MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020450	AATC	2	8	207477	207484	50 %	25 %	0 %	25 %	459284414
4002	NC_020450	TAA	2	6	207491	207496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284414
4003	NC_020450	TGA	2	6	207620	207625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284414
4004	NC_020450	TCAA	2	8	207649	207656	50 %	25 %	0 %	25 %	459284414
4005	NC_020450	A	6	6	207674	207679	100 %	0 %	0 %	0 %	459284414
4006	NC_020450	TGA	2	6	207704	207709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284414
4007	NC_020450	TGA	2	6	207926	207931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284414
4008	NC_020450	GAA	2	6	207960	207965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284414
4009	NC_020450	TCA	2	6	207993	207998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284414
4010	NC_020450	AAAAG	2	10	208056	208065	80 %	0 %	20 %	0 %	459284415
4011	NC_020450	TAT	2	6	208073	208078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284415
4012	NC_020450	A	6	6	208084	208089	100 %	0 %	0 %	0 %	459284415
4013	NC_020450	GAA	2	6	208094	208099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284415
4014	NC_020450	CAT	2	6	208127	208132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284415
4015	NC_020450	TGC	2	6	208136	208141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284415
4016	NC_020450	GCA	2	6	208230	208235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284415
4017	NC_020450	ATT	3	9	208263	208271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284415
4018	NC_020450	ATT	2	6	208305	208310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284415
4019	NC_020450	AGA	2	6	208326	208331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284415
4020	NC_020450	GCA	3	9	208347	208355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284415
4021	NC_020450	TTA	2	6	208390	208395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284415
4022	NC_020450	ATT	2	6	208419	208424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284415
4023	NC_020450	TTA	2	6	208437	208442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284415
4024	NC_020450	GAA	2	6	208464	208469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284415
4025	NC_020450	AAT	2	6	208495	208500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284415
4026	NC_020450	TTG	2	6	208677	208682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284416
4027	NC_020450	A	7	7	208685	208691	100 %	0 %	0 %	0 %	459284416
4028	NC_020450	GCT	2	6	208751	208756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284416
4029	NC_020450	TCA	2	6	208787	208792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284416
4030	NC_020450	GGT	3	9	208871	208879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284416
4031	NC_020450	TAC	2	6	208987	208992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284416
4032	NC_020450	TGG	2	6	209005	209010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284416
4033	NC_020450	AGC	2	6	209020	209025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284416
4034	NC_020450	CTGACC	2	12	209079	209090	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	459284416
4035	NC_020450	GAA	3	9	209141	209149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284416
4036	NC_020450	TTG	2	6	209157	209162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284416
4037	NC_020450	AGC	2	6	209209	209214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284416
4038	NC_020450	CAA	2	6	209232	209237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284416
4039	NC_020450	AGA	2	6	209281	209286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284416
4040	NC_020450	GAT	4	12	209324	209335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284416
4041	NC_020450	A	6	6	209461	209466	100 %	0 %	0 %	0 %	459284417
4042	NC_020450	ATT	3	9	209477	209485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284417
4043	NC_020450	CAA	2	6	209555	209560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284417
4044	NC_020450	AAG	2	6	209573	209578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284417
4045	NC_020450	TGA	2	6	209750	209755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284417
4046	NC_020450	AAG	2	6	209800	209805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284417
4047	NC_020450	A	6	6	209818	209823	100 %	0 %	0 %	0 %	459284417
4048	NC_020450	GATTT	2	10	209825	209834	20 %	60 %	20 %	0 %	459284417
4049	NC_020450	CATT	2	8	209883	209890	25 %	50 %	0 %	25 %	459284417
4050	NC_020450	TGA	2	6	209901	209906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284417
4051	NC_020450	TCA	2	6	209979	209984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284417
4052	NC_020450	AAC	2	6	210036	210041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284417
4053	NC_020450	GA	3	6	210058	210063	50 %	0 %	50 %	0 %	459284417
4054	NC_020450	GAA	2	6	210077	210082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284417
4055	NC_020450	AGA	2	6	210119	210124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284418
4056	NC_020450	ATCA	2	8	210150	210157	50 %	25 %	0 %	25 %	459284418
