MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 49051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021514	ACG	2	6	1053754	1053759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840836
17002	NC_021514	GAA	2	6	1053767	1053772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840836
17003	NC_021514	TGC	2	6	1053824	1053829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840836
17004	NC_021514	TGA	2	6	1053841	1053846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840836
17005	NC_021514	CAA	2	6	1053873	1053878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840836
17006	NC_021514	CAT	2	6	1053914	1053919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840836
17007	NC_021514	ACA	2	6	1053922	1053927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840836
17008	NC_021514	ATG	2	6	1053971	1053976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840836
17009	NC_021514	ATT	2	6	1054173	1054178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840837
17010	NC_021514	TTC	2	6	1054198	1054203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840837
17011	NC_021514	GTC	2	6	1054444	1054449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840837
17012	NC_021514	AAG	2	6	1054492	1054497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840837
17013	NC_021514	TAC	2	6	1054582	1054587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840837
17014	NC_021514	TGGT	2	8	1054602	1054609	0 %	50 %	50 %	0 %	513840837
17015	NC_021514	GCTG	2	8	1054618	1054625	0 %	25 %	50 %	25 %	513840837
17016	NC_021514	GCC	2	6	1054666	1054671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513840837
17017	NC_021514	TGG	2	6	1054712	1054717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840837
17018	NC_021514	AGCT	2	8	1054742	1054749	25 %	25 %	25 %	25 %	513840837
17019	NC_021514	GCC	3	9	1054840	1054848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513840837
17020	NC_021514	TGA	2	6	1054850	1054855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840837
17021	NC_021514	GTT	2	6	1054867	1054872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840837
17022	NC_021514	TCT	2	6	1054880	1054885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840837
17023	NC_021514	CAT	2	6	1054944	1054949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840837
17024	NC_021514	TAT	2	6	1054988	1054993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840837
17025	NC_021514	ATT	2	6	1055017	1055022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840837
17026	NC_021514	AAATGG	2	12	1055040	1055051	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	513840837
17027	NC_021514	AGT	2	6	1055077	1055082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840838
17028	NC_021514	GCA	2	6	1055149	1055154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840838
17029	NC_021514	CCTT	2	8	1055155	1055162	0 %	50 %	0 %	50 %	513840838
17030	NC_021514	GGC	2	6	1055183	1055188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840838
17031	NC_021514	TATTCT	2	12	1055234	1055245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	513840838
17032	NC_021514	TGG	2	6	1055256	1055261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840838
17033	NC_021514	CCTC	2	8	1055313	1055320	0 %	25 %	0 %	75 %	513840838
17034	NC_021514	GCG	2	6	1055395	1055400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840838
17035	NC_021514	TCT	2	6	1055427	1055432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840838
17036	NC_021514	TATG	2	8	1055472	1055479	25 %	50 %	25 %	0 %	513840838
17037	NC_021514	TTGA	2	8	1055518	1055525	25 %	50 %	25 %	0 %	513840838
17038	NC_021514	GAA	2	6	1055754	1055759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840838
17039	NC_021514	ATT	3	9	1055848	1055856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840838
17040	NC_021514	TCT	2	6	1055885	1055890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840838
17041	NC_021514	CAC	2	6	1055930	1055935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840838
17042	NC_021514	AGA	2	6	1055969	1055974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840838
17043	NC_021514	AGG	2	6	1056095	1056100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513840838
17044	NC_021514	TTG	2	6	1056236	1056241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840839
17045	NC_021514	GAC	2	6	1056267	1056272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840839
17046	NC_021514	ATT	2	6	1056346	1056351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840839
17047	NC_021514	CAT	2	6	1056422	1056427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840839
17048	NC_021514	CAA	2	6	1056434	1056439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840839
17049	NC_021514	TGA	2	6	1056470	1056475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840839
17050	NC_021514	GAA	2	6	1056489	1056494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840839
17051	NC_021514	A	6	6	1056493	1056498	100 %	0 %	0 %	0 %	513840839
17052	NC_021514	TTGG	2	8	1056532	1056539	0 %	50 %	50 %	0 %	513840839
17053	NC_021514	GATTGC	2	12	1056612	1056623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	513840839
17054	NC_021514	TGA	2	6	1056654	1056659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840839
17055	NC_021514	TGA	2	6	1056707	1056712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840839
17056	NC_021514	TCT	2	6	1056845	1056850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840839
17057	NC_021514	CCA	2	6	1056943	1056948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840839
17058	NC_021514	ACC	2	6	1056960	1056965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840839
17059	NC_021514	CTG	2	6	1057106	1057111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840839
17060	NC_021514	AGTA	2	8	1057187	1057194	50 %	25 %	25 %	0 %	513840839
