MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_020558	T	6	6	1621640	1621645	0 %	100 %	0 %	0 %	470210643
30002	NC_020558	ACT	2	6	1621689	1621694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210643
30003	NC_020558	AGT	2	6	1621703	1621708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470210643
30004	NC_020558	GAA	2	6	1621714	1621719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470210643
30005	NC_020558	ATA	2	6	1621751	1621756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210643
30006	NC_020558	A	6	6	1621791	1621796	100 %	0 %	0 %	0 %	470210643
30007	NC_020558	GCT	2	6	1621804	1621809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470210643
30008	NC_020558	TTC	2	6	1621829	1621834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210643
30009	NC_020558	GCC	2	6	1621842	1621847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470210643
30010	NC_020558	GCT	2	6	1621941	1621946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470210643
30011	NC_020558	CTTCA	2	10	1621958	1621967	20 %	40 %	0 %	40 %	470210643
30012	NC_020558	ATA	2	6	1622025	1622030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210643
30013	NC_020558	CAA	2	6	1622065	1622070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210643
30014	NC_020558	CTC	2	6	1622096	1622101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470210643
30015	NC_020558	ACGA	2	8	1622104	1622111	50 %	0 %	25 %	25 %	470210643
30016	NC_020558	CTT	2	6	1622209	1622214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210644
30017	NC_020558	AATG	2	8	1622215	1622222	50 %	25 %	25 %	0 %	470210644
30018	NC_020558	TCT	2	6	1622261	1622266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210644
30019	NC_020558	TAA	2	6	1622284	1622289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210644
30020	NC_020558	AAGA	2	8	1622358	1622365	75 %	0 %	25 %	0 %	470210644
30021	NC_020558	CCG	2	6	1622583	1622588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470210644
30022	NC_020558	AAC	2	6	1622639	1622644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210644
30023	NC_020558	CCA	2	6	1622669	1622674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470210644
30024	NC_020558	ATT	2	6	1622716	1622721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470210644
30025	NC_020558	CCA	2	6	1622756	1622761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470210644
30026	NC_020558	TCG	2	6	1622769	1622774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470210644
30027	NC_020558	GCG	2	6	1622823	1622828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470210644
30028	NC_020558	TAT	2	6	1622838	1622843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470210644
30029	NC_020558	AGC	2	6	1622909	1622914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470210644
30030	NC_020558	TGT	2	6	1622986	1622991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470210644
30031	NC_020558	CAA	2	6	1622994	1622999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210644
30032	NC_020558	CCA	2	6	1623036	1623041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470210644
30033	NC_020558	CCG	2	6	1623053	1623058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470210644
30034	NC_020558	AAT	2	6	1623073	1623078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210644
30035	NC_020558	GCC	2	6	1623122	1623127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470210644
30036	NC_020558	ACC	2	6	1623157	1623162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470210644
30037	NC_020558	CTT	2	6	1623212	1623217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210644
30038	NC_020558	AGA	2	6	1623265	1623270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470210644
30039	NC_020558	CAA	2	6	1623452	1623457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210645
30040	NC_020558	ATC	2	6	1623630	1623635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210645
30041	NC_020558	CCA	2	6	1623636	1623641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470210645
30042	NC_020558	TCC	2	6	1623660	1623665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470210645
30043	NC_020558	CGC	2	6	1623689	1623694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470210645
30044	NC_020558	T	6	6	1623697	1623702	0 %	100 %	0 %	0 %	470210645
30045	NC_020558	TGT	2	6	1623717	1623722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470210645
30046	NC_020558	AGA	2	6	1623814	1623819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470210645
30047	NC_020558	CAT	2	6	1623865	1623870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210645
30048	NC_020558	ACC	2	6	1623875	1623880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470210645
30049	NC_020558	TCG	2	6	1623889	1623894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470210645
30050	NC_020558	GCT	2	6	1623931	1623936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470210645
30051	NC_020558	TAT	2	6	1623958	1623963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470210645
30052	NC_020558	C	6	6	1624172	1624177	0 %	0 %	0 %	100 %	470210645
30053	NC_020558	TAA	2	6	1624195	1624200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210645
30054	NC_020558	GCT	2	6	1624449	1624454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470210645
30055	NC_020558	CTT	2	6	1624534	1624539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210646
30056	NC_020558	CTT	2	6	1624744	1624749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210646
