MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_021721	A	6	6	2629991	2629996	100 %	0 %	0 %	0 %	523515092
42503	NC_021721	ACA	2	6	2630035	2630040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515092
42504	NC_021721	AAG	2	6	2630073	2630078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523515092
42505	NC_021721	GCACA	2	10	2630091	2630100	40 %	0 %	20 %	40 %	523515092
42506	NC_021721	CAG	2	6	2630102	2630107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515092
42507	NC_021721	TCA	2	6	2630199	2630204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515092
42508	NC_021721	CAA	2	6	2630216	2630221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515092
42509	NC_021721	CAA	2	6	2630249	2630254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515092
42510	NC_021721	A	6	6	2630307	2630312	100 %	0 %	0 %	0 %	523515092
42511	NC_021721	CGT	2	6	2630351	2630356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515092
42512	NC_021721	TCG	2	6	2630386	2630391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515092
42513	NC_021721	ATC	2	6	2630442	2630447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515092
42514	NC_021721	AAAAAT	2	12	2630461	2630472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	523515092
42515	NC_021721	AATT	2	8	2630500	2630507	50 %	50 %	0 %	0 %	523515092
42516	NC_021721	GC	3	6	2630528	2630533	0 %	0 %	50 %	50 %	523515092
42517	NC_021721	TCA	2	6	2630542	2630547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515092
42518	NC_021721	CTG	3	9	2630666	2630674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515093
42519	NC_021721	AAC	2	6	2630679	2630684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515093
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42525	NC_021721	GGCG	2	8	2631058	2631065	0 %	0 %	75 %	25 %	523515093
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42528	NC_021721	AAATT	2	10	2631226	2631235	60 %	40 %	0 %	0 %	523515093
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42607	NC_021721	ACGAG	2	10	2636413	2636422	40 %	0 %	40 %	20 %	523515100
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42616	NC_021721	TTGG	2	8	2637074	2637081	0 %	50 %	50 %	0 %	523515101
42617	NC_021721	A	6	6	2637103	2637108	100 %	0 %	0 %	0 %	523515101
42618	NC_021721	GTT	2	6	2637149	2637154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515101
42619	NC_021721	GCT	2	6	2637226	2637231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515101
42620	NC_021721	GTC	2	6	2637282	2637287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515101
42621	NC_021721	TGTT	2	8	2637339	2637346	0 %	75 %	25 %	0 %	523515101
42622	NC_021721	CATG	2	8	2637380	2637387	25 %	25 %	25 %	25 %	523515101
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42628	NC_021721	GTC	2	6	2637520	2637525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515101
42629	NC_021721	T	6	6	2637546	2637551	0 %	100 %	0 %	0 %	523515101
42630	NC_021721	TGT	2	6	2637553	2637558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515101
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42724	NC_021721	CAT	2	6	2642746	2642751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515108
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42847	NC_021721	ATG	2	6	2650958	2650963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515121
42848	NC_021721	ACGGA	2	10	2651107	2651116	40 %	0 %	40 %	20 %	523515121
42849	NC_021721	CCA	2	6	2651122	2651127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515121
42850	NC_021721	GCA	2	6	2651128	2651133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515121
42851	NC_021721	CTT	2	6	2651144	2651149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515121
42852	NC_021721	CAG	2	6	2651150	2651155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515121
42853	NC_021721	CTT	2	6	2651241	2651246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515121
42854	NC_021721	CTT	2	6	2651282	2651287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515121
42855	NC_021721	CGA	2	6	2651330	2651335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515121
42856	NC_021721	GCA	2	6	2651344	2651349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515121
42857	NC_021721	GAC	2	6	2651357	2651362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515121
42858	NC_021721	AAC	2	6	2651373	2651378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515121
42859	NC_021721	TCT	2	6	2651410	2651415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515121
42860	NC_021721	ATG	2	6	2651441	2651446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515121
42861	NC_021721	TGC	2	6	2651497	2651502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515122
42862	NC_021721	GCA	2	6	2651513	2651518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515122
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42864	NC_021721	AGC	2	6	2651617	2651622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515122
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42866	NC_021721	ACT	2	6	2651869	2651874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523515123
