MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36004	NC_020558	TTA	2	6	1944167	1944172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211005
36005	NC_020558	TTG	2	6	1944181	1944186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211005
36006	NC_020558	TGC	2	6	1944225	1944230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211005
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36012	NC_020558	TTG	2	6	1944504	1944509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211006
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36017	NC_020558	GAA	2	6	1944748	1944753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211007
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36021	NC_020558	ACA	2	6	1944846	1944851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211007
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36023	NC_020558	AT	3	6	1944909	1944914	50 %	50 %	0 %	0 %	470211007
36024	NC_020558	TTG	2	6	1944926	1944931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211007
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36055	NC_020558	ATC	2	6	1946671	1946676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211010
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36089	NC_020558	CCGC	2	8	1948414	1948421	0 %	0 %	25 %	75 %	470211014
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36102	NC_020558	TAA	2	6	1949465	1949470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211015
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36116	NC_020558	TGA	2	6	1950190	1950195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211016
36117	NC_020558	TTCTAC	2	12	1950237	1950248	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211016
36118	NC_020558	CAT	2	6	1950290	1950295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211016
36119	NC_020558	CCA	2	6	1950335	1950340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211016
36120	NC_020558	CTA	2	6	1950386	1950391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211016
36121	NC_020558	T	6	6	1950456	1950461	0 %	100 %	0 %	0 %	470211016
36122	NC_020558	CTA	2	6	1950470	1950475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211016
36123	NC_020558	CTT	2	6	1950476	1950481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211016
36124	NC_020558	T	6	6	1950590	1950595	0 %	100 %	0 %	0 %	470211016
36125	NC_020558	CAC	2	6	1950606	1950611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211016
36126	NC_020558	GGT	2	6	1950674	1950679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211016
36127	NC_020558	ACT	2	6	1950691	1950696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211016
36128	NC_020558	TC	3	6	1950739	1950744	0 %	50 %	0 %	50 %	470211016
36129	NC_020558	TCA	2	6	1950754	1950759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211016
36130	NC_020558	T	6	6	1950856	1950861	0 %	100 %	0 %	0 %	470211017
36131	NC_020558	ATA	2	6	1950879	1950884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211017
36132	NC_020558	GCG	2	6	1950909	1950914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211017
36133	NC_020558	CTG	2	6	1950924	1950929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211017
36134	NC_020558	TAA	2	6	1950943	1950948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211017
36135	NC_020558	ATC	2	6	1950949	1950954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211017
36136	NC_020558	CG	3	6	1951033	1951038	0 %	0 %	50 %	50 %	470211017
36137	NC_020558	TCT	2	6	1951040	1951045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211017
36138	NC_020558	ATA	2	6	1951070	1951075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211017
36139	NC_020558	TA	3	6	1951096	1951101	50 %	50 %	0 %	0 %	470211017
36140	NC_020558	AT	3	6	1951112	1951117	50 %	50 %	0 %	0 %	470211017
36141	NC_020558	TCT	2	6	1951118	1951123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211017
36142	NC_020558	CG	3	6	1951179	1951184	0 %	0 %	50 %	50 %	470211017
36143	NC_020558	AGC	2	6	1951195	1951200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211017
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36145	NC_020558	AGC	2	6	1951264	1951269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211017
36146	NC_020558	T	7	7	1951305	1951311	0 %	100 %	0 %	0 %	470211017
36147	NC_020558	TCC	2	6	1951340	1951345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211017
36148	NC_020558	TCT	2	6	1951436	1951441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211017
