MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020558	TTTG	2	8	340880	340887	0 %	75 %	25 %	0 %	470209130
6002	NC_020558	T	6	6	340935	340940	0 %	100 %	0 %	0 %	470209130
6003	NC_020558	GAT	2	6	340998	341003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209130
6004	NC_020558	TGC	2	6	341070	341075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209130
6005	NC_020558	GGC	2	6	341102	341107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470209130
6006	NC_020558	TGGT	2	8	341120	341127	0 %	50 %	50 %	0 %	470209130
6007	NC_020558	GT	3	6	341244	341249	0 %	50 %	50 %	0 %	470209130
6008	NC_020558	ATG	2	6	341287	341292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209130
6009	NC_020558	TGGA	2	8	341297	341304	25 %	25 %	50 %	0 %	470209130
6010	NC_020558	GCT	2	6	341317	341322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209130
6011	NC_020558	GAA	2	6	341358	341363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209130
6012	NC_020558	CCG	2	6	341386	341391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209130
6013	NC_020558	TGC	2	6	341412	341417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209130
6014	NC_020558	T	6	6	341512	341517	0 %	100 %	0 %	0 %	470209131
6015	NC_020558	TTTG	2	8	341608	341615	0 %	75 %	25 %	0 %	470209131
6016	NC_020558	GCT	2	6	341639	341644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209131
6017	NC_020558	CG	3	6	341651	341656	0 %	0 %	50 %	50 %	470209131
6018	NC_020558	CTT	2	6	341734	341739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209131
6019	NC_020558	CGA	2	6	341783	341788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209131
6020	NC_020558	CTTCA	2	10	341828	341837	20 %	40 %	0 %	40 %	470209131
6021	NC_020558	TGC	2	6	341879	341884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209131
6022	NC_020558	CGT	2	6	341908	341913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209131
6023	NC_020558	CAG	2	6	341935	341940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209131
6024	NC_020558	TCT	2	6	341961	341966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209131
6025	NC_020558	AAC	2	6	342020	342025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209131
6026	NC_020558	AGC	2	6	342088	342093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209131
6027	NC_020558	ACA	2	6	342126	342131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209131
6028	NC_020558	GGTT	2	8	342141	342148	0 %	50 %	50 %	0 %	470209131
6029	NC_020558	AGT	2	6	342221	342226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209131
6030	NC_020558	GCTC	2	8	342301	342308	0 %	25 %	25 %	50 %	470209131
6031	NC_020558	ATA	2	6	342517	342522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209131
6032	NC_020558	TCA	2	6	342546	342551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209131
6033	NC_020558	CTT	2	6	342572	342577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209132
6034	NC_020558	CTGA	2	8	342579	342586	25 %	25 %	25 %	25 %	470209132
6035	NC_020558	TG	3	6	342680	342685	0 %	50 %	50 %	0 %	470209132
6036	NC_020558	CTT	2	6	342701	342706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209132
6037	NC_020558	TGCT	2	8	342728	342735	0 %	50 %	25 %	25 %	470209132
6038	NC_020558	T	6	6	342774	342779	0 %	100 %	0 %	0 %	470209132
6039	NC_020558	TTAA	2	8	342787	342794	50 %	50 %	0 %	0 %	470209132
6040	NC_020558	ATC	2	6	342816	342821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209132
6041	NC_020558	CTT	2	6	342953	342958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209132
6042	NC_020558	TAC	3	9	342975	342983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209132
6043	NC_020558	CTT	2	6	343013	343018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209132
6044	NC_020558	CTT	2	6	343097	343102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209132
6045	NC_020558	CTT	2	6	343115	343120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209132
6046	NC_020558	GAT	2	6	343125	343130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209132
6047	NC_020558	GGTTG	2	10	343131	343140	0 %	40 %	60 %	0 %	470209132
6048	NC_020558	GTT	2	6	343141	343146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209132
6049	NC_020558	ATT	2	6	343219	343224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209132
6050	NC_020558	TTTA	2	8	343266	343273	25 %	75 %	0 %	0 %	470209133
6051	NC_020558	CCG	2	6	343283	343288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209133
6052	NC_020558	TAA	2	6	343311	343316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209133
6053	NC_020558	CTT	2	6	343359	343364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209133
6054	NC_020558	AATT	2	8	343390	343397	50 %	50 %	0 %	0 %	470209133
6055	NC_020558	T	6	6	343396	343401	0 %	100 %	0 %	0 %	470209133
6056	NC_020558	T	6	6	343432	343437	0 %	100 %	0 %	0 %	470209133
6057	NC_020558	CATTAA	2	12	343473	343484	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470209133
6058	NC_020558	TGT	2	6	343485	343490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209133
6059	NC_020558	CCATT	2	10	343498	343507	20 %	40 %	0 %	40 %	470209133
6060	NC_020558	GCT	2	6	343535	343540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209133
