MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_020558	TACATA	2	12	2053107	2053118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470211133
38002	NC_020558	GC	3	6	2053127	2053132	0 %	0 %	50 %	50 %	470211133
38003	NC_020558	CGA	2	6	2053183	2053188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211133
38004	NC_020558	TGT	2	6	2053216	2053221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211133
38005	NC_020558	TACA	2	8	2053256	2053263	50 %	25 %	0 %	25 %	470211133
38006	NC_020558	TCATG	2	10	2053277	2053286	20 %	40 %	20 %	20 %	470211133
38007	NC_020558	TCAA	2	8	2053288	2053295	50 %	25 %	0 %	25 %	470211133
38008	NC_020558	TAG	2	6	2053311	2053316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211133
38009	NC_020558	CTT	2	6	2053349	2053354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211133
38010	NC_020558	TAAT	2	8	2053418	2053425	50 %	50 %	0 %	0 %	470211133
38011	NC_020558	T	6	6	2053642	2053647	0 %	100 %	0 %	0 %	470211134
38012	NC_020558	TAT	2	6	2053665	2053670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211134
38013	NC_020558	CTTC	2	8	2053688	2053695	0 %	50 %	0 %	50 %	470211134
38014	NC_020558	CTT	2	6	2053730	2053735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211134
38015	NC_020558	AT	3	6	2053784	2053789	50 %	50 %	0 %	0 %	470211134
38016	NC_020558	CGAAC	2	10	2053798	2053807	40 %	0 %	20 %	40 %	470211134
38017	NC_020558	ACC	2	6	2053842	2053847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211134
38018	NC_020558	TAA	2	6	2053856	2053861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211134
38019	NC_020558	ATC	2	6	2053905	2053910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211134
38020	NC_020558	GTG	2	6	2053929	2053934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211134
38021	NC_020558	GCA	2	6	2053940	2053945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211134
38022	NC_020558	CCAA	2	8	2054073	2054080	50 %	0 %	0 %	50 %	470211134
38023	NC_020558	GTA	2	6	2054086	2054091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211134
38024	NC_020558	AT	3	6	2054119	2054124	50 %	50 %	0 %	0 %	470211134
38025	NC_020558	ATC	2	6	2054199	2054204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211134
38026	NC_020558	TCG	2	6	2054253	2054258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211134
38027	NC_020558	TCA	2	6	2054267	2054272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211134
38028	NC_020558	CTGA	2	8	2054380	2054387	25 %	25 %	25 %	25 %	470211135
38029	NC_020558	AAC	2	6	2054388	2054393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211135
38030	NC_020558	TAA	2	6	2054447	2054452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211135
38031	NC_020558	TTG	2	6	2054477	2054482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211135
38032	NC_020558	CTTC	2	8	2054533	2054540	0 %	50 %	0 %	50 %	470211135
38033	NC_020558	TCC	2	6	2054586	2054591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211135
38034	NC_020558	TGT	2	6	2054592	2054597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211135
38035	NC_020558	TCT	2	6	2054598	2054603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211135
38036	NC_020558	AAT	2	6	2054673	2054678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211135
38037	NC_020558	TGT	2	6	2054721	2054726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211135
38038	NC_020558	TCT	2	6	2054829	2054834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211135
38039	NC_020558	TGGA	2	8	2054842	2054849	25 %	25 %	50 %	0 %	470211135
38040	NC_020558	ACA	2	6	2054854	2054859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211135
38041	NC_020558	ATA	2	6	2054899	2054904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211136
38042	NC_020558	GTT	2	6	2054935	2054940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211136
38043	NC_020558	A	6	6	2054950	2054955	100 %	0 %	0 %	0 %	470211136
38044	NC_020558	GGC	2	6	2055001	2055006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211136
38045	NC_020558	GAA	2	6	2055018	2055023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211136
38046	NC_020558	TTCC	2	8	2055058	2055065	0 %	50 %	0 %	50 %	470211136
38047	NC_020558	TGG	2	6	2055080	2055085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211136
38048	NC_020558	GAA	2	6	2055117	2055122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211136
38049	NC_020558	TATC	2	8	2055136	2055143	25 %	50 %	0 %	25 %	470211136
38050	NC_020558	ATG	3	9	2055216	2055224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211136
38051	NC_020558	TTA	2	6	2055233	2055238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211136
38052	NC_020558	TCG	2	6	2055326	2055331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211137
38053	NC_020558	GAT	2	6	2055391	2055396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211137
38054	NC_020558	TGC	2	6	2055486	2055491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211137
38055	NC_020558	TGG	2	6	2055492	2055497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211137
38056	NC_020558	ATG	2	6	2055526	2055531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211137
