MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_020450	AGC	2	6	2212376	2212381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286260
43003	NC_020450	CAT	2	6	2212382	2212387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286260
43004	NC_020450	AAAT	2	8	2212399	2212406	75 %	25 %	0 %	0 %	459286260
43005	NC_020450	T	6	6	2212440	2212445	0 %	100 %	0 %	0 %	459286260
43006	NC_020450	A	6	6	2212454	2212459	100 %	0 %	0 %	0 %	459286260
43007	NC_020450	TGC	2	6	2212472	2212477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286260
43008	NC_020450	TGAT	2	8	2212508	2212515	25 %	50 %	25 %	0 %	459286260
43009	NC_020450	CCA	2	6	2212538	2212543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286260
43010	NC_020450	AAT	2	6	2212676	2212681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286260
43011	NC_020450	TTC	2	6	2212694	2212699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286260
43012	NC_020450	ATA	2	6	2212752	2212757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286260
43013	NC_020450	TGA	2	6	2212833	2212838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286260
43014	NC_020450	TTA	2	6	2212848	2212853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286260
43015	NC_020450	AAT	2	6	2213108	2213113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286260
43016	NC_020450	TAA	2	6	2213114	2213119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286260
43017	NC_020450	T	7	7	2213153	2213159	0 %	100 %	0 %	0 %	459286260
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43021	NC_020450	GCA	2	6	2213546	2213551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286261
43022	NC_020450	GAT	2	6	2213615	2213620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286261
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43032	NC_020450	TAT	2	6	2214048	2214053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286262
43033	NC_020450	TAA	2	6	2214058	2214063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286262
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43037	NC_020450	AT	3	6	2214191	2214196	50 %	50 %	0 %	0 %	459286262
43038	NC_020450	TTGAA	2	10	2214199	2214208	40 %	40 %	20 %	0 %	459286262
43039	NC_020450	T	6	6	2214238	2214243	0 %	100 %	0 %	0 %	459286262
43040	NC_020450	T	8	8	2214271	2214278	0 %	100 %	0 %	0 %	459286262
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43044	NC_020450	T	7	7	2214345	2214351	0 %	100 %	0 %	0 %	459286263
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43053	NC_020450	T	6	6	2214595	2214600	0 %	100 %	0 %	0 %	459286263
43054	NC_020450	CAA	2	6	2214622	2214627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286263
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43119	NC_020450	T	6	6	2217519	2217524	0 %	100 %	0 %	0 %	459286267
43120	NC_020450	AT	3	6	2217626	2217631	50 %	50 %	0 %	0 %	459286267
43121	NC_020450	A	6	6	2217656	2217661	100 %	0 %	0 %	0 %	459286267
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43229	NC_020450	ATC	2	6	2223699	2223704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286276
43230	NC_020450	CGTT	2	8	2223731	2223738	0 %	50 %	25 %	25 %	459286276
43231	NC_020450	TCA	2	6	2223742	2223747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286276
43232	NC_020450	TAA	2	6	2223915	2223920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286276
43233	NC_020450	ATTTT	2	10	2224063	2224072	20 %	80 %	0 %	0 %	459286277
43234	NC_020450	GTT	2	6	2224131	2224136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286277
43235	NC_020450	TCC	2	6	2224180	2224185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459286277
43236	NC_020450	GGC	2	6	2224222	2224227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286277
43237	NC_020450	ATAC	2	8	2224296	2224303	50 %	25 %	0 %	25 %	459286277
43238	NC_020450	AGA	2	6	2224401	2224406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286277
43239	NC_020450	CAAT	2	8	2224419	2224426	50 %	25 %	0 %	25 %	459286277
43240	NC_020450	AGA	2	6	2224434	2224439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286277
43241	NC_020450	CAAC	2	8	2224486	2224493	50 %	0 %	0 %	50 %	459286277
43242	NC_020450	TTG	2	6	2224617	2224622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286277
43243	NC_020450	TTG	2	6	2224672	2224677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286277
43244	NC_020450	GTT	2	6	2224685	2224690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286277
43245	NC_020450	ATAA	2	8	2224693	2224700	75 %	25 %	0 %	0 %	459286277
43246	NC_020450	TCA	2	6	2224781	2224786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286277
43247	NC_020450	CCG	2	6	2224800	2224805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286277
43248	NC_020450	ATC	2	6	2224928	2224933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286277
43249	NC_020450	CAG	2	6	2224992	2224997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286277
43250	NC_020450	AGCA	2	8	2225020	2225027	50 %	0 %	25 %	25 %	459286277
43251	NC_020450	ACG	2	6	2225062	2225067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286277
43252	NC_020450	CAA	2	6	2225094	2225099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286277
43253	NC_020450	CAA	2	6	2225122	2225127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286277
43254	NC_020450	TGCAT	2	10	2225189	2225198	20 %	40 %	20 %	20 %	459286277
43255	NC_020450	TCA	2	6	2225214	2225219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286277
43256	NC_020450	TTAC	2	8	2225237	2225244	25 %	50 %	0 %	25 %	459286277
43257	NC_020450	A	6	6	2225377	2225382	100 %	0 %	0 %	0 %	459286277
43258	NC_020450	CTT	2	6	2225468	2225473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286278
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43260	NC_020450	AGC	2	6	2225487	2225492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286278
43261	NC_020450	AGC	3	9	2225508	2225516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286278
43262	NC_020450	T	6	6	2225544	2225549	0 %	100 %	0 %	0 %	459286278
43263	NC_020450	TGA	2	6	2225600	2225605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286278
43264	NC_020450	AGC	2	6	2225610	2225615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286278
43265	NC_020450	CCA	2	6	2225773	2225778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286278
43266	NC_020450	TGA	2	6	2225832	2225837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286278
43267	NC_020450	CAG	2	6	2225879	2225884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286278
