MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 50320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16004	NC_021721	AAATT	2	10	1019860	1019869	60 %	40 %	0 %	0 %	523513482
16005	NC_021721	AC	4	8	1019906	1019913	50 %	0 %	0 %	50 %	523513482
16006	NC_021721	ATT	2	6	1019955	1019960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513482
16007	NC_021721	TTG	2	6	1020046	1020051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513482
16008	NC_021721	GAA	2	6	1020108	1020113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513482
16009	NC_021721	A	7	7	1020199	1020205	100 %	0 %	0 %	0 %	523513482
16010	NC_021721	GAA	2	6	1020375	1020380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513482
16011	NC_021721	AAG	2	6	1020385	1020390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513482
16012	NC_021721	TGTT	2	8	1020400	1020407	0 %	75 %	25 %	0 %	523513482
16013	NC_021721	GCA	2	6	1020419	1020424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513482
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16015	NC_021721	TGA	2	6	1020567	1020572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513483
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16017	NC_021721	CGG	2	6	1020600	1020605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513483
16018	NC_021721	AGA	2	6	1020747	1020752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513483
16019	NC_021721	CGGA	2	8	1020871	1020878	25 %	0 %	50 %	25 %	523513483
16020	NC_021721	TG	4	8	1020926	1020933	0 %	50 %	50 %	0 %	523513483
16021	NC_021721	CGG	2	6	1020972	1020977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513483
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16023	NC_021721	GAT	2	6	1021114	1021119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513483
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16032	NC_021721	ACGGCA	2	12	1021397	1021408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513484
16033	NC_021721	ACAG	2	8	1021448	1021455	50 %	0 %	25 %	25 %	523513484
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16036	NC_021721	TTAA	2	8	1021617	1021624	50 %	50 %	0 %	0 %	523513484
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16063	NC_021721	AAGT	2	8	1023256	1023263	50 %	25 %	25 %	0 %	523513485
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16231	NC_021721	CAT	2	6	1034234	1034239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513496
16232	NC_021721	ACC	2	6	1034310	1034315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513497
16233	NC_021721	ATT	2	6	1034372	1034377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513497
16234	NC_021721	AGC	2	6	1034420	1034425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513497
16235	NC_021721	GAT	2	6	1034526	1034531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513497
16236	NC_021721	AGC	2	6	1034561	1034566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513497
16237	NC_021721	CTT	2	6	1034570	1034575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513497
16238	NC_021721	ATT	2	6	1034659	1034664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513497
16239	NC_021721	GAT	3	9	1034676	1034684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513497
16240	NC_021721	GCG	2	6	1034697	1034702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513497
16241	NC_021721	GCA	2	6	1034711	1034716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513497
16242	NC_021721	GATCAG	2	12	1034733	1034744	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523513497
16243	NC_021721	TACT	2	8	1034804	1034811	25 %	50 %	0 %	25 %	523513497
16244	NC_021721	ATG	2	6	1034820	1034825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513497
16245	NC_021721	GTC	2	6	1034838	1034843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513497
16246	NC_021721	GCA	2	6	1034880	1034885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513497
16247	NC_021721	CAG	2	6	1034929	1034934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513497
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16249	NC_021721	GCA	2	6	1035054	1035059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513497
16250	NC_021721	TGG	2	6	1035064	1035069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513497
16251	NC_021721	ATT	2	6	1035077	1035082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513497
16252	NC_021721	GGC	2	6	1035084	1035089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513497
16253	NC_021721	TTA	2	6	1035140	1035145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513497
16254	NC_021721	GGC	2	6	1035248	1035253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513497
16255	NC_021721	ATC	2	6	1035313	1035318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513497
16256	NC_021721	GCC	2	6	1035324	1035329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513497
16257	NC_021721	GTT	2	6	1035371	1035376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513497
16258	NC_021721	TGA	2	6	1035401	1035406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513497
16259	NC_021721	GCC	2	6	1035453	1035458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513497
16260	NC_021721	GGA	2	6	1035497	1035502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513497
16261	NC_021721	CCGG	2	8	1035689	1035696	0 %	0 %	50 %	50 %	523513498
16262	NC_021721	ATG	2	6	1035741	1035746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513498
16263	NC_021721	T	6	6	1035811	1035816	0 %	100 %	0 %	0 %	523513498
16264	NC_021721	ACA	2	6	1035824	1035829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513498
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16266	NC_021721	T	7	7	1035881	1035887	0 %	100 %	0 %	0 %	523513498
16267	NC_021721	GAT	2	6	1035947	1035952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513498
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16270	NC_021721	TTG	2	6	1036113	1036118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513498
16271	NC_021721	TTG	2	6	1036152	1036157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513498
16272	NC_021721	AGC	2	6	1036168	1036173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513498
16273	NC_021721	GAT	2	6	1036232	1036237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513498
16274	NC_021721	ACG	2	6	1036319	1036324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513498
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16277	NC_021721	TTTGAT	2	12	1036436	1036447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	523513498
16278	NC_021721	GGT	2	6	1036484	1036489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513498
