MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 49051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021514	ATAA	2	8	1150468	1150475	75 %	25 %	0 %	0 %	513840910
18502	NC_021514	AGA	2	6	1150607	1150612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840911
18503	NC_021514	ATCAAT	2	12	1150654	1150665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	513840911
18504	NC_021514	TATT	2	8	1150755	1150762	25 %	75 %	0 %	0 %	513840911
18505	NC_021514	T	7	7	1150802	1150808	0 %	100 %	0 %	0 %	513840911
18506	NC_021514	CAA	2	6	1150811	1150816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840911
18507	NC_021514	GGT	2	6	1150820	1150825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840911
18508	NC_021514	T	6	6	1150904	1150909	0 %	100 %	0 %	0 %	513840911
18509	NC_021514	TCG	2	6	1150927	1150932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840911
18510	NC_021514	GTT	3	9	1150940	1150948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840911
18511	NC_021514	ATC	2	6	1150971	1150976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840911
18512	NC_021514	AATGCG	2	12	1151045	1151056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	513840911
18513	NC_021514	AATT	2	8	1151091	1151098	50 %	50 %	0 %	0 %	513840911
18514	NC_021514	AAT	2	6	1151241	1151246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840912
18515	NC_021514	ACC	2	6	1151375	1151380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840912
18516	NC_021514	TGA	2	6	1151420	1151425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840912
18517	NC_021514	GAC	2	6	1151486	1151491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840912
18518	NC_021514	CCAA	2	8	1151526	1151533	50 %	0 %	0 %	50 %	513840912
18519	NC_021514	TAA	2	6	1151544	1151549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840912
18520	NC_021514	TTAA	2	8	1151638	1151645	50 %	50 %	0 %	0 %	513840913
18521	NC_021514	GC	3	6	1151727	1151732	0 %	0 %	50 %	50 %	513840913
18522	NC_021514	ATCA	2	8	1151742	1151749	50 %	25 %	0 %	25 %	513840913
18523	NC_021514	CGTT	2	8	1151779	1151786	0 %	50 %	25 %	25 %	513840913
18524	NC_021514	TAACT	2	10	1152004	1152013	40 %	40 %	0 %	20 %	513840913
18525	NC_021514	CTT	2	6	1152092	1152097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840913
18526	NC_021514	TCA	2	6	1152149	1152154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840913
18527	NC_021514	GTC	2	6	1152304	1152309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840913
18528	NC_021514	TCG	2	6	1152359	1152364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840913
18529	NC_021514	T	6	6	1152503	1152508	0 %	100 %	0 %	0 %	513840913
18530	NC_021514	TGG	2	6	1152561	1152566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840913
18531	NC_021514	TGC	2	6	1152602	1152607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840913
18532	NC_021514	CAA	2	6	1152658	1152663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840913
18533	NC_021514	CCA	2	6	1152664	1152669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840913
18534	NC_021514	TTC	2	6	1152708	1152713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840913
18535	NC_021514	ACC	2	6	1152739	1152744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840913
18536	NC_021514	TGA	2	6	1152965	1152970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840913
18537	NC_021514	ATA	2	6	1153029	1153034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840913
18538	NC_021514	TGGT	2	8	1153060	1153067	0 %	50 %	50 %	0 %	513840913
18539	NC_021514	GTT	2	6	1153085	1153090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840913
18540	NC_021514	GCA	2	6	1153102	1153107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840913
18541	NC_021514	TGAT	2	8	1153234	1153241	25 %	50 %	25 %	0 %	513840913
18542	NC_021514	GGT	2	6	1153242	1153247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840913
18543	NC_021514	AAT	2	6	1153311	1153316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840913
18544	NC_021514	TTCA	2	8	1153480	1153487	25 %	50 %	0 %	25 %	513840913
18545	NC_021514	CCT	2	6	1153493	1153498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513840914
18546	NC_021514	GC	3	6	1153537	1153542	0 %	0 %	50 %	50 %	513840914
18547	NC_021514	GCT	2	6	1153562	1153567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840914
18548	NC_021514	GAT	2	6	1153825	1153830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840914
18549	NC_021514	GTG	2	6	1153892	1153897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840914
18550	NC_021514	GCT	2	6	1153944	1153949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840914
18551	NC_021514	TCA	2	6	1153979	1153984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840914
18552	NC_021514	AAT	2	6	1153990	1153995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840914
18553	NC_021514	CTT	2	6	1154025	1154030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840914
18554	NC_021514	TCG	2	6	1154078	1154083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840914
18555	NC_021514	GTG	2	6	1154112	1154117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840914