43268	NC_020450	AATG	2	8	2225890	2225897	50 %	25 %	25 %	0 %	459286278
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43270	NC_020450	ATTA	2	8	2226176	2226183	50 %	50 %	0 %	0 %	459286279
43271	NC_020450	CTT	2	6	2226186	2226191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286279
43272	NC_020450	TACCA	2	10	2226220	2226229	40 %	20 %	0 %	40 %	459286279
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43274	NC_020450	TAC	2	6	2226253	2226258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286279
43275	NC_020450	TAATTT	2	12	2226342	2226353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286279
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43303	NC_020450	GTTT	2	8	2227216	2227223	0 %	75 %	25 %	0 %	459286281
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43308	NC_020450	ACG	2	6	2227540	2227545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286282
43309	NC_020450	GCT	2	6	2227559	2227564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286282
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43317	NC_020450	T	7	7	2227995	2228001	0 %	100 %	0 %	0 %	459286282
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43319	NC_020450	TAC	2	6	2228273	2228278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286283
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43324	NC_020450	GTCA	2	8	2228597	2228604	25 %	25 %	25 %	25 %	459286283
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43326	NC_020450	A	7	7	2228858	2228864	100 %	0 %	0 %	0 %	459286284
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43329	NC_020450	GCA	2	6	2228989	2228994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286284
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43331	NC_020450	ATG	2	6	2229097	2229102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286284
43332	NC_020450	ACC	2	6	2229126	2229131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286284
43333	NC_020450	AGT	2	6	2229138	2229143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286284
43334	NC_020450	AGA	2	6	2229162	2229167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286284
43335	NC_020450	AGC	2	6	2229198	2229203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286284
43336	NC_020450	ACT	2	6	2229273	2229278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286284
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43338	NC_020450	CTTT	2	8	2229340	2229347	0 %	75 %	0 %	25 %	459286284
43339	NC_020450	A	7	7	2229388	2229394	100 %	0 %	0 %	0 %	459286284
43340	NC_020450	TTTTAA	2	12	2229416	2229427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286284
43341	NC_020450	T	6	6	2229610	2229615	0 %	100 %	0 %	0 %	459286285
43342	NC_020450	AAC	2	6	2229760	2229765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286285
43343	NC_020450	AGCA	2	8	2229829	2229836	50 %	0 %	25 %	25 %	459286286
43344	NC_020450	TTC	2	6	2229847	2229852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286286
43345	NC_020450	GTT	2	6	2229866	2229871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286286
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43347	NC_020450	GT	3	6	2229954	2229959	0 %	50 %	50 %	0 %	459286286
43348	NC_020450	TTTG	2	8	2229982	2229989	0 %	75 %	25 %	0 %	459286286
43349	NC_020450	AGC	2	6	2230114	2230119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286286
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43351	NC_020450	GTT	2	6	2230204	2230209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286286
43352	NC_020450	TAC	2	6	2230303	2230308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286286
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43354	NC_020450	T	6	6	2230385	2230390	0 %	100 %	0 %	0 %	459286287
43355	NC_020450	T	6	6	2230403	2230408	0 %	100 %	0 %	0 %	459286287
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43360	NC_020450	AGT	2	6	2230610	2230615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286287
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43469	NC_020450	GCGAAT	2	12	2236283	2236294	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	459286299
43470	NC_020450	T	7	7	2236294	2236300	0 %	100 %	0 %	0 %	459286299
43471	NC_020450	T	6	6	2236309	2236314	0 %	100 %	0 %	0 %	459286299
43472	NC_020450	ATC	2	6	2236686	2236691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286300
43473	NC_020450	TGTT	2	8	2236756	2236763	0 %	75 %	25 %	0 %	459286300
43474	NC_020450	ATG	2	6	2236834	2236839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286300
43475	NC_020450	TCA	2	6	2236849	2236854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286300
43476	NC_020450	TCA	2	6	2236888	2236893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286300
43477	NC_020450	A	6	6	2236908	2236913	100 %	0 %	0 %	0 %	459286300
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43479	NC_020450	GAA	2	6	2236926	2236931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286300
43480	NC_020450	A	7	7	2236933	2236939	100 %	0 %	0 %	0 %	459286300
43481	NC_020450	GAA	2	6	2236941	2236946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286300
43482	NC_020450	A	6	6	2236980	2236985	100 %	0 %	0 %	0 %	459286300
43483	NC_020450	A	7	7	2236990	2236996	100 %	0 %	0 %	0 %	459286300
43484	NC_020450	AAAT	2	8	2237075	2237082	75 %	25 %	0 %	0 %	459286301
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43489	NC_020450	CAT	2	6	2237388	2237393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286301
43490	NC_020450	TCG	2	6	2237396	2237401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286301
43491	NC_020450	GCT	3	9	2237455	2237463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286301
43492	NC_020450	AAT	2	6	2237577	2237582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286301
43493	NC_020450	CAT	2	6	2237583	2237588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286301
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43495	NC_020450	AGA	2	6	2237821	2237826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286301
43496	NC_020450	A	7	7	2237832	2237838	100 %	0 %	0 %	0 %	459286301
43497	NC_020450	GTC	2	6	2237893	2237898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286301
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43499	NC_020450	ATAA	2	8	2237940	2237947	75 %	25 %	0 %	0 %	459286301
43500	NC_020450	A	6	6	2238040	2238045	100 %	0 %	0 %	0 %	459286301

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