MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 49051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_021514	TAA	2	6	2282979	2282984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841986
37002	NC_021514	CCT	2	6	2283078	2283083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513841987
37003	NC_021514	CCGT	2	8	2283119	2283126	0 %	25 %	25 %	50 %	513841987
37004	NC_021514	ATC	2	6	2283137	2283142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841987
37005	NC_021514	CAT	2	6	2283166	2283171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841987
37006	NC_021514	TGC	2	6	2283219	2283224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841987
37007	NC_021514	GAT	2	6	2283250	2283255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841987
37008	NC_021514	TGA	2	6	2283257	2283262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841987
37009	NC_021514	TCA	2	6	2283290	2283295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841987
37010	NC_021514	AAT	3	9	2283297	2283305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841987
37011	NC_021514	GGT	2	6	2283358	2283363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841987
37012	NC_021514	TAA	2	6	2283448	2283453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841987
37013	NC_021514	CGGC	2	8	2283528	2283535	0 %	0 %	50 %	50 %	513841987
37014	NC_021514	ATG	2	6	2283536	2283541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841987
37015	NC_021514	CAC	2	6	2283561	2283566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841987
37016	NC_021514	AAT	2	6	2283573	2283578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841987
37017	NC_021514	CCA	2	6	2283593	2283598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841987
37018	NC_021514	ACC	2	6	2283605	2283610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841987
37019	NC_021514	AATCA	2	10	2283646	2283655	60 %	20 %	0 %	20 %	513841987
37020	NC_021514	TCA	2	6	2283738	2283743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841987
37021	NC_021514	CA	3	6	2283812	2283817	50 %	0 %	0 %	50 %	513841988
37022	NC_021514	TCG	2	6	2283820	2283825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841988
37023	NC_021514	ATC	2	6	2283846	2283851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841988
37024	NC_021514	CAT	2	6	2283926	2283931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841988
37025	NC_021514	ATTG	2	8	2283958	2283965	25 %	50 %	25 %	0 %	513841988
37026	NC_021514	CCT	2	6	2284005	2284010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513841989
37027	NC_021514	TCA	2	6	2284142	2284147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841989
37028	NC_021514	GGT	2	6	2284165	2284170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841989
37029	NC_021514	CGC	2	6	2284216	2284221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841989
37030	NC_021514	ATC	2	6	2284333	2284338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841989
37031	NC_021514	AAC	2	6	2284441	2284446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841989
37032	NC_021514	ATT	2	6	2284567	2284572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841989
37033	NC_021514	TCGCTT	2	12	2284677	2284688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	513841989
37034	NC_021514	AAAGC	2	10	2284698	2284707	60 %	0 %	20 %	20 %	513841989
37035	NC_021514	ATT	3	9	2284730	2284738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841989
37036	NC_021514	TGC	2	6	2284770	2284775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841990
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37038	NC_021514	CAAC	2	8	2284871	2284878	50 %	0 %	0 %	50 %	513841990
37039	NC_021514	TCA	2	6	2284900	2284905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841990
37040	NC_021514	GTG	2	6	2285042	2285047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841990
37041	NC_021514	TAA	2	6	2285061	2285066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841990
37042	NC_021514	ATC	2	6	2285070	2285075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841990
37043	NC_021514	CGC	2	6	2285105	2285110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841990
37044	NC_021514	TG	3	6	2285196	2285201	0 %	50 %	50 %	0 %	513841990
37045	NC_021514	ATG	2	6	2285208	2285213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841990
37046	NC_021514	AAC	2	6	2285247	2285252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841990
37047	NC_021514	CAG	2	6	2285255	2285260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841990
37048	NC_021514	CAT	2	6	2285274	2285279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841990
37049	NC_021514	CAC	2	6	2285355	2285360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841990
37050	NC_021514	GCC	2	6	2285404	2285409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841990
37051	NC_021514	GAA	2	6	2285510	2285515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841990
37052	NC_021514	AGTGC	2	10	2285554	2285563	20 %	20 %	40 %	20 %	513841990
37053	NC_021514	GCA	2	6	2285590	2285595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841990
37054	NC_021514	TCA	2	6	2285608	2285613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841990
37055	NC_021514	GC	3	6	2285649	2285654	0 %	0 %	50 %	50 %	513841990
37056	NC_021514	GCC	2	6	2285668	2285673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841990
37057	NC_021514	ATC	2	6	2285676	2285681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841990
37058	NC_021514	CAA	2	6	2285690	2285695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841990
37059	NC_021514	TCA	2	6	2285783	2285788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841990
37060	NC_021514	CCA	2	6	2285806	2285811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841990
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37063	NC_021514	TGT	2	6	2285912	2285917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841991
37064	NC_021514	GGC	2	6	2285947	2285952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841991
