MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_020558	TAT	2	6	2216431	2216436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211300
41002	NC_020558	TTA	2	6	2216441	2216446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211300
41003	NC_020558	A	6	6	2216469	2216474	100 %	0 %	0 %	0 %	470211300
41004	NC_020558	TTTA	2	8	2216527	2216534	25 %	75 %	0 %	0 %	470211300
41005	NC_020558	TAT	2	6	2216563	2216568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211300
41006	NC_020558	TAG	2	6	2216589	2216594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211300
41007	NC_020558	AAG	2	6	2216616	2216621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211300
41008	NC_020558	TTG	2	6	2216634	2216639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211300
41009	NC_020558	CTTG	2	8	2216659	2216666	0 %	50 %	25 %	25 %	470211300
41010	NC_020558	ATT	2	6	2216686	2216691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211300
41011	NC_020558	GAT	2	6	2216698	2216703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211300
41012	NC_020558	TAT	2	6	2216713	2216718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211300
41013	NC_020558	GTGAT	2	10	2216814	2216823	20 %	40 %	40 %	0 %	470211300
41014	NC_020558	CGT	2	6	2216842	2216847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211300
41015	NC_020558	CTT	2	6	2216854	2216859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211300
41016	NC_020558	ACA	2	6	2216879	2216884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211300
41017	NC_020558	GGCT	2	8	2216911	2216918	0 %	25 %	50 %	25 %	470211300
41018	NC_020558	TGA	2	6	2216919	2216924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211300
41019	NC_020558	CAA	2	6	2216976	2216981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211300
41020	NC_020558	CAA	2	6	2217009	2217014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211300
41021	NC_020558	ATC	2	6	2217028	2217033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211300
41022	NC_020558	TGG	2	6	2217049	2217054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211300
41023	NC_020558	TAC	2	6	2217067	2217072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211300
41024	NC_020558	TTC	2	6	2217107	2217112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211300
41025	NC_020558	CAC	2	6	2217114	2217119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211300
41026	NC_020558	TTG	2	6	2217120	2217125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211300
41027	NC_020558	GTT	2	6	2217170	2217175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211300
41028	NC_020558	GTA	2	6	2217177	2217182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211300
41029	NC_020558	TGA	2	6	2217183	2217188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211300
41030	NC_020558	ACTT	2	8	2217265	2217272	25 %	50 %	0 %	25 %	470211300
41031	NC_020558	ATTT	2	8	2217301	2217308	25 %	75 %	0 %	0 %	470211300
41032	NC_020558	TAT	2	6	2217378	2217383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211300
41033	NC_020558	TAA	2	6	2217413	2217418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211300
41034	NC_020558	TGT	3	9	2217563	2217571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211301
41035	NC_020558	ATT	2	6	2217654	2217659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211301
41036	NC_020558	TGG	2	6	2217680	2217685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211301
41037	NC_020558	GCA	2	6	2217744	2217749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211301
41038	NC_020558	ATA	2	6	2218889	2218894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211302
41039	NC_020558	AGT	2	6	2218964	2218969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211302
41040	NC_020558	TTC	2	6	2219041	2219046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211302
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41042	NC_020558	TGT	2	6	2219223	2219228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211303
41043	NC_020558	AC	3	6	2219252	2219257	50 %	0 %	0 %	50 %	470211303
41044	NC_020558	AAG	2	6	2219261	2219266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211303
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41047	NC_020558	ATT	2	6	2219482	2219487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211303
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41049	NC_020558	AGA	2	6	2219514	2219519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211303
41050	NC_020558	AAT	2	6	2219570	2219575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211304
41051	NC_020558	ACA	2	6	2219606	2219611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211304
41052	NC_020558	AAT	2	6	2219625	2219630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211304
41053	NC_020558	T	6	6	2219654	2219659	0 %	100 %	0 %	0 %	470211304
41054	NC_020558	AGA	2	6	2219671	2219676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211304