4057	NC_020450	CCA	2	6	210183	210188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284418
4058	NC_020450	ATTGA	2	10	210210	210219	40 %	40 %	20 %	0 %	459284418
4059	NC_020450	CAAA	2	8	210231	210238	75 %	0 %	0 %	25 %	459284418
4060	NC_020450	TTG	2	6	210247	210252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284418
4061	NC_020450	GGCTT	2	10	210288	210297	0 %	40 %	40 %	20 %	459284418
4062	NC_020450	AGA	2	6	210383	210388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284418
4063	NC_020450	GAT	2	6	210525	210530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284418
4064	NC_020450	GGT	2	6	210558	210563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284418
4065	NC_020450	AGAA	2	8	210570	210577	75 %	0 %	25 %	0 %	459284418
4066	NC_020450	GCG	2	6	210618	210623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284418
4067	NC_020450	T	6	6	210654	210659	0 %	100 %	0 %	0 %	459284418
4068	NC_020450	GATT	2	8	210716	210723	25 %	50 %	25 %	0 %	459284418
4069	NC_020450	TAAA	2	8	210728	210735	75 %	25 %	0 %	0 %	459284418
4070	NC_020450	TGA	2	6	210831	210836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284419
4071	NC_020450	GAAG	2	8	210870	210877	50 %	0 %	50 %	0 %	459284419
4072	NC_020450	ATG	2	6	210927	210932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284419
4073	NC_020450	AGC	2	6	210971	210976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284419
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4075	NC_020450	CAC	2	6	211180	211185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284419
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4077	NC_020450	GCCA	2	8	211247	211254	25 %	0 %	25 %	50 %	459284419
4078	NC_020450	TCT	2	6	211278	211283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284419
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4080	NC_020450	GTT	2	6	211333	211338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284419
4081	NC_020450	TGC	2	6	211343	211348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284419
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4084	NC_020450	ATA	2	6	211494	211499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284419
4085	NC_020450	TGAC	2	8	211527	211534	25 %	25 %	25 %	25 %	459284419
4086	NC_020450	TGGA	2	8	211559	211566	25 %	25 %	50 %	0 %	459284419
4087	NC_020450	GAA	2	6	211588	211593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284419
4088	NC_020450	TTGTA	2	10	211614	211623	20 %	60 %	20 %	0 %	459284419
4089	NC_020450	ATTT	2	8	211635	211642	25 %	75 %	0 %	0 %	459284419
4090	NC_020450	A	7	7	211789	211795	100 %	0 %	0 %	0 %	459284420
4091	NC_020450	AGC	2	6	211818	211823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284420
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4094	NC_020450	AAT	2	6	212002	212007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284420
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4098	NC_020450	A	6	6	212087	212092	100 %	0 %	0 %	0 %	459284420
4099	NC_020450	GAA	2	6	212116	212121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284420
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4101	NC_020450	AAG	2	6	212190	212195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284420
4102	NC_020450	GAA	2	6	212245	212250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284420
4103	NC_020450	ATG	2	6	212261	212266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284420
4104	NC_020450	CAT	2	6	212278	212283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284420
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4106	NC_020450	T	6	6	212454	212459	0 %	100 %	0 %	0 %	459284421
4107	NC_020450	AAG	2	6	212496	212501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284421
4108	NC_020450	AGCA	2	8	212517	212524	50 %	0 %	25 %	25 %	459284421
4109	NC_020450	T	6	6	212581	212586	0 %	100 %	0 %	0 %	459284421
4110	NC_020450	AAG	2	6	212613	212618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284421
4111	NC_020450	TGT	3	9	212619	212627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284421
4112	NC_020450	GTT	2	6	212701	212706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284421
4113	NC_020450	TAG	2	6	212718	212723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284421
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4116	NC_020450	GAT	2	6	212951	212956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284421
4117	NC_020450	AAAAT	2	10	213180	213189	80 %	20 %	0 %	0 %	459284421
4118	NC_020450	TAA	2	6	213216	213221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284421
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4120	NC_020450	CAT	2	6	213258	213263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284421
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4122	NC_020450	AAG	2	6	213302	213307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284421
4123	NC_020450	T	6	6	213330	213335	0 %	100 %	0 %	0 %	459284421
4124	NC_020450	TGA	2	6	213404	213409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284421
4125	NC_020450	C	6	6	213447	213452	0 %	0 %	0 %	100 %	459284421
4126	NC_020450	AGC	2	6	213486	213491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284421
