MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 50906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_020557	AGA	2	6	2160958	2160963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208106
40002	NC_020557	GTT	2	6	2161016	2161021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208106
40003	NC_020557	AAGA	2	8	2161041	2161048	75 %	0 %	25 %	0 %	470208106
40004	NC_020557	GAG	2	6	2161070	2161075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208106
40005	NC_020557	AGC	2	6	2161108	2161113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208106
40006	NC_020557	TAA	2	6	2161123	2161128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208106
40007	NC_020557	GAA	2	6	2161135	2161140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208106
40008	NC_020557	ATA	2	6	2161180	2161185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208106
40009	NC_020557	T	7	7	2161310	2161316	0 %	100 %	0 %	0 %	470208107
40010	NC_020557	T	6	6	2161330	2161335	0 %	100 %	0 %	0 %	470208107
40011	NC_020557	TCT	2	6	2161392	2161397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208107
40012	NC_020557	TA	3	6	2161405	2161410	50 %	50 %	0 %	0 %	470208107
40013	NC_020557	GTT	2	6	2161513	2161518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208107
40014	NC_020557	CCG	3	9	2161533	2161541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470208107
40015	NC_020557	CCA	2	6	2161545	2161550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208107
40016	NC_020557	CAC	2	6	2161606	2161611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208107
40017	NC_020557	TTC	2	6	2161612	2161617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208107
40018	NC_020557	TGT	2	6	2161634	2161639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208107
40019	NC_020557	T	6	6	2161649	2161654	0 %	100 %	0 %	0 %	470208107
40020	NC_020557	TCC	2	6	2161665	2161670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208108
40021	NC_020557	TTGTT	2	10	2161674	2161683	0 %	80 %	20 %	0 %	470208108
40022	NC_020557	TG	3	6	2161708	2161713	0 %	50 %	50 %	0 %	470208108
40023	NC_020557	GAC	2	6	2161835	2161840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208108
40024	NC_020557	TTC	2	6	2161938	2161943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208108
40025	NC_020557	AAGCA	2	10	2161959	2161968	60 %	0 %	20 %	20 %	470208108
40026	NC_020557	AT	3	6	2161969	2161974	50 %	50 %	0 %	0 %	470208108
40027	NC_020557	GTT	2	6	2162060	2162065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208108
40028	NC_020557	ACC	2	6	2162254	2162259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208109
40029	NC_020557	ACA	2	6	2162282	2162287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208109
40030	NC_020557	AAT	2	6	2162371	2162376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208109
40031	NC_020557	TAG	2	6	2162454	2162459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208109
40032	NC_020557	T	6	6	2162473	2162478	0 %	100 %	0 %	0 %	470208109
40033	NC_020557	TCA	2	6	2162522	2162527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208109
40034	NC_020557	CAT	2	6	2162589	2162594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208109
40035	NC_020557	AGC	2	6	2162617	2162622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208109
40036	NC_020557	TTC	2	6	2162731	2162736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208109
40037	NC_020557	AAT	2	6	2162764	2162769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208109
40038	NC_020557	GAC	2	6	2162796	2162801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208109
40039	NC_020557	TCTGGA	2	12	2162810	2162821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470208109
40040	NC_020557	TTA	2	6	2162837	2162842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208109
40041	NC_020557	CCA	2	6	2162888	2162893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208109
40042	NC_020557	TGTTGC	2	12	2162953	2162964	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470208109
40043	NC_020557	TGT	2	6	2162977	2162982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208109
40044	NC_020557	ATC	2	6	2163041	2163046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208109
40045	NC_020557	CGA	2	6	2163071	2163076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208109
40046	NC_020557	ATC	2	6	2163172	2163177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208109
40047	NC_020557	CTT	2	6	2163255	2163260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208109
40048	NC_020557	T	6	6	2163259	2163264	0 %	100 %	0 %	0 %	470208109
40049	NC_020557	CTG	2	6	2163300	2163305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208109
40050	NC_020557	T	7	7	2163367	2163373	0 %	100 %	0 %	0 %	470208109
40051	NC_020557	AAG	2	6	2163384	2163389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208109
40052	NC_020557	AAC	2	6	2163433	2163438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208109
40053	NC_020557	CTCTT	2	10	2163441	2163450	0 %	60 %	0 %	40 %	470208109
40054	NC_020557	CTTA	2	8	2163658	2163665	25 %	50 %	0 %	25 %	470208110
40055	NC_020557	CCG	2	6	2163699	2163704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470208110
40056	NC_020557	CTT	2	6	2163748	2163753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208110
40057	NC_020557	TCA	2	6	2163820	2163825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208110
40058	NC_020557	TTC	2	6	2163830	2163835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208110
40059	NC_020557	TCT	2	6	2163909	2163914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208110
40060	NC_020557	ACC	2	6	2164037	2164042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208110
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40062	NC_020557	AAT	2	6	2164128	2164133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208110
40063	NC_020557	TGT	2	6	2164139	2164144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208110
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40065	NC_020557	TGC	2	6	2164229	2164234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208110
40066	NC_020557	ACT	2	6	2164239	2164244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208110
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40071	NC_020557	TGC	2	6	2164421	2164426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208110
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40074	NC_020557	TTC	2	6	2164475	2164480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208110
40075	NC_020557	AGTTCG	2	12	2164487	2164498	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470208110
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40081	NC_020557	TTA	2	6	2164736	2164741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208111
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40083	NC_020557	ATT	2	6	2164870	2164875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208111
40084	NC_020557	ACT	2	6	2164886	2164891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208111
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40087	NC_020557	AT	3	6	2164943	2164948	50 %	50 %	0 %	0 %	470208111
40088	NC_020557	A	6	6	2164986	2164991	100 %	0 %	0 %	0 %	470208111
40089	NC_020557	T	6	6	2165124	2165129	0 %	100 %	0 %	0 %	470208111
40090	NC_020557	TAT	2	6	2165142	2165147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208111
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40101	NC_020557	TTG	3	9	2165683	2165691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208111
40102	NC_020557	GTTTG	2	10	2165723	2165732	0 %	60 %	40 %	0 %	470208111
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40104	NC_020557	GTG	2	6	2166176	2166181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208112
40105	NC_020557	CTTT	2	8	2166203	2166210	0 %	75 %	0 %	25 %	470208112
40106	NC_020557	TTCT	2	8	2166225	2166232	0 %	75 %	0 %	25 %	470208112
40107	NC_020557	TAT	2	6	2166268	2166273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208112
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40111	NC_020557	ATTT	2	8	2166462	2166469	25 %	75 %	0 %	0 %	470208113
40112	NC_020557	ATC	2	6	2166481	2166486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208113
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40114	NC_020557	TCA	3	9	2166539	2166547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208113
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40116	NC_020557	CGT	2	6	2166611	2166616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208113
40117	NC_020557	CTT	2	6	2166618	2166623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208113
40118	NC_020557	TCCA	2	8	2166644	2166651	25 %	25 %	0 %	50 %	470208113
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40216	NC_020557	AAAC	2	8	2171675	2171682	75 %	0 %	0 %	25 %	470208117
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40227	NC_020557	GTCTT	2	10	2172044	2172053	0 %	60 %	20 %	20 %	470208117
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40229	NC_020557	AAT	2	6	2172137	2172142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208117
40230	NC_020557	ATCGA	2	10	2172200	2172209	40 %	20 %	20 %	20 %	470208117
40231	NC_020557	AAT	2	6	2172299	2172304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208117
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