MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_020558	TAG	2	6	2389901	2389906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211483
44003	NC_020558	AAG	2	6	2389918	2389923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211483
44004	NC_020558	ACCA	2	8	2389924	2389931	50 %	0 %	0 %	50 %	470211483
44005	NC_020558	TGC	2	6	2389940	2389945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211483
44006	NC_020558	ACC	2	6	2389975	2389980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211483
44007	NC_020558	GCC	2	6	2390079	2390084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211483
44008	NC_020558	AGCA	2	8	2390089	2390096	50 %	0 %	25 %	25 %	470211483
44009	NC_020558	AAT	2	6	2390105	2390110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211483
44010	NC_020558	ATA	2	6	2390118	2390123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211483
44011	NC_020558	GAA	2	6	2390161	2390166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211483
44012	NC_020558	TCCC	2	8	2390173	2390180	0 %	25 %	0 %	75 %	470211483
44013	NC_020558	CAA	2	6	2390182	2390187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211483
44014	NC_020558	ATG	2	6	2390240	2390245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211483
44015	NC_020558	T	6	6	2390274	2390279	0 %	100 %	0 %	0 %	470211483
44016	NC_020558	A	6	6	2390283	2390288	100 %	0 %	0 %	0 %	470211483
44017	NC_020558	TTA	3	9	2390556	2390564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211484
44018	NC_020558	GCT	2	6	2390610	2390615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211484
44019	NC_020558	ATT	2	6	2390643	2390648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211484
44020	NC_020558	GAT	2	6	2390661	2390666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211484
44021	NC_020558	ATG	2	6	2390713	2390718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211484
44022	NC_020558	GAT	2	6	2390730	2390735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211484
44023	NC_020558	AAC	2	6	2390765	2390770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211484
44024	NC_020558	AAT	2	6	2390981	2390986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211485
44025	NC_020558	AAC	2	6	2391024	2391029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211485
44026	NC_020558	TAA	2	6	2391076	2391081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211485
44027	NC_020558	TTA	2	6	2391093	2391098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211485
44028	NC_020558	ATTT	2	8	2391585	2391592	25 %	75 %	0 %	0 %	470211486
44029	NC_020558	CG	3	6	2391596	2391601	0 %	0 %	50 %	50 %	470211486
44030	NC_020558	TAA	2	6	2391674	2391679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211486
44031	NC_020558	CAA	2	6	2391688	2391693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211486
44032	NC_020558	TTC	2	6	2391725	2391730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211487
44033	NC_020558	TAA	2	6	2391738	2391743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211487
44034	NC_020558	CGA	2	6	2391776	2391781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211487
44035	NC_020558	TGG	2	6	2391820	2391825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211487
44036	NC_020558	ACC	2	6	2391841	2391846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211487
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44038	NC_020558	CTTC	2	8	2391978	2391985	0 %	50 %	0 %	50 %	470211487
44039	NC_020558	TAA	2	6	2391993	2391998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211487
44040	NC_020558	CAG	2	6	2392026	2392031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211487
44041	NC_020558	CGA	2	6	2392052	2392057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211487
44042	NC_020558	AGC	2	6	2392099	2392104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211487
44043	NC_020558	CTT	2	6	2392131	2392136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211487
44044	NC_020558	GCG	2	6	2392148	2392153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211487
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44050	NC_020558	TACT	2	8	2392608	2392615	25 %	50 %	0 %	25 %	470211489
44051	NC_020558	TTG	2	6	2392778	2392783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211489
44052	NC_020558	GAA	2	6	2392860	2392865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211489
44053	NC_020558	GC	3	6	2392866	2392871	0 %	0 %	50 %	50 %	470211489
44054	NC_020558	ATA	2	6	2392883	2392888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211489
44055	NC_020558	T	6	6	2392905	2392910	0 %	100 %	0 %	0 %	470211489
44056	NC_020558	CTT	2	6	2392914	2392919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211489
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44058	NC_020558	CG	3	6	2392958	2392963	0 %	0 %	50 %	50 %	470211489
44059	NC_020558	TCA	2	6	2392980	2392985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211489
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44062	NC_020558	GAA	2	6	2393042	2393047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211489
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44065	NC_020558	TA	3	6	2393218	2393223	50 %	50 %	0 %	0 %	470211489
44066	NC_020558	ATT	2	6	2393227	2393232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211489
44067	NC_020558	T	8	8	2393231	2393238	0 %	100 %	0 %	0 %	470211489
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44071	NC_020558	TTCT	2	8	2393446	2393453	0 %	75 %	0 %	25 %	470211489
44072	NC_020558	ACTC	2	8	2393481	2393488	25 %	25 %	0 %	50 %	470211490
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44078	NC_020558	GTAA	2	8	2393847	2393854	50 %	25 %	25 %	0 %	470211490
