MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_020558	CTG	2	6	2245709	2245714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211330
41502	NC_020558	TAC	2	6	2245731	2245736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211330
41503	NC_020558	TTG	2	6	2245738	2245743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211330
41504	NC_020558	CTTT	2	8	2245753	2245760	0 %	75 %	0 %	25 %	470211330
41505	NC_020558	CTT	2	6	2245859	2245864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211330
41506	NC_020558	ATTGT	2	10	2245927	2245936	20 %	60 %	20 %	0 %	470211330
41507	NC_020558	CTC	2	6	2245962	2245967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211330
41508	NC_020558	TCA	2	6	2245991	2245996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211330
41509	NC_020558	CGC	2	6	2246037	2246042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211330
41510	NC_020558	TCAT	2	8	2246570	2246577	25 %	50 %	0 %	25 %	470211331
41511	NC_020558	ATTA	2	8	2246625	2246632	50 %	50 %	0 %	0 %	470211331
41512	NC_020558	CTTT	2	8	2246647	2246654	0 %	75 %	0 %	25 %	470211331
41513	NC_020558	T	6	6	2246659	2246664	0 %	100 %	0 %	0 %	470211331
41514	NC_020558	CTTTTG	2	12	2246672	2246683	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470211331
41515	NC_020558	AGCT	2	8	2247119	2247126	25 %	25 %	25 %	25 %	470211332
41516	NC_020558	CCGC	2	8	2247135	2247142	0 %	0 %	25 %	75 %	470211332
41517	NC_020558	TTTC	2	8	2247197	2247204	0 %	75 %	0 %	25 %	470211332
41518	NC_020558	TTC	2	6	2247217	2247222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211332
41519	NC_020558	CAAA	2	8	2247268	2247275	75 %	0 %	0 %	25 %	470211332
41520	NC_020558	GCA	2	6	2248105	2248110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211333
41521	NC_020558	A	6	6	2248184	2248189	100 %	0 %	0 %	0 %	470211333
41522	NC_020558	CTT	2	6	2248191	2248196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211333
41523	NC_020558	TTTA	2	8	2248224	2248231	25 %	75 %	0 %	0 %	470211333
41524	NC_020558	GTC	2	6	2248322	2248327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211333
41525	NC_020558	ACT	2	6	2248535	2248540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211334
41526	NC_020558	CGC	2	6	2248542	2248547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211334
41527	NC_020558	TCAAG	2	10	2248912	2248921	40 %	20 %	20 %	20 %	470211335
41528	NC_020558	AAGTT	2	10	2248972	2248981	40 %	40 %	20 %	0 %	470211335
41529	NC_020558	ATAA	2	8	2249009	2249016	75 %	25 %	0 %	0 %	470211335
41530	NC_020558	ACA	2	6	2249068	2249073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211335
41531	NC_020558	CCA	2	6	2249091	2249096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211335
41532	NC_020558	GTC	2	6	2249108	2249113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211335
41533	NC_020558	CATT	2	8	2249136	2249143	25 %	50 %	0 %	25 %	470211335
41534	NC_020558	TCA	2	6	2249561	2249566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211336
41535	NC_020558	T	6	6	2249578	2249583	0 %	100 %	0 %	0 %	470211336
41536	NC_020558	CTT	2	6	2250608	2250613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211337
41537	NC_020558	TGC	2	6	2250615	2250620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211337
41538	NC_020558	AGC	2	6	2250645	2250650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211337
41539	NC_020558	TCT	2	6	2250652	2250657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211337
41540	NC_020558	TGAA	2	8	2250663	2250670	50 %	25 %	25 %	0 %	470211337
41541	NC_020558	ATTG	2	8	2250700	2250707	25 %	50 %	25 %	0 %	470211337
41542	NC_020558	TTCG	2	8	2250944	2250951	0 %	50 %	25 %	25 %	470211338
41543	NC_020558	TTC	2	6	2250989	2250994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211338
41544	NC_020558	ATTTCG	2	12	2251002	2251013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470211338
41545	NC_020558	T	6	6	2251086	2251091	0 %	100 %	0 %	0 %	470211338
41546	NC_020558	CTG	2	6	2251102	2251107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211338
41547	NC_020558	TGCT	2	8	2251751	2251758	0 %	50 %	25 %	25 %	470211339
41548	NC_020558	TTA	2	6	2251770	2251775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211339
41549	NC_020558	CAT	2	6	2251810	2251815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211339
41550	NC_020558	TGT	3	9	2251860	2251868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211339
41551	NC_020558	T	6	6	2251868	2251873	0 %	100 %	0 %	0 %	470211339
41552	NC_020558	ATT	2	6	2251916	2251921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211339
41553	NC_020558	TTC	2	6	2251949	2251954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211339
41554	NC_020558	AAATT	2	10	2252657	2252666	60 %	40 %	0 %	0 %	470211340
41555	NC_020558	A	7	7	2252673	2252679	100 %	0 %	0 %	0 %	470211340
41556	NC_020558	AG	3	6	2252682	2252687	50 %	0 %	50 %	0 %	470211340
41557	NC_020558	ATT	2	6	2252728	2252733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211340
41558	NC_020558	GAAT	2	8	2252817	2252824	50 %	25 %	25 %	0 %	470211340
41559	NC_020558	CCA	2	6	2252893	2252898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211341
41560	NC_020558	GCG	2	6	2252934	2252939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211341
41561	NC_020558	GAT	2	6	2252984	2252989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211341
41562	NC_020558	T	6	6	2254297	2254302	0 %	100 %	0 %	0 %	470211342
41563	NC_020558	TAA	2	6	2254336	2254341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211342
41564	NC_020558	GTAT	2	8	2254354	2254361	25 %	50 %	25 %	0 %	470211342
41565	NC_020558	AAAGG	2	10	2254406	2254415	60 %	0 %	40 %	0 %	470211342
