MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8

Total Repeats: 48914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021224	TGATAT	2	12	490367	490378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	501145790
8002	NC_021224	CTGA	2	8	490392	490399	25 %	25 %	25 %	25 %	501145790
8003	NC_021224	TGA	2	6	490403	490408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145790
8004	NC_021224	TCA	2	6	490426	490431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145790
8005	NC_021224	GTGG	2	8	490518	490525	0 %	25 %	75 %	0 %	501145790
8006	NC_021224	CGGCC	2	10	490558	490567	0 %	0 %	40 %	60 %	501145790
8007	NC_021224	CGC	2	6	490635	490640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145790
8008	NC_021224	AATTA	2	10	490667	490676	60 %	40 %	0 %	0 %	501145790
8009	NC_021224	GACC	2	8	490927	490934	25 %	0 %	25 %	50 %	501145791
8010	NC_021224	TGA	2	6	490951	490956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145791
8011	NC_021224	AT	3	6	491011	491016	50 %	50 %	0 %	0 %	501145791
8012	NC_021224	GTG	2	6	491045	491050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145791
8013	NC_021224	ATC	2	6	491112	491117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145791
8014	NC_021224	TGG	2	6	491146	491151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145791
8015	NC_021224	ATA	2	6	491175	491180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145791
8016	NC_021224	CGC	2	6	491185	491190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145791
8017	NC_021224	CAT	2	6	491239	491244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145791
8018	NC_021224	ATG	2	6	491331	491336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145791
8019	NC_021224	GCG	2	6	491351	491356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145791
8020	NC_021224	GAT	2	6	491362	491367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145791
8021	NC_021224	AATTA	2	10	491482	491491	60 %	40 %	0 %	0 %	501145791
8022	NC_021224	GAA	2	6	491504	491509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145791
8023	NC_021224	AAT	2	6	491588	491593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145791
8024	NC_021224	TGT	2	6	491779	491784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145791
8025	NC_021224	GAT	3	9	491827	491835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145791
8026	NC_021224	ATGA	2	8	491939	491946	50 %	25 %	25 %	0 %	501145791
8027	NC_021224	ATT	2	6	492211	492216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145792
8028	NC_021224	GC	3	6	492286	492291	0 %	0 %	50 %	50 %	501145792
8029	NC_021224	GTA	2	6	492299	492304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145792
8030	NC_021224	CTG	2	6	492368	492373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145792
8031	NC_021224	AGG	2	6	492435	492440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501145792
8032	NC_021224	CGA	2	6	492452	492457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145792
8033	NC_021224	TGA	2	6	492462	492467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145792
8034	NC_021224	AGTTAC	2	12	492485	492496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	501145792
8035	NC_021224	GAC	2	6	492540	492545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145792
8036	NC_021224	ACC	2	6	492581	492586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145792
8037	NC_021224	GTA	2	6	492599	492604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145792
8038	NC_021224	GCT	2	6	492625	492630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145792
8039	NC_021224	GCT	2	6	492663	492668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145792
8040	NC_021224	GTG	2	6	492773	492778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145792
8041	NC_021224	ATT	2	6	492867	492872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145792
8042	NC_021224	TGG	3	9	493308	493316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145793
8043	NC_021224	TGG	2	6	493324	493329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145793
8044	NC_021224	GGT	2	6	493403	493408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145793
8045	NC_021224	CGT	2	6	493463	493468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145793
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8047	NC_021224	CTA	2	6	493583	493588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145793
8048	NC_021224	TCA	2	6	493601	493606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145793
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8050	NC_021224	ATG	2	6	493731	493736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145793
8051	NC_021224	TTAATA	2	12	493753	493764	50 %	50 %	0 %	0 %	501145793
8052	NC_021224	GCCA	2	8	493776	493783	25 %	0 %	25 %	50 %	501145793
8053	NC_021224	TTG	2	6	493816	493821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145793
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8055	NC_021224	GAC	2	6	494558	494563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145794
8056	NC_021224	CGA	2	6	494599	494604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145794
8057	NC_021224	TCAA	2	8	494652	494659	50 %	25 %	0 %	25 %	501145794
8058	NC_021224	CA	3	6	494679	494684	50 %	0 %	0 %	50 %	501145794
8059	NC_021224	GAA	2	6	494843	494848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145794
8060	NC_021224	GCT	2	6	494852	494857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145794
8061	NC_021224	CAA	2	6	494872	494877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145794
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8063	NC_021224	TTG	2	6	494991	494996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145794
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8079	NC_021224	TGCA	2	8	495886	495893	25 %	25 %	25 %	25 %	501145795