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16280	NC_021721	GCAT	2	8	1036504	1036511	25 %	25 %	25 %	25 %	523513498
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16284	NC_021721	TGAT	2	8	1036737	1036744	25 %	50 %	25 %	0 %	523513498
16285	NC_021721	AGC	2	6	1036806	1036811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513499
16286	NC_021721	TTG	2	6	1036817	1036822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513499
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16291	NC_021721	ATTT	2	8	1037072	1037079	25 %	75 %	0 %	0 %	523513499
16292	NC_021721	AAC	2	6	1037103	1037108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513499
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16300	NC_021721	TGA	2	6	1037672	1037677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513500
16301	NC_021721	GAA	2	6	1037724	1037729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513500
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16304	NC_021721	GCA	2	6	1037868	1037873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513500
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16307	NC_021721	TGC	2	6	1037963	1037968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513500
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16312	NC_021721	CAAG	2	8	1038121	1038128	50 %	0 %	25 %	25 %	523513500
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16315	NC_021721	GTC	2	6	1038167	1038172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513500
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16331	NC_021721	ATT	2	6	1039521	1039526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	523513502
16332	NC_021721	CAG	2	6	1039597	1039602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16333	NC_021721	GGT	2	6	1039628	1039633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513502
16334	NC_021721	GAG	2	6	1039656	1039661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523513502
16335	NC_021721	GAT	2	6	1039728	1039733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513502
16336	NC_021721	GC	4	8	1039809	1039816	0 %	0 %	50 %	50 %	523513502
16337	NC_021721	CAG	2	6	1039824	1039829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16338	NC_021721	TAA	2	6	1039844	1039849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	523513502
16339	NC_021721	GCA	2	6	1039934	1039939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16340	NC_021721	ACC	2	6	1039961	1039966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523513502
16341	NC_021721	CTG	2	6	1039998	1040003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16342	NC_021721	GAC	2	6	1040100	1040105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16343	NC_021721	CCAA	2	8	1040113	1040120	50 %	0 %	0 %	50 %	523513502
16344	NC_021721	CAT	2	6	1040234	1040239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523513502
16345	NC_021721	GAC	2	6	1040274	1040279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16346	NC_021721	AGC	2	6	1040369	1040374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16347	NC_021721	CAA	2	6	1040437	1040442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513502
16348	NC_021721	T	6	6	1040450	1040455	0 %	100 %	0 %	0 %	523513502
16349	NC_021721	GCG	2	6	1040544	1040549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523513502
16350	NC_021721	CTG	2	6	1040605	1040610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513502
16351	NC_021721	GCGCG	2	10	1040631	1040640	0 %	0 %	60 %	40 %	523513502
16352	NC_021721	ATG	2	6	1040686	1040691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513502
16353	NC_021721	TGA	2	6	1040707	1040712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513502
16354	NC_021721	ATG	2	6	1040718	1040723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513502
16355	NC_021721	A	7	7	1040859	1040865	100 %	0 %	0 %	0 %	523513503
16356	NC_021721	CG	3	6	1040910	1040915	0 %	0 %	50 %	50 %	523513503
16357	NC_021721	TGA	2	6	1040947	1040952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513503
16358	NC_021721	CG	3	6	1040976	1040981	0 %	0 %	50 %	50 %	523513503
16359	NC_021721	AAC	2	6	1041022	1041027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523513503
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16362	NC_021721	CCAG	2	8	1041157	1041164	25 %	0 %	25 %	50 %	523513503
16363	NC_021721	TGA	2	6	1041193	1041198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513503
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16365	NC_021721	TGC	2	6	1041244	1041249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513503
16366	NC_021721	GGT	2	6	1041437	1041442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523513503
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16369	NC_021721	GA	4	8	1041644	1041651	50 %	0 %	50 %	0 %	523513503
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16373	NC_021721	TATGG	2	10	1041785	1041794	20 %	40 %	40 %	0 %	523513503
16374	NC_021721	ATG	2	6	1042160	1042165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513504
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16382	NC_021721	A	7	7	1042333	1042339	100 %	0 %	0 %	0 %	523513504
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16400	NC_021721	ATCC	2	8	1043006	1043013	25 %	25 %	0 %	50 %	523513504
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16446	NC_021721	TGC	2	6	1046091	1046096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523513507
16447	NC_021721	ATG	2	6	1046150	1046155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513507
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16449	NC_021721	CGC	2	6	1046273	1046278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523513507
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16451	NC_021721	CAAAC	2	10	1046317	1046326	60 %	0 %	0 %	40 %	523513507
16452	NC_021721	TA	3	6	1046348	1046353	50 %	50 %	0 %	0 %	523513507
16453	NC_021721	GGAC	2	8	1046359	1046366	25 %	0 %	50 %	25 %	523513507
16454	NC_021721	TTC	2	6	1046656	1046661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513508
16455	NC_021721	TCTT	2	8	1046746	1046753	0 %	75 %	0 %	25 %	523513508
16456	NC_021721	GAA	2	6	1046767	1046772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513508
16457	NC_021721	GAT	3	9	1046932	1046940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523513508
16458	NC_021721	GTT	2	6	1046950	1046955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523513508
16459	NC_021721	AAG	2	6	1046993	1046998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523513508
16460	NC_021721	CTT	2	6	1047030	1047035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523513508
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