MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 35647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18005	NC_021235	T	6	6	1058825	1058830	0 %	100 %	0 %	0 %	501674808
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18016	NC_021235	ATC	2	6	1059605	1059610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674809
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18018	NC_021235	AT	3	6	1059708	1059713	50 %	50 %	0 %	0 %	501674809
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18052	NC_021235	TACA	2	8	1061134	1061141	50 %	25 %	0 %	25 %	501674812
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18117	NC_021235	CGA	2	6	1064845	1064850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674817
18118	NC_021235	GTC	2	6	1064859	1064864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674817
18119	NC_021235	GGC	2	6	1064878	1064883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674817
18120	NC_021235	CTT	2	6	1064896	1064901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674817
18121	NC_021235	GCG	2	6	1064936	1064941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674817
18122	NC_021235	CCA	2	6	1064942	1064947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674817
18123	NC_021235	CGT	2	6	1065000	1065005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674817
18124	NC_021235	CGA	2	6	1065153	1065158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674817
18125	NC_021235	TTG	2	6	1065182	1065187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674817
18126	NC_021235	AGAT	2	8	1065228	1065235	50 %	25 %	25 %	0 %	501674817
18127	NC_021235	TTC	2	6	1065365	1065370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674817
18128	NC_021235	CAC	2	6	1065402	1065407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674817
18129	NC_021235	CGT	2	6	1065418	1065423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674817
18130	NC_021235	TCA	2	6	1065471	1065476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674817
18131	NC_021235	AGA	2	6	1065487	1065492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674817
18132	NC_021235	TGA	2	6	1065525	1065530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674817
18133	NC_021235	GTG	3	9	1065574	1065582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674817
18134	NC_021235	TGA	2	6	1065618	1065623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674817
18135	NC_021235	TCA	2	6	1065626	1065631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674817
18136	NC_021235	GGA	2	6	1065634	1065639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501674817
18137	NC_021235	GTC	2	6	1065649	1065654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674817
18138	NC_021235	TTC	2	6	1065779	1065784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674817
18139	NC_021235	CTC	2	6	1065797	1065802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674818
18140	NC_021235	TTAA	2	8	1065804	1065811	50 %	50 %	0 %	0 %	501674818
18141	NC_021235	CCGG	2	8	1065859	1065866	0 %	0 %	50 %	50 %	501674818
18142	NC_021235	CCA	2	6	1065868	1065873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674818
18143	NC_021235	TGG	2	6	1065909	1065914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674818
18144	NC_021235	CTT	2	6	1065916	1065921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674818
18145	NC_021235	GGC	2	6	1065926	1065931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674818
18146	NC_021235	CTT	2	6	1065959	1065964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674818
18147	NC_021235	GGTT	2	8	1065965	1065972	0 %	50 %	50 %	0 %	501674818
18148	NC_021235	CGT	2	6	1066075	1066080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674818
18149	NC_021235	GGC	2	6	1066106	1066111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674818
18150	NC_021235	GCG	2	6	1066128	1066133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674818
18151	NC_021235	GTAGT	2	10	1066200	1066209	20 %	40 %	40 %	0 %	501674818
18152	NC_021235	CGG	2	6	1066213	1066218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674818
18153	NC_021235	ATC	2	6	1066233	1066238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674818
18154	NC_021235	CGGT	2	8	1066239	1066246	0 %	25 %	50 %	25 %	501674818
18155	NC_021235	C	6	6	1066276	1066281	0 %	0 %	0 %	100 %	501674818
18156	NC_021235	GGC	2	6	1066295	1066300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674818
18157	NC_021235	GGCTTC	2	12	1066331	1066342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674818
18158	NC_021235	CAT	2	6	1066367	1066372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674818
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18164	NC_021235	TTC	2	6	1066667	1066672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674818
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18166	NC_021235	CGT	2	6	1066728	1066733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674819
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18171	NC_021235	TCCT	2	8	1066978	1066985	0 %	50 %	0 %	50 %	501674820
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18180	NC_021235	AG	3	6	1067459	1067464	50 %	0 %	50 %	0 %	501674820
18181	NC_021235	CTGG	2	8	1067503	1067510	0 %	25 %	50 %	25 %	501674820
18182	NC_021235	CGC	2	6	1067569	1067574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674820
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18185	NC_021235	AGT	2	6	1067675	1067680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674820
18186	NC_021235	TGAC	2	8	1067774	1067781	25 %	25 %	25 %	25 %	501674820
18187	NC_021235	A	6	6	1067791	1067796	100 %	0 %	0 %	0 %	501674820
18188	NC_021235	GC	3	6	1067817	1067822	0 %	0 %	50 %	50 %	501674820
18189	NC_021235	CAAT	2	8	1067868	1067875	50 %	25 %	0 %	25 %	501674820
18190	NC_021235	GTC	2	6	1067884	1067889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674820
18191	NC_021235	CAT	2	6	1067946	1067951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674820
18192	NC_021235	TGC	2	6	1067966	1067971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674820
18193	NC_021235	ATG	2	6	1068096	1068101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674821
18194	NC_021235	AACA	2	8	1068120	1068127	75 %	0 %	0 %	25 %	501674821
18195	NC_021235	CCA	3	9	1068136	1068144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674821
18196	NC_021235	ATG	2	6	1068205	1068210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674821
18197	NC_021235	GAT	2	6	1068224	1068229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674821
18198	NC_021235	GTG	2	6	1068447	1068452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674821
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18200	NC_021235	AAG	2	6	1068540	1068545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674821
18201	NC_021235	GTT	2	6	1068576	1068581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674821