38057	NC_020558	CTAC	2	8	2055620	2055627	25 %	25 %	0 %	50 %	470211137
38058	NC_020558	AGA	2	6	2055711	2055716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211137
38059	NC_020558	A	7	7	2055746	2055752	100 %	0 %	0 %	0 %	470211138
38060	NC_020558	TGG	2	6	2055877	2055882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211138
38061	NC_020558	GAA	2	6	2055982	2055987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211138
38062	NC_020558	TAT	2	6	2055992	2055997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211138
38063	NC_020558	GCT	2	6	2056013	2056018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211138
38064	NC_020558	T	6	6	2056219	2056224	0 %	100 %	0 %	0 %	470211139
38065	NC_020558	TGC	2	6	2056246	2056251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211139
38066	NC_020558	CTG	2	6	2056404	2056409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211139
38067	NC_020558	CTG	2	6	2056443	2056448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211139
38068	NC_020558	TTC	2	6	2056492	2056497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211139
38069	NC_020558	ATC	2	6	2056511	2056516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211139
38070	NC_020558	TTAC	2	8	2056529	2056536	25 %	50 %	0 %	25 %	470211140
38071	NC_020558	GTTTT	2	10	2056542	2056551	0 %	80 %	20 %	0 %	470211140
38072	NC_020558	AAT	2	6	2056552	2056557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211140
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38074	NC_020558	CTT	2	6	2056673	2056678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211140
38075	NC_020558	CTTTAC	2	12	2056685	2056696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211140
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38078	NC_020558	GCT	2	6	2056864	2056869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211140
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38081	NC_020558	GTA	2	6	2056942	2056947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211140
38082	NC_020558	CTG	2	6	2057297	2057302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211141
38083	NC_020558	CAAA	2	8	2057403	2057410	75 %	0 %	0 %	25 %	470211141
38084	NC_020558	TGG	2	6	2057421	2057426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211141
38085	NC_020558	AT	3	6	2057454	2057459	50 %	50 %	0 %	0 %	470211141
38086	NC_020558	TGG	2	6	2057492	2057497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211141
38087	NC_020558	CTT	2	6	2057554	2057559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211142
38088	NC_020558	AAAG	2	8	2057621	2057628	75 %	0 %	25 %	0 %	470211142
38089	NC_020558	AATT	2	8	2057656	2057663	50 %	50 %	0 %	0 %	470211142
38090	NC_020558	TGA	2	6	2057702	2057707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211142
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38092	NC_020558	AAATTT	2	12	2057786	2057797	50 %	50 %	0 %	0 %	470211142
38093	NC_020558	TGT	2	6	2057828	2057833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211142
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38095	NC_020558	A	7	7	2057900	2057906	100 %	0 %	0 %	0 %	470211142
38096	NC_020558	GTC	2	6	2057928	2057933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211142
38097	NC_020558	GAT	2	6	2057955	2057960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211142
38098	NC_020558	AT	3	6	2057959	2057964	50 %	50 %	0 %	0 %	470211142
38099	NC_020558	ACT	2	6	2057967	2057972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211142
38100	NC_020558	CTA	2	6	2058079	2058084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211142
38101	NC_020558	TTTC	2	8	2058111	2058118	0 %	75 %	0 %	25 %	470211142
38102	NC_020558	AGA	2	6	2058134	2058139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211142
38103	NC_020558	TTTG	2	8	2058262	2058269	0 %	75 %	25 %	0 %	470211142
38104	NC_020558	TAT	2	6	2058368	2058373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211142
38105	NC_020558	CTTC	2	8	2058469	2058476	0 %	50 %	0 %	50 %	470211142
38106	NC_020558	AAC	2	6	2058479	2058484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211142
38107	NC_020558	TTA	2	6	2058502	2058507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211142
38108	NC_020558	ATC	2	6	2058528	2058533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211142
38109	NC_020558	TGG	2	6	2058542	2058547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211142
38110	NC_020558	TCT	2	6	2058583	2058588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211142
38111	NC_020558	AGA	2	6	2058602	2058607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211142
38112	NC_020558	GTT	2	6	2058633	2058638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211142
38113	NC_020558	GAA	2	6	2058744	2058749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211142
38114	NC_020558	GC	3	6	2058801	2058806	0 %	0 %	50 %	50 %	470211142
38115	NC_020558	T	6	6	2058837	2058842	0 %	100 %	0 %	0 %	470211142
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38117	NC_020558	GTC	2	6	2058957	2058962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211142
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