41055	NC_020558	T	7	7	2219690	2219696	0 %	100 %	0 %	0 %	470211304
41056	NC_020558	CCA	2	6	2219720	2219725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211304
41057	NC_020558	T	6	6	2219733	2219738	0 %	100 %	0 %	0 %	470211304
41058	NC_020558	TCT	2	6	2219773	2219778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211304
41059	NC_020558	TTC	2	6	2219805	2219810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211304
41060	NC_020558	TA	3	6	2219811	2219816	50 %	50 %	0 %	0 %	470211304
41061	NC_020558	CAAT	2	8	2219837	2219844	50 %	25 %	0 %	25 %	470211304
41062	NC_020558	T	6	6	2219903	2219908	0 %	100 %	0 %	0 %	470211304
41063	NC_020558	TTA	2	6	2219924	2219929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211304
41064	NC_020558	TTA	2	6	2219944	2219949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211304
41065	NC_020558	T	6	6	2219962	2219967	0 %	100 %	0 %	0 %	470211304
41066	NC_020558	TCC	2	6	2220019	2220024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211304
41067	NC_020558	CAGTA	2	10	2220057	2220066	40 %	20 %	20 %	20 %	470211304
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41070	NC_020558	AT	3	6	2220268	2220273	50 %	50 %	0 %	0 %	470211304
41071	NC_020558	TTC	2	6	2220318	2220323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211304
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41087	NC_020558	A	6	6	2221847	2221852	100 %	0 %	0 %	0 %	470211307
41088	NC_020558	GC	3	6	2221866	2221871	0 %	0 %	50 %	50 %	470211307
41089	NC_020558	TTA	2	6	2221928	2221933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211307
41090	NC_020558	AAC	2	6	2221949	2221954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211307
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41097	NC_020558	AGCA	2	8	2222262	2222269	50 %	0 %	25 %	25 %	470211307
41098	NC_020558	TCA	2	6	2222300	2222305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211307
41099	NC_020558	CA	3	6	2222304	2222309	50 %	0 %	0 %	50 %	470211307
41100	NC_020558	G	6	6	2222311	2222316	0 %	0 %	100 %	0 %	470211307
41101	NC_020558	ATT	2	6	2222340	2222345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211307
41102	NC_020558	GAT	2	6	2222541	2222546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211307
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41104	NC_020558	TAA	2	6	2222583	2222588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211307
41105	NC_020558	T	6	6	2222659	2222664	0 %	100 %	0 %	0 %	470211308
41106	NC_020558	CAT	2	6	2222666	2222671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211308
41107	NC_020558	TAA	2	6	2222755	2222760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211308
41108	NC_020558	CAA	2	6	2222782	2222787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211308
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41113	NC_020558	ATC	2	6	2222943	2222948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211308
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41117	NC_020558	CTA	2	6	2223133	2223138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211308
41118	NC_020558	AAG	3	9	2223264	2223272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211308
41119	NC_020558	AACC	2	8	2223327	2223334	50 %	0 %	0 %	50 %	470211308
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41122	NC_020558	AAG	2	6	2223474	2223479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211308
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41235	NC_020558	CAA	2	6	2228495	2228500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211311
41236	NC_020558	ATT	2	6	2228505	2228510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211311
41237	NC_020558	GTC	2	6	2228538	2228543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211311
41238	NC_020558	TCCT	2	8	2228598	2228605	0 %	50 %	0 %	50 %	470211312
41239	NC_020558	TTCT	2	8	2228727	2228734	0 %	75 %	0 %	25 %	470211312
41240	NC_020558	CTT	2	6	2228787	2228792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211312
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41242	NC_020558	AATC	2	8	2228962	2228969	50 %	25 %	0 %	25 %	470211312
41243	NC_020558	T	6	6	2228985	2228990	0 %	100 %	0 %	0 %	470211312
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41246	NC_020558	T	6	6	2229099	2229104	0 %	100 %	0 %	0 %	470211312
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41250	NC_020558	ATC	2	6	2229226	2229231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211312
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41254	NC_020558	TTC	3	9	2229520	2229528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211312
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41340	NC_020558	A	7	7	2234921	2234927	100 %	0 %	0 %	0 %	470211318
41341	NC_020558	AGA	2	6	2235016	2235021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211318
41342	NC_020558	GCGT	2	8	2235053	2235060	0 %	25 %	50 %	25 %	470211318
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41348	NC_020558	T	8	8	2235361	2235368	0 %	100 %	0 %	0 %	470211319
