MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_021721	GTT	2	6	1049494	1049499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513510
16503	NC_021721	TCG	2	6	1049540	1049545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513510
16504	NC_021721	TGAT	2	8	1049564	1049571	25 %	50 %	25 %	0 %	523513510
16505	NC_021721	GGC	2	6	1049599	1049604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513510
16506	NC_021721	A	6	6	1049609	1049614	100 %	0 %	0 %	0 %	523513510
16507	NC_021721	CAT	2	6	1049788	1049793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513510
16508	NC_021721	CAT	2	6	1049820	1049825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513510
16509	NC_021721	TTG	2	6	1049870	1049875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513510
16510	NC_021721	AAG	2	6	1049945	1049950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513510
16511	NC_021721	CTT	2	6	1050003	1050008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513510
16512	NC_021721	AAG	2	6	1050059	1050064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513510
16513	NC_021721	CAA	2	6	1050108	1050113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513510
16514	NC_021721	GTT	2	6	1050178	1050183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513510
16515	NC_021721	TGA	2	6	1050273	1050278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513510
16516	NC_021721	GAA	2	6	1050309	1050314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513510
16517	NC_021721	AAG	2	6	1050323	1050328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513510
16518	NC_021721	CGA	2	6	1050374	1050379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513510
16519	NC_021721	GTC	2	6	1050470	1050475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513510
16520	NC_021721	GAT	2	6	1050553	1050558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513510
16521	NC_021721	TGA	2	6	1050560	1050565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513510
16522	NC_021721	GAT	3	9	1050619	1050627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513510
16523	NC_021721	GAT	2	6	1050645	1050650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513510
16524	NC_021721	GAA	2	6	1050708	1050713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513510
16525	NC_021721	ATG	3	9	1050725	1050733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513510
16526	NC_021721	AAC	2	6	1050743	1050748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513510
16527	NC_021721	AGC	2	6	1050764	1050769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513510
16528	NC_021721	GCA	2	6	1050771	1050776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513510
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16530	NC_021721	TGAT	2	8	1050920	1050927	25 %	50 %	25 %	0 %	523513510
16531	NC_021721	AGC	2	6	1051028	1051033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513510
16532	NC_021721	GTT	2	6	1051069	1051074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513510
16533	NC_021721	AAG	3	9	1051187	1051195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513510
16534	NC_021721	GAA	2	6	1051210	1051215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513510
16535	NC_021721	TGA	3	9	1051230	1051238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513510
16536	NC_021721	TAA	2	6	1051288	1051293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513510
16537	NC_021721	GGC	2	6	1051566	1051571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513511
16538	NC_021721	ACA	3	9	1051586	1051594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513511
16539	NC_021721	CGAT	2	8	1051614	1051621	25 %	25 %	25 %	25 %	523513511
16540	NC_021721	TTA	2	6	1051669	1051674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513511
16541	NC_021721	GCA	2	6	1051698	1051703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513511
16542	NC_021721	AGA	3	9	1051704	1051712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513511
16543	NC_021721	CAA	2	6	1051788	1051793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513511
16544	NC_021721	GGC	2	6	1051822	1051827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513511
16545	NC_021721	GCT	2	6	1051953	1051958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513511
16546	NC_021721	AC	3	6	1052052	1052057	50 %	0 %	0 %	50 %	523513511
16547	NC_021721	GCG	2	6	1052153	1052158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513511
16548	NC_021721	CAA	2	6	1052175	1052180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513511
16549	NC_021721	GCGATG	2	12	1052272	1052283	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523513511
16550	NC_021721	GAA	3	9	1052308	1052316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513511
16551	NC_021721	AAGGCC	2	12	1052329	1052340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513511
16552	NC_021721	ATC	2	6	1052420	1052425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513511
16553	NC_021721	GGCAAT	2	12	1052443	1052454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523513511
16554	NC_021721	TCA	2	6	1052483	1052488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513511
16555	NC_021721	ATG	2	6	1052685	1052690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513512
16556	NC_021721	TGA	2	6	1052791	1052796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513512
16557	NC_021721	CAA	2	6	1052808	1052813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513512
16558	NC_021721	A	6	6	1052943	1052948	100 %	0 %	0 %	0 %	523513512
16559	NC_021721	TGA	2	6	1053013	1053018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513512
16560	NC_021721	AAC	3	9	1053033	1053041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513512
16561	NC_021721	GT	3	6	1053042	1053047	0 %	50 %	50 %	0 %	523513512
16562	NC_021721	CAA	2	6	1053067	1053072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513512
