MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 35647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20004	NC_021235	CTC	2	6	1179140	1179145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674937
20005	NC_021235	CAT	2	6	1179214	1179219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674937
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20007	NC_021235	CGA	2	6	1179282	1179287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674937
20008	NC_021235	CCT	2	6	1179339	1179344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674937
20009	NC_021235	ATC	2	6	1179347	1179352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674937
20010	NC_021235	ATC	2	6	1179398	1179403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674937
20011	NC_021235	TCA	2	6	1179405	1179410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674937
20012	NC_021235	CTT	2	6	1179484	1179489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674937
20013	NC_021235	GCC	2	6	1179490	1179495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674937
20014	NC_021235	ATC	2	6	1179563	1179568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674937
20015	NC_021235	CAT	3	9	1179583	1179591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674937
20016	NC_021235	GAA	2	6	1179695	1179700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674937
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20018	NC_021235	ATC	3	9	1179752	1179760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674937
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20031	NC_021235	CCTT	2	8	1180290	1180297	0 %	50 %	0 %	50 %	501674937
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20037	NC_021235	GCT	2	6	1180736	1180741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674938
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20043	NC_021235	TTA	2	6	1181009	1181014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501674938
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20049	NC_021235	CGA	2	6	1181360	1181365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674938
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20114	NC_021235	TCA	2	6	1186443	1186448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674944
20115	NC_021235	CTA	2	6	1186452	1186457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674944
20116	NC_021235	CTC	2	6	1186556	1186561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674944
20117	NC_021235	CTT	2	6	1186582	1186587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674944
20118	NC_021235	GAG	2	6	1186589	1186594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501674944
20119	NC_021235	CGA	2	6	1186627	1186632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674944
20120	NC_021235	CCT	2	6	1186642	1186647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674944
20121	NC_021235	GTCG	2	8	1186805	1186812	0 %	25 %	50 %	25 %	501674944
20122	NC_021235	TTC	2	6	1187102	1187107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674945
20123	NC_021235	GGT	2	6	1187133	1187138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674945
20124	NC_021235	TAGG	2	8	1187155	1187162	25 %	25 %	50 %	0 %	501674945
20125	NC_021235	CAC	2	6	1187227	1187232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674945
20126	NC_021235	CCA	2	6	1187244	1187249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674945
20127	NC_021235	ACC	2	6	1187292	1187297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674945
20128	NC_021235	CAAAGA	2	12	1187316	1187327	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	501674945
20129	NC_021235	TCG	2	6	1187339	1187344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674945
20130	NC_021235	TTA	2	6	1187444	1187449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501674945
20131	NC_021235	GGCC	2	8	1187477	1187484	0 %	0 %	50 %	50 %	501674945
20132	NC_021235	TTC	2	6	1187602	1187607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674946
20133	NC_021235	ATC	2	6	1187614	1187619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674946
20134	NC_021235	GGT	2	6	1187715	1187720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674946
20135	NC_021235	CGTT	2	8	1187804	1187811	0 %	50 %	25 %	25 %	501674946
20136	NC_021235	CTC	2	6	1187812	1187817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674946
20137	NC_021235	GTA	2	6	1187827	1187832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674946
20138	NC_021235	TGG	2	6	1187885	1187890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674946
20139	NC_021235	GTC	2	6	1187924	1187929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674946
20140	NC_021235	C	7	7	1187980	1187986	0 %	0 %	0 %	100 %	501674946
20141	NC_021235	TAGG	2	8	1187998	1188005	25 %	25 %	50 %	0 %	501674946
20142	NC_021235	CTA	2	6	1188024	1188029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674946
20143	NC_021235	TAA	2	6	1188032	1188037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674946
20144	NC_021235	TCTTGG	2	12	1188056	1188067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	501674946
20145	NC_021235	AAT	2	6	1188112	1188117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674946
20146	NC_021235	CG	3	6	1188177	1188182	0 %	0 %	50 %	50 %	501674946
20147	NC_021235	T	7	7	1188236	1188242	0 %	100 %	0 %	0 %	501674946
20148	NC_021235	CTC	2	6	1188298	1188303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674946
20149	NC_021235	CTT	2	6	1188357	1188362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674946
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20152	NC_021235	CGAT	2	8	1188870	1188877	25 %	25 %	25 %	25 %	501674947
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20154	NC_021235	CCG	2	6	1189009	1189014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674947
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20156	NC_021235	CAT	2	6	1189066	1189071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674947
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20159	NC_021235	ATC	2	6	1189202	1189207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674947
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20193	NC_021235	GTAA	2	8	1190939	1190946	50 %	25 %	25 %	0 %	501674949
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20207	NC_021235	GTA	2	6	1191868	1191873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674950
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20210	NC_021235	CTT	2	6	1192158	1192163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674950
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20219	NC_021235	CTT	2	6	1192645	1192650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674950
20220	NC_021235	TTG	2	6	1192687	1192692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674950
20221	NC_021235	TTG	2	6	1192730	1192735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674950
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20223	NC_021235	CGC	2	6	1192795	1192800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674950