37065	NC_021514	TCG	2	6	2285994	2285999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841991
37066	NC_021514	AGT	2	6	2286092	2286097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841991
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37068	NC_021514	AAT	2	6	2286148	2286153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841991
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37072	NC_021514	TTGG	2	8	2286950	2286957	0 %	50 %	50 %	0 %	513841992
37073	NC_021514	CAT	2	6	2286999	2287004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841992
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37080	NC_021514	CCAT	2	8	2287376	2287383	25 %	25 %	0 %	50 %	513841992
37081	NC_021514	GTT	2	6	2287408	2287413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841992
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37084	NC_021514	GCAT	2	8	2287559	2287566	25 %	25 %	25 %	25 %	513841992
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37087	NC_021514	CATC	2	8	2287647	2287654	25 %	25 %	0 %	50 %	513841992
37088	NC_021514	CGA	2	6	2287849	2287854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841992
37089	NC_021514	AAG	2	6	2287869	2287874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841992
37090	NC_021514	GCA	2	6	2287949	2287954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841992
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37094	NC_021514	CT	3	6	2288207	2288212	0 %	50 %	0 %	50 %	513841993
37095	NC_021514	CTT	2	6	2288240	2288245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841993
37096	NC_021514	CGT	2	6	2288250	2288255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841993
37097	NC_021514	T	6	6	2288274	2288279	0 %	100 %	0 %	0 %	513841993
37098	NC_021514	AAC	2	6	2288311	2288316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841993
37099	NC_021514	TCG	2	6	2288327	2288332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841993
37100	NC_021514	TCA	2	6	2288362	2288367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841993
37101	NC_021514	AATG	2	8	2288377	2288384	50 %	25 %	25 %	0 %	513841993
37102	NC_021514	AAT	2	6	2288499	2288504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841993
37103	NC_021514	TAA	2	6	2288603	2288608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841993
37104	NC_021514	TTGC	2	8	2288642	2288649	0 %	50 %	25 %	25 %	513841993
37105	NC_021514	AT	3	6	2288749	2288754	50 %	50 %	0 %	0 %	513841993
37106	NC_021514	CAA	2	6	2288757	2288762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841993
37107	NC_021514	ACG	2	6	2289052	2289057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841994
37108	NC_021514	ATCAA	2	10	2289063	2289072	60 %	20 %	0 %	20 %	513841994
37109	NC_021514	CCG	2	6	2289079	2289084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841994
37110	NC_021514	ACG	2	6	2289177	2289182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841994
37111	NC_021514	GAA	2	6	2289203	2289208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841994
37112	NC_021514	CCA	2	6	2289244	2289249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841994
37113	NC_021514	GCT	2	6	2289292	2289297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841994
37114	NC_021514	TGAC	2	8	2289314	2289321	25 %	25 %	25 %	25 %	513841994
37115	NC_021514	AATCC	2	10	2289326	2289335	40 %	20 %	0 %	40 %	513841994
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37231	NC_021514	CT	3	6	2297070	2297075	0 %	50 %	0 %	50 %	513842001
37232	NC_021514	TGC	2	6	2297084	2297089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842001
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37331	NC_021514	TGGT	2	8	2302776	2302783	0 %	50 %	50 %	0 %	513842011
37332	NC_021514	TCTTCA	2	12	2302866	2302877	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	513842011
37333	NC_021514	TGAA	2	8	2302914	2302921	50 %	25 %	25 %	0 %	513842011
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37337	NC_021514	GTT	2	6	2303388	2303393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842011
37338	NC_021514	CTT	2	6	2303399	2303404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842011
37339	NC_021514	TGC	2	6	2303411	2303416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842011
37340	NC_021514	CCG	2	6	2303902	2303907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842012
37341	NC_021514	CAA	2	6	2303939	2303944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842012
37342	NC_021514	C	6	6	2303949	2303954	0 %	0 %	0 %	100 %	513842012
37343	NC_021514	ATA	2	6	2303969	2303974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842012
37344	NC_021514	ATTA	2	8	2303978	2303985	50 %	50 %	0 %	0 %	513842012
37345	NC_021514	TGT	2	6	2304005	2304010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842012
37346	NC_021514	CTCA	2	8	2304101	2304108	25 %	25 %	0 %	50 %	513842012
37347	NC_021514	GTC	2	6	2304120	2304125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842012
37348	NC_021514	TTA	2	6	2304177	2304182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513842012
37349	NC_021514	CAAA	2	8	2304216	2304223	75 %	0 %	0 %	25 %	513842012
37350	NC_021514	ATC	2	6	2304249	2304254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842012
37351	NC_021514	TTAG	2	8	2304461	2304468	25 %	50 %	25 %	0 %	513842013
37352	NC_021514	TAA	2	6	2304487	2304492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842013
37353	NC_021514	ACC	2	6	2304517	2304522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842013
37354	NC_021514	TGC	2	6	2304615	2304620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842013
37355	NC_021514	TCT	2	6	2304624	2304629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513842013
37356	NC_021514	GCT	2	6	2304637	2304642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842013
37357	NC_021514	CAC	2	6	2304695	2304700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842013
37358	NC_021514	TAG	2	6	2304798	2304803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842013
