MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45116	NC_021721	AAC	2	6	2796793	2796798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515248
45117	NC_021721	ATC	2	6	2796804	2796809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515248
45118	NC_021721	CCA	2	6	2796818	2796823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515248
45119	NC_021721	GAT	2	6	2796824	2796829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515248
45120	NC_021721	AAATC	2	10	2796991	2797000	60 %	20 %	0 %	20 %	523515248
45121	NC_021721	ATGG	2	8	2797009	2797016	25 %	25 %	50 %	0 %	523515248
45122	NC_021721	GTT	2	6	2797095	2797100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515248
45123	NC_021721	AGCA	2	8	2797137	2797144	50 %	0 %	25 %	25 %	523515248
45124	NC_021721	TGT	2	6	2797186	2797191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515248
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45130	NC_021721	AGGA	2	8	2797787	2797794	50 %	0 %	50 %	0 %	523515248
45131	NC_021721	AT	3	6	2797813	2797818	50 %	50 %	0 %	0 %	523515248
45132	NC_021721	AAT	2	6	2797860	2797865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515248
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45136	NC_021721	GCCGT	2	10	2798079	2798088	0 %	20 %	40 %	40 %	523515248
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45139	NC_021721	CAAGG	2	10	2798834	2798843	40 %	0 %	40 %	20 %	523515250
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45142	NC_021721	GC	4	8	2799170	2799177	0 %	0 %	50 %	50 %	523515250
45143	NC_021721	TATT	2	8	2799188	2799195	25 %	75 %	0 %	0 %	523515250
45144	NC_021721	CAG	2	6	2799232	2799237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515250
45145	NC_021721	AAC	2	6	2799241	2799246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515250
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45148	NC_021721	ATT	2	6	2799417	2799422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515250
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45151	NC_021721	GGCA	2	8	2799625	2799632	25 %	0 %	50 %	25 %	523515250
45152	NC_021721	ATT	2	6	2799683	2799688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515250
45153	NC_021721	ATG	2	6	2799703	2799708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515250
45154	NC_021721	GCC	2	6	2799719	2799724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515250
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45178	NC_021721	CCAG	2	8	2801274	2801281	25 %	0 %	25 %	50 %	523515251
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45182	NC_021721	CGA	2	6	2801358	2801363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515251
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45186	NC_021721	A	6	6	2801424	2801429	100 %	0 %	0 %	0 %	523515251
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45200	NC_021721	TGC	2	6	2801826	2801831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515251
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45203	NC_021721	TGC	2	6	2801940	2801945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515251
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45209	NC_021721	TGCT	2	8	2802083	2802090	0 %	50 %	25 %	25 %	523515252
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45214	NC_021721	TTG	2	6	2802653	2802658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515252
45215	NC_021721	A	7	7	2802681	2802687	100 %	0 %	0 %	0 %	523515252
45216	NC_021721	ATC	2	6	2802780	2802785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515252
45217	NC_021721	CGATG	2	10	2802812	2802821	20 %	20 %	40 %	20 %	523515252
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45219	NC_021721	CCT	2	6	2802906	2802911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515252
45220	NC_021721	CTA	2	6	2802922	2802927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515252
45221	NC_021721	TGCCA	2	10	2803164	2803173	20 %	20 %	20 %	40 %	523515253
45222	NC_021721	AAC	2	6	2803252	2803257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515253
45223	NC_021721	TTG	2	6	2803474	2803479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515254
45224	NC_021721	TTG	2	6	2803482	2803487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515254
45225	NC_021721	AAGT	2	8	2803530	2803537	50 %	25 %	25 %	0 %	523515254
45226	NC_021721	CAAG	2	8	2803539	2803546	50 %	0 %	25 %	25 %	523515254
45227	NC_021721	CGC	2	6	2803549	2803554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515254
45228	NC_021721	GAA	2	6	2803571	2803576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515254
45229	NC_021721	CGC	2	6	2803656	2803661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515254
45230	NC_021721	TCA	2	6	2803681	2803686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515254
45231	NC_021721	CTC	2	6	2803706	2803711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515254
45232	NC_021721	CCA	2	6	2803722	2803727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515254
45233	NC_021721	TAA	2	6	2803736	2803741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515254
45234	NC_021721	TTGA	2	8	2803743	2803750	25 %	50 %	25 %	0 %	523515254
45235	NC_021721	TGA	2	6	2803834	2803839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515254