41566	NC_020558	CAT	2	6	2254449	2254454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211342
41567	NC_020558	TAA	2	6	2254456	2254461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211342
41568	NC_020558	GTT	3	9	2254469	2254477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211342
41569	NC_020558	CGGT	2	8	2254516	2254523	0 %	25 %	50 %	25 %	470211342
41570	NC_020558	CGC	2	6	2254573	2254578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211342
41571	NC_020558	GTT	2	6	2254581	2254586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211342
41572	NC_020558	TTTC	2	8	2254603	2254610	0 %	75 %	0 %	25 %	470211342
41573	NC_020558	AATT	2	8	2254618	2254625	50 %	50 %	0 %	0 %	470211342
41574	NC_020558	AAT	3	9	2254804	2254812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
41575	NC_020558	AAT	2	6	2254816	2254821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
41576	NC_020558	CTC	2	6	2254860	2254865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211343
41577	NC_020558	AATG	2	8	2254990	2254997	50 %	25 %	25 %	0 %	470211343
41578	NC_020558	AGTT	2	8	2255013	2255020	25 %	50 %	25 %	0 %	470211343
41579	NC_020558	ATTT	2	8	2255049	2255056	25 %	75 %	0 %	0 %	470211343
41580	NC_020558	GTG	2	6	2255088	2255093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211343
41581	NC_020558	TACCA	2	10	2255095	2255104	40 %	20 %	0 %	40 %	470211343
41582	NC_020558	TTG	2	6	2255112	2255117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211343
41583	NC_020558	AT	3	6	2255175	2255180	50 %	50 %	0 %	0 %	470211343
41584	NC_020558	AGC	2	6	2255182	2255187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211343
41585	NC_020558	TTA	2	6	2255189	2255194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211343
41586	NC_020558	CAT	2	6	2255218	2255223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
41587	NC_020558	CGTT	2	8	2255253	2255260	0 %	50 %	25 %	25 %	470211343
41588	NC_020558	AAG	2	6	2255276	2255281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211343
41589	NC_020558	ACT	2	6	2255375	2255380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
41590	NC_020558	TAAT	2	8	2255424	2255431	50 %	50 %	0 %	0 %	470211343
41591	NC_020558	ACC	2	6	2255455	2255460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211343
41592	NC_020558	CAC	2	6	2255484	2255489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211343
41593	NC_020558	AT	3	6	2255558	2255563	50 %	50 %	0 %	0 %	470211343
41594	NC_020558	GCGATA	2	12	2255702	2255713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470211343
41595	NC_020558	CCA	2	6	2255717	2255722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211343
41596	NC_020558	TTG	2	6	2255773	2255778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211343
41597	NC_020558	CTT	2	6	2255859	2255864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
41598	NC_020558	AAT	2	6	2255962	2255967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
41599	NC_020558	TTA	2	6	2256059	2256064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211343
41600	NC_020558	CAA	2	6	2256171	2256176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211343
41601	NC_020558	TCT	2	6	2256182	2256187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
41602	NC_020558	TCT	2	6	2256191	2256196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
41603	NC_020558	TTG	2	6	2256203	2256208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211343
41604	NC_020558	GCT	2	6	2256290	2256295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211343
41605	NC_020558	GCA	2	6	2256332	2256337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211343
41606	NC_020558	GCTG	2	8	2256356	2256363	0 %	25 %	50 %	25 %	470211343
41607	NC_020558	CAT	2	6	2256375	2256380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
41608	NC_020558	ACA	2	6	2256410	2256415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211343
41609	NC_020558	CTT	2	6	2256507	2256512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
41610	NC_020558	TCA	2	6	2256524	2256529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
41611	NC_020558	AGC	2	6	2256574	2256579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211343
41612	NC_020558	TAA	2	6	2256625	2256630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
41613	NC_020558	TCC	2	6	2256652	2256657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211344
41614	NC_020558	GCA	2	6	2256759	2256764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211344
41615	NC_020558	TC	3	6	2256780	2256785	0 %	50 %	0 %	50 %	470211344
41616	NC_020558	CAA	2	6	2256802	2256807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211344
41617	NC_020558	TCT	2	6	2256882	2256887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211344
41618	NC_020558	GC	3	6	2256937	2256942	0 %	0 %	50 %	50 %	470211344
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41734	NC_020558	TGT	2	6	2263409	2263414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211352
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41737	NC_020558	CTT	2	6	2263684	2263689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211352
41738	NC_020558	AGC	2	6	2263730	2263735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211352
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41743	NC_020558	CTA	2	6	2264061	2264066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211352
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41851	NC_020558	T	6	6	2268706	2268711	0 %	100 %	0 %	0 %	470211359
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41853	NC_020558	CAT	2	6	2268773	2268778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211359
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