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44097	NC_020558	TAA	2	6	2394905	2394910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211491
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44101	NC_020558	TAT	2	6	2395082	2395087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211491
44102	NC_020558	CTTT	2	8	2395174	2395181	0 %	75 %	0 %	25 %	470211491
44103	NC_020558	TCT	2	6	2395246	2395251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211491
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44105	NC_020558	CAC	2	6	2395507	2395512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211492
44106	NC_020558	CTG	2	6	2395603	2395608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211492
44107	NC_020558	AAT	2	6	2395653	2395658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211492
44108	NC_020558	CTA	2	6	2395671	2395676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211492
44109	NC_020558	ACCC	2	8	2395680	2395687	25 %	0 %	0 %	75 %	470211492
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44117	NC_020558	CTTT	2	8	2396124	2396131	0 %	75 %	0 %	25 %	470211492
44118	NC_020558	TAA	2	6	2396137	2396142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211492
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44222	NC_020558	CTT	3	9	2401257	2401265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211497
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44227	NC_020558	AGAAT	2	10	2401405	2401414	60 %	20 %	20 %	0 %	470211497
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44231	NC_020558	CTT	2	6	2401764	2401769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211497
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44233	NC_020558	T	6	6	2401872	2401877	0 %	100 %	0 %	0 %	470211497
44234	NC_020558	TAT	2	6	2401982	2401987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211498
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44381	NC_020558	TTC	2	6	2408563	2408568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
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44452	NC_020558	CAT	2	6	2411899	2411904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
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44454	NC_020558	CTT	2	6	2411989	2411994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211507
44455	NC_020558	T	7	7	2412022	2412028	0 %	100 %	0 %	0 %	470211507
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44461	NC_020558	TGAT	2	8	2412228	2412235	25 %	50 %	25 %	0 %	470211507
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44466	NC_020558	CAT	2	6	2412500	2412505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
44467	NC_020558	TTCG	2	8	2412519	2412526	0 %	50 %	25 %	25 %	470211507
44468	NC_020558	TAT	2	6	2412556	2412561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211507
44469	NC_020558	T	6	6	2412617	2412622	0 %	100 %	0 %	0 %	470211507
44470	NC_020558	ATA	2	6	2412624	2412629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211507
44471	NC_020558	TCA	2	6	2412732	2412737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
44472	NC_020558	ACA	2	6	2412792	2412797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211507
44473	NC_020558	CTA	2	6	2412859	2412864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
44474	NC_020558	TC	3	6	2412922	2412927	0 %	50 %	0 %	50 %	470211507
44475	NC_020558	GCA	2	6	2413005	2413010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211507
44476	NC_020558	TCA	2	6	2413038	2413043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
44477	NC_020558	AT	3	6	2413065	2413070	50 %	50 %	0 %	0 %	470211507
44478	NC_020558	CTT	2	6	2413225	2413230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211507
44479	NC_020558	T	7	7	2413301	2413307	0 %	100 %	0 %	0 %	470211507
44480	NC_020558	AACT	2	8	2413367	2413374	50 %	25 %	0 %	25 %	470211507
44481	NC_020558	CTT	2	6	2413659	2413664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211508
44482	NC_020558	GCA	2	6	2413673	2413678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211508
44483	NC_020558	AAT	3	9	2413722	2413730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211508
44484	NC_020558	GCG	2	6	2413768	2413773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211508
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44486	NC_020558	T	6	6	2413897	2413902	0 %	100 %	0 %	0 %	470211509
44487	NC_020558	T	6	6	2413957	2413962	0 %	100 %	0 %	0 %	470211509
44488	NC_020558	AGCA	2	8	2413976	2413983	50 %	0 %	25 %	25 %	470211509
44489	NC_020558	CTT	2	6	2414182	2414187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211509
44490	NC_020558	T	6	6	2414244	2414249	0 %	100 %	0 %	0 %	470211509
44491	NC_020558	TCT	2	6	2414259	2414264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211509
44492	NC_020558	AAT	2	6	2414341	2414346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211509
44493	NC_020558	CTT	2	6	2414398	2414403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211509
44494	NC_020558	TGA	2	6	2414535	2414540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211509
44495	NC_020558	TTC	2	6	2414573	2414578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211510
44496	NC_020558	GTTTTT	2	12	2414581	2414592	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470211510
44497	NC_020558	CAT	2	6	2414624	2414629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211510
44498	NC_020558	GCA	2	6	2414637	2414642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211510
44499	NC_020558	AAT	2	6	2414705	2414710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211510
44500	NC_020558	GTC	2	6	2414727	2414732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211510

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