45236	NC_021721	GTT	2	6	2803909	2803914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515254
45237	NC_021721	GCA	2	6	2803947	2803952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515254
45238	NC_021721	GCA	2	6	2804061	2804066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515254
45239	NC_021721	CAA	2	6	2804071	2804076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515254
45240	NC_021721	GAA	2	6	2804092	2804097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515254
45241	NC_021721	T	7	7	2804702	2804708	0 %	100 %	0 %	0 %	523515255
45242	NC_021721	TGAT	2	8	2804761	2804768	25 %	50 %	25 %	0 %	523515255
45243	NC_021721	TGT	2	6	2804781	2804786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515255
45244	NC_021721	GTG	2	6	2804816	2804821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515255
45245	NC_021721	CCA	2	6	2804845	2804850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515255
45246	NC_021721	CATA	2	8	2804861	2804868	50 %	25 %	0 %	25 %	523515255
45247	NC_021721	CCAATG	2	12	2804878	2804889	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523515255
45248	NC_021721	GC	3	6	2805019	2805024	0 %	0 %	50 %	50 %	523515255
45249	NC_021721	CTG	2	6	2805045	2805050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515255
45250	NC_021721	GGC	3	9	2805051	2805059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515255
45251	NC_021721	GCC	3	9	2805115	2805123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515255
45252	NC_021721	ACA	2	6	2805127	2805132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515255
45253	NC_021721	GTT	2	6	2805164	2805169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515255
45254	NC_021721	T	6	6	2805235	2805240	0 %	100 %	0 %	0 %	523515255
45255	NC_021721	CCA	2	6	2805296	2805301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515255
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45259	NC_021721	CAG	2	6	2805621	2805626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515256
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45262	NC_021721	AGCA	2	8	2805713	2805720	50 %	0 %	25 %	25 %	523515256
45263	NC_021721	AAC	2	6	2806101	2806106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515257
45264	NC_021721	TGG	2	6	2806144	2806149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515257
45265	NC_021721	GGTC	2	8	2806158	2806165	0 %	25 %	50 %	25 %	523515257
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45268	NC_021721	TGC	2	6	2806550	2806555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515257
45269	NC_021721	TTCAA	2	10	2806569	2806578	40 %	40 %	0 %	20 %	523515257
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45272	NC_021721	GCC	2	6	2806626	2806631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515257
45273	NC_021721	ATTGAT	2	12	2806737	2806748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	523515257
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45290	NC_021721	GCA	2	6	2808026	2808031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515257
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45293	NC_021721	AGCGC	2	10	2808251	2808260	20 %	0 %	40 %	40 %	523515257
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45297	NC_021721	GGC	2	6	2808566	2808571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515257
45298	NC_021721	TCT	2	6	2808685	2808690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515258
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45300	NC_021721	GAT	2	6	2808756	2808761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515258
45301	NC_021721	ATGCCA	2	12	2808794	2808805	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	523515258
45302	NC_021721	CTT	2	6	2808858	2808863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515258
45303	NC_021721	TTGG	2	8	2808897	2808904	0 %	50 %	50 %	0 %	523515258
45304	NC_021721	ACA	2	6	2808953	2808958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515258
45305	NC_021721	TGT	2	6	2809052	2809057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515258
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45308	NC_021721	TCT	2	6	2809201	2809206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515258
45309	NC_021721	ATC	2	6	2809218	2809223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515258
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45311	NC_021721	GCT	2	6	2809425	2809430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515258
45312	NC_021721	TGC	2	6	2809555	2809560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515258
45313	NC_021721	TGC	2	6	2809641	2809646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515258
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45318	NC_021721	ACT	2	6	2809952	2809957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515260
45319	NC_021721	A	7	7	2809966	2809972	100 %	0 %	0 %	0 %	523515260
45320	NC_021721	CAT	2	6	2809995	2810000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515260
45321	NC_021721	CAG	2	6	2810076	2810081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515260