16563	NC_021721	CGA	2	6	1053091	1053096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513512
16564	NC_021721	TTG	2	6	1053135	1053140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513512
16565	NC_021721	TTA	2	6	1053177	1053182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513512
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16568	NC_021721	CAT	2	6	1053429	1053434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513513
16569	NC_021721	GAA	2	6	1053482	1053487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513513
16570	NC_021721	ACG	2	6	1053492	1053497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513513
16571	NC_021721	AAC	2	6	1053499	1053504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513513
16572	NC_021721	CAG	2	6	1053570	1053575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513513
16573	NC_021721	CGG	2	6	1053593	1053598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513513
16574	NC_021721	CGA	2	6	1053682	1053687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513513
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16580	NC_021721	TGC	2	6	1053976	1053981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513513
16581	NC_021721	TTG	2	6	1053991	1053996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513513
16582	NC_021721	GTT	2	6	1054011	1054016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513513
16583	NC_021721	CAGCTT	2	12	1054022	1054033	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523513513
16584	NC_021721	TTGAT	2	10	1054090	1054099	20 %	60 %	20 %	0 %	523513513
16585	NC_021721	ATC	3	9	1054116	1054124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513513
16586	NC_021721	GCG	2	6	1054151	1054156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513513
16587	NC_021721	CTTA	2	8	1054513	1054520	25 %	50 %	0 %	25 %	523513514
16588	NC_021721	GGTT	2	8	1054528	1054535	0 %	50 %	50 %	0 %	523513514
16589	NC_021721	GCC	2	6	1054599	1054604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513514
16590	NC_021721	GC	3	6	1054612	1054617	0 %	0 %	50 %	50 %	523513514
16591	NC_021721	TTC	2	6	1054649	1054654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513514
16592	NC_021721	GAC	2	6	1054704	1054709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513514
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16594	NC_021721	TTGC	2	8	1054730	1054737	0 %	50 %	25 %	25 %	523513514
16595	NC_021721	TAG	2	6	1054755	1054760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513514
16596	NC_021721	TGG	2	6	1054793	1054798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513514
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16598	NC_021721	TAT	2	6	1054884	1054889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513514
16599	NC_021721	CAA	2	6	1054952	1054957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513514
16600	NC_021721	CCG	2	6	1054960	1054965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513514
16601	NC_021721	GCG	2	6	1054979	1054984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513514
16602	NC_021721	CTGTTG	2	12	1055025	1055036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	523513514
16603	NC_021721	CTG	2	6	1055057	1055062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513514
16604	NC_021721	GGC	2	6	1055154	1055159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513514
16605	NC_021721	GGC	2	6	1055177	1055182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513514
16606	NC_021721	TTG	2	6	1055211	1055216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513514
16607	NC_021721	GTCTT	2	10	1055247	1055256	0 %	60 %	20 %	20 %	523513514
16608	NC_021721	CAG	2	6	1055259	1055264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513514
16609	NC_021721	TTGG	2	8	1055279	1055286	0 %	50 %	50 %	0 %	523513514
16610	NC_021721	GGTGT	2	10	1055342	1055351	0 %	40 %	60 %	0 %	523513514
16611	NC_021721	AACC	2	8	1055475	1055482	50 %	0 %	0 %	50 %	523513514
16612	NC_021721	GGA	2	6	1055584	1055589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513514
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16614	NC_021721	TTG	2	6	1055612	1055617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513515
16615	NC_021721	TGC	2	6	1055642	1055647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513515
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16619	NC_021721	TTG	2	6	1055861	1055866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513515
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16724	NC_021721	CG	3	6	1061491	1061496	0 %	0 %	50 %	50 %	523513520
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16730	NC_021721	GCC	2	6	1061638	1061643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513520
16731	NC_021721	TTC	2	6	1061665	1061670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513520
16732	NC_021721	ATG	2	6	1061693	1061698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513520
16733	NC_021721	CGA	2	6	1061735	1061740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513520
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16742	NC_021721	CAA	2	6	1062308	1062313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513521
16743	NC_021721	GC	3	6	1062314	1062319	0 %	0 %	50 %	50 %	523513521
16744	NC_021721	TGC	2	6	1062353	1062358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513521
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16843	NC_021721	TGG	2	6	1068597	1068602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513528
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16962	NC_021721	TTGC	2	8	1075351	1075358	0 %	50 %	25 %	25 %	523513534
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17000	NC_021721	CAT	2	6	1077968	1077973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513537

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