36149	NC_020558	CTTT	2	8	1951472	1951479	0 %	75 %	0 %	25 %	470211017
36150	NC_020558	CTT	2	6	1951490	1951495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211017
36151	NC_020558	CCT	2	6	1951523	1951528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211017
36152	NC_020558	GATG	2	8	1951551	1951558	25 %	25 %	50 %	0 %	470211017
36153	NC_020558	GCA	2	6	1951617	1951622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211017
36154	NC_020558	TTC	2	6	1951645	1951650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211017
36155	NC_020558	AT	3	6	1951682	1951687	50 %	50 %	0 %	0 %	470211017
36156	NC_020558	CTGCG	2	10	1951690	1951699	0 %	20 %	40 %	40 %	470211017
36157	NC_020558	TAGAAC	2	12	1951710	1951721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470211017
36158	NC_020558	GAT	2	6	1951801	1951806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211017
36159	NC_020558	ATA	2	6	1951837	1951842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211017
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36162	NC_020558	TAA	2	6	1951918	1951923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211018
36163	NC_020558	T	6	6	1951948	1951953	0 %	100 %	0 %	0 %	470211018
36164	NC_020558	AAG	2	6	1951970	1951975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211018
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36168	NC_020558	T	6	6	1952166	1952171	0 %	100 %	0 %	0 %	470211018
36169	NC_020558	AGG	2	6	1952249	1952254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211018
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36171	NC_020558	TAT	2	6	1952385	1952390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211018
36172	NC_020558	ATCTTT	2	12	1952410	1952421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470211018
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36174	NC_020558	GATTG	2	10	1952586	1952595	20 %	40 %	40 %	0 %	470211018
36175	NC_020558	TCGT	2	8	1952596	1952603	0 %	50 %	25 %	25 %	470211018
36176	NC_020558	A	6	6	1952637	1952642	100 %	0 %	0 %	0 %	470211018
36177	NC_020558	T	6	6	1952656	1952661	0 %	100 %	0 %	0 %	470211018
36178	NC_020558	CTTCAT	2	12	1952680	1952691	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211018
36179	NC_020558	CAT	2	6	1952704	1952709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211019
36180	NC_020558	T	6	6	1952736	1952741	0 %	100 %	0 %	0 %	470211019
36181	NC_020558	TTC	2	6	1952874	1952879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211019
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36183	NC_020558	AAGCA	2	10	1952900	1952909	60 %	0 %	20 %	20 %	470211019
36184	NC_020558	CTA	2	6	1953004	1953009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211019
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36186	NC_020558	AAC	2	6	1953167	1953172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211019
36187	NC_020558	AAT	2	6	1953269	1953274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211019
36188	NC_020558	ATA	2	6	1953339	1953344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211019
36189	NC_020558	AAAT	2	8	1953422	1953429	75 %	25 %	0 %	0 %	470211019
36190	NC_020558	TGC	2	6	1953449	1953454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211019
36191	NC_020558	GCAA	2	8	1953459	1953466	50 %	0 %	25 %	25 %	470211019
36192	NC_020558	T	8	8	1953531	1953538	0 %	100 %	0 %	0 %	470211020
36193	NC_020558	TGC	2	6	1953550	1953555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211020
36194	NC_020558	CTTTTT	2	12	1953569	1953580	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470211020
36195	NC_020558	CTT	2	6	1953602	1953607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211020
36196	NC_020558	ACA	2	6	1953736	1953741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211020
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36200	NC_020558	GTA	2	6	1953944	1953949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211020
36201	NC_020558	T	6	6	1953980	1953985	0 %	100 %	0 %	0 %	470211020
36202	NC_020558	CATTT	2	10	1954066	1954075	20 %	60 %	0 %	20 %	470211021
36203	NC_020558	GCTCAA	2	12	1954176	1954187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470211021
36204	NC_020558	AAT	2	6	1954219	1954224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211021
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36207	NC_020558	T	6	6	1954414	1954419	0 %	100 %	0 %	0 %	470211021
36208	NC_020558	TTGG	2	8	1954485	1954492	0 %	50 %	50 %	0 %	470211021