4127	NC_020450	CAT	2	6	213534	213539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284421
4128	NC_020450	ATC	2	6	213565	213570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284421
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4130	NC_020450	GA	3	6	213642	213647	50 %	0 %	50 %	0 %	459284421
4131	NC_020450	GAA	2	6	213727	213732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284421
4132	NC_020450	GAG	2	6	213741	213746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284421
4133	NC_020450	TTAAT	2	10	213773	213782	40 %	60 %	0 %	0 %	459284421
4134	NC_020450	CAT	2	6	213798	213803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284421
4135	NC_020450	A	6	6	214087	214092	100 %	0 %	0 %	0 %	459284422
4136	NC_020450	AAG	2	6	214159	214164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284422
4137	NC_020450	AAG	2	6	214282	214287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284422
4138	NC_020450	A	7	7	214398	214404	100 %	0 %	0 %	0 %	459284422
4139	NC_020450	TCA	2	6	214412	214417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284422
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4141	NC_020450	CTAGT	2	10	214446	214455	20 %	40 %	20 %	20 %	459284422
4142	NC_020450	GAC	2	6	214576	214581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284423
4143	NC_020450	ACGTAA	2	12	214671	214682	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	459284423
4144	NC_020450	AGC	2	6	214689	214694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284423
4145	NC_020450	ACGTAA	2	12	214695	214706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	459284423
4146	NC_020450	A	6	6	214705	214710	100 %	0 %	0 %	0 %	459284423
4147	NC_020450	T	6	6	214843	214848	0 %	100 %	0 %	0 %	459284424
4148	NC_020450	TGA	2	6	214871	214876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284424
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4150	NC_020450	TAAT	2	8	214975	214982	50 %	50 %	0 %	0 %	459284424
4151	NC_020450	TGG	2	6	215018	215023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284424
4152	NC_020450	A	6	6	215037	215042	100 %	0 %	0 %	0 %	459284424
4153	NC_020450	A	6	6	215103	215108	100 %	0 %	0 %	0 %	459284424
4154	NC_020450	AAAT	2	8	215119	215126	75 %	25 %	0 %	0 %	459284424
4155	NC_020450	TAG	2	6	215218	215223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284424
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4158	NC_020450	A	6	6	215356	215361	100 %	0 %	0 %	0 %	459284424
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4162	NC_020450	AGA	2	6	215582	215587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284424
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4164	NC_020450	A	6	6	215866	215871	100 %	0 %	0 %	0 %	459284425
4165	NC_020450	CTG	2	6	215939	215944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284425
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4240	NC_020450	TGA	2	6	219347	219352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284428
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4245	NC_020450	AGA	2	6	219572	219577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284428
4246	NC_020450	A	6	6	219577	219582	100 %	0 %	0 %	0 %	459284428
4247	NC_020450	A	6	6	219597	219602	100 %	0 %	0 %	0 %	459284428
4248	NC_020450	A	6	6	219778	219783	100 %	0 %	0 %	0 %	459284429
4249	NC_020450	A	6	6	219924	219929	100 %	0 %	0 %	0 %	459284429
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4253	NC_020450	A	6	6	220093	220098	100 %	0 %	0 %	0 %	459284429
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4355	NC_020450	A	8	8	225390	225397	100 %	0 %	0 %	0 %	459284435
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4359	NC_020450	A	7	7	225594	225600	100 %	0 %	0 %	0 %	459284435
4360	NC_020450	GCGG	2	8	225617	225624	0 %	0 %	75 %	25 %	459284435
4361	NC_020450	GCA	2	6	225683	225688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284435
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4365	NC_020450	AG	3	6	225784	225789	50 %	0 %	50 %	0 %	459284435
4366	NC_020450	A	6	6	225792	225797	100 %	0 %	0 %	0 %	459284435
4367	NC_020450	GATG	2	8	225805	225812	25 %	25 %	50 %	0 %	459284435
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4491	NC_020450	ATG	2	6	231880	231885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4492	NC_020450	ATG	2	6	231898	231903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4493	NC_020450	CTG	2	6	231949	231954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284440
4494	NC_020450	T	7	7	231956	231962	0 %	100 %	0 %	0 %	459284440
4495	NC_020450	TTGCC	2	10	231965	231974	0 %	40 %	20 %	40 %	459284440
4496	NC_020450	TTA	2	6	231995	232000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284440
4497	NC_020450	CAAA	2	8	232036	232043	75 %	0 %	0 %	25 %	459284440
4498	NC_020450	CAA	2	6	232069	232074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284440
4499	NC_020450	TGA	2	6	232137	232142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4500	NC_020450	GAC	2	6	232182	232187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284440

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