MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_020558	CAA	2	6	648519	648524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209493
11503	NC_020558	T	6	6	648534	648539	0 %	100 %	0 %	0 %	470209493
11504	NC_020558	ATT	2	6	648541	648546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209493
11505	NC_020558	A	6	6	648552	648557	100 %	0 %	0 %	0 %	470209493
11506	NC_020558	ATA	2	6	648586	648591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209494
11507	NC_020558	CGC	2	6	648607	648612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209494
11508	NC_020558	AAT	2	6	648666	648671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209494
11509	NC_020558	CTT	2	6	648699	648704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209494
11510	NC_020558	T	7	7	648707	648713	0 %	100 %	0 %	0 %	470209494
11511	NC_020558	TTG	2	6	648748	648753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209494
11512	NC_020558	GTTT	2	8	648799	648806	0 %	75 %	25 %	0 %	470209494
11513	NC_020558	TGA	2	6	648868	648873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209494
11514	NC_020558	ATTTT	2	10	648894	648903	20 %	80 %	0 %	0 %	470209494
11515	NC_020558	ACTC	2	8	649096	649103	25 %	25 %	0 %	50 %	470209494
11516	NC_020558	CTT	2	6	649178	649183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209494
11517	NC_020558	A	6	6	649202	649207	100 %	0 %	0 %	0 %	470209494
11518	NC_020558	AAG	2	6	649285	649290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209495
11519	NC_020558	GAA	2	6	649324	649329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209495
11520	NC_020558	AAC	2	6	649355	649360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209495
11521	NC_020558	CGT	2	6	649375	649380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209495
11522	NC_020558	ACAAA	2	10	649392	649401	80 %	0 %	0 %	20 %	470209495
11523	NC_020558	ACGG	2	8	649472	649479	25 %	0 %	50 %	25 %	470209495
11524	NC_020558	GAT	2	6	649486	649491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209495
11525	NC_020558	ACG	2	6	649526	649531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209495
11526	NC_020558	ATAC	2	8	649543	649550	50 %	25 %	0 %	25 %	470209495
11527	NC_020558	AAG	2	6	649551	649556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209495
11528	NC_020558	TA	3	6	649560	649565	50 %	50 %	0 %	0 %	470209495
11529	NC_020558	TGA	2	6	649581	649586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209495
11530	NC_020558	AAC	2	6	649620	649625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209495
11531	NC_020558	A	7	7	649688	649694	100 %	0 %	0 %	0 %	470209496
11532	NC_020558	GAAT	2	8	649835	649842	50 %	25 %	25 %	0 %	470209496
11533	NC_020558	CTT	2	6	649855	649860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209496
11534	NC_020558	ACT	2	6	649923	649928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209496
11535	NC_020558	GTA	2	6	649975	649980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209496
11536	NC_020558	TGT	2	6	649985	649990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209496
11537	NC_020558	ATT	2	6	650007	650012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209496
11538	NC_020558	TTC	2	6	650045	650050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209496
11539	NC_020558	AGC	2	6	650066	650071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209496
11540	NC_020558	GAAA	2	8	650156	650163	75 %	0 %	25 %	0 %	470209496
11541	NC_020558	TGCT	2	8	650254	650261	0 %	50 %	25 %	25 %	470209496
11542	NC_020558	GTT	2	6	650262	650267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209496
11543	NC_020558	TTCG	2	8	650312	650319	0 %	50 %	25 %	25 %	470209496
11544	NC_020558	CTG	2	6	650401	650406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209496
11545	NC_020558	GAT	2	6	650439	650444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209496
11546	NC_020558	GGT	2	6	650486	650491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209496
11547	NC_020558	TGC	2	6	650504	650509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209496
11548	NC_020558	CGT	2	6	650570	650575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209496
11549	NC_020558	ATC	2	6	650583	650588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209496
11550	NC_020558	AATTT	2	10	650602	650611	40 %	60 %	0 %	0 %	470209496
11551	NC_020558	A	6	6	650616	650621	100 %	0 %	0 %	0 %	470209496
11552	NC_020558	GCA	2	6	650706	650711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209496
11553	NC_020558	GTT	2	6	650730	650735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209496
11554	NC_020558	A	6	6	650770	650775	100 %	0 %	0 %	0 %	470209496
11555	NC_020558	GTC	2	6	650802	650807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209496
11556	NC_020558	ATA	2	6	650869	650874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209496
11557	NC_020558	CG	3	6	650887	650892	0 %	0 %	50 %	50 %	470209496
11558	NC_020558	GTTGCG	2	12	650919	650930	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470209496
11559	NC_020558	GCG	2	6	650932	650937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470209496
11560	NC_020558	TGA	2	6	650980	650985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209496
11561	NC_020558	AGA	2	6	651059	651064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209496
11562	NC_020558	GAA	2	6	651074	651079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209496
11563	NC_020558	TGT	2	6	651125	651130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209496
11564	NC_020558	GAA	2	6	651137	651142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209496
11565	NC_020558	ACT	2	6	651152	651157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209496
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11567	NC_020558	TGA	2	6	651197	651202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209496
11568	NC_020558	TGAT	2	8	651214	651221	25 %	50 %	25 %	0 %	470209496
11569	NC_020558	A	6	6	651231	651236	100 %	0 %	0 %	0 %	470209496
11570	NC_020558	ATT	2	6	651244	651249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209496
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11572	NC_020558	ATT	2	6	651327	651332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209496
11573	NC_020558	GCT	2	6	651446	651451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209496
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11582	NC_020558	TGCT	2	8	652048	652055	0 %	50 %	25 %	25 %	470209497
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11586	NC_020558	ATC	2	6	652121	652126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209497
11587	NC_020558	GAG	2	6	652179	652184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470209497
11588	NC_020558	GAT	2	6	652305	652310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209497
11589	NC_020558	TTAT	2	8	652331	652338	25 %	75 %	0 %	0 %	470209497
11590	NC_020558	GGA	2	6	652355	652360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470209497
11591	NC_020558	ATT	2	6	652386	652391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209497
11592	NC_020558	GCT	2	6	652451	652456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209497
11593	NC_020558	CGA	2	6	652564	652569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209497
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11596	NC_020558	GAG	2	6	652665	652670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470209497
11597	NC_020558	AGTG	2	8	652673	652680	25 %	25 %	50 %	0 %	470209497
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11600	NC_020558	TGA	2	6	652759	652764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209497
11601	NC_020558	TAT	2	6	652805	652810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209497
11602	NC_020558	ACG	2	6	652827	652832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209497
11603	NC_020558	GACG	2	8	652889	652896	25 %	0 %	50 %	25 %	470209497
11604	NC_020558	AGCGG	2	10	652943	652952	20 %	0 %	60 %	20 %	470209497
11605	NC_020558	TTG	2	6	652954	652959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209497
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11607	NC_020558	GCA	2	6	653006	653011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209498
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11609	NC_020558	AAGTG	2	10	653101	653110	40 %	20 %	40 %	0 %	470209498
11610	NC_020558	CTG	2	6	653187	653192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209498
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11612	NC_020558	TTTCAC	2	12	653316	653327	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470209498
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11615	NC_020558	GCC	2	6	653486	653491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209498
11616	NC_020558	A	6	6	653694	653699	100 %	0 %	0 %	0 %	470209499
11617	NC_020558	AAG	2	6	653732	653737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209499
11618	NC_020558	CTTTA	2	10	653816	653825	20 %	60 %	0 %	20 %	470209500
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11620	NC_020558	GAA	3	9	653911	653919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209500
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