MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 49051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_021514	TGA	2	6	1299110	1299115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841042
21003	NC_021514	TAGATA	2	12	1299826	1299837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	513841043
21004	NC_021514	CAG	2	6	1299887	1299892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841043
21005	NC_021514	GAGG	2	8	1299962	1299969	25 %	0 %	75 %	0 %	513841043
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21007	NC_021514	GA	3	6	1300129	1300134	50 %	0 %	50 %	0 %	513841043
21008	NC_021514	ATG	2	6	1300194	1300199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841043
21009	NC_021514	GAC	2	6	1300374	1300379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841043
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21012	NC_021514	AAG	2	6	1300516	1300521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841043
21013	NC_021514	TAG	2	6	1300591	1300596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841044
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21016	NC_021514	GAA	2	6	1300712	1300717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841044
21017	NC_021514	GCG	2	6	1300789	1300794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841044
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21019	NC_021514	GGC	2	6	1300917	1300922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841044
21020	NC_021514	ATG	2	6	1301228	1301233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841045
21021	NC_021514	CAG	2	6	1301291	1301296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841045
21022	NC_021514	TGA	2	6	1301328	1301333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841045
21023	NC_021514	TGA	2	6	1301397	1301402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841045
21024	NC_021514	ATG	2	6	1301438	1301443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841045
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21117	NC_021514	TGG	2	6	1307119	1307124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841049
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21225	NC_021514	GTCG	2	8	1312833	1312840	0 %	25 %	50 %	25 %	513841057
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21229	NC_021514	ATG	2	6	1313183	1313188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841058
21230	NC_021514	AT	3	6	1313254	1313259	50 %	50 %	0 %	0 %	513841058
21231	NC_021514	AAGC	2	8	1313287	1313294	50 %	0 %	25 %	25 %	513841058
21232	NC_021514	ATG	2	6	1313342	1313347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841058
21233	NC_021514	CCG	2	6	1313482	1313487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841059
21234	NC_021514	AGA	2	6	1313497	1313502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841059
21235	NC_021514	T	6	6	1313512	1313517	0 %	100 %	0 %	0 %	513841059
21236	NC_021514	CATC	2	8	1313619	1313626	25 %	25 %	0 %	50 %	513841059
21237	NC_021514	GAA	2	6	1313645	1313650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841059
21238	NC_021514	AAC	2	6	1313783	1313788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841059
21239	NC_021514	TTC	2	6	1313858	1313863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841059
21240	NC_021514	ATGA	2	8	1313873	1313880	50 %	25 %	25 %	0 %	513841059
21241	NC_021514	GCC	2	6	1313958	1313963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841059
21242	NC_021514	ACTTGA	2	12	1313974	1313985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	513841059
21243	NC_021514	AGCC	2	8	1314007	1314014	25 %	0 %	25 %	50 %	513841059
21244	NC_021514	ATG	2	6	1314231	1314236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841059
21245	NC_021514	ATC	2	6	1314262	1314267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841059
21246	NC_021514	CTT	2	6	1314280	1314285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841059
21247	NC_021514	GGT	2	6	1314287	1314292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841059
21248	NC_021514	TGA	2	6	1314294	1314299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841059
21249	NC_021514	CTG	2	6	1314318	1314323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841059
21250	NC_021514	ACC	2	6	1314550	1314555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841059
21251	NC_021514	GATGAA	2	12	1314587	1314598	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	513841059
21252	NC_021514	CAGA	2	8	1314659	1314666	50 %	0 %	25 %	25 %	513841059
21253	NC_021514	CGA	2	6	1314669	1314674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841059
21254	NC_021514	GAA	2	6	1314676	1314681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841059
21255	NC_021514	CAA	2	6	1314749	1314754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841059