37359	NC_021514	GGT	2	6	2304947	2304952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842013
37360	NC_021514	ATC	2	6	2304996	2305001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842013
37361	NC_021514	CGT	2	6	2305008	2305013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842013
37362	NC_021514	ATG	2	6	2305022	2305027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513842013
37363	NC_021514	CCAAT	2	10	2305074	2305083	40 %	20 %	0 %	40 %	513842013
37364	NC_021514	ATTG	2	8	2305098	2305105	25 %	50 %	25 %	0 %	513842013
37365	NC_021514	GTC	2	6	2305316	2305321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842014
37366	NC_021514	GTT	2	6	2305322	2305327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842014
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37368	NC_021514	AAAAC	2	10	2305384	2305393	80 %	0 %	0 %	20 %	513842014
37369	NC_021514	GGCC	2	8	2305438	2305445	0 %	0 %	50 %	50 %	513842014
37370	NC_021514	TGG	2	6	2305454	2305459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842014
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37373	NC_021514	CAAC	2	8	2305512	2305519	50 %	0 %	0 %	50 %	513842014
37374	NC_021514	TCCG	2	8	2306016	2306023	0 %	25 %	25 %	50 %	513842015
37375	NC_021514	TTG	2	6	2306132	2306137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513842015
37376	NC_021514	CGA	2	6	2306169	2306174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842015
37377	NC_021514	CAC	2	6	2306188	2306193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842015
37378	NC_021514	ATA	2	6	2306216	2306221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513842015
37379	NC_021514	CAT	2	6	2306366	2306371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842015
37380	NC_021514	GTTGA	2	10	2306408	2306417	20 %	40 %	40 %	0 %	513842015
37381	NC_021514	AAC	2	6	2306424	2306429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842015
37382	NC_021514	ACT	2	6	2306498	2306503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842015
37383	NC_021514	CAC	2	6	2306554	2306559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842015
37384	NC_021514	TCA	2	6	2306589	2306594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842015
37385	NC_021514	ATCA	2	8	2306651	2306658	50 %	25 %	0 %	25 %	513842015
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37388	NC_021514	CG	3	6	2306887	2306892	0 %	0 %	50 %	50 %	513842015
37389	NC_021514	GATC	2	8	2306959	2306966	25 %	25 %	25 %	25 %	513842015
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37392	NC_021514	AT	3	6	2307234	2307239	50 %	50 %	0 %	0 %	513842015
37393	NC_021514	CGT	2	6	2307283	2307288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842015
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37400	NC_021514	TAAG	2	8	2307464	2307471	50 %	25 %	25 %	0 %	513842015
37401	NC_021514	CAAA	2	8	2307478	2307485	75 %	0 %	0 %	25 %	513842015
37402	NC_021514	TCA	2	6	2307796	2307801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842016
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37405	NC_021514	AAG	2	6	2307905	2307910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842016
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37433	NC_021514	ACA	2	6	2309411	2309416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842017
37434	NC_021514	CAAC	3	12	2309426	2309437	50 %	0 %	0 %	50 %	513842017
37435	NC_021514	TGG	2	6	2309459	2309464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513842017
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37445	NC_021514	GAA	2	6	2309901	2309906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842017
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37447	NC_021514	ACC	2	6	2309982	2309987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842017
37448	NC_021514	CAG	2	6	2310144	2310149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842018
37449	NC_021514	T	6	6	2310166	2310171	0 %	100 %	0 %	0 %	513842018
37450	NC_021514	GAA	2	6	2310221	2310226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513842018
37451	NC_021514	CTTGA	2	10	2310314	2310323	20 %	40 %	20 %	20 %	513842018
37452	NC_021514	TTCAA	2	10	2310390	2310399	40 %	40 %	0 %	20 %	513842018
37453	NC_021514	TCG	2	6	2310411	2310416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842018
37454	NC_021514	GCA	2	6	2310677	2310682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842018
37455	NC_021514	GCT	2	6	2310710	2310715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842018
37456	NC_021514	GCT	3	9	2310722	2310730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842018
37457	NC_021514	TCA	2	6	2310934	2310939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513842019
37458	NC_021514	GCC	2	6	2310980	2310985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842019
37459	NC_021514	CAC	2	6	2311062	2311067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513842019
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37461	NC_021514	CAA	2	6	2311127	2311132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513842019
37462	NC_021514	GCC	2	6	2311165	2311170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842019
37463	NC_021514	TTCG	2	8	2311176	2311183	0 %	50 %	25 %	25 %	513842019
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37488	NC_021514	CGAT	2	8	2312846	2312853	25 %	25 %	25 %	25 %	513842022
37489	NC_021514	GTTG	2	8	2312980	2312987	0 %	50 %	50 %	0 %	513842022
37490	NC_021514	ACG	2	6	2313019	2313024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842022
37491	NC_021514	CGC	2	6	2313060	2313065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513842022
37492	NC_021514	CGT	2	6	2313117	2313122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513842022
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37495	NC_021514	CGA	2	6	2313403	2313408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513842023
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37500	NC_021514	A	6	6	2313805	2313810	100 %	0 %	0 %	0 %	513842024

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