MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 35647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_021235	TCT	2	6	1263183	1263188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675023
21502	NC_021235	TCA	2	6	1263201	1263206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675023
21503	NC_021235	CAC	2	6	1263307	1263312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675023
21504	NC_021235	GTG	2	6	1263413	1263418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675023
21505	NC_021235	TGG	2	6	1263444	1263449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675023
21506	NC_021235	CTG	2	6	1263527	1263532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675023
21507	NC_021235	TTG	2	6	1263587	1263592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675023
21508	NC_021235	CGC	2	6	1263604	1263609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675023
21509	NC_021235	CGG	2	6	1263618	1263623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675023
21510	NC_021235	AAG	2	6	1263654	1263659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675023
21511	NC_021235	TCT	2	6	1263672	1263677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675023
21512	NC_021235	GCC	2	6	1263698	1263703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675023
21513	NC_021235	CGG	2	6	1263759	1263764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675023
21514	NC_021235	CTC	2	6	1263812	1263817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675023
21515	NC_021235	ACC	2	6	1263833	1263838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675023
21516	NC_021235	ATC	2	6	1264050	1264055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675024
21517	NC_021235	GTT	2	6	1264079	1264084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675024
21518	NC_021235	ATC	2	6	1264275	1264280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675024
21519	NC_021235	CCG	2	6	1264300	1264305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675024
21520	NC_021235	TTC	2	6	1264351	1264356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675024
21521	NC_021235	A	6	6	1264382	1264387	100 %	0 %	0 %	0 %	501675024
21522	NC_021235	TTC	2	6	1264443	1264448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675024
21523	NC_021235	TCT	2	6	1264456	1264461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675024
21524	NC_021235	GCC	2	6	1264494	1264499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675024
21525	NC_021235	TCTCCC	2	12	1264564	1264575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675024
21526	NC_021235	CAT	2	6	1264664	1264669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675024
21527	NC_021235	CGAT	2	8	1264711	1264718	25 %	25 %	25 %	25 %	501675024
21528	NC_021235	CGC	2	6	1264721	1264726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675024
21529	NC_021235	AAG	2	6	1264743	1264748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675024
21530	NC_021235	TCT	2	6	1264804	1264809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675024
21531	NC_021235	CAT	2	6	1264817	1264822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675024
21532	NC_021235	GAA	2	6	1264845	1264850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675024
21533	NC_021235	GCG	2	6	1264868	1264873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675024
21534	NC_021235	GAA	2	6	1265007	1265012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675024
21535	NC_021235	GAA	2	6	1265031	1265036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675024
21536	NC_021235	GAT	2	6	1265127	1265132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675024
21537	NC_021235	C	6	6	1265266	1265271	0 %	0 %	0 %	100 %	501675024
21538	NC_021235	TTA	2	6	1265314	1265319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675024
21539	NC_021235	AAGGCT	2	12	1265331	1265342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	501675024
21540	NC_021235	TTAA	2	8	1265399	1265406	50 %	50 %	0 %	0 %	501675024
21541	NC_021235	GATT	2	8	1265692	1265699	25 %	50 %	25 %	0 %	501675025
21542	NC_021235	AC	3	6	1265722	1265727	50 %	0 %	0 %	50 %	501675025
21543	NC_021235	TTAC	2	8	1265866	1265873	25 %	50 %	0 %	25 %	501675025
21544	NC_021235	CAA	2	6	1265875	1265880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675025
21545	NC_021235	GAG	2	6	1265919	1265924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675025
21546	NC_021235	ACCA	2	8	1266092	1266099	50 %	0 %	0 %	50 %	501675025
21547	NC_021235	AAG	2	6	1266121	1266126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675025
21548	NC_021235	A	7	7	1266179	1266185	100 %	0 %	0 %	0 %	501675025
21549	NC_021235	AGC	2	6	1266283	1266288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675026
21550	NC_021235	TAC	2	6	1266308	1266313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675026
21551	NC_021235	TCAAGA	2	12	1266349	1266360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	501675026
21552	NC_021235	AAG	2	6	1266467	1266472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675026
21553	NC_021235	GCAGGA	2	12	1266541	1266552	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	501675026
