MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 DNA

Total Repeats: 39047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_020819	GCGGT	2	10	2392351	2392360	0 %	20 %	60 %	20 %	472408124
39002	NC_020819	T	6	6	2392394	2392399	0 %	100 %	0 %	0 %	472408124
39003	NC_020819	AAAT	2	8	2392448	2392455	75 %	25 %	0 %	0 %	472408124
39004	NC_020819	CGA	2	6	2392470	2392475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472408124
39005	NC_020819	CG	3	6	2392479	2392484	0 %	0 %	50 %	50 %	472408124
39006	NC_020819	TAT	2	6	2392488	2392493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472408124
39007	NC_020819	CCG	2	6	2392519	2392524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472408124
39008	NC_020819	GCG	2	6	2392565	2392570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472408124
39009	NC_020819	CAA	2	6	2392639	2392644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472408124
39010	NC_020819	CCTT	2	8	2392646	2392653	0 %	50 %	0 %	50 %	472408124
39011	NC_020819	GGT	2	6	2392657	2392662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472408124
39012	NC_020819	TGG	2	6	2392737	2392742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472408124
39013	NC_020819	GCC	2	6	2392769	2392774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472408124
39014	NC_020819	GTT	2	6	2392779	2392784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472408124
39015	NC_020819	TGC	2	6	2392867	2392872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472408124
39016	NC_020819	CGC	2	6	2392888	2392893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472408124
39017	NC_020819	CAAC	2	8	2392972	2392979	50 %	0 %	0 %	50 %	472408124
39018	NC_020819	ACC	2	6	2392997	2393002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472408124
39019	NC_020819	TAGC	2	8	2393037	2393044	25 %	25 %	25 %	25 %	472408124
39020	NC_020819	TGC	2	6	2393056	2393061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472408124
39021	NC_020819	TCA	3	9	2393088	2393096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472408124
39022	NC_020819	TCC	2	6	2393099	2393104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472408124
39023	NC_020819	CCG	2	6	2393190	2393195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472408124
39024	NC_020819	CCG	2	6	2393305	2393310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472408125
39025	NC_020819	ACGGT	2	10	2393324	2393333	20 %	20 %	40 %	20 %	472408125
39026	NC_020819	CCTTTT	2	12	2393343	2393354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472408125
39027	NC_020819	AAG	2	6	2393398	2393403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472408125
39028	NC_020819	GAC	2	6	2393452	2393457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472408125
39029	NC_020819	GAA	2	6	2393475	2393480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472408125
39030	NC_020819	CAC	2	6	2393481	2393486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472408125
39031	NC_020819	ATC	3	9	2393503	2393511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472408125
39032	NC_020819	GTC	2	6	2393545	2393550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472408125
39033	NC_020819	AGC	2	6	2393577	2393582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472408125
39034	NC_020819	AAG	2	6	2393632	2393637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472408125
39035	NC_020819	GAT	2	6	2393688	2393693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472408125
39036	NC_020819	CAT	2	6	2393724	2393729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472408125
39037	NC_020819	CTGC	2	8	2393768	2393775	0 %	25 %	25 %	50 %	472408125
39038	NC_020819	CTT	2	6	2393811	2393816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472408125
39039	NC_020819	ATC	2	6	2393878	2393883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472408125
39040	NC_020819	ATA	2	6	2393905	2393910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472408125
39041	NC_020819	CCG	2	6	2393944	2393949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472408125
39042	NC_020819	TTG	2	6	2394037	2394042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472408125
39043	NC_020819	CAG	2	6	2394140	2394145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472408126
39044	NC_020819	CAAG	2	8	2394265	2394272	50 %	0 %	25 %	25 %	472408126
39045	NC_020819	TCT	2	6	2394322	2394327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472408126
39046	NC_020819	CTG	2	6	2394428	2394433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472408126
39047	NC_020819	CTT	2	6	2394442	2394447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472408126

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.