36209	NC_020558	CTT	2	6	1954530	1954535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211021
36210	NC_020558	TAA	2	6	1954540	1954545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211021
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36212	NC_020558	A	6	6	1954581	1954586	100 %	0 %	0 %	0 %	470211021
36213	NC_020558	TCC	2	6	1954710	1954715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211022
36214	NC_020558	ATTTG	2	10	1954750	1954759	20 %	60 %	20 %	0 %	470211022
36215	NC_020558	TCA	2	6	1954797	1954802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211022
36216	NC_020558	ACT	2	6	1954824	1954829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211022
36217	NC_020558	TTC	2	6	1954901	1954906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211022
36218	NC_020558	ATT	2	6	1954964	1954969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211022
36219	NC_020558	TTA	2	6	1955035	1955040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211023
36220	NC_020558	TTC	2	6	1955048	1955053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211023
36221	NC_020558	CTA	2	6	1955123	1955128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211023
36222	NC_020558	ACT	2	6	1955172	1955177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211023
36223	NC_020558	ATTG	2	8	1955199	1955206	25 %	50 %	25 %	0 %	470211023
36224	NC_020558	T	6	6	1955243	1955248	0 %	100 %	0 %	0 %	470211023
36225	NC_020558	CTT	2	6	1955258	1955263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211023
36226	NC_020558	GCT	2	6	1955356	1955361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211023
36227	NC_020558	TTC	2	6	1955391	1955396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211023
36228	NC_020558	CTG	2	6	1955405	1955410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211023
36229	NC_020558	T	6	6	1955929	1955934	0 %	100 %	0 %	0 %	470211024
36230	NC_020558	TTC	3	9	1955963	1955971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211024
36231	NC_020558	TGT	2	6	1955983	1955988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211024
36232	NC_020558	TTTC	2	8	1956024	1956031	0 %	75 %	0 %	25 %	470211024
36233	NC_020558	CAT	2	6	1956112	1956117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211024
36234	NC_020558	TTC	2	6	1956134	1956139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211024
36235	NC_020558	TCA	2	6	1956153	1956158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211024
36236	NC_020558	AT	3	6	1956171	1956176	50 %	50 %	0 %	0 %	470211024
36237	NC_020558	TTGT	2	8	1956277	1956284	0 %	75 %	25 %	0 %	470211024
36238	NC_020558	ATC	2	6	1956308	1956313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211024
36239	NC_020558	CGA	2	6	1956343	1956348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211024
36240	NC_020558	T	6	6	1956349	1956354	0 %	100 %	0 %	0 %	470211024
36241	NC_020558	AATA	2	8	1956370	1956377	75 %	25 %	0 %	0 %	470211024
36242	NC_020558	T	7	7	1956416	1956422	0 %	100 %	0 %	0 %	470211024
36243	NC_020558	TAA	2	6	1956672	1956677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211025
36244	NC_020558	GTA	2	6	1956688	1956693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211025
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36247	NC_020558	CTG	2	6	1956793	1956798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211025
36248	NC_020558	GCT	2	6	1956873	1956878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211025
36249	NC_020558	T	6	6	1956895	1956900	0 %	100 %	0 %	0 %	470211025
36250	NC_020558	ACC	2	6	1957004	1957009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211025
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36254	NC_020558	TCA	2	6	1957251	1957256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211025
36255	NC_020558	TGGT	2	8	1957400	1957407	0 %	50 %	50 %	0 %	470211025
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36260	NC_020558	TGGT	2	8	1957550	1957557	0 %	50 %	50 %	0 %	470211025
36261	NC_020558	AAG	2	6	1957581	1957586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211025
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36264	NC_020558	CTA	2	6	1957633	1957638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211025
36265	NC_020558	T	6	6	1957651	1957656	0 %	100 %	0 %	0 %	470211025
36266	NC_020558	CGA	2	6	1957665	1957670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211025