21554	NC_021235	ACC	2	6	1266579	1266584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675026
21555	NC_021235	ACG	2	6	1266626	1266631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675026
21556	NC_021235	ACA	2	6	1266642	1266647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675026
21557	NC_021235	ATT	2	6	1266713	1266718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675026
21558	NC_021235	AGC	2	6	1266814	1266819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675026
21559	NC_021235	ACT	2	6	1266843	1266848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675026
21560	NC_021235	TAA	2	6	1266856	1266861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675026
21561	NC_021235	TGG	2	6	1266920	1266925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675026
21562	NC_021235	ATCT	2	8	1266937	1266944	25 %	50 %	0 %	25 %	501675026
21563	NC_021235	CAC	2	6	1266957	1266962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675026
21564	NC_021235	GCA	2	6	1267058	1267063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675026
21565	NC_021235	GAT	2	6	1267357	1267362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675027
21566	NC_021235	ATCACA	2	12	1267492	1267503	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	501675027
21567	NC_021235	GAT	2	6	1267511	1267516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675027
21568	NC_021235	TCGA	2	8	1267547	1267554	25 %	25 %	25 %	25 %	501675027
21569	NC_021235	TGA	2	6	1267567	1267572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675027
21570	NC_021235	CAT	2	6	1267585	1267590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675027
21571	NC_021235	GAA	2	6	1267612	1267617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675027
21572	NC_021235	CCG	2	6	1267618	1267623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675027
21573	NC_021235	GGA	2	6	1267665	1267670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675028
21574	NC_021235	ACG	2	6	1267763	1267768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675028
21575	NC_021235	CCA	2	6	1267809	1267814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675028
21576	NC_021235	TC	3	6	1267833	1267838	0 %	50 %	0 %	50 %	501675028
21577	NC_021235	TAA	2	6	1267859	1267864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675028
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21580	NC_021235	ATCG	2	8	1267985	1267992	25 %	25 %	25 %	25 %	501675029
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21583	NC_021235	TTA	2	6	1268137	1268142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675029
21584	NC_021235	T	6	6	1268195	1268200	0 %	100 %	0 %	0 %	501675029
21585	NC_021235	GCC	2	6	1268205	1268210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675029
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21587	NC_021235	TTA	2	6	1268290	1268295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675029
21588	NC_021235	TTA	2	6	1268312	1268317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675029
21589	NC_021235	TGG	2	6	1268400	1268405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675029
21590	NC_021235	TAC	2	6	1268411	1268416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675029
21591	NC_021235	ACCA	2	8	1268447	1268454	50 %	0 %	0 %	50 %	501675029
21592	NC_021235	GAA	2	6	1268571	1268576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675029
21593	NC_021235	TAGA	2	8	1268620	1268627	50 %	25 %	25 %	0 %	501675029
21594	NC_021235	ATC	2	6	1268637	1268642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675029
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21597	NC_021235	CAT	2	6	1269200	1269205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675030
21598	NC_021235	AT	3	6	1269204	1269209	50 %	50 %	0 %	0 %	501675030
21599	NC_021235	AAG	2	6	1269250	1269255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675030
21600	NC_021235	TTG	2	6	1269356	1269361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675030
21601	NC_021235	CAA	2	6	1269430	1269435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675030
21602	NC_021235	TCA	2	6	1269509	1269514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675030
21603	NC_021235	ACTC	2	8	1269529	1269536	25 %	25 %	0 %	50 %	501675030
21604	NC_021235	AGTG	2	8	1269591	1269598	25 %	25 %	50 %	0 %	501675030
21605	NC_021235	ACCG	2	8	1269622	1269629	25 %	0 %	25 %	50 %	501675030
21606	NC_021235	TATC	2	8	1269673	1269680	25 %	50 %	0 %	25 %	501675030
21607	NC_021235	CT	4	8	1269713	1269720	0 %	50 %	0 %	50 %	501675030
21608	NC_021235	TA	3	6	1269758	1269763	50 %	50 %	0 %	0 %	501675030
21609	NC_021235	GAA	2	6	1269879	1269884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675030
21610	NC_021235	CAA	2	6	1269999	1270004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675030
21611	NC_021235	TCAC	2	8	1270071	1270078	25 %	25 %	0 %	50 %	501675030
21612	NC_021235	TGCT	2	8	1270091	1270098	0 %	50 %	25 %	25 %	501675030
21613	NC_021235	TCA	2	6	1270261	1270266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675030
21614	NC_021235	TGA	2	6	1270281	1270286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675030
21615	NC_021235	TC	3	6	1270363	1270368	0 %	50 %	0 %	50 %	501675031