30057	NC_020558	AAT	2	6	1624760	1624765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210646
30058	NC_020558	CTT	2	6	1624776	1624781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210646
30059	NC_020558	AAT	2	6	1624829	1624834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210646
30060	NC_020558	CAT	2	6	1624921	1624926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210646
30061	NC_020558	GCTT	2	8	1624947	1624954	0 %	50 %	25 %	25 %	470210646
30062	NC_020558	CTT	2	6	1625029	1625034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210646
30063	NC_020558	CAA	2	6	1625062	1625067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210646
30064	NC_020558	CAT	2	6	1625080	1625085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210646
30065	NC_020558	TGA	2	6	1625104	1625109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470210646
30066	NC_020558	CTTT	2	8	1625172	1625179	0 %	75 %	0 %	25 %	470210646
30067	NC_020558	TCT	2	6	1625190	1625195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210646
30068	NC_020558	GCG	2	6	1625221	1625226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470210646
30069	NC_020558	CCAA	2	8	1625258	1625265	50 %	0 %	0 %	50 %	470210646
30070	NC_020558	GC	3	6	1625381	1625386	0 %	0 %	50 %	50 %	470210646
30071	NC_020558	GTT	2	6	1625496	1625501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470210646
30072	NC_020558	TGC	2	6	1625529	1625534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470210646
30073	NC_020558	CTT	2	6	1625599	1625604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210646
30074	NC_020558	ATT	2	6	1625615	1625620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470210646
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30076	NC_020558	GTA	2	6	1625812	1625817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470210646
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30078	NC_020558	AGTA	2	8	1625873	1625880	50 %	25 %	25 %	0 %	470210646
30079	NC_020558	ATCA	2	8	1625924	1625931	50 %	25 %	0 %	25 %	470210646
30080	NC_020558	CGC	2	6	1626023	1626028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470210646
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30082	NC_020558	TCA	2	6	1626183	1626188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210646
30083	NC_020558	CT	3	6	1626221	1626226	0 %	50 %	0 %	50 %	470210646
30084	NC_020558	TAA	2	6	1626260	1626265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210646
30085	NC_020558	TAAG	2	8	1626305	1626312	50 %	25 %	25 %	0 %	470210646
30086	NC_020558	CAA	2	6	1626322	1626327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210646
30087	NC_020558	CTT	2	6	1626364	1626369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470210646
30088	NC_020558	TAA	3	9	1626372	1626380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210646
30089	NC_020558	ATCCGC	2	12	1626407	1626418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470210646
30090	NC_020558	TAGT	2	8	1626441	1626448	25 %	50 %	25 %	0 %	470210646
30091	NC_020558	CAT	2	6	1626535	1626540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210646
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30097	NC_020558	T	6	6	1626822	1626827	0 %	100 %	0 %	0 %	470210646
30098	NC_020558	TTTTC	2	10	1627100	1627109	0 %	80 %	0 %	20 %	470210647
30099	NC_020558	CAA	2	6	1627140	1627145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210647
30100	NC_020558	CTA	2	6	1627169	1627174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210647
30101	NC_020558	AAAAT	2	10	1627176	1627185	80 %	20 %	0 %	0 %	470210647
30102	NC_020558	ATC	2	6	1627207	1627212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210647
30103	NC_020558	AAT	2	6	1627233	1627238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210647
30104	NC_020558	ACCA	2	8	1627260	1627267	50 %	0 %	0 %	50 %	470210647
30105	NC_020558	AGA	2	6	1627364	1627369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470210647
30106	NC_020558	CTGCTC	2	12	1627421	1627432	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470210647
30107	NC_020558	TAA	2	6	1627475	1627480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210647
30108	NC_020558	AAT	2	6	1627500	1627505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470210647
30109	NC_020558	AGA	2	6	1627521	1627526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470210647
30110	NC_020558	ATC	3	9	1627540	1627548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210647
30111	NC_020558	CAA	2	6	1627571	1627576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210647
30112	NC_020558	CGG	2	6	1627623	1627628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470210647
30113	NC_020558	ATC	2	6	1627630	1627635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470210647
30114	NC_020558	CAA	2	6	1627718	1627723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470210647
30115	NC_020558	CAAAC	2	10	1627736	1627745	60 %	0 %	0 %	40 %	470210647
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30117	NC_020558	AAAC	2	8	1627854	1627861	75 %	0 %	0 %	25 %	470210647
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30474	NC_020558	GCA	2	6	1651892	1651897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470210664
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30490	NC_020558	AT	3	6	1652840	1652845	50 %	50 %	0 %	0 %	470210666
30491	NC_020558	A	6	6	1652947	1652952	100 %	0 %	0 %	0 %	470210666
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