18556	NC_021514	CAGT	2	8	1154280	1154287	25 %	25 %	25 %	25 %	513840914
18557	NC_021514	TCT	2	6	1154357	1154362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840914
18558	NC_021514	TGC	2	6	1154440	1154445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840914
18559	NC_021514	GTT	3	9	1154489	1154497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840914
18560	NC_021514	GCG	2	6	1154594	1154599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840914
18561	NC_021514	GTT	2	6	1154611	1154616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840914
18562	NC_021514	GACTG	2	10	1154622	1154631	20 %	20 %	40 %	20 %	513840914
18563	NC_021514	AGGCC	2	10	1154745	1154754	20 %	0 %	40 %	40 %	513840914
18564	NC_021514	TGG	2	6	1154790	1154795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840914
18565	NC_021514	TAA	2	6	1154809	1154814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840914
18566	NC_021514	ATC	2	6	1154842	1154847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840914
18567	NC_021514	CTG	2	6	1154866	1154871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840914
18568	NC_021514	AAT	2	6	1154923	1154928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840914
18569	NC_021514	GTCCA	2	10	1155007	1155016	20 %	20 %	20 %	40 %	513840914
18570	NC_021514	CGT	2	6	1155154	1155159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840914
18571	NC_021514	TTC	2	6	1155217	1155222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840914
18572	NC_021514	TTG	2	6	1155229	1155234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840914
18573	NC_021514	TAA	2	6	1155244	1155249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840914
18574	NC_021514	CGG	2	6	1155270	1155275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840914
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18576	NC_021514	GTA	2	6	1155379	1155384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840914
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18579	NC_021514	CGG	2	6	1155486	1155491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840914
18580	NC_021514	TAG	2	6	1155515	1155520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840914
18581	NC_021514	T	6	6	1155679	1155684	0 %	100 %	0 %	0 %	513840914
18582	NC_021514	TAA	2	6	1155792	1155797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840914
18583	NC_021514	GAA	2	6	1156688	1156693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840915
18584	NC_021514	CAA	2	6	1156732	1156737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840915
18585	NC_021514	GT	3	6	1156797	1156802	0 %	50 %	50 %	0 %	513840915
18586	NC_021514	TC	3	6	1156819	1156824	0 %	50 %	0 %	50 %	513840915
18587	NC_021514	TCA	2	6	1156892	1156897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840915
18588	NC_021514	GCG	2	6	1156984	1156989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840915
18589	NC_021514	T	7	7	1157010	1157016	0 %	100 %	0 %	0 %	513840915
18590	NC_021514	ATGA	2	8	1157053	1157060	50 %	25 %	25 %	0 %	513840915
18591	NC_021514	GC	3	6	1157160	1157165	0 %	0 %	50 %	50 %	513840915
18592	NC_021514	ACCG	2	8	1157233	1157240	25 %	0 %	25 %	50 %	513840915
18593	NC_021514	TTTG	2	8	1157271	1157278	0 %	75 %	25 %	0 %	513840915
18594	NC_021514	GAC	2	6	1157289	1157294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840915
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18596	NC_021514	GGC	2	6	1157343	1157348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840915
18597	NC_021514	TACT	2	8	1157464	1157471	25 %	50 %	0 %	25 %	513840915
18598	NC_021514	CGA	2	6	1157532	1157537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840915
18599	NC_021514	TGAC	2	8	1157540	1157547	25 %	25 %	25 %	25 %	513840915
18600	NC_021514	TCAAG	2	10	1157673	1157682	40 %	20 %	20 %	20 %	513840915
18601	NC_021514	AAT	3	9	1157740	1157748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840915
18602	NC_021514	ACG	2	6	1157893	1157898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840915
18603	NC_021514	GTG	2	6	1157932	1157937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840915
18604	NC_021514	TGA	2	6	1157964	1157969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840915
18605	NC_021514	CCA	2	6	1158028	1158033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840915
18606	NC_021514	TGC	2	6	1158099	1158104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840915
18607	NC_021514	GGC	2	6	1158189	1158194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840915
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18610	NC_021514	TGG	2	6	1158337	1158342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840916
18611	NC_021514	AGTT	2	8	1158345	1158352	25 %	50 %	25 %	0 %	513840916
18612	NC_021514	AGA	2	6	1158358	1158363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840916
18613	NC_021514	GCT	2	6	1158386	1158391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840916
18614	NC_021514	AGC	2	6	1158393	1158398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840916
18615	NC_021514	AAT	2	6	1158416	1158421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840916