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45332	NC_021721	ATG	2	6	2810713	2810718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515260
45333	NC_021721	TAA	2	6	2810748	2810753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515260
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45335	NC_021721	AGA	2	6	2810965	2810970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515261
45336	NC_021721	CAAG	2	8	2811008	2811015	50 %	0 %	25 %	25 %	523515261
45337	NC_021721	A	6	6	2811059	2811064	100 %	0 %	0 %	0 %	523515261
45338	NC_021721	GAA	2	6	2811081	2811086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515261
45339	NC_021721	TGT	2	6	2811127	2811132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515261
45340	NC_021721	TTGC	2	8	2811163	2811170	0 %	50 %	25 %	25 %	523515261
45341	NC_021721	GAAAAA	2	12	2811487	2811498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	523515262
45342	NC_021721	GTT	2	6	2811517	2811522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515262
45343	NC_021721	TGTCA	2	10	2811523	2811532	20 %	40 %	20 %	20 %	523515262
45344	NC_021721	AAG	2	6	2811533	2811538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515262
45345	NC_021721	CGG	3	9	2811690	2811698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515262
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45347	NC_021721	CAG	2	6	2812091	2812096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515263
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45461	NC_021721	GTC	2	6	2818322	2818327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515270
45462	NC_021721	CCG	2	6	2818345	2818350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515270
45463	NC_021721	GCC	2	6	2818389	2818394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515270
45464	NC_021721	GCC	2	6	2818397	2818402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515270
45465	NC_021721	GTT	2	6	2818440	2818445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515270
45466	NC_021721	CCG	2	6	2818497	2818502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515270
45467	NC_021721	GAC	2	6	2818541	2818546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515270
45468	NC_021721	TCT	2	6	2818612	2818617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515270
45469	NC_021721	TAT	2	6	2818666	2818671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515270
45470	NC_021721	ATG	2	6	2819099	2819104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515271
45471	NC_021721	TCA	2	6	2819277	2819282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515271
45472	NC_021721	GGC	2	6	2819294	2819299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515271
45473	NC_021721	ACC	2	6	2819337	2819342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515271
45474	NC_021721	GGCG	2	8	2819458	2819465	0 %	0 %	75 %	25 %	523515271
45475	NC_021721	TA	3	6	2819487	2819492	50 %	50 %	0 %	0 %	523515271
45476	NC_021721	T	6	6	2819611	2819616	0 %	100 %	0 %	0 %	523515271
45477	NC_021721	TGA	2	6	2819640	2819645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515271
45478	NC_021721	CGG	2	6	2819674	2819679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523515271
45479	NC_021721	CTG	2	6	2819741	2819746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515271
45480	NC_021721	TTG	2	6	2819763	2819768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515271
45481	NC_021721	GCT	2	6	2819975	2819980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515272
45482	NC_021721	CACG	2	8	2820023	2820030	25 %	0 %	25 %	50 %	523515272
45483	NC_021721	CAT	2	6	2820053	2820058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515272
45484	NC_021721	ATC	2	6	2820075	2820080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515272
45485	NC_021721	CTG	2	6	2820090	2820095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515272
45486	NC_021721	CATG	2	8	2820103	2820110	25 %	25 %	25 %	25 %	523515272
45487	NC_021721	AAT	2	6	2820212	2820217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515272
45488	NC_021721	CGAC	2	8	2820232	2820239	25 %	0 %	25 %	50 %	523515272
45489	NC_021721	CAA	2	6	2820284	2820289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515272
45490	NC_021721	ACC	2	6	2820294	2820299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515272
45491	NC_021721	CTGA	2	8	2820327	2820334	25 %	25 %	25 %	25 %	523515272
45492	NC_021721	T	6	6	2820420	2820425	0 %	100 %	0 %	0 %	523515272
45493	NC_021721	TTAA	2	8	2821131	2821138	50 %	50 %	0 %	0 %	523515273
45494	NC_021721	TGC	2	6	2821174	2821179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515273
45495	NC_021721	AAG	2	6	2821271	2821276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515273
45496	NC_021721	TCCT	2	8	2821417	2821424	0 %	50 %	0 %	50 %	523515273
45497	NC_021721	CAT	2	6	2821512	2821517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515273
45498	NC_021721	TTG	2	6	2821556	2821561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515273
45499	NC_021721	ATC	3	9	2821588	2821596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515273
45500	NC_021721	GGT	2	6	2821597	2821602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523515273

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