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8085	NC_021224	TGG	3	9	496197	496205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145795
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8111	NC_021224	CAAT	3	12	497337	497348	50 %	25 %	0 %	25 %	501145797
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8116	NC_021224	AT	3	6	497618	497623	50 %	50 %	0 %	0 %	501145797
8117	NC_021224	A	6	6	497694	497699	100 %	0 %	0 %	0 %	501145797
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8120	NC_021224	GAC	2	6	498081	498086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145798
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8133	NC_021224	ATC	2	6	498866	498871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145798
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8239	NC_021224	GGCCC	2	10	504679	504688	0 %	0 %	40 %	60 %	501145803
8240	NC_021224	CCA	2	6	504804	504809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501145804
8241	NC_021224	GAC	2	6	504864	504869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145804
8242	NC_021224	AAC	2	6	504884	504889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145804
8243	NC_021224	TCG	2	6	504890	504895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145804
8244	NC_021224	GCG	2	6	504975	504980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145804
8245	NC_021224	TGT	2	6	505011	505016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145804
8246	NC_021224	CAA	2	6	505039	505044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145804
8247	NC_021224	ATG	2	6	505078	505083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145804
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8250	NC_021224	AAG	2	6	505193	505198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145804
8251	NC_021224	GAAT	2	8	505217	505224	50 %	25 %	25 %	0 %	501145804
8252	NC_021224	AGC	2	6	505251	505256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145804
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8254	NC_021224	CAA	2	6	505390	505395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145804
8255	NC_021224	CGG	2	6	505415	505420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145804
8256	NC_021224	CGG	2	6	505430	505435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145804
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8260	NC_021224	CAA	2	6	505634	505639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145805
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8262	NC_021224	CGG	2	6	505677	505682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145805
8263	NC_021224	A	6	6	505762	505767	100 %	0 %	0 %	0 %	501145805
8264	NC_021224	G	7	7	505769	505775	0 %	0 %	100 %	0 %	501145805
8265	NC_021224	GTT	2	6	505961	505966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145805
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8271	NC_021224	TGC	2	6	506200	506205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145805
8272	NC_021224	TGGTC	2	10	506426	506435	0 %	40 %	40 %	20 %	501145806
8273	NC_021224	CGT	2	6	506439	506444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145806
8274	NC_021224	AGT	2	6	506472	506477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145806
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8277	NC_021224	AG	3	6	506652	506657	50 %	0 %	50 %	0 %	501145806
8278	NC_021224	ATCG	2	8	506661	506668	25 %	25 %	25 %	25 %	501145806
8279	NC_021224	GACT	2	8	506830	506837	25 %	25 %	25 %	25 %	501145806
8280	NC_021224	ATA	2	6	506848	506853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145806
8281	NC_021224	TGCCGT	2	12	506857	506868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145806
8282	NC_021224	GAC	2	6	506873	506878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145806
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8284	NC_021224	GTCACG	2	12	507001	507012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	501145806
8285	NC_021224	TGA	2	6	507026	507031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145806
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8289	NC_021224	ATC	2	6	507166	507171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145806
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8291	NC_021224	T	6	6	507213	507218	0 %	100 %	0 %	0 %	501145806
8292	NC_021224	GATT	2	8	507221	507228	25 %	50 %	25 %	0 %	501145806
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8299	NC_021224	GCTGTT	2	12	507518	507529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	501145806
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8302	NC_021224	ATC	2	6	507942	507947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145807
8303	NC_021224	TGA	2	6	507949	507954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145807
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8307	NC_021224	TTCG	2	8	508154	508161	0 %	50 %	25 %	25 %	501145807
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8312	NC_021224	GATG	2	8	508484	508491	25 %	25 %	50 %	0 %	501145807
8313	NC_021224	AT	3	6	508499	508504	50 %	50 %	0 %	0 %	501145807
8314	NC_021224	CGG	2	6	508505	508510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145807
8315	NC_021224	AGC	2	6	508569	508574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145807
8316	NC_021224	TGA	2	6	508636	508641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145807
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8318	NC_021224	GGC	2	6	509071	509076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145808
8319	NC_021224	TGA	2	6	509102	509107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145808
8320	NC_021224	A	6	6	509137	509142	100 %	0 %	0 %	0 %	501145808
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8322	NC_021224	AATCC	2	10	509375	509384	40 %	20 %	0 %	40 %	501145809