21616	NC_021235	GCG	3	9	1270412	1270420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675031
21617	NC_021235	GCGGT	2	10	1270461	1270470	0 %	20 %	60 %	20 %	501675031
21618	NC_021235	CACT	2	8	1270565	1270572	25 %	25 %	0 %	50 %	501675031
21619	NC_021235	GAT	2	6	1270576	1270581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675031
21620	NC_021235	CTAC	2	8	1270582	1270589	25 %	25 %	0 %	50 %	501675031
21621	NC_021235	CCAC	2	8	1270662	1270669	25 %	0 %	0 %	75 %	501675031
21622	NC_021235	GCC	2	6	1270694	1270699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675031
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21628	NC_021235	GGT	2	6	1270798	1270803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675031
21629	NC_021235	CTT	2	6	1270846	1270851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675031
21630	NC_021235	AAGC	2	8	1270862	1270869	50 %	0 %	25 %	25 %	501675031
21631	NC_021235	TGA	4	12	1270944	1270955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675031
21632	NC_021235	TGA	2	6	1270986	1270991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675031
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21648	NC_021235	GTC	3	9	1271743	1271751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675033
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21652	NC_021235	TCC	2	6	1271941	1271946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675034
21653	NC_021235	CGG	2	6	1271962	1271967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675034
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21662	NC_021235	CAT	2	6	1272285	1272290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675034
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21665	NC_021235	TAGTT	2	10	1272513	1272522	20 %	60 %	20 %	0 %	501675035
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21847	NC_021235	GTA	2	6	1282218	1282223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675044
21848	NC_021235	TAA	2	6	1282327	1282332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675044
21849	NC_021235	CGA	2	6	1282374	1282379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675044
21850	NC_021235	CGCC	2	8	1282388	1282395	0 %	0 %	25 %	75 %	501675044
21851	NC_021235	GCC	2	6	1282483	1282488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675044
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21960	NC_021235	T	7	7	1287759	1287765	0 %	100 %	0 %	0 %	501675050
21961	NC_021235	GGCG	2	8	1287889	1287896	0 %	0 %	75 %	25 %	501675050
21962	NC_021235	CGGT	2	8	1288044	1288051	0 %	25 %	50 %	25 %	501675050
21963	NC_021235	CGG	2	6	1288198	1288203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675050
21964	NC_021235	GAT	2	6	1288313	1288318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675050
21965	NC_021235	TCT	2	6	1288606	1288611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675051
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21967	NC_021235	GCCA	2	8	1288712	1288719	25 %	0 %	25 %	50 %	501675051
21968	NC_021235	CGC	2	6	1288730	1288735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675051
21969	NC_021235	CAG	2	6	1288739	1288744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675051
21970	NC_021235	CAA	2	6	1288811	1288816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675051
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21972	NC_021235	CGA	2	6	1288867	1288872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675051
21973	NC_021235	TGGC	2	8	1288893	1288900	0 %	25 %	50 %	25 %	501675051
21974	NC_021235	CCAA	2	8	1288928	1288935	50 %	0 %	0 %	50 %	501675051
21975	NC_021235	CGG	2	6	1288939	1288944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675051
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21984	NC_021235	CCT	2	6	1289361	1289366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675052
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21988	NC_021235	GTT	2	6	1289614	1289619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675052
21989	NC_021235	CTT	2	6	1289644	1289649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675052
21990	NC_021235	CGT	2	6	1289655	1289660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675052
21991	NC_021235	CAT	2	6	1289713	1289718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675052
21992	NC_021235	GAGGTT	2	12	1289918	1289929	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	501675052
21993	NC_021235	CAC	2	6	1290010	1290015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675052
21994	NC_021235	ATT	2	6	1290022	1290027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675052
21995	NC_021235	CTT	2	6	1290039	1290044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675052
21996	NC_021235	AG	3	6	1290046	1290051	50 %	0 %	50 %	0 %	501675052
21997	NC_021235	AAC	2	6	1290070	1290075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675052
21998	NC_021235	ACT	2	6	1290328	1290333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675053
21999	NC_021235	AACC	2	8	1290359	1290366	50 %	0 %	0 %	50 %	501675053
22000	NC_021235	TGG	2	6	1290387	1290392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675053

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