21256	NC_021514	CG	4	8	1315025	1315032	0 %	0 %	50 %	50 %	513841060
21257	NC_021514	CAA	2	6	1315048	1315053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841060
21258	NC_021514	GAC	2	6	1315099	1315104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841060
21259	NC_021514	CTTA	2	8	1315149	1315156	25 %	50 %	0 %	25 %	513841060
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21261	NC_021514	ATT	2	6	1315250	1315255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841060
21262	NC_021514	TAT	2	6	1315279	1315284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841060
21263	NC_021514	GAA	2	6	1315285	1315290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841060
21264	NC_021514	TGG	2	6	1315327	1315332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841060
21265	NC_021514	GAA	2	6	1315390	1315395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841060
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21268	NC_021514	GCA	2	6	1315545	1315550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841060
21269	NC_021514	AGA	2	6	1315602	1315607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841060
21270	NC_021514	GCA	2	6	1315611	1315616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841060
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21279	NC_021514	GCAT	2	8	1316127	1316134	25 %	25 %	25 %	25 %	513841061
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21288	NC_021514	ATTT	2	8	1316346	1316353	25 %	75 %	0 %	0 %	513841061
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21292	NC_021514	TCGG	2	8	1316506	1316513	0 %	25 %	50 %	25 %	513841061
21293	NC_021514	TTGT	2	8	1316543	1316550	0 %	75 %	25 %	0 %	513841061
21294	NC_021514	CAA	2	6	1316669	1316674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841061
21295	NC_021514	GTT	2	6	1316725	1316730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841061
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21300	NC_021514	GCT	2	6	1317044	1317049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841062
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21303	NC_021514	ATG	2	6	1317208	1317213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841062
21304	NC_021514	A	7	7	1317367	1317373	100 %	0 %	0 %	0 %	513841062
21305	NC_021514	GGC	2	6	1317432	1317437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841063
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21309	NC_021514	CTT	2	6	1317513	1317518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841063
21310	NC_021514	AAG	2	6	1317589	1317594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841063
21311	NC_021514	TCG	2	6	1317627	1317632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841063
21312	NC_021514	TGG	2	6	1317682	1317687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841063
21313	NC_021514	TTG	2	6	1317826	1317831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841063
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21316	NC_021514	TCT	2	6	1318389	1318394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841064
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21319	NC_021514	TTTC	2	8	1318513	1318520	0 %	75 %	0 %	25 %	513841064
21320	NC_021514	AAG	2	6	1318576	1318581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841064
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21322	NC_021514	AAT	2	6	1318589	1318594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841064
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21326	NC_021514	CGT	2	6	1318914	1318919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841065
21327	NC_021514	ATC	2	6	1318981	1318986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841065
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21329	NC_021514	TGG	2	6	1319127	1319132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841065
21330	NC_021514	GCT	2	6	1319298	1319303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841066
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21332	NC_021514	TGA	2	6	1319355	1319360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841066
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21334	NC_021514	TAA	2	6	1319386	1319391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841066
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21337	NC_021514	TCG	2	6	1320488	1320493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841067
21338	NC_021514	ATC	2	6	1320496	1320501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841067
21339	NC_021514	TGG	2	6	1320510	1320515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841067
21340	NC_021514	ATT	2	6	1320524	1320529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841067
21341	NC_021514	TTG	2	6	1320536	1320541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841067