8323	NC_021224	T	6	6	509402	509407	0 %	100 %	0 %	0 %	501145809
8324	NC_021224	AGTG	2	8	509470	509477	25 %	25 %	50 %	0 %	501145809
8325	NC_021224	GGC	2	6	509484	509489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145809
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8328	NC_021224	CGT	2	6	509665	509670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145809
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8330	NC_021224	GCT	2	6	509731	509736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145809
8331	NC_021224	ATC	2	6	509777	509782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145809
8332	NC_021224	CTTT	2	8	509838	509845	0 %	75 %	0 %	25 %	501145809
8333	NC_021224	TGC	2	6	509935	509940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145809
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8335	NC_021224	TGG	2	6	510010	510015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145809
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8341	NC_021224	CGT	2	6	510181	510186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145809
8342	NC_021224	AGC	2	6	510237	510242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145809
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8344	NC_021224	ATG	3	9	510258	510266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145809
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8347	NC_021224	ATA	2	6	510512	510517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145810
8348	NC_021224	CAG	2	6	510548	510553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145810
8349	NC_021224	TCA	2	6	510570	510575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145810
8350	NC_021224	GGC	2	6	510800	510805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501145810
8351	NC_021224	GCC	2	6	510822	510827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145810
8352	NC_021224	GTT	2	6	510828	510833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501145810
8353	NC_021224	GCC	2	6	510880	510885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501145810
8354	NC_021224	CAT	2	6	510927	510932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145810
8355	NC_021224	GTG	2	6	510988	510993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501145810
8356	NC_021224	GTA	2	6	511001	511006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145810
8357	NC_021224	TGCG	2	8	511010	511017	0 %	25 %	50 %	25 %	501145810
8358	NC_021224	AGA	2	6	511128	511133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145810
8359	NC_021224	GC	3	6	511516	511521	0 %	0 %	50 %	50 %	501145811
8360	NC_021224	ATG	2	6	511561	511566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145811
8361	NC_021224	TAT	3	9	511580	511588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501145811
8362	NC_021224	ACG	2	6	511705	511710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145811
8363	NC_021224	CTA	2	6	511722	511727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145811
8364	NC_021224	TA	3	6	511759	511764	50 %	50 %	0 %	0 %	501145811
8365	NC_021224	TCA	2	6	511814	511819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145811
8366	NC_021224	AGACG	2	10	511959	511968	40 %	0 %	40 %	20 %	501145811
8367	NC_021224	GAC	2	6	511971	511976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501145811
8368	NC_021224	TGGA	2	8	512038	512045	25 %	25 %	50 %	0 %	501145811
8369	NC_021224	GT	3	6	512055	512060	0 %	50 %	50 %	0 %	501145811
8370	NC_021224	CCAG	2	8	512080	512087	25 %	0 %	25 %	50 %	501145811
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8375	NC_021224	AAC	3	9	512536	512544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145812
8376	NC_021224	TCCA	2	8	512561	512568	25 %	25 %	0 %	50 %	501145812
8377	NC_021224	GAA	2	6	512584	512589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501145812
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8379	NC_021224	TCA	2	6	512688	512693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145812
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8383	NC_021224	GTC	2	6	512965	512970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145812
8384	NC_021224	TGA	2	6	512982	512987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145812
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8388	NC_021224	CGT	2	6	513180	513185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145812
8389	NC_021224	TAAGT	2	10	513241	513250	40 %	40 %	20 %	0 %	501145812
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8394	NC_021224	TCA	2	6	513378	513383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501145812
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8397	NC_021224	AATG	2	8	513527	513534	50 %	25 %	25 %	0 %	501145812
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8400	NC_021224	ACCA	2	8	513940	513947	50 %	0 %	0 %	50 %	501145813
8401	NC_021224	GAT	2	6	514006	514011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501145813
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8483	NC_021224	ATA	2	6	519096	519101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145818
8484	NC_021224	TATT	2	8	519531	519538	25 %	75 %	0 %	0 %	501145819
8485	NC_021224	ATA	2	6	519547	519552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501145819
8486	NC_021224	TTC	2	6	519565	519570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501145819
8487	NC_021224	GATT	2	8	519647	519654	25 %	50 %	25 %	0 %	501145819
8488	NC_021224	AATC	2	8	519712	519719	50 %	25 %	0 %	25 %	501145819
8489	NC_021224	CAA	2	6	519735	519740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501145819
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8491	NC_021224	GCT	2	6	519891	519896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501145819
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