41349	NC_020558	ATGTA	2	10	2235371	2235380	40 %	40 %	20 %	0 %	470211319
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41352	NC_020558	A	6	6	2235549	2235554	100 %	0 %	0 %	0 %	470211319
41353	NC_020558	TAA	2	6	2235555	2235560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211319
41354	NC_020558	ATA	2	6	2235603	2235608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211319
41355	NC_020558	TAT	2	6	2235625	2235630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211319
41356	NC_020558	TTGCGG	2	12	2235649	2235660	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470211319
41357	NC_020558	TAC	2	6	2235671	2235676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211319
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41359	NC_020558	ATC	2	6	2235707	2235712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211319
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41366	NC_020558	TAA	2	6	2236602	2236607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211320
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41452	NC_020558	CAT	2	6	2240303	2240308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211325
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41458	NC_020558	TTCTG	2	10	2241681	2241690	0 %	60 %	20 %	20 %	470211326
41459	NC_020558	CTGT	2	8	2241730	2241737	0 %	50 %	25 %	25 %	470211326
41460	NC_020558	ATT	2	6	2241774	2241779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211326
41461	NC_020558	GCG	2	6	2241788	2241793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211326
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41463	NC_020558	AT	3	6	2241841	2241846	50 %	50 %	0 %	0 %	470211326
41464	NC_020558	T	6	6	2242515	2242520	0 %	100 %	0 %	0 %	470211327
41465	NC_020558	GATT	2	8	2242587	2242594	25 %	50 %	25 %	0 %	470211327
41466	NC_020558	T	6	6	2242640	2242645	0 %	100 %	0 %	0 %	470211327
41467	NC_020558	AGC	2	6	2242704	2242709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211327
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41469	NC_020558	GCT	2	6	2242750	2242755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211327
41470	NC_020558	TGTT	3	12	2242760	2242771	0 %	75 %	25 %	0 %	470211327
41471	NC_020558	TGA	2	6	2242863	2242868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211327
41472	NC_020558	T	6	6	2242911	2242916	0 %	100 %	0 %	0 %	470211327
41473	NC_020558	AGC	2	6	2242950	2242955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211327
41474	NC_020558	GCC	2	6	2243094	2243099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211327
41475	NC_020558	TCC	2	6	2243103	2243108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211327
41476	NC_020558	CTT	2	6	2243180	2243185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211327
41477	NC_020558	CTG	2	6	2243201	2243206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211327
41478	NC_020558	AGC	2	6	2243220	2243225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211327
41479	NC_020558	CTT	2	6	2243228	2243233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211327
41480	NC_020558	CAT	2	6	2243415	2243420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211328
41481	NC_020558	GCT	2	6	2243435	2243440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211328
41482	NC_020558	GTA	2	6	2243441	2243446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
41483	NC_020558	TAT	2	6	2243532	2243537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211328
41484	NC_020558	TCA	2	6	2243588	2243593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211328
41485	NC_020558	AAT	2	6	2243659	2243664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211328
41486	NC_020558	TAG	2	6	2243697	2243702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
41487	NC_020558	TTTG	2	8	2243720	2243727	0 %	75 %	25 %	0 %	470211328
41488	NC_020558	TCG	2	6	2243729	2243734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211328
41489	NC_020558	T	6	6	2243782	2243787	0 %	100 %	0 %	0 %	470211328
41490	NC_020558	T	6	6	2243830	2243835	0 %	100 %	0 %	0 %	470211328
41491	NC_020558	TTC	2	6	2243839	2243844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211328
41492	NC_020558	TTTC	2	8	2243876	2243883	0 %	75 %	0 %	25 %	470211328
41493	NC_020558	GTA	2	6	2243916	2243921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
41494	NC_020558	AGT	2	6	2243974	2243979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
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41497	NC_020558	CTG	2	6	2244001	2244006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211328
41498	NC_020558	GCC	2	6	2245085	2245090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211329
41499	NC_020558	TAC	2	6	2245169	2245174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211329
41500	NC_020558	CTT	2	6	2245700	2245705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211330

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