21342	NC_021514	T	6	6	1320702	1320707	0 %	100 %	0 %	0 %	513841068
21343	NC_021514	AGC	2	6	1320745	1320750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841068
21344	NC_021514	CTT	2	6	1320753	1320758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841068
21345	NC_021514	CGA	2	6	1320764	1320769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841068
21346	NC_021514	CAA	2	6	1320828	1320833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841068
21347	NC_021514	CGG	2	6	1321280	1321285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841069
21348	NC_021514	ATTA	2	8	1321300	1321307	50 %	50 %	0 %	0 %	513841069
21349	NC_021514	ACAG	2	8	1321315	1321322	50 %	0 %	25 %	25 %	513841069
21350	NC_021514	GCA	2	6	1321364	1321369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841069
21351	NC_021514	TTG	2	6	1321416	1321421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841069
21352	NC_021514	T	6	6	1321530	1321535	0 %	100 %	0 %	0 %	513841069
21353	NC_021514	TCAG	2	8	1321560	1321567	25 %	25 %	25 %	25 %	513841069
21354	NC_021514	TCAA	2	8	1321617	1321624	50 %	25 %	0 %	25 %	513841069
21355	NC_021514	ATCA	2	8	1321628	1321635	50 %	25 %	0 %	25 %	513841069
21356	NC_021514	GAC	2	6	1321642	1321647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841069
21357	NC_021514	ATGAT	2	10	1321770	1321779	40 %	40 %	20 %	0 %	513841069
21358	NC_021514	A	7	7	1321811	1321817	100 %	0 %	0 %	0 %	513841069
21359	NC_021514	TGA	2	6	1321827	1321832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841069
21360	NC_021514	T	6	6	1321859	1321864	0 %	100 %	0 %	0 %	513841069
21361	NC_021514	GTGAA	2	10	1321865	1321874	40 %	20 %	40 %	0 %	513841069
21362	NC_021514	ATT	2	6	1322040	1322045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841070
21363	NC_021514	TGG	2	6	1322051	1322056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841070
21364	NC_021514	GCT	3	9	1322109	1322117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841070
21365	NC_021514	AGT	2	6	1322141	1322146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841070
21366	NC_021514	TGG	2	6	1322153	1322158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841070
21367	NC_021514	AAG	2	6	1322265	1322270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841070
21368	NC_021514	AAG	2	6	1322283	1322288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841070
21369	NC_021514	CAAT	2	8	1322491	1322498	50 %	25 %	0 %	25 %	513841071
21370	NC_021514	GTA	2	6	1322529	1322534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841071
21371	NC_021514	TGA	2	6	1322540	1322545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841071
21372	NC_021514	TGG	2	6	1322552	1322557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841071
21373	NC_021514	AC	3	6	1322596	1322601	50 %	0 %	0 %	50 %	513841071
21374	NC_021514	AACA	2	8	1322683	1322690	75 %	0 %	0 %	25 %	513841071
21375	NC_021514	TTC	2	6	1322739	1322744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841072
21376	NC_021514	TC	3	6	1322743	1322748	0 %	50 %	0 %	50 %	513841072
21377	NC_021514	GGT	3	9	1322757	1322765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841072
21378	NC_021514	GTG	2	6	1322899	1322904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841072
21379	NC_021514	CGA	2	6	1322906	1322911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841072
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21381	NC_021514	TCGT	2	8	1322938	1322945	0 %	50 %	25 %	25 %	513841072
21382	NC_021514	AAT	2	6	1322995	1323000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841072
21383	NC_021514	AAT	2	6	1323189	1323194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841073
21384	NC_021514	ATG	2	6	1323386	1323391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841073
21385	NC_021514	ATT	2	6	1323439	1323444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841073
21386	NC_021514	TGA	2	6	1323582	1323587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841073
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21415	NC_021514	TGA	2	6	1325461	1325466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841076
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21442	NC_021514	TGCGGC	2	12	1327339	1327350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	513841078
21443	NC_021514	ATTA	2	8	1327402	1327409	50 %	50 %	0 %	0 %	513841078
21444	NC_021514	GTG	3	9	1327416	1327424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841078
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21446	NC_021514	GCGG	2	8	1327555	1327562	0 %	0 %	75 %	25 %	513841078
21447	NC_021514	TA	3	6	1327599	1327604	50 %	50 %	0 %	0 %	513841078
21448	NC_021514	TTA	2	6	1327613	1327618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841078