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36334	NC_020558	AT	3	6	1960792	1960797	50 %	50 %	0 %	0 %	470211027
36335	NC_020558	AGCA	2	8	1960830	1960837	50 %	0 %	25 %	25 %	470211027
36336	NC_020558	AAT	2	6	1960875	1960880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211027
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36338	NC_020558	TCAC	2	8	1960939	1960946	25 %	25 %	0 %	50 %	470211027
36339	NC_020558	T	7	7	1961012	1961018	0 %	100 %	0 %	0 %	470211028
36340	NC_020558	TAGT	2	8	1961026	1961033	25 %	50 %	25 %	0 %	470211028
36341	NC_020558	GCT	2	6	1961077	1961082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211028
36342	NC_020558	ACTCAT	2	12	1961085	1961096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211028
36343	NC_020558	AAAC	2	8	1961187	1961194	75 %	0 %	0 %	25 %	470211028
36344	NC_020558	TTG	2	6	1961283	1961288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211028
36345	NC_020558	ATCA	2	8	1961304	1961311	50 %	25 %	0 %	25 %	470211028
36346	NC_020558	CGC	2	6	1961313	1961318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211028
36347	NC_020558	GTA	2	6	1961322	1961327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211028
36348	NC_020558	TGC	2	6	1961349	1961354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211028
36349	NC_020558	TCA	2	6	1961396	1961401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211028
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36351	NC_020558	TGT	2	6	1961474	1961479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211028
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36468	NC_020558	TCT	2	6	1967257	1967262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211034
36469	NC_020558	TTG	2	6	1967267	1967272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211034
36470	NC_020558	GTT	2	6	1967293	1967298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211034
36471	NC_020558	GGTT	2	8	1967341	1967348	0 %	50 %	50 %	0 %	470211034
36472	NC_020558	T	6	6	1967414	1967419	0 %	100 %	0 %	0 %	470211034
36473	NC_020558	T	6	6	1967429	1967434	0 %	100 %	0 %	0 %	470211034
36474	NC_020558	GCGT	2	8	1967478	1967485	0 %	25 %	50 %	25 %	470211034
36475	NC_020558	ATC	2	6	1967523	1967528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211034
36476	NC_020558	CTG	2	6	1967549	1967554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211034
36477	NC_020558	TC	3	6	1967558	1967563	0 %	50 %	0 %	50 %	470211034
36478	NC_020558	CAA	2	6	1967711	1967716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211034
36479	NC_020558	CAG	2	6	1967738	1967743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211034
36480	NC_020558	CG	3	6	1967772	1967777	0 %	0 %	50 %	50 %	470211034
36481	NC_020558	TAC	2	6	1967781	1967786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211034
36482	NC_020558	TGTT	2	8	1967817	1967824	0 %	75 %	25 %	0 %	470211034
36483	NC_020558	TTA	2	6	1967866	1967871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211034
36484	NC_020558	TTTA	2	8	1967907	1967914	25 %	75 %	0 %	0 %	470211034
36485	NC_020558	GTA	2	6	1967941	1967946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211034
36486	NC_020558	TTC	2	6	1968000	1968005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211034
36487	NC_020558	GTA	2	6	1968083	1968088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211034
36488	NC_020558	TATT	2	8	1968116	1968123	25 %	75 %	0 %	0 %	470211034
36489	NC_020558	AT	3	6	1968151	1968156	50 %	50 %	0 %	0 %	470211034
36490	NC_020558	ATTC	2	8	1968308	1968315	25 %	50 %	0 %	25 %	470211034
36491	NC_020558	AACC	2	8	1968350	1968357	50 %	0 %	0 %	50 %	470211034
36492	NC_020558	TTTCAA	2	12	1968584	1968595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470211034
36493	NC_020558	ACC	2	6	1968621	1968626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211034
36494	NC_020558	GC	3	6	1968687	1968692	0 %	0 %	50 %	50 %	470211034
36495	NC_020558	AAT	2	6	1968702	1968707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211034
36496	NC_020558	GATTT	2	10	1968795	1968804	20 %	60 %	20 %	0 %	470211034
36497	NC_020558	TAA	2	6	1968900	1968905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211034
36498	NC_020558	CCAT	2	8	1968972	1968979	25 %	25 %	0 %	50 %	470211034
36499	NC_020558	TTG	2	6	1968984	1968989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211034
36500	NC_020558	TGA	2	6	1969147	1969152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211034

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