17061	NC_021514	TGA	2	6	1057203	1057208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840840
17062	NC_021514	A	7	7	1057213	1057219	100 %	0 %	0 %	0 %	513840840
17063	NC_021514	A	6	6	1057261	1057266	100 %	0 %	0 %	0 %	513840840
17064	NC_021514	TGA	2	6	1057284	1057289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840840
17065	NC_021514	CAT	2	6	1057371	1057376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840840
17066	NC_021514	AC	3	6	1057437	1057442	50 %	0 %	0 %	50 %	513840840
17067	NC_021514	AAG	2	6	1057444	1057449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840840
17068	NC_021514	GAT	2	6	1057573	1057578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840840
17069	NC_021514	CAAG	2	8	1057590	1057597	50 %	0 %	25 %	25 %	513840840
17070	NC_021514	GGT	2	6	1057666	1057671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840840
17071	NC_021514	TCA	2	6	1057721	1057726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840840
17072	NC_021514	TGA	2	6	1057731	1057736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840840
17073	NC_021514	TGA	2	6	1057784	1057789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840840
17074	NC_021514	TTAT	3	12	1057818	1057829	25 %	75 %	0 %	0 %	513840840
17075	NC_021514	ATC	2	6	1057928	1057933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840840
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17079	NC_021514	AATT	2	8	1058594	1058601	50 %	50 %	0 %	0 %	513840841
17080	NC_021514	GTC	2	6	1058657	1058662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840841
17081	NC_021514	AAC	2	6	1058710	1058715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840841
17082	NC_021514	TAA	2	6	1058794	1058799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840841
17083	NC_021514	ACG	2	6	1058922	1058927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840841
17084	NC_021514	GAT	2	6	1059208	1059213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840842
17085	NC_021514	T	6	6	1059213	1059218	0 %	100 %	0 %	0 %	513840842
17086	NC_021514	TTGG	2	8	1059268	1059275	0 %	50 %	50 %	0 %	513840842
17087	NC_021514	A	6	6	1059362	1059367	100 %	0 %	0 %	0 %	513840842
17088	NC_021514	AAG	2	6	1059373	1059378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840842
17089	NC_021514	GTT	2	6	1059384	1059389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840842
17090	NC_021514	G	6	6	1059434	1059439	0 %	0 %	100 %	0 %	513840842
17091	NC_021514	GAT	2	6	1059535	1059540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840842
17092	NC_021514	ATT	2	6	1059578	1059583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840842
17093	NC_021514	TGA	3	9	1059611	1059619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840842
17094	NC_021514	CGAG	2	8	1059632	1059639	25 %	0 %	50 %	25 %	513840842
17095	NC_021514	GCC	2	6	1059851	1059856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513840843
17096	NC_021514	GCGAT	2	10	1059926	1059935	20 %	20 %	40 %	20 %	513840843
17097	NC_021514	GACGTG	2	12	1060030	1060041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	513840843
17098	NC_021514	ATC	2	6	1060079	1060084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840843
17099	NC_021514	CAA	2	6	1060089	1060094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840843
17100	NC_021514	TCA	2	6	1060098	1060103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840843
17101	NC_021514	TTGAA	2	10	1060124	1060133	40 %	40 %	20 %	0 %	513840843
17102	NC_021514	AGT	2	6	1060170	1060175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840843
17103	NC_021514	CAG	2	6	1060212	1060217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840843
17104	NC_021514	ATG	3	9	1060271	1060279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840843
17105	NC_021514	CAT	2	6	1060329	1060334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840843
17106	NC_021514	GAC	2	6	1060413	1060418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840843
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17108	NC_021514	GTT	2	6	1060566	1060571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840843
17109	NC_021514	CAA	2	6	1060605	1060610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840843
17110	NC_021514	GGCC	2	8	1060628	1060635	0 %	0 %	50 %	50 %	513840843
17111	NC_021514	CGATT	2	10	1060650	1060659	20 %	40 %	20 %	20 %	513840843
17112	NC_021514	TTC	2	6	1060792	1060797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840843
17113	NC_021514	TTA	2	6	1060841	1060846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840843
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17115	NC_021514	CTTC	2	8	1060926	1060933	0 %	50 %	0 %	50 %	513840843
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17333	NC_021514	A	6	6	1081464	1081469	100 %	0 %	0 %	0 %	513840854
17334	NC_021514	GTTC	2	8	1081479	1081486	0 %	50 %	25 %	25 %	513840854
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17344	NC_021514	GCA	2	6	1081857	1081862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840854
17345	NC_021514	TCAGC	2	10	1081870	1081879	20 %	20 %	20 %	40 %	513840854
17346	NC_021514	CCAAT	2	10	1081992	1082001	40 %	20 %	0 %	40 %	513840855
17347	NC_021514	ACG	2	6	1082069	1082074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840855
17348	NC_021514	GGT	2	6	1082116	1082121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513840855
17349	NC_021514	A	6	6	1082162	1082167	100 %	0 %	0 %	0 %	513840855
17350	NC_021514	CAT	2	6	1082233	1082238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840855
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17352	NC_021514	GC	3	6	1082277	1082282	0 %	0 %	50 %	50 %	513840855
17353	NC_021514	AAT	2	6	1082296	1082301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840855
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17356	NC_021514	TAGATT	2	12	1082368	1082379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	513840855