21449	NC_021514	AGACC	2	10	1327630	1327639	40 %	0 %	20 %	40 %	513841078
21450	NC_021514	TAA	2	6	1327690	1327695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841078
21451	NC_021514	CGT	2	6	1327704	1327709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841078
21452	NC_021514	CTT	2	6	1327762	1327767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841078
21453	NC_021514	CAA	2	6	1327838	1327843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841078
21454	NC_021514	GCA	2	6	1327903	1327908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841078
21455	NC_021514	CAA	2	6	1327952	1327957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841078
21456	NC_021514	CGG	2	6	1328031	1328036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841078
21457	NC_021514	GGT	2	6	1328044	1328049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841078
21458	NC_021514	GGA	2	6	1328138	1328143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513841078
21459	NC_021514	AAT	2	6	1328145	1328150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841078
21460	NC_021514	AAC	2	6	1328156	1328161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841079
21461	NC_021514	AGCA	2	8	1328272	1328279	50 %	0 %	25 %	25 %	513841079
21462	NC_021514	GCAA	2	8	1328283	1328290	50 %	0 %	25 %	25 %	513841079
21463	NC_021514	GAT	2	6	1328322	1328327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841079
21464	NC_021514	CGA	2	6	1328340	1328345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841079
21465	NC_021514	ATT	2	6	1328383	1328388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841080
21466	NC_021514	AGC	2	6	1328439	1328444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841080
21467	NC_021514	CTGA	2	8	1328471	1328478	25 %	25 %	25 %	25 %	513841080
21468	NC_021514	ACG	2	6	1328564	1328569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841080
21469	NC_021514	GTTGA	2	10	1328597	1328606	20 %	40 %	40 %	0 %	513841080
21470	NC_021514	GAT	2	6	1328630	1328635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841080
21471	NC_021514	ACG	2	6	1328662	1328667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841080
21472	NC_021514	ATCG	2	8	1328776	1328783	25 %	25 %	25 %	25 %	513841080
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21474	NC_021514	ACA	2	6	1328869	1328874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841080
21475	NC_021514	ACA	2	6	1328893	1328898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841080
21476	NC_021514	AGA	2	6	1328910	1328915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841080
21477	NC_021514	CAGG	2	8	1328942	1328949	25 %	0 %	50 %	25 %	513841080
21478	NC_021514	CAAC	2	8	1328969	1328976	50 %	0 %	0 %	50 %	513841080
21479	NC_021514	GAT	2	6	1329035	1329040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841080
21480	NC_021514	GCT	2	6	1329173	1329178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841080
21481	NC_021514	GCTT	2	8	1329225	1329232	0 %	50 %	25 %	25 %	513841080
21482	NC_021514	TAT	2	6	1329299	1329304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841081
21483	NC_021514	ACA	2	6	1329309	1329314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841081
21484	NC_021514	ATT	2	6	1329318	1329323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841081
21485	NC_021514	GAA	2	6	1329382	1329387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841081
21486	NC_021514	TCG	2	6	1329544	1329549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841081
21487	NC_021514	TGG	2	6	1329552	1329557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841081
21488	NC_021514	GTA	2	6	1329614	1329619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841081
21489	NC_021514	CG	3	6	1329650	1329655	0 %	0 %	50 %	50 %	513841081
21490	NC_021514	ATTT	2	8	1329744	1329751	25 %	75 %	0 %	0 %	513841081
21491	NC_021514	ATT	2	6	1329784	1329789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841081
21492	NC_021514	GGT	2	6	1329796	1329801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841081
21493	NC_021514	CTG	2	6	1329878	1329883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841081
21494	NC_021514	TCA	2	6	1329885	1329890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841081
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21496	NC_021514	GTG	2	6	1329971	1329976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841081
21497	NC_021514	A	6	6	1330052	1330057	100 %	0 %	0 %	0 %	513841081
21498	NC_021514	GGC	2	6	1330062	1330067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841081
21499	NC_021514	GAA	2	6	1330181	1330186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841082
21500	NC_021514	ATT	2	6	1330214	1330219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841082

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