18616	NC_021514	AATT	2	8	1158441	1158448	50 %	50 %	0 %	0 %	513840916
18617	NC_021514	TGG	2	6	1158454	1158459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840916
18618	NC_021514	TGA	2	6	1158490	1158495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840916
18619	NC_021514	GT	3	6	1158564	1158569	0 %	50 %	50 %	0 %	513840916
18620	NC_021514	ATTGA	2	10	1158590	1158599	40 %	40 %	20 %	0 %	513840916
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18625	NC_021514	TTGG	2	8	1158971	1158978	0 %	50 %	50 %	0 %	513840916
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18728	NC_021514	GGT	2	6	1164149	1164154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840920
18729	NC_021514	CGC	2	6	1164155	1164160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513840920
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18731	NC_021514	GTC	3	9	1164459	1164467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840920
18732	NC_021514	ATC	2	6	1164672	1164677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840920
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18952	NC_021514	GGC	2	6	1178536	1178541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840931
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18956	NC_021514	TGA	2	6	1178630	1178635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840931
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18958	NC_021514	AAT	2	6	1178729	1178734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840932
18959	NC_021514	TTA	2	6	1178739	1178744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840932
18960	NC_021514	ATG	2	6	1178762	1178767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840932
18961	NC_021514	CGA	2	6	1178829	1178834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840932
18962	NC_021514	ATTCC	2	10	1178882	1178891	20 %	40 %	0 %	40 %	513840932
18963	NC_021514	GTT	2	6	1178921	1178926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840932
18964	NC_021514	ATT	2	6	1178995	1179000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840932
18965	NC_021514	TCG	2	6	1179099	1179104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840932
18966	NC_021514	TCCG	2	8	1179116	1179123	0 %	25 %	25 %	50 %	513840932
18967	NC_021514	ATT	2	6	1179217	1179222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840932
18968	NC_021514	TTA	2	6	1179254	1179259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840932
18969	NC_021514	TAT	2	6	1179381	1179386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840932
18970	NC_021514	GAT	2	6	1179409	1179414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840932
18971	NC_021514	GCAG	2	8	1179472	1179479	25 %	0 %	50 %	25 %	513840932
18972	NC_021514	GGT	2	6	1179490	1179495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840932
18973	NC_021514	TGT	2	6	1179510	1179515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840932
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18975	NC_021514	TGT	2	6	1179726	1179731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840932
18976	NC_021514	TGAC	2	8	1179846	1179853	25 %	25 %	25 %	25 %	513840932
18977	NC_021514	CTT	2	6	1179892	1179897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840932
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18980	NC_021514	GCGG	2	8	1179955	1179962	0 %	0 %	75 %	25 %	513840932
18981	NC_021514	TGGGG	2	10	1180048	1180057	0 %	20 %	80 %	0 %	513840933
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18983	NC_021514	CTG	2	6	1180208	1180213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840933
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18985	NC_021514	ATC	2	6	1180274	1180279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840933
18986	NC_021514	AAG	2	6	1180286	1180291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840933
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18989	NC_021514	GGA	2	6	1180488	1180493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513840933
18990	NC_021514	TGG	2	6	1180500	1180505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840933
18991	NC_021514	TAA	2	6	1180608	1180613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840933
18992	NC_021514	CAA	2	6	1180675	1180680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840933
18993	NC_021514	TTG	2	6	1180694	1180699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840933
18994	NC_021514	AGCA	2	8	1180718	1180725	50 %	0 %	25 %	25 %	513840933
18995	NC_021514	GTTG	2	8	1180750	1180757	0 %	50 %	50 %	0 %	513840933
18996	NC_021514	CGG	2	6	1180799	1180804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840933
18997	NC_021514	ACG	2	6	1180890	1180895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840933
18998	NC_021514	ACA	2	6	1181008	1181013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840933
18999	NC_021514	GC	3	6	1181054	1181059	0 %	0 %	50 %	50 %	513840933
19000	NC_021514	ATT	2	6	1181120	1181125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840933

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