18202	NC_021235	GCG	2	6	1068591	1068596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674821
18203	NC_021235	GTA	2	6	1068641	1068646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674821
18204	NC_021235	TCA	2	6	1068736	1068741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674821
18205	NC_021235	TGA	2	6	1068793	1068798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674821
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18208	NC_021235	ACG	2	6	1068886	1068891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674822
18209	NC_021235	ACC	2	6	1068900	1068905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674822
18210	NC_021235	GCC	2	6	1068990	1068995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674822
18211	NC_021235	CTT	2	6	1069148	1069153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674822
18212	NC_021235	CCG	2	6	1069214	1069219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674822
18213	NC_021235	CGT	2	6	1069226	1069231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674822
18214	NC_021235	G	7	7	1069273	1069279	0 %	0 %	100 %	0 %	501674822
18215	NC_021235	T	6	6	1069281	1069286	0 %	100 %	0 %	0 %	501674822
18216	NC_021235	GAT	2	6	1069431	1069436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674823
18217	NC_021235	TTGAT	2	10	1069486	1069495	20 %	60 %	20 %	0 %	501674823
18218	NC_021235	CTG	2	6	1069619	1069624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674823
18219	NC_021235	TGA	2	6	1069820	1069825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674823
18220	NC_021235	TCGT	2	8	1069860	1069867	0 %	50 %	25 %	25 %	501674823
18221	NC_021235	TCCG	2	8	1069907	1069914	0 %	25 %	25 %	50 %	501674823
18222	NC_021235	CAT	2	6	1069917	1069922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674823
18223	NC_021235	ACC	2	6	1070089	1070094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674823
18224	NC_021235	GTG	2	6	1070101	1070106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674823
18225	NC_021235	AGG	2	6	1070108	1070113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501674823
18226	NC_021235	GTT	2	6	1070190	1070195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674823
18227	NC_021235	GCG	2	6	1070197	1070202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674823
18228	NC_021235	TTGG	2	8	1070215	1070222	0 %	50 %	50 %	0 %	501674823
18229	NC_021235	CGA	2	6	1070321	1070326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674823
18230	NC_021235	TCG	2	6	1070392	1070397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674823
18231	NC_021235	CCA	2	6	1070417	1070422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674823
18232	NC_021235	TCA	2	6	1070437	1070442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674823
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18349	NC_021235	CGT	2	6	1079084	1079089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674832
18350	NC_021235	ATG	2	6	1079103	1079108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674832
18351	NC_021235	TCGC	2	8	1079116	1079123	0 %	25 %	25 %	50 %	501674832
18352	NC_021235	GAT	2	6	1079134	1079139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674832
18353	NC_021235	TCG	2	6	1079181	1079186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674832
18354	NC_021235	GTT	2	6	1079189	1079194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501674832
18355	NC_021235	ACT	2	6	1079195	1079200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674832
18356	NC_021235	CTA	2	6	1079249	1079254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674832
18357	NC_021235	GAA	2	6	1079270	1079275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674832
18358	NC_021235	CTCC	2	8	1079350	1079357	0 %	25 %	0 %	75 %	501674832
18359	NC_021235	GGC	2	6	1079399	1079404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674832
18360	NC_021235	TTCC	2	8	1079487	1079494	0 %	50 %	0 %	50 %	501674832
18361	NC_021235	AAC	2	6	1079585	1079590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674832
18362	NC_021235	TGCC	2	8	1079632	1079639	0 %	25 %	25 %	50 %	501674832
18363	NC_021235	TGG	2	6	1079647	1079652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674832
18364	NC_021235	G	6	6	1079657	1079662	0 %	0 %	100 %	0 %	501674832
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18367	NC_021235	CCTT	2	8	1079841	1079848	0 %	50 %	0 %	50 %	501674832
18368	NC_021235	CAAC	2	8	1079883	1079890	50 %	0 %	0 %	50 %	501674832
18369	NC_021235	AAG	2	6	1079966	1079971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501674832
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18372	NC_021235	TCC	2	6	1080213	1080218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501674832
18373	NC_021235	AAC	2	6	1080302	1080307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501674832
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18465	NC_021235	ACC	2	6	1087002	1087007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501674845
18466	NC_021235	TGG	2	6	1087018	1087023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674845
18467	NC_021235	AACC	2	8	1087077	1087084	50 %	0 %	0 %	50 %	501674845
18468	NC_021235	TGA	2	6	1087145	1087150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501674845
18469	NC_021235	GACG	2	8	1087170	1087177	25 %	0 %	50 %	25 %	501674845
18470	NC_021235	ATC	2	6	1087191	1087196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501674845
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18472	NC_021235	GTC	2	6	1087320	1087325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501674845
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18475	NC_021235	AAAT	2	8	1087529	1087536	75 %	25 %	0 %	0 %	501674846
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18481	NC_021235	GACC	2	8	1087750	1087757	25 %	0 %	25 %	50 %	501674846
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18485	NC_021235	GCC	2	6	1087898	1087903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501674846
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18492	NC_021235	G	6	6	1088056	1088061	0 %	0 %	100 %	0 %	501674846
18493	NC_021235	CTT	2	6	1088092	1088097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674846
18494	NC_021235	CGG	2	6	1088107	1088112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501674846
18495	NC_021235	GGAA	2	8	1088154	1088161	50 %	0 %	50 %	0 %	501674846
18496	NC_021235	GTG	2	6	1088186	1088191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501674846
18497	NC_021235	CTT	2	6	1088248	1088253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501674846
18498	NC_021235	CGCC	2	8	1088257	1088264	0 %	0 %	25 %	75 %	501674846
18499	NC_021235	CTTGG	2	10	1088281	1088290	0 %	40 %	40 %	20 %	501674846
18500	NC_021235	CGA	2	6	1088304	1088309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501674846

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