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20225	NC_021235	TTGGCC	2	12	1192925	1192936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674950
20226	NC_021235	AGG	2	6	1192995	1193000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501674950
20227	NC_021235	AAG	3	9	1193021	1193029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674950
20228	NC_021235	TTC	2	6	1193030	1193035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674950
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20347	NC_021235	CAAT	2	8	1199289	1199296	50 %	25 %	0 %	25 %	501674955
20348	NC_021235	GCG	2	6	1199414	1199419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674955
20349	NC_021235	CTT	2	6	1199429	1199434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674955
20350	NC_021235	TAAT	2	8	1199464	1199471	50 %	50 %	0 %	0 %	501674955
20351	NC_021235	ACTA	2	8	1199490	1199497	50 %	25 %	0 %	25 %	501674955
20352	NC_021235	CGG	2	6	1199594	1199599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674956
20353	NC_021235	AAG	2	6	1199622	1199627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674956
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20355	NC_021235	TAC	2	6	1199762	1199767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674956
20356	NC_021235	AATGA	2	10	1199773	1199782	60 %	20 %	20 %	0 %	501674956
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20358	NC_021235	CAA	2	6	1199909	1199914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674957
20359	NC_021235	TTG	2	6	1199928	1199933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674957
20360	NC_021235	AACG	2	8	1199999	1200006	50 %	0 %	25 %	25 %	501674957
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20365	NC_021235	T	6	6	1200336	1200341	0 %	100 %	0 %	0 %	501674958
20366	NC_021235	ATC	2	6	1200347	1200352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674958
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20368	NC_021235	ACT	2	6	1200442	1200447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674958
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20370	NC_021235	TC	3	6	1200605	1200610	0 %	50 %	0 %	50 %	501674958
20371	NC_021235	CGT	2	6	1200798	1200803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674958
20372	NC_021235	TGA	2	6	1200821	1200826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674958
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20375	NC_021235	TCA	2	6	1200991	1200996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674958
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20377	NC_021235	TGAT	2	8	1201159	1201166	25 %	50 %	25 %	0 %	501674958
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20382	NC_021235	CAAC	2	8	1201432	1201439	50 %	0 %	0 %	50 %	501674959
20383	NC_021235	CGACAT	2	12	1201500	1201511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501674959
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20402	NC_021235	TGG	2	6	1202721	1202726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674961
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20447	NC_021235	CAT	2	6	1204963	1204968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674964
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20449	NC_021235	CTT	2	6	1205314	1205319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674964
20450	NC_021235	CACAG	2	10	1205418	1205427	40 %	0 %	20 %	40 %	501674964
20451	NC_021235	CCA	2	6	1205444	1205449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674964
20452	NC_021235	AAT	2	6	1205549	1205554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674964
20453	NC_021235	CTT	2	6	1205565	1205570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674964
20454	NC_021235	AGTG	2	8	1205584	1205591	25 %	25 %	50 %	0 %	501674964
20455	NC_021235	TGAACC	2	12	1205730	1205741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501674965
20456	NC_021235	GTT	2	6	1205744	1205749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674965
20457	NC_021235	CAT	2	6	1205776	1205781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674965
20458	NC_021235	AAG	2	6	1205859	1205864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674965
20459	NC_021235	GTA	2	6	1205960	1205965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674965
20460	NC_021235	AGT	2	6	1206037	1206042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674965
20461	NC_021235	GAA	3	9	1206056	1206064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674965
20462	NC_021235	GTA	2	6	1206095	1206100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674965
20463	NC_021235	TGG	2	6	1206141	1206146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674965
20464	NC_021235	GTTA	2	8	1206206	1206213	25 %	50 %	25 %	0 %	501674965
20465	NC_021235	TCTTT	2	10	1206250	1206259	0 %	80 %	0 %	20 %	501674965
20466	NC_021235	TGATC	2	10	1206268	1206277	20 %	40 %	20 %	20 %	501674965
20467	NC_021235	CTC	2	6	1206335	1206340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674965
20468	NC_021235	AGA	2	6	1206374	1206379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674965
20469	NC_021235	GGTCA	2	10	1206392	1206401	20 %	20 %	40 %	20 %	501674965
20470	NC_021235	ATAA	2	8	1206552	1206559	75 %	25 %	0 %	0 %	501674965
20471	NC_021235	TGG	2	6	1206571	1206576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674965
20472	NC_021235	TCG	2	6	1206747	1206752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674966
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20475	NC_021235	GTG	2	6	1206972	1206977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674967
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20477	NC_021235	GAA	2	6	1207080	1207085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674967
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20482	NC_021235	CAT	2	6	1207299	1207304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674967
20483	NC_021235	ACC	2	6	1207329	1207334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674967
20484	NC_021235	AAT	2	6	1207344	1207349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501674967
20485	NC_021235	GCG	2	6	1207372	1207377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674967
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20487	NC_021235	GCG	2	6	1207427	1207432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674967
20488	NC_021235	AGA	2	6	1207565	1207570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674967
20489	NC_021235	ATC	2	6	1207603	1207608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674967
20490	NC_021235	A	6	6	1207609	1207614	100 %	0 %	0 %	0 %	501674967
20491	NC_021235	CGG	2	6	1207622	1207627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674967
20492	NC_021235	GCC	2	6	1207666	1207671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674967
20493	NC_021235	TGT	2	6	1207720	1207725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674967
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20495	NC_021235	GAT	2	6	1207872	1207877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674967
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