42867	NC_021721	CCTT	2	8	2651886	2651893	0 %	50 %	0 %	50 %	523515123
42868	NC_021721	ACG	2	6	2651894	2651899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515123
42869	NC_021721	ACGG	2	8	2651951	2651958	25 %	0 %	50 %	25 %	523515123
42870	NC_021721	AAC	2	6	2651963	2651968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515123
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42874	NC_021721	TTTC	2	8	2652148	2652155	0 %	75 %	0 %	25 %	523515123
42875	NC_021721	CGA	2	6	2652175	2652180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515123
42876	NC_021721	TGT	2	6	2652184	2652189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515123
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42880	NC_021721	CGC	2	6	2652454	2652459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515124
42881	NC_021721	GAT	2	6	2652512	2652517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515124
42882	NC_021721	ATT	2	6	2652620	2652625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515124
42883	NC_021721	CTTG	2	8	2652658	2652665	0 %	50 %	25 %	25 %	523515124
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42885	NC_021721	T	6	6	2652728	2652733	0 %	100 %	0 %	0 %	523515124
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42909	NC_021721	CAG	2	6	2654805	2654810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515129
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42915	NC_021721	ATT	2	6	2655268	2655273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515131
42916	NC_021721	CCT	2	6	2655276	2655281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523515131
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42925	NC_021721	TTCGAT	2	12	2655761	2655772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	523515131
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42932	NC_021721	AGC	2	6	2656242	2656247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515132
42933	NC_021721	GCCGTT	2	12	2656264	2656275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515132
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42942	NC_021721	TCT	2	6	2656513	2656518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515133
42943	NC_021721	CTGC	2	8	2656528	2656535	0 %	25 %	25 %	50 %	523515133
42944	NC_021721	TCT	2	6	2656543	2656548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515133
42945	NC_021721	T	6	6	2656577	2656582	0 %	100 %	0 %	0 %	523515133
42946	NC_021721	ACGA	2	8	2656655	2656662	50 %	0 %	25 %	25 %	523515134
42947	NC_021721	TCT	2	6	2656696	2656701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515134
42948	NC_021721	TCT	2	6	2656711	2656716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515134
42949	NC_021721	GATG	2	8	2656737	2656744	25 %	25 %	50 %	0 %	523515134
42950	NC_021721	CAC	3	9	2656765	2656773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523515134
42951	NC_021721	CGGA	2	8	2656817	2656824	25 %	0 %	50 %	25 %	523515134
42952	NC_021721	CAA	2	6	2656979	2656984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523515134
42953	NC_021721	GC	3	6	2657017	2657022	0 %	0 %	50 %	50 %	523515134
42954	NC_021721	TTC	2	6	2657073	2657078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515134
42955	NC_021721	GCA	2	6	2657191	2657196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515134
42956	NC_021721	GCCAT	2	10	2657250	2657259	20 %	20 %	20 %	40 %	523515134
42957	NC_021721	TTA	2	6	2657262	2657267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515134
42958	NC_021721	CCG	2	6	2657304	2657309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523515134
42959	NC_021721	GCCG	2	8	2657434	2657441	0 %	0 %	50 %	50 %	523515134
42960	NC_021721	TTG	2	6	2657446	2657451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523515134
42961	NC_021721	TAA	2	6	2657461	2657466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523515134
42962	NC_021721	CAAT	2	8	2657564	2657571	50 %	25 %	0 %	25 %	523515135
42963	NC_021721	CGA	3	9	2657578	2657586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515135
42964	NC_021721	CTT	3	9	2657616	2657624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523515135
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42975	NC_021721	GGTC	2	8	2658149	2658156	0 %	25 %	50 %	25 %	523515136
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42981	NC_021721	TA	3	6	2658406	2658411	50 %	50 %	0 %	0 %	523515136
42982	NC_021721	TAT	2	6	2658448	2658453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523515137
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42985	NC_021721	CAG	2	6	2658522	2658527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523515137
42986	NC_021721	ATG	2	6	2658631	2658636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523515137
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42989	NC_021721	CTG	2	6	2658767	2658772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523515137
42990	NC_021721	CGAA	2	8	2658838	2658845	50 %	0 %	25 %	25 %	523515137
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43000	NC_021721	T	6	6	2659797	2659802	0 %	100 %	0 %	0 %	523515139

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