6061	NC_020558	CCG	2	6	343613	343618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209133
6062	NC_020558	GAAC	2	8	343660	343667	50 %	0 %	25 %	25 %	470209133
6063	NC_020558	AGTTC	2	10	343674	343683	20 %	40 %	20 %	20 %	470209133
6064	NC_020558	TTC	2	6	343702	343707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209133
6065	NC_020558	TCT	2	6	343715	343720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209133
6066	NC_020558	T	6	6	343780	343785	0 %	100 %	0 %	0 %	470209133
6067	NC_020558	TCTT	2	8	343814	343821	0 %	75 %	0 %	25 %	470209133
6068	NC_020558	TGC	2	6	343867	343872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209133
6069	NC_020558	TCT	2	6	343886	343891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209133
6070	NC_020558	CAAG	2	8	343899	343906	50 %	0 %	25 %	25 %	470209133
6071	NC_020558	ACA	2	6	343907	343912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209133
6072	NC_020558	A	6	6	343929	343934	100 %	0 %	0 %	0 %	470209133
6073	NC_020558	TGC	2	6	343963	343968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209133
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6075	NC_020558	T	7	7	344063	344069	0 %	100 %	0 %	0 %	470209134
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6079	NC_020558	TGC	2	6	344251	344256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209134
6080	NC_020558	TTTG	2	8	344272	344279	0 %	75 %	25 %	0 %	470209134
6081	NC_020558	T	6	6	344339	344344	0 %	100 %	0 %	0 %	470209134
6082	NC_020558	GTTT	2	8	344453	344460	0 %	75 %	25 %	0 %	470209134
6083	NC_020558	CGA	2	6	344577	344582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209135
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6088	NC_020558	CGC	2	6	344673	344678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209135
6089	NC_020558	AAT	2	6	344689	344694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209135
6090	NC_020558	TGA	2	6	344708	344713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209135
6091	NC_020558	TTGCC	2	10	344745	344754	0 %	40 %	20 %	40 %	470209135
6092	NC_020558	T	6	6	344849	344854	0 %	100 %	0 %	0 %	470209135
6093	NC_020558	TTCG	2	8	344857	344864	0 %	50 %	25 %	25 %	470209135
6094	NC_020558	CA	3	6	344890	344895	50 %	0 %	0 %	50 %	470209135
6095	NC_020558	TAC	2	6	344896	344901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209135
6096	NC_020558	T	6	6	344910	344915	0 %	100 %	0 %	0 %	470209135
6097	NC_020558	TGAT	2	8	345021	345028	25 %	50 %	25 %	0 %	470209135
6098	NC_020558	ACCAAA	2	12	345085	345096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209135
6099	NC_020558	AAG	2	6	345181	345186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209135
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6101	NC_020558	TAG	2	6	345408	345413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209136
6102	NC_020558	GCAT	2	8	345425	345432	25 %	25 %	25 %	25 %	470209136
6103	NC_020558	CAT	2	6	345520	345525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209136
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6106	NC_020558	T	6	6	345712	345717	0 %	100 %	0 %	0 %	470209136
6107	NC_020558	TTCAC	2	10	345770	345779	20 %	40 %	0 %	40 %	470209136
6108	NC_020558	GATT	2	8	345795	345802	25 %	50 %	25 %	0 %	470209136
6109	NC_020558	A	6	6	345896	345901	100 %	0 %	0 %	0 %	470209136
6110	NC_020558	GT	3	6	345969	345974	0 %	50 %	50 %	0 %	470209137
6111	NC_020558	CAA	2	6	346068	346073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209137
6112	NC_020558	TTTC	2	8	346098	346105	0 %	75 %	0 %	25 %	470209137
6113	NC_020558	ACC	2	6	346156	346161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470209137
6114	NC_020558	TAA	2	6	346170	346175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209137
6115	NC_020558	CTT	2	6	346185	346190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209137
6116	NC_020558	ATTTC	2	10	346203	346212	20 %	60 %	0 %	20 %	470209137
6117	NC_020558	ACT	2	6	346241	346246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209137
6118	NC_020558	CTT	2	6	346320	346325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209137
6119	NC_020558	AGA	3	9	346363	346371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209137
6120	NC_020558	CAG	2	6	346413	346418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209137
6121	NC_020558	TGC	3	9	346450	346458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209137
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6123	NC_020558	CAC	2	6	346497	346502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470209137
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6492	NC_020558	TCA	2	6	366135	366140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209164
6493	NC_020558	TAAAAG	2	12	366147	366158	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470209164
6494	NC_020558	A	6	6	366193	366198	100 %	0 %	0 %	0 %	470209164
6495	NC_020558	TTA	2	6	366290	366295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209165
6496	NC_020558	CAT	2	6	366401	366406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209165
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