	2874100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515324
46339	NC_021721	ACC	2	6	2874101	2874106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515324
46340	NC_021721	GAT	2	6	2874135	2874140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515324
46341	NC_021721	AGA	2	6	2874190	2874195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515324
46342	NC_021721	GTGA	2	8	2874217	2874224	25 %	25 %	50 %	0 %	523515324
46343	NC_021721	AGCA	2	8	2874246	2874253	50 %	0 %	25 %	25 %	523515324
46344	NC_021721	T	7	7	2874254	2874260	0 %	100 %	0 %	0 %	523515324
46345	NC_021721	TAG	2	6	2874447	2874452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515324
46346	NC_021721	TCT	2	6	2874575	2874580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515324
46347	NC_021721	ATC	2	6	2874585	2874590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515324
46348	NC_021721	AATGGT	2	12	2874606	2874617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515324
46349	NC_021721	TGC	2	6	2874712	2874717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515324
46350	NC_021721	GAT	2	6	2874754	2874759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515324
46351	NC_021721	GGAAA	2	10	2874792	2874801	60 %	0 %	40 %	0 %	523515324
46352	NC_021721	ACC	2	6	2874811	2874816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515324
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46355	NC_021721	CTGT	2	8	2874948	2874955	0 %	50 %	25 %	25 %	523515325
46356	NC_021721	CTTG	2	8	2874980	2874987	0 %	50 %	25 %	25 %	523515325
46357	NC_021721	GCA	2	6	2875149	2875154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515325
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46446	NC_021721	ATA	2	6	2879822	2879827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515330
46447	NC_021721	GACC	2	8	2879880	2879887	25 %	0 %	25 %	50 %	523515330
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46452	NC_021721	CAT	2	6	2880136	2880141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515330
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46456	NC_021721	CCG	2	6	2880323	2880328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515331
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46461	NC_021721	T	6	6	2880409	2880414	0 %	100 %	0 %	0 %	523515331
46462	NC_021721	TTC	2	6	2880442	2880447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515331
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46464	NC_021721	AAT	2	6	2880516	2880521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515331
46465	NC_021721	CGG	2	6	2880564	2880569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515331
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46468	NC_021721	CTGAAG	2	12	2880673	2880684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523515331
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