17357	NC_021514	AACTG	2	10	1082487	1082496	40 %	20 %	20 %	20 %	513840855
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17360	NC_021514	GTT	2	6	1082673	1082678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513840855
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17364	NC_021514	TGC	2	6	1083028	1083033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840855
17365	NC_021514	CCAA	2	8	1083045	1083052	50 %	0 %	0 %	50 %	513840855
17366	NC_021514	ATT	2	6	1083268	1083273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840856
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17372	NC_021514	CGC	2	6	1083634	1083639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513840856
17373	NC_021514	TCT	2	6	1083649	1083654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840856
17374	NC_021514	GCA	2	6	1083744	1083749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840856
17375	NC_021514	ATTA	2	8	1083960	1083967	50 %	50 %	0 %	0 %	513840857
17376	NC_021514	T	6	6	1083973	1083978	0 %	100 %	0 %	0 %	513840857
17377	NC_021514	GAT	2	6	1084114	1084119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840857
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17382	NC_021514	ACG	2	6	1084209	1084214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840857
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17447	NC_021514	TAG	2	6	1088918	1088923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840861
17448	NC_021514	AG	3	6	1089004	1089009	50 %	0 %	50 %	0 %	513840861
17449	NC_021514	GCCA	2	8	1089026	1089033	25 %	0 %	25 %	50 %	513840861
17450	NC_021514	GAC	2	6	1089037	1089042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840861
17451	NC_021514	GAC	2	6	1089148	1089153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840861
17452	NC_021514	CGG	2	6	1089195	1089200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840861
17453	NC_021514	ACG	2	6	1089386	1089391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840861
17454	NC_021514	GCG	2	6	1089407	1089412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840861
17455	NC_021514	TTGT	2	8	1089469	1089476	0 %	75 %	25 %	0 %	513840861
17456	NC_021514	GAA	2	6	1089514	1089519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840861
17457	NC_021514	AAT	2	6	1089520	1089525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840861
17458	NC_021514	CCA	2	6	1089656	1089661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840861
17459	NC_021514	AACC	2	8	1089674	1089681	50 %	0 %	0 %	50 %	513840861
17460	NC_021514	TTCCGC	2	12	1089811	1089822	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	513840861
17461	NC_021514	ACC	2	6	1089860	1089865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840861
17462	NC_021514	ATG	2	6	1089917	1089922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840861
17463	NC_021514	GCT	2	6	1089929	1089934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840861
17464	NC_021514	AT	3	6	1090010	1090015	50 %	50 %	0 %	0 %	513840861
17465	NC_021514	T	6	6	1090015	1090020	0 %	100 %	0 %	0 %	513840861
17466	NC_021514	TGA	2	6	1090145	1090150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840861
17467	NC_021514	AAT	2	6	1090172	1090177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513840861
17468	NC_021514	ATC	2	6	1090205	1090210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513840861
17469	NC_021514	GTTT	2	8	1090247	1090254	0 %	75 %	25 %	0 %	513840861
17470	NC_021514	GTC	2	6	1090410	1090415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840862
17471	NC_021514	ACC	2	6	1090498	1090503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513840862
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17473	NC_021514	TGC	2	6	1090610	1090615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840862
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17475	NC_021514	GTA	2	6	1090705	1090710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513840862
17476	NC_021514	CTTA	2	8	1090726	1090733	25 %	50 %	0 %	25 %	513840862
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17480	NC_021514	GGC	2	6	1091078	1091083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840862
17481	NC_021514	GCAA	2	8	1091150	1091157	50 %	0 %	25 %	25 %	513840862
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17483	NC_021514	GCC	2	6	1091202	1091207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513840862
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17486	NC_021514	TAT	2	6	1091707	1091712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840863
17487	NC_021514	GGAA	2	8	1091865	1091872	50 %	0 %	50 %	0 %	513840863
17488	NC_021514	TTTC	2	8	1091892	1091899	0 %	75 %	0 %	25 %	513840863
17489	NC_021514	ACG	2	6	1091995	1092000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513840863
17490	NC_021514	ACA	2	6	1092066	1092071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840863
17491	NC_021514	ATT	2	6	1092086	1092091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840863
17492	NC_021514	CA	3	6	1092184	1092189	50 %	0 %	0 %	50 %	513840863
17493	NC_021514	TAT	2	6	1092196	1092201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513840863
17494	NC_021514	GAA	2	6	1092279	1092284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513840863
17495	NC_021514	CAA	2	6	1092289	1092294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513840863
17496	NC_021514	TTC	2	6	1092304	1092309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513840863
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17498	NC_021514	CTG	2	6	1092356	1092361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513840863
17499	NC_021514	CGG	3	9	1092395	1092403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513840863
17500	NC_021514	GT	3	6	1092433	1092438	0 %	50 %	50 %	0 %	513840863

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